Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (376 folds) |
Fold d.19: MHC antigen-recognition domain [54451] (1 superfamily) dimeric |
Superfamily d.19.1: MHC antigen-recognition domain [54452] (1 family) |
Family d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain [54453] (13 proteins) |
Protein Class II MHC beta chain, N-terminal domain [88819] (15 species) |
Human (Homo sapiens), HLA-DM [TaxId:9606] [88820] (1 PDB entry) |
Domain d1hdmb2: 1hdm B:3-87 [38158] Other proteins in same PDB: d1hdma1, d1hdma2, d1hdmb1 |
Human (Homo sapiens), HLA-DQ2 [TaxId:9606] [102835] (1 PDB entry) |
Domain d1s9vb2: 1s9v B:3-94 [98763] Other proteins in same PDB: d1s9va1, d1s9va2, d1s9vb1, d1s9vd1, d1s9vd2, d1s9ve1 complexed with deamidated gliadin peptide complexed with edo |
Domain d1s9ve2: 1s9v E:3-94 [98767] Other proteins in same PDB: d1s9va1, d1s9va2, d1s9vb1, d1s9vd1, d1s9vd2, d1s9ve1 complexed with deamidated gliadin peptide complexed with edo |
Human (Homo sapiens), HLA-DQ6 [TaxId:9606] [102836] (1 PDB entry) |
Domain d1uvqb2: 1uvq B:3-94 [100065] Other proteins in same PDB: d1uvqa1, d1uvqa2, d1uvqb1 complexed with a hypocretin peptide complexed with acy, gly, nag, zn |
Human (Homo sapiens), HLA-DQ8 [TaxId:9606] [88825] (1 PDB entry) |
Domain d1jk8b2: 1jk8 B:3-94 [63148] Other proteins in same PDB: d1jk8a1, d1jk8a2, d1jk8b1 complexed with a human insulin peptide complexed with nag |
Human (Homo sapiens), HLA-DR1 [TaxId:9606] [88821] (13 PDB entries) |
Domain d1aqdb2: 1aqd B:4-92 [38160] Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdj2, d1aqdk1 |
Domain d1aqde2: 1aqd E:4-92 [38162] Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdj2, d1aqdk1 |
Domain d1aqdh2: 1aqd H:4-92 [38164] Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdj2, d1aqdk1 |
Domain d1aqdk2: 1aqd K:4-92 [38166] Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdj2, d1aqdk1 |
Domain d1h15b2: 1h15 B:2-92 [76457] Other proteins in same PDB: d1h15a1, d1h15a2, d1h15b1, d1h15d1, d1h15d2, d1h15e1 complexed with a peptide from Epstein barr virus DNA polymerase, chains C and H protein/DNA complex; complexed with nag |
Domain d1h15e2: 1h15 E:2-92 [76461] Other proteins in same PDB: d1h15a1, d1h15a2, d1h15b1, d1h15d1, d1h15d2, d1h15e1 complexed with a peptide from Epstein barr virus DNA polymerase, chains C and H protein/DNA complex; complexed with nag |
Domain d1kg0b2: 1kg0 B:3-92 [72444] Other proteins in same PDB: d1kg0a1, d1kg0a2, d1kg0b1, d1kg0c_ |
Domain d1r5ib2: 1r5i B:1-92 [97090] Other proteins in same PDB: d1r5ia1, d1r5ia2, d1r5ib1, d1r5id_, d1r5ie1, d1r5ie2, d1r5if1, d1r5ih_ complexed with po4 |
Domain d1r5if2: 1r5i F:1-92 [97095] Other proteins in same PDB: d1r5ia1, d1r5ia2, d1r5ib1, d1r5id_, d1r5ie1, d1r5ie2, d1r5if1, d1r5ih_ complexed with po4 |
Domain d1sebb2: 1seb B:1-92 [38176] Other proteins in same PDB: d1seba1, d1seba2, d1sebb1, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebe2, d1sebf1, d1sebh1, d1sebh2 |
Domain d1sebf2: 1seb F:1-92 [38178] Other proteins in same PDB: d1seba1, d1seba2, d1sebb1, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebe2, d1sebf1, d1sebh1, d1sebh2 |
Human (Homo sapiens), HLA-DR2 [TaxId:9606] [88822] (13 PDB entries) Uniprot P04229 30-219 |
Domain d1zglb2: 1zgl B:1-92 [125034] Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb1, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle1, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh1, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk1, d1zglp1, d1zglp2, d1zglr1, d1zglr2, d1zglt1, d1zglt2, d1zglv1, d1zglv2 automatically matched to d1fv1b2 |
