Lineage for Species: Mouse (Mus musculus), I-E group

  1. Root: SCOP 1.65
  2. 287094Class b: All beta proteins [48724] (126 folds)
  3. 287095Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (20 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 287096Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (4 families) (S)
  5. 288543Family b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) [48942] (22 proteins)
  6. 288908Protein Class II MHC alpha chain, C-terminal domain [88618] (6 species)
  7. 288963Species Mouse (Mus musculus), I-E group [TaxId:10090] [88622] (7 PDB entries)
    probably orthologous to the human HLA-DR group

PDB entries in Species: Mouse (Mus musculus), I-E group:

  1. Domain(s) for 1fne:
    1. 288966Domain d1fnea1: 1fne A:82-182 [59896]
      Other proteins in same PDB: d1fnea2, d1fneb1, d1fneb2, d1fnec2, d1fned1, d1fned2
    2. 288967Domain d1fnec1: 1fne C:82-182 [59900]
      Other proteins in same PDB: d1fnea2, d1fneb1, d1fneb2, d1fnec2, d1fned1, d1fned2
      complexed with nag; mutant
  2. Domain(s) for 1fng:
    1. 288964Domain d1fnga1: 1fng A:82-182 [59904]
      Other proteins in same PDB: d1fnga2, d1fngb1, d1fngb2, d1fngc2, d1fngd1, d1fngd2
    2. 288965Domain d1fngc1: 1fng C:82-182 [59908]
      Other proteins in same PDB: d1fnga2, d1fngb1, d1fngb2, d1fngc2, d1fngd1, d1fngd2
      complexed with nag
  3. Domain(s) for 1i3r:
    1. 288972Domain d1i3ra1: 1i3r A:82-182 [61620]
      Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb1, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd1, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf1, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh1, d1i3rh2
    2. 288973Domain d1i3rc1: 1i3r C:82-182 [61624]
      Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb1, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd1, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf1, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh1, d1i3rh2
    3. 288974Domain d1i3re1: 1i3r E:82-182 [61628]
      Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb1, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd1, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf1, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh1, d1i3rh2
    4. 288975Domain d1i3rg1: 1i3r G:82-182 [61632]
      Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb1, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd1, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf1, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh1, d1i3rh2
      complexed with nag; mutant
  4. Domain(s) for 1iea:
    1. 288968Domain d1ieaa1: 1iea A:82-182 [21631]
      Other proteins in same PDB: d1ieaa2, d1ieab1, d1ieab2, d1ieac2, d1iead1, d1iead2
    2. 288969Domain d1ieac1: 1iea C:82-182 [21633]
      Other proteins in same PDB: d1ieaa2, d1ieab1, d1ieab2, d1ieac2, d1iead1, d1iead2
      complexed with nag
  5. Domain(s) for 1ieb:
    1. 288976Domain d1ieba1: 1ieb A:82-182 [21635]
      Other proteins in same PDB: d1ieba2, d1iebb1, d1iebb2, d1iebc2, d1iebd1, d1iebd2
    2. 288977Domain d1iebc1: 1ieb C:82-182 [21637]
      Other proteins in same PDB: d1ieba2, d1iebb1, d1iebb2, d1iebc2, d1iebd1, d1iebd2
      complexed with nag, so4
  6. Domain(s) for 1kt2:
    1. 288978Domain d1kt2a1: 1kt2 A:82-182 [72951]
      Other proteins in same PDB: d1kt2a2, d1kt2b1, d1kt2b2, d1kt2c2, d1kt2d1, d1kt2d2
    2. 288979Domain d1kt2c1: 1kt2 C:82-182 [72955]
      Other proteins in same PDB: d1kt2a2, d1kt2b1, d1kt2b2, d1kt2c2, d1kt2d1, d1kt2d2
      complexed with nag
  7. Domain(s) for 1ktd:
    1. 288970Domain d1ktda1: 1ktd A:82-182 [72964]
      Other proteins in same PDB: d1ktda2, d1ktdb1, d1ktdb2, d1ktdc2, d1ktdd1, d1ktdd2
    2. 288971Domain d1ktdc1: 1ktd C:82-182 [72968]
      Other proteins in same PDB: d1ktda2, d1ktdb1, d1ktdb2, d1ktdc2, d1ktdd1, d1ktdd2
      complexed with nag, so4; mutant

More info for Species Mouse (Mus musculus), I-E group [TaxId:10090] from b.1.1.2 Class II MHC alpha chain, C-terminal domain

Timeline for Species Mouse (Mus musculus), I-E group [TaxId:10090] from b.1.1.2 Class II MHC alpha chain, C-terminal domain: