Lineage for Protein: Central domain of alpha subunit of F1 ATP synthase

  1. Root: SCOP 1.65
  2. 305035Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (121 folds)
  3. 313180Fold c.37: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52539] (1 superfamily)
    3 layers: a/b/a, parallel or mixed beta-sheets of variable sizes
  4. 313181Superfamily c.37.1: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52540] (21 families) (S)
    division into families based on beta-sheet topologies
  5. 314141Family c.37.1.11: RecA protein-like (ATPase-domain) [52670] (11 proteins)
    core: mixed beta-sheet of 8 strands, order 32451678; strand 7 is antiparallel to the rest
  6. 314194Protein Central domain of alpha subunit of F1 ATP synthase [88774] (4 species)

Species:

  1. 314195Bacillus sp., strain ps3 [TaxId:1409] [88777] (1 PDB entry)
  2. 314197Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [88775] (10 PDB entries)
    1. Domains for 1bmf:
      1. 314207Domain d1bmfa3: 1bmf A:95-379 [32326]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa2, d1bmfb1, d1bmfb2, d1bmfc1, d1bmfc2, d1bmfd1, d1bmfd2, d1bmfd3, d1bmfe1, d1bmfe2, d1bmfe3, d1bmff1, d1bmff2, d1bmff3, d1bmfg_
      2. 314208Domain d1bmfb3: 1bmf B:95-379 [32327]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa2, d1bmfb1, d1bmfb2, d1bmfc1, d1bmfc2, d1bmfd1, d1bmfd2, d1bmfd3, d1bmfe1, d1bmfe2, d1bmfe3, d1bmff1, d1bmff2, d1bmff3, d1bmfg_
      3. 314209Domain d1bmfc3: 1bmf C:95-379 [32328]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa2, d1bmfb1, d1bmfb2, d1bmfc1, d1bmfc2, d1bmfd1, d1bmfd2, d1bmfd3, d1bmfe1, d1bmfe2, d1bmfe3, d1bmff1, d1bmff2, d1bmff3, d1bmfg_
        complexed with adp, anp, mg
    2. Domains for 1cow:
      1. 314225Domain d1cowa3: 1cow A:95-379 [32350]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa2, d1cowb1, d1cowb2, d1cowc1, d1cowc2, d1cowd1, d1cowd2, d1cowd3, d1cowe1, d1cowe2, d1cowe3, d1cowf1, d1cowf2, d1cowf3, d1cowg_
      2. 314226Domain d1cowb3: 1cow B:95-379 [32351]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa2, d1cowb1, d1cowb2, d1cowc1, d1cowc2, d1cowd1, d1cowd2, d1cowd3, d1cowe1, d1cowe2, d1cowe3, d1cowf1, d1cowf2, d1cowf3, d1cowg_
      3. 314227Domain d1cowc3: 1cow C:95-379 [32352]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa2, d1cowb1, d1cowb2, d1cowc1, d1cowc2, d1cowd1, d1cowd2, d1cowd3, d1cowe1, d1cowe2, d1cowe3, d1cowf1, d1cowf2, d1cowf3, d1cowg_
        complexed with adp, anp, aur, mg
    3. Domains for 1e1q:
      1. 314210Domain d1e1qa3: 1e1q A:95-379 [32338]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa2, d1e1qb1, d1e1qb2, d1e1qc1, d1e1qc2, d1e1qd1, d1e1qd2, d1e1qd3, d1e1qe1, d1e1qe2, d1e1qe3, d1e1qf1, d1e1qf2, d1e1qf3, d1e1qg_
      2. 314211Domain d1e1qb3: 1e1q B:95-379 [32339]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa2, d1e1qb1, d1e1qb2, d1e1qc1, d1e1qc2, d1e1qd1, d1e1qd2, d1e1qd3, d1e1qe1, d1e1qe2, d1e1qe3, d1e1qf1, d1e1qf2, d1e1qf3, d1e1qg_
      3. 314212Domain d1e1qc3: 1e1q C:95-379 [32340]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa2, d1e1qb1, d1e1qb2, d1e1qc1, d1e1qc2, d1e1qd1, d1e1qd2, d1e1qd3, d1e1qe1, d1e1qe2, d1e1qe3, d1e1qf1, d1e1qf2, d1e1qf3, d1e1qg_
        complexed with adp, anp, mg, po4
    4. Domains for 1e1r:
      1. 314204Domain d1e1ra3: 1e1r A:95-379 [32320]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra2, d1e1rb1, d1e1rb2, d1e1rc1, d1e1rc2, d1e1rd1, d1e1rd2, d1e1rd3, d1e1re1, d1e1re2, d1e1re3, d1e1rf1, d1e1rf2, d1e1rf3, d1e1rg_
      2. 314205Domain d1e1rb3: 1e1r B:95-379 [32321]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra2, d1e1rb1, d1e1rb2, d1e1rc1, d1e1rc2, d1e1rd1, d1e1rd2, d1e1rd3, d1e1re1, d1e1re2, d1e1re3, d1e1rf1, d1e1rf2, d1e1rf3, d1e1rg_
      3. 314206Domain d1e1rc3: 1e1r C:95-379 [32322]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra2, d1e1rb1, d1e1rb2, d1e1rc1, d1e1rc2, d1e1rd1, d1e1rd2, d1e1rd3, d1e1re1, d1e1re2, d1e1re3, d1e1rf1, d1e1rf2, d1e1rf3, d1e1rg_
        complexed with adp, af3, anp, mg, po4
    5. Domains for 1e79:
      1. 314198Domain d1e79a3: 1e79 A:95-379 [32314]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a2, d1e79b1, d1e79b2, d1e79c1, d1e79c2, d1e79d1, d1e79d2, d1e79d3, d1e79e1, d1e79e2, d1e79e3, d1e79f1, d1e79f2, d1e79f3, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
      2. 314199Domain d1e79b3: 1e79 B:95-379 [32315]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a2, d1e79b1, d1e79b2, d1e79c1, d1e79c2, d1e79d1, d1e79d2, d1e79d3, d1e79e1, d1e79e2, d1e79e3, d1e79f1, d1e79f2, d1e79f3, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
      3. 314200Domain d1e79c3: 1e79 C:95-379 [32316]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a2, d1e79b1, d1e79b2, d1e79c1, d1e79c2, d1e79d1, d1e79d2, d1e79d3, d1e79e1, d1e79e2, d1e79e3, d1e79f1, d1e79f2, d1e79f3, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
        complexed with adp, atp, cry, glh, mg, so4
    6. Domains for 1efr:
      1. 314216Domain d1efra3: 1efr A:95-379 [32344]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra2, d1efrb1, d1efrb2, d1efrc1, d1efrc2, d1efrd1, d1efrd2, d1efrd3, d1efre1, d1efre2, d1efre3, d1efrf1, d1efrf2, d1efrf3, d1efrg_
      2. 314217Domain d1efrb3: 1efr B:95-379 [32345]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra2, d1efrb1, d1efrb2, d1efrc1, d1efrc2, d1efrd1, d1efrd2, d1efrd3, d1efre1, d1efre2, d1efre3, d1efrf1, d1efrf2, d1efrf3, d1efrg_
      3. 314218Domain d1efrc3: 1efr C:95-379 [32346]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra2, d1efrb1, d1efrb2, d1efrc1, d1efrc2, d1efrd1, d1efrd2, d1efrd3, d1efre1, d1efre2, d1efre3, d1efrf1, d1efrf2, d1efrf3, d1efrg_
        complexed with adp, anp, app, bal, cpi, mg, tlx
    7. Domains for 1h8e:
      1. 314201Domain d1h8ea3: 1h8e A:95-379 [60740]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea2, d1h8eb1, d1h8eb2, d1h8ec1, d1h8ec2, d1h8ed1, d1h8ed2, d1h8ed3, d1h8ee1, d1h8ee2, d1h8ee3, d1h8ef1, d1h8ef2, d1h8ef3, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
