Lineage for Protein: Phycocyanin alpha subunit

  1. Root: SCOP 1.71
  2. 530466Class a: All alpha proteins [46456] (226 folds)
  3. 530467Fold a.1: Globin-like [46457] (2 superfamilies)
    core: 6 helices; folded leaf, partly opened
  4. 530468Superfamily a.1.1: Globin-like [46458] (4 families) (S)
  5. 531798Family a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins [46532] (6 proteins)
    oligomers of two different types of globin-like subunits containing two extra helices at the N-terminus
    binds a bilin chromophore
  6. 531823Protein Phycocyanin alpha subunit [88933] (6 species)

Species:

  1. 531824Cyanobacterium (Fremyella diplosiphon) [TaxId:1197] [88937] (1 PDB entry)
  2. 531827Red alga (Cyanidium caldarium) [TaxId:2771] [88934] (1 PDB entry)
  3. 531829Red alga (Polysiphonia urceolata) [TaxId:65404] [88936] (1 PDB entry)
  4. 531833Spirulina platensis [TaxId:118562] [88939] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1gh0:
      1. 531846Domain d1gh0a_: 1gh0 A: [60491]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      2. 531847Domain d1gh0c_: 1gh0 C: [60493]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      3. 531848Domain d1gh0e_: 1gh0 E: [60495]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      4. 531849Domain d1gh0g_: 1gh0 G: [60497]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      5. 531850Domain d1gh0i_: 1gh0 I: [60499]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      6. 531851Domain d1gh0k_: 1gh0 K: [60501]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      7. 531852Domain d1gh0m_: 1gh0 M: [60503]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      8. 531853Domain d1gh0o_: 1gh0 O: [60505]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      9. 531854Domain d1gh0q_: 1gh0 Q: [60507]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      10. 531855Domain d1gh0s_: 1gh0 S: [60509]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      11. 531856Domain d1gh0u_: 1gh0 U: [60511]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      12. 531857Domain d1gh0w_: 1gh0 W: [60513]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
        complexed with cyc
    2. Domains for 1ha7:
      1. 531834Domain d1ha7a_: 1ha7 A: [70935]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      2. 531835Domain d1ha7c_: 1ha7 C: [70937]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      3. 531836Domain d1ha7e_: 1ha7 E: [70939]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      4. 531837Domain d1ha7g_: 1ha7 G: [70941]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      5. 531838Domain d1ha7i_: 1ha7 I: [70943]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      6. 531839Domain d1ha7k_: 1ha7 K: [70945]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      7. 531840Domain d1ha7m_: 1ha7 M: [70947]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      8. 531841Domain d1ha7o_: 1ha7 O: [70949]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      9. 531842Domain d1ha7q_: 1ha7 Q: [70951]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      10. 531843Domain d1ha7s_: 1ha7 S: [70953]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      11. 531844Domain d1ha7u_: 1ha7 U: [70955]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      12. 531845Domain d1ha7w_: 1ha7 W: [70957]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
        complexed with cyc, men
  5. 531858Synechococcus elongatus [TaxId:32046] [88967] (1 PDB entry)
  6. 531860Synechococcus vulcanus [TaxId:32053] [88938] (3 PDB entries)
    1. Domain for 1i7y:
    2. Domain for 1ktp:
    3. Domain for 1on7:

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