Domain d1zgle2: 1zgl E:2-92 [125038] Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb1, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle1, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh1, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk1, d1zglp1, d1zglp2, d1zglr1, d1zglr2, d1zglt1, d1zglt2, d1zglv1, d1zglv2 automatically matched to d1fv1b2 |
Domain d1zglh2: 1zgl H:1-92 [125042] Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb1, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle1, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh1, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk1, d1zglp1, d1zglp2, d1zglr1, d1zglr2, d1zglt1, d1zglt2, d1zglv1, d1zglv2 automatically matched to d1fv1b2 |
Domain d1zglk2: 1zgl K:1-92 [125046] Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb1, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle1, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh1, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk1, d1zglp1, d1zglp2, d1zglr1, d1zglr2, d1zglt1, d1zglt2, d1zglv1, d1zglv2 automatically matched to d1fv1b2 |
Domain d2nnab2: 2nna B:7-92 [148316] Other proteins in same PDB: d2nnab1 automatically matched to d1bx2b2 |
Human (Homo sapiens), HLA-DR3 [TaxId:9606] [88823] (1 PDB entry) |
Domain d1a6ab2: 1a6a B:5-92 [38190] Other proteins in same PDB: d1a6aa1, d1a6aa2, d1a6ab1 complexed with nag |
Human (Homo sapiens), HLA-DR4 [TaxId:9606] [88824] (12 PDB entries) |
Domain d2iamb2: 2iam B:1-92 [137161] Other proteins in same PDB: d2iama1, d2iama2, d2iamb1 automatically matched to d1d5xb2 mutant |
Domain d2ianb2: 2ian B:3-92 [137165] Other proteins in same PDB: d2iana1, d2iana2, d2ianb1, d2ianf1, d2ianf2, d2iang1, d2iank1, d2iank2, d2ianl1, d2ianp1, d2ianp2, d2ianq1 automatically matched to d1d5xb2 mutant |
Domain d2iang2: 2ian G:2-92 [137169] Other proteins in same PDB: d2iana1, d2iana2, d2ianb1, d2ianf1, d2ianf2, d2iang1, d2iank1, d2iank2, d2ianl1, d2ianp1, d2ianp2, d2ianq1 automatically matched to d1d5xb2 mutant |
Domain d2ianl2: 2ian L:3-92 [137173] Other proteins in same PDB: d2iana1, d2iana2, d2ianb1, d2ianf1, d2ianf2, d2iang1, d2iank1, d2iank2, d2ianl1, d2ianp1, d2ianp2, d2ianq1 automatically matched to d1d5xb2 mutant |
Domain d2ianq2: 2ian Q:3-92 [137177] Other proteins in same PDB: d2iana1, d2iana2, d2ianb1, d2ianf1, d2ianf2, d2iang1, d2iank1, d2iank2, d2ianl1, d2ianp1, d2ianp2, d2ianq1 automatically matched to d1d5xb2 mutant |
Domain d2icwb2: 2icw B:1-92 [137246] Other proteins in same PDB: d2icwa1, d2icwa2, d2icwb1, d2icwd1, d2icwd2, d2icwe1, d2icwg_, d2icwh_, d2icwj1, d2icwl_ automatically matched to d1d5xb2 |
Domain d2icwe2: 2icw E:1-92 [137250] Other proteins in same PDB: d2icwa1, d2icwa2, d2icwb1, d2icwd1, d2icwd2, d2icwe1, d2icwg_, d2icwh_, d2icwj1, d2icwl_ automatically matched to d1d5xb2 |
Domain d2ojeb2: 2oje B:1-92 [139106] Other proteins in same PDB: d2ojea1, d2ojea2, d2ojeb1, d2ojed1, d2ojee1, d2ojee2, d2ojef1, d2ojeh1 automatically matched to d1d5xb2 complexed with po4 |
Domain d2ojef2: 2oje F:1-92 [139111] Other proteins in same PDB: d2ojea1, d2ojea2, d2ojeb1, d2ojed1, d2ojee1, d2ojee2, d2ojef1, d2ojeh1 automatically matched to d1d5xb2 complexed with po4 |
Mouse (Mus musculus), H2-DM [TaxId:10090] [88831] (1 PDB entry) |
Domain d1k8ib2: 1k8i B:1-94 [68304] Other proteins in same PDB: d1k8ia1, d1k8ia2, d1k8ib1 complexed with nag |
Mouse (Mus musculus), I-A(G7) [TaxId:10090] [88830] (5 PDB entries) |
Domain d1es0b2: 1es0 B:5-93 [38218] Other proteins in same PDB: d1es0a1, d1es0a2, d1es0b1 |
Domain d1u3hd2: 1u3h D:4-93 [119513] Other proteins in same PDB: d1u3ha1, d1u3hb1, d1u3hc1, d1u3hc2, d1u3hd1, d1u3he_, d1u3hf_, d1u3hg1, d1u3hg2, d1u3hh1 automatically matched to d1f3jb2 |
Domain d1u3hh2: 1u3h H:4-93 [119517] Other proteins in same PDB: d1u3ha1, d1u3hb1, d1u3hc1, d1u3hc2, d1u3hd1, d1u3he_, d1u3hf_, d1u3hg1, d1u3hg2, d1u3hh1 automatically matched to d1f3jb2 |
