Lineage for Protein: Central domain of beta subunit of F1 ATP synthase

  1. Root: SCOPe 2.02
  2. 1143363Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (147 folds)
  3. 1162955Fold c.37: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52539] (1 superfamily)
    3 layers: a/b/a, parallel or mixed beta-sheets of variable sizes
  4. 1162956Superfamily c.37.1: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52540] (25 families) (S)
    division into families based on beta-sheet topologies
  5. 1165223Family c.37.1.11: RecA protein-like (ATPase-domain) [52670] (18 proteins)
    core: mixed beta-sheet of 8 strands, order 32451678; strand 7 is antiparallel to the rest
  6. 1165331Protein Central domain of beta subunit of F1 ATP synthase [88779] (4 species)

Species:

  1. 1165332Bacillus sp., strain ps3 [TaxId:1409] [88782] (1 PDB entry)
  2. 1165334Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [88780] (14 PDB entries)
    Uniprot P00829
    1. Domains for 1bmf:
      1. 1165356Domain d1bmfd3: 1bmf D:82-357 [32329]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa2, d1bmfa3, d1bmfb1, d1bmfb2, d1bmfb3, d1bmfc1, d1bmfc2, d1bmfc3, d1bmfd1, d1bmfd2, d1bmfe1, d1bmfe2, d1bmff1, d1bmff2, d1bmfg_
        complexed with adp, anp, mg
      2. 1165357Domain d1bmfe3: 1bmf E:82-357 [32330]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa2, d1bmfa3, d1bmfb1, d1bmfb2, d1bmfb3, d1bmfc1, d1bmfc2, d1bmfc3, d1bmfd1, d1bmfd2, d1bmfe1, d1bmfe2, d1bmff1, d1bmff2, d1bmfg_
        complexed with adp, anp, mg
      3. 1165358Domain d1bmff3: 1bmf F:82-357 [32331]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa2, d1bmfa3, d1bmfb1, d1bmfb2, d1bmfb3, d1bmfc1, d1bmfc2, d1bmfc3, d1bmfd1, d1bmfd2, d1bmfe1, d1bmfe2, d1bmff1, d1bmff2, d1bmfg_
        complexed with adp, anp, mg
    2. Domains for 1cow:
      1. 1165374Domain d1cowd3: 1cow D:82-357 [32353]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa2, d1cowa3, d1cowb1, d1cowb2, d1cowb3, d1cowc1, d1cowc2, d1cowc3, d1cowd1, d1cowd2, d1cowe1, d1cowe2, d1cowf1, d1cowf2, d1cowg_
        complexed with adp, anp, aur, mg
      2. 1165375Domain d1cowe3: 1cow E:82-357 [32354]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa2, d1cowa3, d1cowb1, d1cowb2, d1cowb3, d1cowc1, d1cowc2, d1cowc3, d1cowd1, d1cowd2, d1cowe1, d1cowe2, d1cowf1, d1cowf2, d1cowg_
        complexed with adp, anp, aur, mg
      3. 1165376Domain d1cowf3: 1cow F:82-357 [32355]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa2, d1cowa3, d1cowb1, d1cowb2, d1cowb3, d1cowc1, d1cowc2, d1cowc3, d1cowd1, d1cowd2, d1cowe1, d1cowe2, d1cowf1, d1cowf2, d1cowg_
        complexed with adp, anp, aur, mg
    3. Domains for 1e1q:
      1. 1165362Domain d1e1qd3: 1e1q D:82-357 [32341]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa2, d1e1qa3, d1e1qb1, d1e1qb2, d1e1qb3, d1e1qc1, d1e1qc2, d1e1qc3, d1e1qd1, d1e1qd2, d1e1qe1, d1e1qe2, d1e1qf1, d1e1qf2, d1e1qg_
