SCOPe 2.03: Protein: Class II MHC alpha chain, C-terminal domain

Lineage for Protein: Class II MHC alpha chain, C-terminal domain

Root: SCOPe 2.03
Class b: All beta proteins [48724] (174 folds)
Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (28 superfamilies)
sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
some members of the fold have additional strands
Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (5 families)
Family b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) [48942] (24 proteins)
Protein Class II MHC alpha chain, C-terminal domain [88618] (6 species)

Species:

Human (Homo sapiens), HLA-DM [TaxId:9606] [88619] (1 PDB entry)
probably orthologous to the mouse H2-DM
- Domain for 1hdm:
  - Domain d1hdma1: 1hdm A:94-196 [21583]
    Other proteins in same PDB: d1hdma2, d1hdmb1, d1hdmb2
Human (Homo sapiens), HLA-DQ group [TaxId:9606] [88623] (3 PDB entries)
probably orthologous to the mouse I-A group
1. Domain for 1jk8:
  - Domain d1jk8a1: 1jk8 A:85-181 [63145]
    Other proteins in same PDB: d1jk8a2, d1jk8b1, d1jk8b2
    complexed with a human insulin peptide
    complexed with nag
2. Domains for 1s9v:
  1. Domain d1s9va1: 1s9v A:85-180 [98760]
    Other proteins in same PDB: d1s9va2, d1s9vb1, d1s9vb2, d1s9vd2, d1s9ve1, d1s9ve2
    complexed with deamidated gliadin peptide
    complexed with edo
  2. Domain d1s9vd1: 1s9v D:85-178 [98764]
    Other proteins in same PDB: d1s9va2, d1s9vb1, d1s9vb2, d1s9vd2, d1s9ve1, d1s9ve2
    complexed with deamidated gliadin peptide
    complexed with edo
3. Domain for 1uvq:
  - Domain d1uvqa1: 1uvq A:85-183 [100062]
    Other proteins in same PDB: d1uvqa2, d1uvqb1, d1uvqb2
    complexed with a hypocretin peptide
    complexed with acy, gly, nag, zn

Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] [88621] (37 PDB entries)
Uniprot P01903 28-207
probably orthologous to the mouse I-E group

