Lineage for Species: Thermus thermophilus [TaxId: 274]

  1. Root: SCOP 1.73
  2. 631650Class a: All alpha proteins [46456] (258 folds)
  3. 634286Fold a.4: DNA/RNA-binding 3-helical bundle [46688] (14 superfamilies)
    core: 3-helices; bundle, closed or partly opened, right-handed twist; up-and down
  4. 636223Superfamily a.4.13: Sigma3 and sigma4 domains of RNA polymerase sigma factors [88659] (3 families) (S)
  5. 636256Family a.4.13.2: Sigma4 domain [88665] (4 proteins)
  6. 636264Protein Sigma70 (SigA, RpoD) [88666] (4 species)
  7. 636274Species Thermus thermophilus [TaxId:274] [88667] (9 PDB entries)

PDB entries in Species: Thermus thermophilus [TaxId: 274]:

  1. Domain(s) for 1iw7:
    1. 636285Domain d1iw7f2: 1iw7 F:319-423 [83087]
      Other proteins in same PDB: d1iw7a1, d1iw7a2, d1iw7b1, d1iw7b2, d1iw7c_, d1iw7d_, d1iw7e_, d1iw7f1, d1iw7f3, d1iw7k1, d1iw7k2, d1iw7l1, d1iw7l2, d1iw7m_, d1iw7n_, d1iw7o_, d1iw7p1, d1iw7p3
    2. 636286Domain d1iw7p2: 1iw7 P:319-423 [83090]
      Other proteins in same PDB: d1iw7a1, d1iw7a2, d1iw7b1, d1iw7b2, d1iw7c_, d1iw7d_, d1iw7e_, d1iw7f1, d1iw7f3, d1iw7k1, d1iw7k2, d1iw7l1, d1iw7l2, d1iw7m_, d1iw7n_, d1iw7o_, d1iw7p1, d1iw7p3
      complexed with mg, pb
  2. Domain(s) for 1smy:
    1. 636279Domain d1smyf2: 1smy F:319-423 [105782]
      Other proteins in same PDB: d1smya1, d1smya2, d1smyb1, d1smyb2, d1smyc_, d1smyd_, d1smye_, d1smyf1, d1smyf3, d1smyk1, d1smyk2, d1smyl1, d1smyl2, d1smym_, d1smyn_, d1smyo_, d1smyp1, d1smyp3
    2. 636280Domain d1smyp2: 1smy P:319-423 [105792]
      Other proteins in same PDB: d1smya1, d1smya2, d1smyb1, d1smyb2, d1smyc_, d1smyd_, d1smye_, d1smyf1, d1smyf3, d1smyk1, d1smyk2, d1smyl1, d1smyl2, d1smym_, d1smyn_, d1smyo_, d1smyp1, d1smyp3
      complexed with g4p, mg, zn
  3. Domain(s) for 1zyr:
    1. 636289Domain d1zyrf2: 1zyr F:319-423 [125857]
      Other proteins in same PDB: d1zyra1, d1zyra2, d1zyrb1, d1zyrb2, d1zyrc1, d1zyrd1, d1zyre1, d1zyrf1, d1zyrf3, d1zyrk1, d1zyrk2, d1zyrl1, d1zyrl2, d1zyrm1, d1zyrn1, d1zyro1, d1zyrp1, d1zyrp3
      automatically matched to d1iw7f2
      complexed with mg, std, zn
    2. 636290Domain d1zyrp2: 1zyr P:319-423 [125867]
      Other proteins in same PDB: d1zyra1, d1zyra2, d1zyrb1, d1zyrb2, d1zyrc1, d1zyrd1, d1zyre1, d1zyrf1, d1zyrf3, d1zyrk1, d1zyrk2, d1zyrl1, d1zyrl2, d1zyrm1, d1zyrn1, d1zyro1, d1zyrp1, d1zyrp3
      automatically matched to d1iw7f2
      complexed with mg, std, zn
  4. Domain(s) for 2a68:
    1. 636281Domain d2a68f2: 2a68 F:319-423 [126199]
      Other proteins in same PDB: d2a68a1, d2a68a2, d2a68b1, d2a68b2, d2a68c1, d2a68d1, d2a68e1, d2a68f1, d2a68f3, d2a68k1, d2a68k2, d2a68l1, d2a68l2, d2a68m1, d2a68n1, d2a68o1, d2a68p1, d2a68p3
      automatically matched to d1iw7f2
      complexed with mg, rbt, zn
    2. 636282Domain d2a68p2: 2a68 P:319-423 [126209]
      Other proteins in same PDB: d2a68a1, d2a68a2, d2a68b1, d2a68b2, d2a68c1, d2a68d1, d2a68e1, d2a68f1, d2a68f3, d2a68k1, d2a68k2, d2a68l1, d2a68l2, d2a68m1, d2a68n1, d2a68o1, d2a68p1, d2a68p3
      automatically matched to d1iw7f2
      complexed with mg, rbt, zn
  5. Domain(s) for 2a69:
    1. 636275Domain d2a69f2: 2a69 F:319-423 [126219]
      Other proteins in same PDB: d2a69a1, d2a69a2, d2a69b1, d2a69b2, d2a69c1, d2a69d1, d2a69e1, d2a69f1, d2a69f3, d2a69k1, d2a69k2, d2a69l1, d2a69l2, d2a69m1, d2a69n1, d2a69o1, d2a69p1, d2a69p3