        complexed with adp, anp, mg, po4
      2. 1165363Domain d1e1qe3: 1e1q E:82-357 [32342]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa2, d1e1qa3, d1e1qb1, d1e1qb2, d1e1qb3, d1e1qc1, d1e1qc2, d1e1qc3, d1e1qd1, d1e1qd2, d1e1qe1, d1e1qe2, d1e1qf1, d1e1qf2, d1e1qg_
        complexed with adp, anp, mg, po4
      3. 1165364Domain d1e1qf3: 1e1q F:82-357 [32343]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa2, d1e1qa3, d1e1qb1, d1e1qb2, d1e1qb3, d1e1qc1, d1e1qc2, d1e1qc3, d1e1qd1, d1e1qd2, d1e1qe1, d1e1qe2, d1e1qf1, d1e1qf2, d1e1qg_
        complexed with adp, anp, mg, po4
    4. Domains for 1e1r:
      1. 1165353Domain d1e1rd3: 1e1r D:82-357 [32323]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra2, d1e1ra3, d1e1rb1, d1e1rb2, d1e1rb3, d1e1rc1, d1e1rc2, d1e1rc3, d1e1rd1, d1e1rd2, d1e1re1, d1e1re2, d1e1rf1, d1e1rf2, d1e1rg_
        complexed with adp, af3, anp, mg, po4
      2. 1165354Domain d1e1re3: 1e1r E:82-357 [32324]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra2, d1e1ra3, d1e1rb1, d1e1rb2, d1e1rb3, d1e1rc1, d1e1rc2, d1e1rc3, d1e1rd1, d1e1rd2, d1e1re1, d1e1re2, d1e1rf1, d1e1rf2, d1e1rg_
        complexed with adp, af3, anp, mg, po4
      3. 1165355Domain d1e1rf3: 1e1r F:82-357 [32325]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra2, d1e1ra3, d1e1rb1, d1e1rb2, d1e1rb3, d1e1rc1, d1e1rc2, d1e1rc3, d1e1rd1, d1e1rd2, d1e1re1, d1e1re2, d1e1rf1, d1e1rf2, d1e1rg_
        complexed with adp, af3, anp, mg, po4
    5. Domains for 1e79:
      1. 1165344Domain d1e79d3: 1e79 D:82-357 [32317]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a2, d1e79a3, d1e79b1, d1e79b2, d1e79b3, d1e79c1, d1e79c2, d1e79c3, d1e79d1, d1e79d2, d1e79e1, d1e79e2, d1e79f1, d1e79f2, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
        complexed with adp, atp, dcw, gol, mg, so4
      2. 1165345Domain d1e79e3: 1e79 E:82-357 [32318]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a2, d1e79a3, d1e79b1, d1e79b2, d1e79b3, d1e79c1, d1e79c2, d1e79c3, d1e79d1, d1e79d2, d1e79e1, d1e79e2, d1e79f1, d1e79f2, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
        complexed with adp, atp, dcw, gol, mg, so4
      3. 1165346Domain d1e79f3: 1e79 F:82-357 [32319]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a2, d1e79a3, d1e79b1, d1e79b2, d1e79b3, d1e79c1, d1e79c2, d1e79c3, d1e79d1, d1e79d2, d1e79e1, d1e79e2, d1e79f1, d1e79f2, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
        complexed with adp, atp, dcw, gol, mg, so4
    6. Domains for 1efr:
      1. 1165365Domain d1efrd3: 1efr D:82-357 [32347]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra2, d1efra3, d1efrb1, d1efrb2, d1efrb3, d1efrc1, d1efrc2, d1efrc3, d1efrd1, d1efrd2, d1efre1, d1efre2, d1efrf1, d1efrf2, d1efrg_
        complexed with adp, anp, mg
      2. 1165366Domain d1efre3: 1efr E:82-357 [32348]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra2, d1efra3, d1efrb1, d1efrb2, d1efrb3, d1efrc1, d1efrc2, d1efrc3, d1efrd1, d1efrd2, d1efre1, d1efre2, d1efrf1, d1efrf2, d1efrg_
        complexed with adp, anp, mg
      3. 1165367Domain d1efrf3: 1efr F:82-357 [32349]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra2, d1efra3, d1efrb1, d1efrb2, d1efrb3, d1efrc1, d1efrc2, d1efrc3, d1efrd1, d1efrd2, d1efre1, d1efre2, d1efrf1, d1efrf2, d1efrg_
        complexed with adp, anp, mg
    7. Domains for 1h8e:
      1. 1165350Domain d1h8ed3: 1h8e D:82-357 [60749]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea2, d1h8ea3, d1h8eb1, d1h8eb2, d1h8eb3, d1h8ec1, d1h8ec2, d1h8ec3, d1h8ed1, d1h8ed2, d1h8ee1, d1h8ee2, d1h8ef1, d1h8ef2, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
        complexed with adp, alf, gol, mg, so4
      2. 1165351Domain d1h8ee3: 1h8e E:82-357 [60752]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea2, d1h8ea3, d1h8eb1, d1h8eb2, d1h8eb3, d1h8ec1, d1h8ec2, d1h8ec3, d1h8ed1, d1h8ed2, d1h8ee1, d1h8ee2, d1h8ef1, d1h8ef2, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
        complexed with adp, alf, gol, mg, so4
      3. 1165352Domain d1h8ef3: 1h8e F:82-357 [60755]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea2, d1h8ea3, d1h8eb1, d1h8eb2, d1h8eb3, d1h8ec1, d1h8ec2, d1h8ec3, d1h8ed1, d1h8ed2, d1h8ee1, d1h8ee2, d1h8ef1, d1h8ef2, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
        complexed with adp, alf, gol, mg, so4
    8. Domains for 1h8h:
      1. 1165368Domain d1h8hd3: 1h8h D:82-357 [60770]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha2, d1h8ha3, d1h8hb1, d1h8hb2, d1h8hb3, d1h8hc1, d1h8hc2, d1h8hc3, d1h8hd1, d1h8hd2, d1h8he1, d1h8he2, d1h8hf1, d1h8hf2, d1h8hg_
        complexed with adp, atp, gol, mg, po4
      2. 1165369Domain d1h8he3: 1h8h E:82-357 [60773]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha2, d1h8ha3, d1h8hb1, d1h8hb2, d1h8hb3, d1h8hc1, d1h8hc2, d1h8hc3, d1h8hd1, d1h8hd2, d1h8he1, d1h8he2, d1h8hf1, d1h8hf2, d1h8hg_
        complexed with adp, atp, gol, mg, po4
      3. 1165370Domain d1h8hf3: 1h8h F:82-357 [60776]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha2, d1h8ha3, d1h8hb1, d1h8hb2, d1h8hb3, d1h8hc1, d1h8hc2, d1h8hc3, d1h8hd1, d1h8hd2, d1h8he1, d1h8he2, d1h8hf1, d1h8hf2, d1h8hg_
        complexed with adp, atp, gol, mg, po4
    9. Domains for 1nbm:
      1. 1165359Domain d1nbmd3: 1nbm D:82-357 [32335]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma2, d1nbma3, d1nbmb1, d1nbmb2, d1nbmb3, d1nbmc1, d1nbmc2, d1nbmc3, d1nbmd1, d1nbmd2, d1nbme1, d1nbme2, d1nbmf1, d1nbmf2, d1nbmg_
        complexed with adp, atp, mg, po4