Domain for 1a6a:
- Domain d1a6aa1: 1a6a A:82-180 [21615]
  Other proteins in same PDB: d1a6aa2, d1a6ab1, d1a6ab2
  complexed with nag
Domains for 1aqd:
1. Domain d1aqda1: 1aqd A:82-181 [21585]
  Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk1, d1aqdk2
2. Domain d1aqdd1: 1aqd D:82-179 [21587]
  Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk1, d1aqdk2
3. Domain d1aqdg1: 1aqd G:82-179 [21589]
  Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk1, d1aqdk2
4. Domain d1aqdj1: 1aqd J:82-179 [21591]
  Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk1, d1aqdk2
Domains for 1bx2:
1. Domain d1bx2a1: 1bx2 A:82-181 [21609]
  Other proteins in same PDB: d1bx2a2, d1bx2b1, d1bx2b2, d1bx2d2, d1bx2e1, d1bx2e2
  complexed with nag
2. Domain d1bx2d1: 1bx2 D:82-181 [21611]
  Other proteins in same PDB: d1bx2a2, d1bx2b1, d1bx2b2, d1bx2d2, d1bx2e1, d1bx2e2
  complexed with nag
Domain for 1d5m:
- Domain d1d5ma1: 1d5m A:82-181 [21617]
  Other proteins in same PDB: d1d5ma2, d1d5mb1, d1d5mb2, d1d5mc1, d1d5mc2
  complexed with nag
Domain for 1d5x:
- Domain d1d5xa1: 1d5x A:82-181 [21623]
  Other proteins in same PDB: d1d5xa2, d1d5xb1, d1d5xb2, d1d5xc1, d1d5xc2
Domain for 1d5z:
- Domain d1d5za1: 1d5z A:82-180 [21619]
  Other proteins in same PDB: d1d5za2, d1d5zb1, d1d5zb2, d1d5zc1, d1d5zc2
Domain for 1d6e:
- Domain d1d6ea1: 1d6e A:82-180 [21621]
  Other proteins in same PDB: d1d6ea2, d1d6eb1, d1d6eb2, d1d6ec1, d1d6ec2
Domains for 1dlh:
1. Domain d1dlha1: 1dlh A:82-182 [21597]
  Other proteins in same PDB: d1dlha2, d1dlhb1, d1dlhb2, d1dlhd2, d1dlhe1, d1dlhe2
  complexed with nag, ndg
2. Domain d1dlhd1: 1dlh D:82-182 [21599]
  Other proteins in same PDB: d1dlha2, d1dlhb1, d1dlhb2, d1dlhd2, d1dlhe1, d1dlhe2
  complexed with nag, ndg
Domains for 1fv1:
1. Domain d1fv1a1: 1fv1 A:82-181 [21605]
  Other proteins in same PDB: d1fv1a2, d1fv1b1, d1fv1b2, d1fv1d2, d1fv1e1, d1fv1e2
  complexed with gol, so4
2. Domain d1fv1d1: 1fv1 D:82-181 [21607]
  Other proteins in same PDB: d1fv1a2, d1fv1b1, d1fv1b2, d1fv1d2, d1fv1e1, d1fv1e2
  complexed with gol, so4
Domain for 1fyt:
- Domain d1fyta1: 1fyt A:82-181 [21595]
  Other proteins in same PDB: d1fyta2, d1fytb1, d1fytb2, d1fytd1, d1fytd2, d1fyte1, d1fyte2
  complexed with nag
Domains for 1h15:
1. Domain d1h15a1: 1h15 A:82-182 [76454]
  Other proteins in same PDB: d1h15a2, d1h15b1, d1h15b2, d1h15d2, d1h15e1, d1h15e2
  protein/DNA complex; complexed with nag
2. Domain d1h15d1: 1h15 D:82-182 [76458]
  Other proteins in same PDB: d1h15a2, d1h15b1, d1h15b2, d1h15d2, d1h15e1, d1h15e2
  protein/DNA complex; complexed with nag
Domain for 1hqr:
- Domain d1hqra1: 1hqr A:82-181 [21613]
  Other proteins in same PDB: d1hqra2, d1hqrb1, d1hqrb2, d1hqrd1, d1hqrd2
  complexed with zn
Domain for 1hxy:
- Domain d1hxya1: 1hxy A:82-182 [61386]
  Other proteins in same PDB: d1hxya2, d1hxyb1, d1hxyb2, d1hxyd1, d1hxyd2
  complexed with zn
Domain for 1j8h:
- Domain d1j8ha1: 1j8h A:82-181 [71602]
  Other proteins in same PDB: d1j8ha2, d1j8hb1, d1j8hb2, d1j8hd1, d1j8hd2, d1j8he1, d1j8he2
  complexed with nag, ndg
Domain for 1jwm:
- Domain d1jwma1: 1jwm A:82-182 [84236]
  Other proteins in same PDB: d1jwma2, d1jwmb1, d1jwmb2, d1jwmd1, d1jwmd2
Domain for 1jws:
- Domain d1jwsa1: 1jws A:82-182 [84242]
  Other proteins in same PDB: d1jwsa2, d1jwsb1, d1jwsb2, d1jwsd1, d1jwsd2
Domain for 1jwu:
- Domain d1jwua1: 1jwu A:82-182 [84248]
  Other proteins in same PDB: d1jwua2, d1jwub1, d1jwub2, d1jwud1, d1jwud2
Domain for 1kg0:
- Domain d1kg0a1: 1kg0 A:82-182 [72441]
  Other proteins in same PDB: d1kg0a2, d1kg0b1, d1kg0b2, d1kg0c_
Domain for 1klg:
- Domain d1klga1: 1klg A:82-180 [72714]
  Other proteins in same PDB: d1klga2, d1klgb1, d1klgb2, d1klgd1, d1klgd2
  mutant
Domain for 1klu:
- Domain d1klua1: 1klu A:82-182 [72724]
  Other proteins in same PDB: d1klua2, d1klub1, d1klub2, d1klud1, d1klud2
Domain for 1lo5:
- Domain d1lo5a1: 1lo5 A:82-182 [78116]
  Other proteins in same PDB: d1lo5a2, d1lo5b1, d1lo5b2, d1lo5d1, d1lo5d2
Domain for 1pyw:
- Domain d1pywa1: 1pyw A:82-182 [95377]
  Other proteins in same PDB: d1pywa2, d1pywb1, d1pywb2, d1pywd1, d1pywd2
Domains for 1r5i:
1. Domain d1r5ia1: 1r5i A:82-181 [97087]
  Other proteins in same PDB: d1r5ia2, d1r5ib1, d1r5ib2, d1r5id_, d1r5ie2, d1r5if1, d1r5if2, d1r5ih_
  complexed with po4
2. Domain d1r5ie1: 1r5i E:82-181 [97092]
  Other proteins in same PDB: d1r5ia2, d1r5ib1, d1r5ib2, d1r5id_, d1r5ie2, d1r5if1, d1r5if2, d1r5ih_
  complexed with po4
Domains for 1seb:
1. Domain d1seba1: 1seb A:82-181 [21601]
  Other proteins in same PDB: d1seba2, d1sebb1, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe2, d1sebf1, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
2. Domain d1sebe1: 1seb E:82-181 [21603]
  Other proteins in same PDB: d1seba2, d1sebb1, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe2, d1sebf1, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
Domain for 1sje:
- Domain d1sjea1: 1sje A:82-181 [105640]
  Other proteins in same PDB: d1sjea2, d1sjeb1, d1sjeb2, d1sjed1, d1sjed2
Domain for 1sjh:
- Domain d1sjha1: 1sjh A:82-181 [105648]
  Other proteins in same PDB: d1sjha2, d1sjhb1, d1sjhb2, d1sjhd1, d1sjhd2
Domains for 1t5w:
1. Domain d1t5wa1: 1t5w A:82-181 [106481]
  Other proteins in same PDB: d1t5wa2, d1t5wb1, d1t5wb2, d1t5wd2, d1t5we1, d1t5we2
2. Domain d1t5wd1: 1t5w D:82-181 [106485]
  Other proteins in same PDB: d1t5wa2, d1t5wb1, d1t5wb2, d1t5wd2, d1t5we1, d1t5we2
Domain for 1t5x:
- Domain d1t5xa1: 1t5x A:82-181 [106489]
  Other proteins in same PDB: d1t5xa2, d1t5xb1, d1t5xb2, d1t5xd1, d1t5xd2
Domain for 2iam:
- Domain d2iama1: 2iam A:82-181 [137158]
  Other proteins in same PDB: d2iama2, d2iamb1, d2iamb2, d2iamc1, d2iamc2, d2iamd1, d2iamd2
  automated match to d1jwua1
  mutant

