SCOPe 2.04: Species: Human (Homo sapiens), HLA-DR1 [TaxId: 9606]

Lineage for Species: Human (Homo sapiens), HLA-DR1 [TaxId: 9606]

Root: SCOPe 2.04
Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (380 folds)
Fold d.19: MHC antigen-recognition domain [54451] (1 superfamily)
dimeric
Superfamily d.19.1: MHC antigen-recognition domain [54452] (2 families)
Family d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain [54453] (13 proteins)
Protein Class II MHC alpha chain, N-terminal domain [88806] (15 species)
Species Human (Homo sapiens), HLA-DR1 [TaxId:9606] [88808] (18 PDB entries)
Uniprot P01903 28-207

PDB entries in Species: Human (Homo sapiens), HLA-DR1 [TaxId: 9606]:

Domain(s) for 1aqd:
1. Domain d1aqda2: 1aqd A:3-81 [38159]
  Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj1, d1aqdk1, d1aqdk2
2. Domain d1aqdd2: 1aqd D:3-81 [38161]
  Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj1, d1aqdk1, d1aqdk2
3. Domain d1aqdg2: 1aqd G:3-81 [38163]
  Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj1, d1aqdk1, d1aqdk2
4. Domain d1aqdj2: 1aqd J:3-81 [38165]
  Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj1, d1aqdk1, d1aqdk2
Domain(s) for 1dlh:
1. Domain d1dlha2: 1dlh A:3-81 [38171]
  Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlhb1, d1dlhb2, d1dlhd1, d1dlhe1, d1dlhe2
  complexed with nag, ndg
2. Domain d1dlhd2: 1dlh D:3-81 [38173]
  Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlhb1, d1dlhb2, d1dlhd1, d1dlhe1, d1dlhe2
  complexed with nag, ndg
Domain(s) for 1fyt:
- Domain d1fyta2: 1fyt A:2-81 [38169]
  Other proteins in same PDB: d1fyta1, d1fytb1, d1fytb2, d1fytd1, d1fytd2, d1fyte1, d1fyte2
  complexed with nag

Domain(s) for 1h15:

Domain d1h15a2: 1h15 A:3-81 [76455]
Other proteins in same PDB: d1h15a1, d1h15b1, d1h15b2, d1h15d1, d1h15e1, d1h15e2
complexed with a peptide from epstein barr virus dna polymerase, chains C and H
protein/DNA complex; complexed with nag

Domain d1h15d2: 1h15 D:3-81 [76459]
Other proteins in same PDB: d1h15a1, d1h15b1, d1h15b2, d1h15d1, d1h15e1, d1h15e2
complexed with a peptide from epstein barr virus dna polymerase, chains C and H
protein/DNA complex; complexed with nag