Mouse (Mus musculus), I-AB [TaxId:10090] [88828] (5 PDB entries) |
Domain d1lnub2: 1lnu B:1-120 [74100] Other proteins in same PDB: d1lnua1, d1lnua2, d1lnub1, d1lnuc1, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnue1, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnug1, d1lnug2, d1lnuh1 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H complexed with nag, ndg |
Domain d1lnud2: 1lnu D:1-120 [74104] Other proteins in same PDB: d1lnua1, d1lnua2, d1lnub1, d1lnuc1, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnue1, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnug1, d1lnug2, d1lnuh1 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H complexed with nag, ndg |
Domain d1lnuf2: 1lnu F:1-120 [74108] Other proteins in same PDB: d1lnua1, d1lnua2, d1lnub1, d1lnuc1, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnue1, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnug1, d1lnug2, d1lnuh1 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H complexed with nag, ndg |
Domain d1lnuh2: 1lnu H:1-120 [74112] Other proteins in same PDB: d1lnua1, d1lnua2, d1lnub1, d1lnuc1, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnue1, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnug1, d1lnug2, d1lnuh1 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H complexed with nag, ndg |
Domain d1mujb2: 1muj B:3-93 [79491] Other proteins in same PDB: d1muja1, d1muja2, d1mujb1 complex with a human clip peptide, chain C complexed with nag |
Domain d3c5zd2: 3c5z D:1-120 [155956] Other proteins in same PDB: d3c5zc1, d3c5zc2, d3c5zd1, d3c5zg1, d3c5zg2, d3c5zh1 automatically matched to d1lnub2 |
Domain d3c5zh2: 3c5z H:1-120 [155960] Other proteins in same PDB: d3c5zc1, d3c5zc2, d3c5zd1, d3c5zg1, d3c5zg2, d3c5zh1 automatically matched to d1lnub2 |
Domain d3c60d2: 3c60 D:1-120 [155964] Other proteins in same PDB: d3c60c1, d3c60c2, d3c60d1, d3c60g1, d3c60g2, d3c60h1 automatically matched to d1lnub2 |
Domain d3c60h2: 3c60 H:1-120 [155968] Other proteins in same PDB: d3c60c1, d3c60c2, d3c60d1, d3c60g1, d3c60g2, d3c60h1 automatically matched to d1lnub2 |
Domain d3c6ld2: 3c6l D:1-120 [155982] Other proteins in same PDB: d3c6la1, d3c6la2, d3c6lc1, d3c6lc2, d3c6ld1, d3c6le1, d3c6le2, d3c6lg1, d3c6lg2, d3c6lh1 automatically matched to d1lnub2 complexed with ca |
Domain d3c6lh2: 3c6l H:1-120 [155988] Other proteins in same PDB: d3c6la1, d3c6la2, d3c6lc1, d3c6lc2, d3c6ld1, d3c6le1, d3c6le2, d3c6lg1, d3c6lg2, d3c6lh1 automatically matched to d1lnub2 complexed with ca |
Mouse (Mus musculus), I-AD [TaxId:10090] [88829] (2 PDB entries) |
Domain d1iaob2: 1iao B:6-93 [38216] Other proteins in same PDB: d1iaoa1, d1iaoa2, d1iaob1 complexed with nag |
Domain d2iadb2: 2iad B:5-93 [38214] Other proteins in same PDB: d2iada1, d2iada2, d2iadb1 |
Mouse (Mus musculus), I-AK [TaxId:10090] [88826] (3 PDB entries) |
Domain d1d9kd2: 1d9k D:2-92 [38202] Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc1, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg1, d1d9kg2, d1d9kh1 complexed with ndg |
Domain d1d9kh2: 1d9k H:2-92 [38204] Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc1, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg1, d1d9kg2, d1d9kh1 complexed with ndg |
Domain d1iakb2: 1iak B:5-92 [38200] Other proteins in same PDB: d1iaka1, d1iaka2, d1iakb1 complexed with nag |
Mouse (Mus musculus), I-AU [TaxId:10090] [89860] (1 PDB entry) |
Domain d1k2db2: 1k2d B:5-92 [84294] Other proteins in same PDB: d1k2da1, d1k2da2, d1k2db1 complexed with nag, ndg |
Mouse (Mus musculus), I-EK [TaxId:10090] [88827] (9 PDB entries) |
Domain d1fneb2: 1fne B:4-92 [59899] Other proteins in same PDB: d1fnea1, d1fnea2, d1fneb1, d1fnec1, d1fnec2, d1fned1 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D complexed with nag |
