Lineage for Protein: Phycocyanin alpha subunit

  1. Root: SCOP 1.65
  2. 275720Class a: All alpha proteins [46456] (179 folds)
  3. 275721Fold a.1: Globin-like [46457] (2 superfamilies)
    core: 6 helices; folded leaf, partly opened
  4. 275722Superfamily a.1.1: Globin-like [46458] (4 families) (S)
  5. 276690Family a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins [46532] (6 proteins)
    oligomers of two different types of globin-like subunits containing two extra helices at the N-terminus
    binds a bilin chromophore
  6. 276715Protein Phycocyanin alpha subunit [88933] (6 species)

Species:

  1. 276716Cyanobacterium (Fremyella diplosiphon) [TaxId:1197] [88937] (1 PDB entry)
  2. 276719Red alga (Cyanidium caldarium) [TaxId:2771] [88934] (1 PDB entry)
  3. 276721Red alga (Polysiphonia urceolata) [TaxId:65404] [88936] (1 PDB entry)
  4. 276725Spirulina platensis [TaxId:118562] [88939] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1gh0:
      1. 276726Domain d1gh0a_: 1gh0 A: [60491]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      2. 276727Domain d1gh0c_: 1gh0 C: [60493]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      3. 276728Domain d1gh0e_: 1gh0 E: [60495]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      4. 276729Domain d1gh0g_: 1gh0 G: [60497]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      5. 276730Domain d1gh0i_: 1gh0 I: [60499]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      6. 276731Domain d1gh0k_: 1gh0 K: [60501]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      7. 276732Domain d1gh0m_: 1gh0 M: [60503]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      8. 276733Domain d1gh0o_: 1gh0 O: [60505]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      9. 276734Domain d1gh0q_: 1gh0 Q: [60507]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      10. 276735Domain d1gh0s_: 1gh0 S: [60509]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      11. 276736Domain d1gh0u_: 1gh0 U: [60511]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
      12. 276737Domain d1gh0w_: 1gh0 W: [60513]
        Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
        complexed with cyc
    2. Domains for 1ha7:
      1. 276738Domain d1ha7a_: 1ha7 A: [70935]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      2. 276739Domain d1ha7c_: 1ha7 C: [70937]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      3. 276740Domain d1ha7e_: 1ha7 E: [70939]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      4. 276741Domain d1ha7g_: 1ha7 G: [70941]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      5. 276742Domain d1ha7i_: 1ha7 I: [70943]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      6. 276743Domain d1ha7k_: 1ha7 K: [70945]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      7. 276744Domain d1ha7m_: 1ha7 M: [70947]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      8. 276745Domain d1ha7o_: 1ha7 O: [70949]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      9. 276746Domain d1ha7q_: 1ha7 Q: [70951]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      10. 276747Domain d1ha7s_: 1ha7 S: [70953]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      11. 276748Domain d1ha7u_: 1ha7 U: [70955]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
      12. 276749Domain d1ha7w_: 1ha7 W: [70957]
        Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
        complexed with cyc, men
  5. 276750Synechococcus elongatus [TaxId:32046] [88967] (1 PDB entry)
  6. 276752Synechococcus vulcanus [TaxId:32053] [88938] (3 PDB entries)
    1. Domain for 1i7y:
    2. Domain for 1ktp:
    3. Domain for 1on7:

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