      2. 314202Domain d1h8eb3: 1h8e B:95-379 [60743]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea2, d1h8eb1, d1h8eb2, d1h8ec1, d1h8ec2, d1h8ed1, d1h8ed2, d1h8ed3, d1h8ee1, d1h8ee2, d1h8ee3, d1h8ef1, d1h8ef2, d1h8ef3, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
      3. 314203Domain d1h8ec3: 1h8e C:95-379 [60746]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea2, d1h8eb1, d1h8eb2, d1h8ec1, d1h8ec2, d1h8ed1, d1h8ed2, d1h8ed3, d1h8ee1, d1h8ee2, d1h8ee3, d1h8ef1, d1h8ef2, d1h8ef3, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
        complexed with adp, alf, gol, mg, so4
    8. Domains for 1h8h:
      1. 314219Domain d1h8ha3: 1h8h A:95-379 [60761]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha2, d1h8hb1, d1h8hb2, d1h8hc1, d1h8hc2, d1h8hd1, d1h8hd2, d1h8hd3, d1h8he1, d1h8he2, d1h8he3, d1h8hf1, d1h8hf2, d1h8hf3, d1h8hg_
      2. 314220Domain d1h8hb3: 1h8h B:95-379 [60764]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha2, d1h8hb1, d1h8hb2, d1h8hc1, d1h8hc2, d1h8hd1, d1h8hd2, d1h8hd3, d1h8he1, d1h8he2, d1h8he3, d1h8hf1, d1h8hf2, d1h8hf3, d1h8hg_
      3. 314221Domain d1h8hc3: 1h8h C:95-379 [60767]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha2, d1h8hb1, d1h8hb2, d1h8hc1, d1h8hc2, d1h8hd1, d1h8hd2, d1h8hd3, d1h8he1, d1h8he2, d1h8he3, d1h8hf1, d1h8hf2, d1h8hf3, d1h8hg_
        complexed with adp, atp, gol, mg, po4
    9. Domains for 1nbm:
      1. 314213Domain d1nbma3: 1nbm A:95-379 [32332]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma2, d1nbmb1, d1nbmb2, d1nbmc1, d1nbmc2, d1nbmd1, d1nbmd2, d1nbmd3, d1nbme1, d1nbme2, d1nbme3, d1nbmf1, d1nbmf2, d1nbmf3, d1nbmg_
      2. 314214Domain d1nbmb3: 1nbm B:95-379 [32333]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma2, d1nbmb1, d1nbmb2, d1nbmc1, d1nbmc2, d1nbmd1, d1nbmd2, d1nbmd3, d1nbme1, d1nbme2, d1nbme3, d1nbmf1, d1nbmf2, d1nbmf3, d1nbmg_
      3. 314215Domain d1nbmc3: 1nbm C:95-379 [32334]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma2, d1nbmb1, d1nbmb2, d1nbmc1, d1nbmc2, d1nbmd1, d1nbmd2, d1nbmd3, d1nbme1, d1nbme2, d1nbme3, d1nbmf1, d1nbmf2, d1nbmf3, d1nbmg_
        complexed with adp, atp, mg, po4, tyn
    10. Domains for 1ohh:
      1. 314222Domain d1ohha3: 1ohh A:95-379 [87017]
        Other proteins in same PDB: d1ohha1, d1ohha2, d1ohhb1, d1ohhb2, d1ohhc1, d1ohhc2, d1ohhd1, d1ohhd2, d1ohhd3, d1ohhe1, d1ohhe2, d1ohhe3, d1ohhf1, d1ohhf2, d1ohhf3, d1ohhg_, d1ohhh_
      2. 314223Domain d1ohhb3: 1ohh B:95-379 [87020]
        Other proteins in same PDB: d1ohha1, d1ohha2, d1ohhb1, d1ohhb2, d1ohhc1, d1ohhc2, d1ohhd1, d1ohhd2, d1ohhd3, d1ohhe1, d1ohhe2, d1ohhe3, d1ohhf1, d1ohhf2, d1ohhf3, d1ohhg_, d1ohhh_
      3. 314224Domain d1ohhc3: 1ohh C:95-379 [87023]
        Other proteins in same PDB: d1ohha1, d1ohha2, d1ohhb1, d1ohhb2, d1ohhc1, d1ohhc2, d1ohhd1, d1ohhd2, d1ohhd3, d1ohhe1, d1ohhe2, d1ohhe3, d1ohhf1, d1ohhf2, d1ohhf3, d1ohhg_, d1ohhh_
        complexed with anp, mg
  3. 314228Rat (Rattus norvegicus) [TaxId:10116] [88776] (1 PDB entry)
  4. 314230Spinach (Spinacia oleracea), chloroplast [TaxId:3562] [88778] (2 PDB entries)
    1. Domain for 1fx0:
    2. Domain for 1kmh:

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