Domain d1fned2: 1fne D:4-92 [59903] Other proteins in same PDB: d1fnea1, d1fnea2, d1fneb1, d1fnec1, d1fnec2, d1fned1 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D complexed with nag |
Domain d1fngb2: 1fng B:4-92 [59907] Other proteins in same PDB: d1fnga1, d1fnga2, d1fngb1, d1fngc1, d1fngc2, d1fngd1 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D complexed with nag |
Domain d1fngd2: 1fng D:4-92 [59911] Other proteins in same PDB: d1fnga1, d1fnga2, d1fngb1, d1fngc1, d1fngc2, d1fngd1 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D complexed with nag |
Domain d1i3rb2: 1i3r B:1-120 [61623] Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3ra2, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rc2, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3re2, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rg2, d1i3rh1 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H complexed with nag, ndg; mutant |
Domain d1i3rd2: 1i3r D:1-120 [61627] Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3ra2, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rc2, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3re2, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rg2, d1i3rh1 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H complexed with nag, ndg; mutant |
Domain d1i3rf2: 1i3r F:1-120 [61631] Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3ra2, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rc2, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3re2, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rg2, d1i3rh1 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H complexed with nag, ndg; mutant |
Domain d1i3rh2: 1i3r H:1-120 [61635] Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3ra2, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rc2, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3re2, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rg2, d1i3rh1 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H complexed with nag, ndg; mutant |
Domain d1ieab2: 1iea B:4-92 [38206] Other proteins in same PDB: d1ieaa1, d1ieaa2, d1ieab1, d1ieac1, d1ieac2, d1iead1 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D complexed with nag |
Domain d1iead2: 1iea D:4-92 [38208] Other proteins in same PDB: d1ieaa1, d1ieaa2, d1ieab1, d1ieac1, d1ieac2, d1iead1 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D complexed with nag |
Domain d1iebb2: 1ieb B:4-92 [38210] Other proteins in same PDB: d1ieba1, d1ieba2, d1iebb1, d1iebc1, d1iebc2, d1iebd1 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D complexed with nag, ndg, so4 |
Domain d1iebd2: 1ieb D:4-92 [38212] Other proteins in same PDB: d1ieba1, d1ieba2, d1iebb1, d1iebc1, d1iebc2, d1iebd1 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D complexed with nag, ndg, so4 |
Domain d1kt2b2: 1kt2 B:2-120 [72954] Other proteins in same PDB: d1kt2a1, d1kt2a2, d1kt2b1, d1kt2c1, d1kt2c2, d1kt2d1 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D complexed with nag |
Domain d1kt2d2: 1kt2 D:2-120 [72958] Other proteins in same PDB: d1kt2a1, d1kt2a2, d1kt2b1, d1kt2c1, d1kt2c2, d1kt2d1 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D complexed with nag |
Domain d1ktdb2: 1ktd B:1-120 [72967] Other proteins in same PDB: d1ktda1, d1ktda2, d1ktdb1, d1ktdc1, d1ktdc2, d1ktdd1 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D complexed with nag, so4 |
Domain d1ktdd2: 1ktd D:1-120 [72971] Other proteins in same PDB: d1ktda1, d1ktda2, d1ktdb1, d1ktdc1, d1ktdc2, d1ktdd1 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D complexed with nag, so4 |
Timeline for Protein Class II MHC beta chain, N-terminal domain from d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain: