Lineage for Protein: Phycocyanin beta subunit

  1. Root: SCOP 1.65
  2. 275720Class a: All alpha proteins [46456] (179 folds)
  3. 275721Fold a.1: Globin-like [46457] (2 superfamilies)
    core: 6 helices; folded leaf, partly opened
  4. 275722Superfamily a.1.1: Globin-like [46458] (4 families) (S)
  5. 276690Family a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins [46532] (6 proteins)
    oligomers of two different types of globin-like subunits containing two extra helices at the N-terminus
    binds a bilin chromophore
  6. 276756Protein Phycocyanin beta subunit [88940] (6 species)

Species:

  1. 276757Cyanobacterium (Fremyella diplosiphon) [TaxId:1197] [88943] (1 PDB entry)
  2. 276760Red alga (Cyanidium caldarium) [TaxId:2771] [88941] (1 PDB entry)
  3. 276762Red alga (Polysiphonia urceolata) [TaxId:65404] [88942] (1 PDB entry)
  4. 276766Spirulina platensis [TaxId:118562] [88952] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1gh0:
      1. 276767Domain d1gh0b_: 1gh0 B: [60492]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
      2. 276768Domain d1gh0d_: 1gh0 D: [60494]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
      3. 276769Domain d1gh0f_: 1gh0 F: [60496]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
      4. 276770Domain d1gh0h_: 1gh0 H: [60498]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
      5. 276771Domain d1gh0j_: 1gh0 J: [60500]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
      6. 276772Domain d1gh0l_: 1gh0 L: [60502]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
      7. 276773Domain d1gh0n_: 1gh0 N: [60504]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
      8. 276774Domain d1gh0p_: 1gh0 P: [60506]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
      9. 276775Domain d1gh0r_: 1gh0 R: [60508]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
      10. 276776Domain d1gh0t_: 1gh0 T: [60510]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
      11. 276777Domain d1gh0v_: 1gh0 V: [60512]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
      12. 276778Domain d1gh0x_: 1gh0 X: [60514]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
        complexed with cyc
    2. Domains for 1ha7:
      1. 276779Domain d1ha7b_: 1ha7 B: [70936]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
      2. 276780Domain d1ha7d_: 1ha7 D: [70938]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
      3. 276781Domain d1ha7f_: 1ha7 F: [70940]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
      4. 276782Domain d1ha7h_: 1ha7 H: [70942]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
      5. 276783Domain d1ha7j_: 1ha7 J: [70944]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
      6. 276784Domain d1ha7l_: 1ha7 L: [70946]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
      7. 276785Domain d1ha7n_: 1ha7 N: [70948]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
      8. 276786Domain d1ha7p_: 1ha7 P: [70950]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
      9. 276787Domain d1ha7r_: 1ha7 R: [70952]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
      10. 276788Domain d1ha7t_: 1ha7 T: [70954]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
      11. 276789Domain d1ha7v_: 1ha7 V: [70956]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
      12. 276790Domain d1ha7x_: 1ha7 X: [70958]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
        complexed with cyc, men
  5. 276791Synechococcus elongatus [TaxId:32046] [88968] (1 PDB entry)
  6. 276793Synechococcus vulcanus [TaxId:32053] [88944] (3 PDB entries)
    1. Domain for 1i7y:
    2. Domain for 1ktp:
    3. Domain for 1on7:

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