Class a: All alpha proteins [46456] (284 folds) |
Fold a.4: DNA/RNA-binding 3-helical bundle [46688] (14 superfamilies) core: 3-helices; bundle, closed or partly opened, right-handed twist; up-and down |
Superfamily a.4.5: "Winged helix" DNA-binding domain [46785] (85 families) contains a small beta-sheet (wing) |
Family a.4.5.4: CAP C-terminal domain-like [46796] (8 proteins) |
Protein Listeriolysin regulatory protein PrfA, C-terminal domain [88975] (1 species) |
Species Listeria monocytogenes [TaxId:1639] [88976] (3 PDB entries) |
Domain d1omia2: 1omi A:1138-1237 [87080] Other proteins in same PDB: d1omia1, d1omib1 complexed with gol |
Domain d1omib2: 1omi B:2138-2237 [87082] Other proteins in same PDB: d1omia1, d1omib1 complexed with gol |
Domain d2beoa1: 2beo A:138-237 [128381] Other proteins in same PDB: d2beoa2, d2beob2 automatically matched to d1omia2 complexed with acm, cl, gln, pg4 |
Domain d2beob1: 2beo B:138-237 [128383] Other proteins in same PDB: d2beoa2, d2beob2 automatically matched to d1omia2 complexed with acm, cl, gln, pg4 |
Domain d2bgca1: 2bgc A:138-237 [128458] Other proteins in same PDB: d2bgca2, d2bgcb2, d2bgcd2, d2bgce2, d2bgcf2, d2bgcg2, d2bgch2, d2bgci2 automatically matched to d1omia2 complexed with dtt, dtu; mutant |
Domain d2bgcb1: 2bgc B:138-237 [128460] Other proteins in same PDB: d2bgca2, d2bgcb2, d2bgcd2, d2bgce2, d2bgcf2, d2bgcg2, d2bgch2, d2bgci2 automatically matched to d1omia2 complexed with dtt, dtu; mutant |
Domain d2bgcd1: 2bgc D:138-237 [128462] Other proteins in same PDB: d2bgca2, d2bgcb2, d2bgcd2, d2bgce2, d2bgcf2, d2bgcg2, d2bgch2, d2bgci2 automatically matched to d1omia2 complexed with dtt, dtu; mutant |
Domain d2bgce1: 2bgc E:138-237 [128464] Other proteins in same PDB: d2bgca2, d2bgcb2, d2bgcd2, d2bgce2, d2bgcf2, d2bgcg2, d2bgch2, d2bgci2 automatically matched to d1omia2 complexed with dtt, dtu; mutant |
Domain d2bgcf1: 2bgc F:138-237 [128466] Other proteins in same PDB: d2bgca2, d2bgcb2, d2bgcd2, d2bgce2, d2bgcf2, d2bgcg2, d2bgch2, d2bgci2 automatically matched to d1omia2 complexed with dtt, dtu; mutant |
Domain d2bgcg1: 2bgc G:138-237 [128468] Other proteins in same PDB: d2bgca2, d2bgcb2, d2bgcd2, d2bgce2, d2bgcf2, d2bgcg2, d2bgch2, d2bgci2 automatically matched to d1omia2 complexed with dtt, dtu; mutant |
Domain d2bgch1: 2bgc H:138-235 [128470] Other proteins in same PDB: d2bgca2, d2bgcb2, d2bgcd2, d2bgce2, d2bgcf2, d2bgcg2, d2bgch2, d2bgci2 automatically matched to d1omia2 complexed with dtt, dtu; mutant |
Domain d2bgci1: 2bgc I:138-237 [128472] Other proteins in same PDB: d2bgca2, d2bgcb2, d2bgcd2, d2bgce2, d2bgcf2, d2bgcg2, d2bgch2, d2bgci2 automatically matched to d1omia2 complexed with dtt, dtu; mutant |
Timeline for Species Listeria monocytogenes [TaxId:1639] from a.4.5.4 Listeriolysin regulatory protein PrfA, C-terminal domain: