Lineage for Protein: Class II MHC alpha chain, N-terminal domain

  1. Root: SCOP 1.71
  2. 595667Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (286 folds)
  3. 600225Fold d.19: MHC antigen-recognition domain [54451] (1 superfamily)
    dimeric
  4. 600226Superfamily d.19.1: MHC antigen-recognition domain [54452] (1 family) (S)
  5. 600227Family d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain [54453] (12 proteins)
  6. 600497Protein Class II MHC alpha chain, N-terminal domain [88806] (15 species)

Species:

  1. 600498Human (Homo sapiens), HLA-DM [TaxId:9606] [88807] (1 PDB entry)
  2. 600500Human (Homo sapiens), HLA-DQ2 [TaxId:9606] [102833] (1 PDB entry)
  3. 600503Human (Homo sapiens), HLA-DQ6 [TaxId:9606] [102834] (1 PDB entry)
  4. 600505Human (Homo sapiens), HLA-DQ8 [TaxId:9606] [88812] (1 PDB entry)
  5. 600507Human (Homo sapiens), HLA-DR1 [TaxId:9606] [88808] (15 PDB entries)
    1. Domains for 1aqd:
      1. 600513Domain d1aqda2: 1aqd A:3-81 [38159]
        Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj1, d1aqdk1, d1aqdk2
      2. 600514Domain d1aqdd2: 1aqd D:3-81 [38161]
        Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj1, d1aqdk1, d1aqdk2
      3. 600515Domain d1aqdg2: 1aqd G:3-81 [38163]
        Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj1, d1aqdk1, d1aqdk2
      4. 600516Domain d1aqdj2: 1aqd J:3-81 [38165]
        Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj1, d1aqdk1, d1aqdk2
    2. Domains for 1dlh:
      1. 600523Domain d1dlha2: 1dlh A:3-81 [38171]
        Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlhb1, d1dlhb2, d1dlhd1, d1dlhe1, d1dlhe2
      2. 600524Domain d1dlhd2: 1dlh D:3-81 [38173]
        Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlhb1, d1dlhb2, d1dlhd1, d1dlhe1, d1dlhe2
        complexed with nag
    3. Domain for 1fyt:
    4. Domains for 1h15:
      1. 600527Domain d1h15a2: 1h15 A:3-81 [76455]
        Other proteins in same PDB: d1h15a1, d1h15b1, d1h15b2, d1h15d1, d1h15e1, d1h15e2
      2. 600528Domain d1h15d2: 1h15 D:3-81 [76459]
        Other proteins in same PDB: d1h15a1, d1h15b1, d1h15b2, d1h15d1, d1h15e1, d1h15e2
        complexed with a peptide from epstein barr virus dna polymerase, chains C and H
        complexed with nag, ndg
    5. Domain for 1hxy:
    6. Domain for 1kg0:
    7. Domain for 1klg:
    8. Domain for 1klu:
    9. Domain for 1lo5:
    10. Domains for 1seb:
      1. 600525Domain d1seba2: 1seb A:1-81 [38175]
        Other proteins in same PDB: d1seba1, d1sebb1, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebf1, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
      2. 600526Domain d1sebe2: 1seb E:1-81 [38177]
        Other proteins in same PDB: d1seba1, d1sebb1, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebf1, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
    11. Domain for 1sje:
    12. Domain for 1sjh:
    13. Domains for 1t5w:
      1. 600517Domain d1t5wa2: 1t5w A:4-81 [106482]
        Other proteins in same PDB: d1t5wa1, d1t5wb1, d1t5wb2, d1t5wd1, d1t5we1, d1t5we2
      2. 600518Domain d1t5wd2: 1t5w D:4-81 [106486]
        Other proteins in same PDB: d1t5wa1, d1t5wb1, d1t5wb2, d1t5wd1, d1t5we1, d1t5we2
    14. Domain for 1t5x:
    15. Domain for 2seb:
  6. 600530Human (Homo sapiens), HLA-DR2 [TaxId:9606] [88809] (8 PDB entries)
    1. Domains for 1bx2:
      1. 600539Domain d1bx2a2: 1bx2 A:2-81 [38183]
        Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2b1, d1bx2b2, d1bx2d1, d1bx2e1, d1bx2e2
      2. 600540Domain d1bx2d2: 1bx2 D:2-81 [38185]
        Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2b1, d1bx2b2, d1bx2d1, d1bx2e1, d1bx2e2
        complexed with nag
    2. Domains for 1fv1:
      1. 600531Domain d1fv1a2: 1fv1 A:3-81 [38179]
        Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1b1, d1fv1b2, d1fv1d1, d1fv1e1, d1fv1e2
      2. 600532Domain d1fv1d2: 1fv1 D:4-81 [38181]
        Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1b1, d1fv1b2, d1fv1d1, d1fv1e1, d1fv1e2
        complexed with cry, so4
    3. Domain for 1hqr:
    4. Domain for 1jwm:
    5. Domain for 1jws:
    6. Domain for 1jwu:
    7. Domain for 1pyw:
    8. Domains for 1r5i:
      1. 600537Domain d1r5ia2: 1r5i A:1-81 [97088]
        Other proteins in same PDB: d1r5ia1, d1r5ib1, d1r5ib2, d1r5id_, d1r5ie1, d1r5if1, d1r5if2, d1r5ih_
      2. 600538Domain d1r5ie2: 1r5i E:1-81 [97093]
        Other proteins in same PDB: d1r5ia1, d1r5ib1, d1r5ib2, d1r5id_, d1r5ie1, d1r5if1, d1r5if2, d1r5ih_
        complexed with po4
  7. 600542Human (Homo sapiens), HLA-DR3 [TaxId:9606] [88810] (1 PDB entry)
  8. 600544Human (Homo sapiens), HLA-DR4 [TaxId:9606] [88811] (5 PDB entries)
    1. Domain for 1d5m:
    2. Domain for 1d5x:
    3. Domain for 1d5z:
    4. Domain for 1d6e:
    5. Domain for 1j8h:
  9. 600550Mouse (Mus musculus), H2-DM [TaxId:10090] [88818] (1 PDB entry)
  10. 600552Mouse (Mus musculus), I-A(G7) [TaxId:10090] [88817] (2 PDB entries)
    1. Domain for 1es0:
    2. Domains for 1f3j:
      1. 600554Domain d1f3ja2: 1f3j A:1-82 [38219]
        Other proteins in same PDB: d1f3ja1, d1f3jb1, d1f3jb2, d1f3jd1, d1f3je1, d1f3je2
      2. 600555Domain d1f3jd2: 1f3j D:1-82 [38221]
        Other proteins in same PDB: d1f3ja1, d1f3jb1, d1f3jb2, d1f3jd1, d1f3je1, d1f3je2
        complexed with nag
  11. 600556Mouse (Mus musculus), I-AB [TaxId:10090] [88815] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1lnu:
      1. 600558Domain d1lnua2: 1lnu A:1-83 [74098]
        Other proteins in same PDB: d1lnua1, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc1, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue1, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug1, d1lnuh1, d1lnuh2
      2. 600559Domain d1lnuc2: 1lnu C:1-83 [74102]
        Other proteins in same PDB: d1lnua1, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc1, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue1, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug1, d1lnuh1, d1lnuh2
      3. 600560Domain d1lnue2: 1lnu E:1-83 [74106]
        Other proteins in same PDB: d1lnua1, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc1, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue1, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug1, d1lnuh1, d1lnuh2
      4. 600561Domain d1lnug2: 1lnu G:1-83 [74110]
        Other proteins in same PDB: d1lnua1, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc1, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue1, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug1, d1lnuh1, d1lnuh2
        complexed with nag
    2. Domain for 1muj:
  12. 600562Mouse (Mus musculus), I-AD [TaxId:10090] [88816] (2 PDB entries)
    1. Domain for 1iao:
    2. Domain for 2iad:
  13. 600565Mouse (Mus musculus), I-AK [TaxId:10090] [88813] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1d9k:
      1. 600567Domain d1d9kc2: 1d9k C:1-81 [38201]
        Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc1, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg1, d1d9kh1, d1d9kh2
      2. 600568Domain d1d9kg2: 1d9k G:1-81 [38203]
        Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc1, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg1, d1d9kh1, d1d9kh2
    2. Domain for 1iak:
    3. Domain for 1jl4:
  14. 600570Mouse (Mus musculus), I-AU [TaxId:10090] [89859] (1 PDB entry)
  15. 600572Mouse (Mus musculus), I-EK [TaxId:10090] [88814] (9 PDB entries)
    1. Domains for 1fne:
      1. 600575Domain d1fnea2: 1fne A:1-81 [59897]
        Other proteins in same PDB: d1fnea1, d1fneb1, d1fneb2, d1fnec1, d1fned1, d1fned2
      2. 600576Domain d1fnec2: 1fne C:1-81 [59901]
        Other proteins in same PDB: d1fnea1, d1fneb1, d1fneb2, d1fnec1, d1fned1, d1fned2
        complexed with nag; mutant
    2. Domains for 1fng:
      1. 600573Domain d1fnga2: 1fng A:1-81 [59905]
        Other proteins in same PDB: d1fnga1, d1fngb1, d1fngb2, d1fngc1, d1fngd1, d1fngd2
      2. 600574Domain d1fngc2: 1fng C:1-81 [59909]
        Other proteins in same PDB: d1fnga1, d1fngb1, d1fngb2, d1fngc1, d1fngd1, d1fngd2
        complexed with nag
    3. Domains for 1i3r:
      1. 600579Domain d1i3ra2: 1i3r A:1-81 [61621]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3rb1, d1i3rb2, d1i3rc1, d1i3rd1, d1i3rd2, d1i3re1, d1i3rf1, d1i3rf2, d1i3rg1, d1i3rh1, d1i3rh2
      2. 600580Domain d1i3rc2: 1i3r C:1-81 [61625]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3rb1, d1i3rb2, d1i3rc1, d1i3rd1, d1i3rd2, d1i3re1, d1i3rf1, d1i3rf2, d1i3rg1, d1i3rh1, d1i3rh2
      3. 600581Domain d1i3re2: 1i3r E:1-81 [61629]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3rb1, d1i3rb2, d1i3rc1, d1i3rd1, d1i3rd2, d1i3re1, d1i3rf1, d1i3rf2, d1i3rg1, d1i3rh1, d1i3rh2
      4. 600582Domain d1i3rg2: 1i3r G:1-81 [61633]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3rb1, d1i3rb2, d1i3rc1, d1i3rd1, d1i3rd2, d1i3re1, d1i3rf1, d1i3rf2, d1i3rg1, d1i3rh1, d1i3rh2
        complexed with nag; mutant
    4. Domains for 1iea:
      1. 600577Domain d1ieaa2: 1iea A:1-81 [38205]
        Other proteins in same PDB: d1ieaa1, d1ieab1, d1ieab2, d1ieac1, d1iead1, d1iead2
      2. 600578Domain d1ieac2: 1iea C:1-81 [38207]
        Other proteins in same PDB: d1ieaa1, d1ieab1, d1ieab2, d1ieac1, d1iead1, d1iead2
        complexed with nag
    5. Domains for 1ieb:
      1. 600587Domain d1ieba2: 1ieb A:1-81 [38209]
        Other proteins in same PDB: d1ieba1, d1iebb1, d1iebb2, d1iebc1, d1iebd1, d1iebd2
      2. 600588Domain d1iebc2: 1ieb C:1-81 [38211]
        Other proteins in same PDB: d1ieba1, d1iebb1, d1iebb2, d1iebc1, d1iebd1, d1iebd2
        complexed with nag, so4
    6. Domains for 1kt2:
      1. 600589Domain d1kt2a2: 1kt2 A:1-81 [72952]
        Other proteins in same PDB: d1kt2a1, d1kt2b1, d1kt2b2, d1kt2c1, d1kt2d1, d1kt2d2
      2. 600590Domain d1kt2c2: 1kt2 C:1-81 [72956]
        Other proteins in same PDB: d1kt2a1, d1kt2b1, d1kt2b2, d1kt2c1, d1kt2d1, d1kt2d2
        complexed with nag
    7. Domains for 1ktd:
      1. 600583Domain d1ktda2: 1ktd A:1-81 [72965]
        Other proteins in same PDB: d1ktda1, d1ktdb1, d1ktdb2, d1ktdc1, d1ktdd1, d1ktdd2
      2. 600584Domain d1ktdc2: 1ktd C:1-81 [72969]
        Other proteins in same PDB: d1ktda1, d1ktdb1, d1ktdb2, d1ktdc1, d1ktdd1, d1ktdd2
        complexed with nag, so4; mutant
    8. Domains for 1r5v:
      1. 600585Domain d1r5va2: 1r5v A:3-81 [97117]
        Other proteins in same PDB: d1r5va1, d1r5vb1, d1r5vb2, d1r5vc1, d1r5vd1, d1r5vd2
      2. 600586Domain d1r5vc2: 1r5v C:3-81 [97121]
        Other proteins in same PDB: d1r5va1, d1r5vb1, d1r5vb2, d1r5vc1, d1r5vd1, d1r5vd2
    9. Domains for 1r5w:
      1. 600591Domain d1r5wa2: 1r5w A:3-81 [97125]
        Other proteins in same PDB: d1r5wa1, d1r5wb1, d1r5wb2, d1r5wc1, d1r5wd1, d1r5wd2
      2. 600592Domain d1r5wc2: 1r5w C:3-81 [97129]
        Other proteins in same PDB: d1r5wa1, d1r5wb1, d1r5wb2, d1r5wc1, d1r5wd1, d1r5wd2
        mutant

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