Domains for 2ian:

Domain d2iana1: 2ian A:82-181 [137162]
Other proteins in same PDB: d2iana2, d2ianb1, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf2, d2iang1, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank2, d2ianl1, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp2, d2ianq1, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
automated match to d1pywa1
mutant

Domain d2ianf1: 2ian F:82-181 [137166]
Other proteins in same PDB: d2iana2, d2ianb1, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf2, d2iang1, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank2, d2ianl1, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp2, d2ianq1, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
automated match to d1jwua1
mutant

Domain d2iank1: 2ian K:82-181 [137170]
Other proteins in same PDB: d2iana2, d2ianb1, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf2, d2iang1, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank2, d2ianl1, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp2, d2ianq1, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
automated match to d1jwua1
mutant

Domain d2ianp1: 2ian P:82-181 [137174]
Other proteins in same PDB: d2iana2, d2ianb1, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf2, d2iang1, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank2, d2ianl1, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp2, d2ianq1, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
automated match to d1jwua1
mutant

Domain for 2seb:
- Domain d2seba1: 2seb A:82-180 [21593]
  Other proteins in same PDB: d2seba2, d2sebb1, d2sebb2, d2sebd1, d2sebd2
  complexed with nag
Domain for 3c5j:
- Domain d3c5ja2: 3c5j A:82-180 [208794]
  Other proteins in same PDB: d3c5ja1, d3c5jb1, d3c5jb2
  automated match to d1fv1a1
  complexed with nag, so4
Domains for 3o6f:
1. Domain d3o6fa2: 3o6f A:82-181 [214201]
  Other proteins in same PDB: d3o6fa1, d3o6fc1, d3o6fc2, d3o6fd1, d3o6fd2, d3o6fe1, d3o6fg1, d3o6fg2, d3o6fh1, d3o6fh2
  automated match to d1pywa1
2. Domain d3o6fe2: 3o6f E:82-180 [214207]
  Other proteins in same PDB: d3o6fa1, d3o6fc1, d3o6fc2, d3o6fd1, d3o6fd2, d3o6fe1, d3o6fg1, d3o6fg2, d3o6fh1, d3o6fh2
  automated match to d1jwua1

Domains for 4e41:

Domain d4e41a2: 4e41 A:82-181 [220249]
Other proteins in same PDB: d4e41a1, d4e41b1, d4e41b2, d4e41d1, d4e41d2, d4e41e1, d4e41e2, d4e41f1, d4e41g1, d4e41g2, d4e41i1, d4e41i2, d4e41j1, d4e41j2
automated match to d1jwua1
complexed with na; mutant

Domain d4e41f2: 4e41 F:82-181 [220257]
Other proteins in same PDB: d4e41a1, d4e41b1, d4e41b2, d4e41d1, d4e41d2, d4e41e1, d4e41e2, d4e41f1, d4e41g1, d4e41g2, d4e41i1, d4e41i2, d4e41j1, d4e41j2
automated match to d1jwua1
complexed with na; mutant