Domain(s) for 1hxy:
- Domain d1hxya2: 1hxy A:3-81 [61387]
  Other proteins in same PDB: d1hxya1, d1hxyb1, d1hxyb2, d1hxyd1, d1hxyd2
  complexed with zn
Domain(s) for 1kg0:
- Domain d1kg0a2: 1kg0 A:3-81 [72442]
  Other proteins in same PDB: d1kg0a1, d1kg0b1, d1kg0b2, d1kg0c_
Domain(s) for 1klg:
- Domain d1klga2: 1klg A:4-81 [72715]
  Other proteins in same PDB: d1klga1, d1klgb1, d1klgb2, d1klgd1, d1klgd2
  mutant
Domain(s) for 1klu:
- Domain d1klua2: 1klu A:4-81 [72725]
  Other proteins in same PDB: d1klua1, d1klub1, d1klub2, d1klud1, d1klud2
Domain(s) for 1lo5:
- Domain d1lo5a2: 1lo5 A:4-81 [78117]
  Other proteins in same PDB: d1lo5a1, d1lo5b1, d1lo5b2, d1lo5d1, d1lo5d2
  complexed with a peptide from hemagglutinin
Domain(s) for 1seb:
1. Domain d1seba2: 1seb A:1-81 [38175]
  Other proteins in same PDB: d1seba1, d1sebb1, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebf1, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
2. Domain d1sebe2: 1seb E:1-81 [38177]
  Other proteins in same PDB: d1seba1, d1sebb1, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebf1, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
Domain(s) for 1sje:
- Domain d1sjea2: 1sje A:4-81 [105641]
  Other proteins in same PDB: d1sjea1, d1sjeb1, d1sjeb2, d1sjed1, d1sjed2
Domain(s) for 1sjh:
- Domain d1sjha2: 1sjh A:4-81 [105649]
  Other proteins in same PDB: d1sjha1, d1sjhb1, d1sjhb2, d1sjhd1, d1sjhd2
Domain(s) for 1t5w:
1. Domain d1t5wa2: 1t5w A:4-81 [106482]
  Other proteins in same PDB: d1t5wa1, d1t5wb1, d1t5wb2, d1t5wd1, d1t5we1, d1t5we2
2. Domain d1t5wd2: 1t5w D:4-81 [106486]
  Other proteins in same PDB: d1t5wa1, d1t5wb1, d1t5wb2, d1t5wd1, d1t5we1, d1t5we2
Domain(s) for 1t5x:
- Domain d1t5xa2: 1t5x A:4-81 [106490]
  Other proteins in same PDB: d1t5xa1, d1t5xb1, d1t5xb2, d1t5xd1, d1t5xd2
Domain(s) for 2seb:
- Domain d2seba2: 2seb A:1-81 [38167]
  Other proteins in same PDB: d2seba1, d2sebb1, d2sebb2, d2sebd1, d2sebd2
  complexed with nag
Domain(s) for 4h25:
1. Domain d4h25a1: 4h25 A:3-81 [228334]
  Other proteins in same PDB: d4h25a2, d4h25b1, d4h25b2, d4h25d2, d4h25e1, d4h25e2
  automated match to d1kg0a2
  complexed with ipa
2. Domain d4h25d1: 4h25 D:3-81 [228336]
  Other proteins in same PDB: d4h25a2, d4h25b1, d4h25b2, d4h25d2, d4h25e1, d4h25e2
  automated match to d1kg0a2
  complexed with ipa
Domain(s) for 4h26:
1. Domain d4h26a1: 4h26 A:3-81 [228339]
  Other proteins in same PDB: d4h26a2, d4h26b1, d4h26b2, d4h26d2, d4h26e1, d4h26e2
  automated match to d1aqda2
2. Domain d4h26d1: 4h26 D:3-81 [228338]
  Other proteins in same PDB: d4h26a2, d4h26b1, d4h26b2, d4h26d2, d4h26e1, d4h26e2
  automated match to d1aqda2
Domain(s) for 4i5b:
1. Domain d4i5ba1: 4i5b A:2-81 [234810]
  Other proteins in same PDB: d4i5ba2, d4i5bb1, d4i5bb2, d4i5bd2, d4i5be1, d4i5be2
  automated match to d4i5bd1
2. Domain d4i5bd1: 4i5b D:2-81 [229424]
  Other proteins in same PDB: d4i5ba2, d4i5bb1, d4i5bb2, d4i5bd2, d4i5be1, d4i5be2
  automated match to d1aqda2

More info for Species Human (Homo sapiens), HLA-DR1 [TaxId:9606] from d.19.1.1 Class II MHC alpha chain, N-terminal domain

Timeline for Species Human (Homo sapiens), HLA-DR1 [TaxId:9606] from d.19.1.1 Class II MHC alpha chain, N-terminal domain:

Species Human (Homo sapiens), HLA-DR1 [TaxId:9606] from d.19.1.1 Class II MHC alpha chain, N-terminal domain first appeared in SCOP 1.65
Species Human (Homo sapiens), HLA-DR1 [TaxId:9606] from d.19.1.1 Class II MHC alpha chain, N-terminal domain appears in SCOPe 2.03
Species Human (Homo sapiens), HLA-DR1 [TaxId:9606] from d.19.1.1 Class II MHC alpha chain, N-terminal domain appears in SCOPe 2.05
Species Human (Homo sapiens), HLA-DR1 [TaxId:9606] from d.19.1.1 Class II MHC alpha chain, N-terminal domain appears in the current release, SCOPe 2.08