      2. 1165360Domain d1nbme3: 1nbm E:82-357 [32336]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma2, d1nbma3, d1nbmb1, d1nbmb2, d1nbmb3, d1nbmc1, d1nbmc2, d1nbmc3, d1nbmd1, d1nbmd2, d1nbme1, d1nbme2, d1nbmf1, d1nbmf2, d1nbmg_
        complexed with adp, atp, mg, po4
      3. 1165361Domain d1nbmf3: 1nbm F:82-357 [32337]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma2, d1nbma3, d1nbmb1, d1nbmb2, d1nbmb3, d1nbmc1, d1nbmc2, d1nbmc3, d1nbmd1, d1nbmd2, d1nbme1, d1nbme2, d1nbmf1, d1nbmf2, d1nbmg_
        complexed with adp, atp, mg, po4
    10. Domains for 1ohh:
      1. 1165371Domain d1ohhd3: 1ohh D:82-357 [87026]
        Other proteins in same PDB: d1ohha1, d1ohha2, d1ohha3, d1ohhb1, d1ohhb2, d1ohhb3, d1ohhc1, d1ohhc2, d1ohhc3, d1ohhd1, d1ohhd2, d1ohhe1, d1ohhe2, d1ohhf1, d1ohhf2, d1ohhg_, d1ohhh_
        complexed with anp, mg
      2. 1165372Domain d1ohhe3: 1ohh E:82-357 [87029]
        Other proteins in same PDB: d1ohha1, d1ohha2, d1ohha3, d1ohhb1, d1ohhb2, d1ohhb3, d1ohhc1, d1ohhc2, d1ohhc3, d1ohhd1, d1ohhd2, d1ohhe1, d1ohhe2, d1ohhf1, d1ohhf2, d1ohhg_, d1ohhh_
        complexed with anp, mg
      3. 1165373Domain d1ohhf3: 1ohh F:82-357 [87032]
        Other proteins in same PDB: d1ohha1, d1ohha2, d1ohha3, d1ohhb1, d1ohhb2, d1ohhb3, d1ohhc1, d1ohhc2, d1ohhc3, d1ohhd1, d1ohhd2, d1ohhe1, d1ohhe2, d1ohhf1, d1ohhf2, d1ohhg_, d1ohhh_
        complexed with anp, mg
    11. Domains for 1w0j:
      1. 1165341Domain d1w0jd3: 1w0j D:82-357 [109000]
        Other proteins in same PDB: d1w0ja1, d1w0ja2, d1w0ja3, d1w0jb1, d1w0jb2, d1w0jb3, d1w0jc1, d1w0jc2, d1w0jc3, d1w0jd1, d1w0jd2, d1w0je1, d1w0je2, d1w0jf1, d1w0jf2, d1w0jg_
        complexed with adp, bef, gol, mg, po4
      2. 1165342Domain d1w0je3: 1w0j E:82-357 [109003]
        Other proteins in same PDB: d1w0ja1, d1w0ja2, d1w0ja3, d1w0jb1, d1w0jb2, d1w0jb3, d1w0jc1, d1w0jc2, d1w0jc3, d1w0jd1, d1w0jd2, d1w0je1, d1w0je2, d1w0jf1, d1w0jf2, d1w0jg_
        complexed with adp, bef, gol, mg, po4
      3. 1165343Domain d1w0jf3: 1w0j F:82-357 [109006]
        Other proteins in same PDB: d1w0ja1, d1w0ja2, d1w0ja3, d1w0jb1, d1w0jb2, d1w0jb3, d1w0jc1, d1w0jc2, d1w0jc3, d1w0jd1, d1w0jd2, d1w0je1, d1w0je2, d1w0jf1, d1w0jf2, d1w0jg_
        complexed with adp, bef, gol, mg, po4
    12. Domains for 1w0k:
      1. 1165347Domain d1w0kd3: 1w0k D:82-357 [109019]
        Other proteins in same PDB: d1w0ka1, d1w0ka2, d1w0ka3, d1w0kb1, d1w0kb2, d1w0kb3, d1w0kc1, d1w0kc2, d1w0kc3, d1w0kd1, d1w0kd2, d1w0ke1, d1w0ke2, d1w0kf1, d1w0kf2, d1w0kg_
        complexed with adp, gol, mg, po4
      2. 1165348Domain d1w0ke3: 1w0k E:82-357 [109022]
        Other proteins in same PDB: d1w0ka1, d1w0ka2, d1w0ka3, d1w0kb1, d1w0kb2, d1w0kb3, d1w0kc1, d1w0kc2, d1w0kc3, d1w0kd1, d1w0kd2, d1w0ke1, d1w0ke2, d1w0kf1, d1w0kf2, d1w0kg_
        complexed with adp, gol, mg, po4
      3. 1165349Domain d1w0kf3: 1w0k F:82-357 [109025]