      automatically matched to d1iw7f2
      complexed with mg, rpt, zn
    2. 636276Domain d2a69p2: 2a69 P:319-423 [126229]
      Other proteins in same PDB: d2a69a1, d2a69a2, d2a69b1, d2a69b2, d2a69c1, d2a69d1, d2a69e1, d2a69f1, d2a69f3, d2a69k1, d2a69k2, d2a69l1, d2a69l2, d2a69m1, d2a69n1, d2a69o1, d2a69p1, d2a69p3
      automatically matched to d1iw7f2
      complexed with mg, rpt, zn
  6. Domain(s) for 2a6e:
    1. 636287Domain d2a6ef2: 2a6e F:319-423 [126248]
      Other proteins in same PDB: d2a6ea1, d2a6ea2, d2a6eb1, d2a6eb2, d2a6ec1, d2a6ed1, d2a6ee1, d2a6ef1, d2a6ef3, d2a6ek1, d2a6ek2, d2a6el1, d2a6el2, d2a6em1, d2a6en1, d2a6eo1, d2a6ep1, d2a6ep3
      automatically matched to d1iw7f2
      complexed with mg, zn
    2. 636288Domain d2a6ep2: 2a6e P:319-423 [126258]
      Other proteins in same PDB: d2a6ea1, d2a6ea2, d2a6eb1, d2a6eb2, d2a6ec1, d2a6ed1, d2a6ee1, d2a6ef1, d2a6ef3, d2a6ek1, d2a6ek2, d2a6el1, d2a6el2, d2a6em1, d2a6en1, d2a6eo1, d2a6ep1, d2a6ep3
      automatically matched to d1iw7f2
      complexed with mg, zn
  7. Domain(s) for 2a6h:
    1. 636277Domain d2a6hf2: 2a6h F:319-423 [126268]
      Other proteins in same PDB: d2a6ha1, d2a6ha2, d2a6hb1, d2a6hb2, d2a6hc1, d2a6hd1, d2a6he1, d2a6hf1, d2a6hf3, d2a6hk1, d2a6hk2, d2a6hl1, d2a6hl2, d2a6hm1, d2a6hn1, d2a6ho1, d2a6hp1, d2a6hp3
      automatically matched to d1iw7f2
      complexed with mg, std, zn
    2. 636278Domain d2a6hp2: 2a6h P:319-423 [126278]
      Other proteins in same PDB: d2a6ha1, d2a6ha2, d2a6hb1, d2a6hb2, d2a6hc1, d2a6hd1, d2a6he1, d2a6hf1, d2a6hf3, d2a6hk1, d2a6hk2, d2a6hl1, d2a6hl2, d2a6hm1, d2a6hn1, d2a6ho1, d2a6hp1, d2a6hp3
      automatically matched to d1iw7f2
      complexed with mg, std, zn
  8. Domain(s) for 2be5:
    1. 636283Domain d2be5f2: 2be5 F:319-423 [128359]
      Other proteins in same PDB: d2be5a1, d2be5a2, d2be5b1, d2be5b2, d2be5c1, d2be5d1, d2be5e1, d2be5f1, d2be5f3, d2be5k1, d2be5k2, d2be5l1, d2be5l2, d2be5m1, d2be5n1, d2be5o1, d2be5p1, d2be5p3
      automatically matched to d1iw7f2
      complexed with mg, tgt, zn
    2. 636284Domain d2be5p2: 2be5 P:319-423 [128369]
      Other proteins in same PDB: d2be5a1, d2be5a2, d2be5b1, d2be5b2, d2be5c1, d2be5d1, d2be5e1, d2be5f1, d2be5f3, d2be5k1, d2be5k2, d2be5l1, d2be5l2, d2be5m1, d2be5n1, d2be5o1, d2be5p1, d2be5p3
      automatically matched to d1iw7f2
      complexed with mg, tgt, zn
  9. Domain(s) for 2cw0:
    1. 636291Domain d2cw0f2: 2cw0 F:319-423 [130906]
      Other proteins in same PDB: d2cw0a1, d2cw0a2, d2cw0b1, d2cw0b2, d2cw0c1, d2cw0d1, d2cw0e1, d2cw0f1, d2cw0f3, d2cw0k1, d2cw0k2, d2cw0l1, d2cw0l2, d2cw0m1, d2cw0n1, d2cw0o1, d2cw0p1, d2cw0p3
      automatically matched to d1iw7f2
      complexed with mg, zn
    2. 636292Domain d2cw0p2: 2cw0 P:319-423 [130916]
      Other proteins in same PDB: d2cw0a1, d2cw0a2, d2cw0b1, d2cw0b2, d2cw0c1, d2cw0d1, d2cw0e1, d2cw0f1, d2cw0f3, d2cw0k1, d2cw0k2, d2cw0l1, d2cw0l2, d2cw0m1, d2cw0n1, d2cw0o1, d2cw0p1, d2cw0p3
      automatically matched to d1iw7f2
      complexed with mg, zn

More info for Species Thermus thermophilus [TaxId:274] from a.4.13.2 Sigma70 (SigA, RpoD)

Timeline for Species Thermus thermophilus [TaxId:274] from a.4.13.2 Sigma70 (SigA, RpoD):