        Other proteins in same PDB: d1w0ka1, d1w0ka2, d1w0ka3, d1w0kb1, d1w0kb2, d1w0kb3, d1w0kc1, d1w0kc2, d1w0kc3, d1w0kd1, d1w0kd2, d1w0ke1, d1w0ke2, d1w0kf1, d1w0kf2, d1w0kg_
        complexed with adp, gol, mg, po4
    13. Domains for 2ck3:
      1. 1165338Domain d2ck3d3: 2ck3 D:82-357 [130555]
        Other proteins in same PDB: d2ck3a1, d2ck3a2, d2ck3a3, d2ck3b1, d2ck3b2, d2ck3b3, d2ck3c1, d2ck3c2, d2ck3c3, d2ck3d1, d2ck3d2, d2ck3e1, d2ck3e2, d2ck3f1, d2ck3f2, d2ck3g_, d2ck3h1, d2ck3h2, d2ck3i_
        automatically matched to d1mabb3
        complexed with adp, anp, azi, mg, po4
      2. 1165339Domain d2ck3e3: 2ck3 E:82-357 [130558]
        Other proteins in same PDB: d2ck3a1, d2ck3a2, d2ck3a3, d2ck3b1, d2ck3b2, d2ck3b3, d2ck3c1, d2ck3c2, d2ck3c3, d2ck3d1, d2ck3d2, d2ck3e1, d2ck3e2, d2ck3f1, d2ck3f2, d2ck3g_, d2ck3h1, d2ck3h2, d2ck3i_
        automatically matched to d1mabb3
        complexed with adp, anp, azi, mg, po4
      3. 1165340Domain d2ck3f3: 2ck3 F:82-357 [130561]
        Other proteins in same PDB: d2ck3a1, d2ck3a2, d2ck3a3, d2ck3b1, d2ck3b2, d2ck3b3, d2ck3c1, d2ck3c2, d2ck3c3, d2ck3d1, d2ck3d2, d2ck3e1, d2ck3e2, d2ck3f1, d2ck3f2, d2ck3g_, d2ck3h1, d2ck3h2, d2ck3i_
        automatically matched to d1mabb3
        complexed with adp, anp, azi, mg, po4
    14. Domains for 2jdi:
      1. 1165335Domain d2jdid3: 2jdi D:82-357 [138265]
        Other proteins in same PDB: d2jdia1, d2jdia2, d2jdia3, d2jdib1, d2jdib2, d2jdib3, d2jdic1, d2jdic2, d2jdic3, d2jdid1, d2jdid2, d2jdie1, d2jdie2, d2jdif1, d2jdif2, d2jdig_, d2jdih1, d2jdih2, d2jdii_
        automatically matched to d1mabb3
        complexed with anp, mg
      2. 1165336Domain d2jdie3: 2jdi E:82-357 [138268]
        Other proteins in same PDB: d2jdia1, d2jdia2, d2jdia3, d2jdib1, d2jdib2, d2jdib3, d2jdic1, d2jdic2, d2jdic3, d2jdid1, d2jdid2, d2jdie1, d2jdie2, d2jdif1, d2jdif2, d2jdig_, d2jdih1, d2jdih2, d2jdii_
        automatically matched to d1mabb3
        complexed with anp, mg
      3. 1165337Domain d2jdif3: 2jdi F:82-357 [138271]
        Other proteins in same PDB: d2jdia1, d2jdia2, d2jdia3, d2jdib1, d2jdib2, d2jdib3, d2jdic1, d2jdic2, d2jdic3, d2jdid1, d2jdid2, d2jdie1, d2jdie2, d2jdif1, d2jdif2, d2jdig_, d2jdih1, d2jdih2, d2jdii_
        automatically matched to d1mabb3
        complexed with anp, mg
  3. 1165377Norway rat (Rattus norvegicus) [TaxId:10116] [88781] (2 PDB entries)
    1. Domain for 1mab:
    2. Domain for 2f43:
  4. 1165380Spinach (Spinacia oleracea), chloroplast [TaxId:3562] [88783] (2 PDB entries)
    1. Domain for 1fx0:
    2. Domain for 1kmh:

More info for Protein Central domain of beta subunit of F1 ATP synthase from c.37.1.11: RecA protein-like (ATPase-domain)

Timeline for Protein Central domain of beta subunit of F1 ATP synthase from c.37.1.11: RecA protein-like (ATPase-domain):