Domains for 4h25:
1. Domain d4h25a2: 4h25 A:82-182 [228335]
  Other proteins in same PDB: d4h25a1, d4h25b1, d4h25b2, d4h25d1, d4h25e1, d4h25e2
  automated match to d1kg0a1
  complexed with ipa
2. Domain d4h25d2: 4h25 D:82-182 [228337]
  Other proteins in same PDB: d4h25a1, d4h25b1, d4h25b2, d4h25d1, d4h25e1, d4h25e2
  automated match to d1kg0a1
Domains for 4h26:
1. Domain d4h26a2: 4h26 A:82-181 [228341]
  Other proteins in same PDB: d4h26a1, d4h26b1, d4h26b2, d4h26d1, d4h26e1, d4h26e2
  automated match to d1fv1a1
2. Domain d4h26d2: 4h26 D:82-181 [228340]
  Other proteins in same PDB: d4h26a1, d4h26b1, d4h26b2, d4h26d1, d4h26e1, d4h26e2
  automated match to d1fv1a1
Domains for 4i5b:
1. Domain d4i5ba2: 4i5b A:82-181 [234811]
  Other proteins in same PDB: d4i5ba1, d4i5bb1, d4i5bb2, d4i5bd1, d4i5be1, d4i5be2
  automated match to d4i5bd2
2. Domain d4i5bd2: 4i5b D:82-188 [229425]
  Other proteins in same PDB: d4i5ba1, d4i5bb1, d4i5bb2, d4i5bd1, d4i5be1, d4i5be2
  automated match to d1fv1a1

Mouse (Mus musculus), H2-DM [TaxId:10090] [88620] (1 PDB entry)
probably orthologous to the human HLA-DM
- Domain for 1k8i:
  - Domain d1k8ia1: 1k8i A:93-191 [68301]
    Other proteins in same PDB: d1k8ia2, d1k8ib1, d1k8ib2
    complexed with nag

Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId:10090] [88624] (24 PDB entries)
probably orthologous to the human HLA-DQ group

Domains for 1d9k:
1. Domain d1d9kc1: 1d9k C:82-182 [21627]
  Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2
  complexed with ndg
2. Domain d1d9kg1: 1d9k G:82-182 [21629]
  Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2
  complexed with ndg
Domain for 1es0:
- Domain d1es0a1: 1es0 A:83-180 [21643]
  Other proteins in same PDB: d1es0a2, d1es0b1, d1es0b2
  contains covalently bound peptides
Domains for 1f3j:
1. Domain d1f3ja1: 1f3j A:83-181 [21645]
  Other proteins in same PDB: d1f3ja2, d1f3jb1, d1f3jb2, d1f3jd2, d1f3je1, d1f3je2
  complexed with nag
2. Domain d1f3jd1: 1f3j D:83-181 [21647]
  Other proteins in same PDB: d1f3ja2, d1f3jb1, d1f3jb2, d1f3jd2, d1f3je1, d1f3je2
  complexed with nag
Domain for 1iak:
- Domain d1iaka1: 1iak A:82-181 [21625]
  Other proteins in same PDB: d1iaka2, d1iakb1, d1iakb2
  complexed with nag
Domain for 1iao:
- Domain d1iaoa1: 1iao A:83-178 [21641]
  Other proteins in same PDB: d1iaoa2, d1iaob1, d1iaob2
  complexed with nag
Domain for 1jl4:
- Domain d1jl4a1: 1jl4 A:82-181 [63157]
  Other proteins in same PDB: d1jl4a2, d1jl4b1, d1jl4b2, d1jl4d1, d1jl4d2
Domain for 1k2d:
- Domain d1k2da1: 1k2d A:82-181 [84291]
  Other proteins in same PDB: d1k2da2, d1k2db1, d1k2db2
  complexed with nag, ndg
Domains for 1lnu:
1. Domain d1lnua1: 1lnu A:84-182 [74097]
  Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh1, d1lnuh2
  complexed with nag, ndg
2. Domain d1lnuc1: 1lnu C:84-182 [74101]
  Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh1, d1lnuh2
  complexed with nag, ndg
3. Domain d1lnue1: 1lnu E:84-182 [74105]
  Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh1, d1lnuh2
  complexed with nag, ndg
4. Domain d1lnug1: 1lnu G:84-182 [74109]
  Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh1, d1lnuh2
  complexed with nag, ndg
Domain for 1muj:
- Domain d1muja1: 1muj A:84-183 [79488]
  Other proteins in same PDB: d1muja2, d1mujb1, d1mujb2
  complexed with nag
Domains for 1u3h:
1. Domain d1u3hc1: 1u3h C:82-181 [119510]
  Other proteins in same PDB: d1u3ha1, d1u3hb1, d1u3hc2, d1u3hd1, d1u3hd2, d1u3he_, d1u3hf_, d1u3hg2, d1u3hh1, d1u3hh2
  automatically matched to d1k2da1
2. Domain d1u3hg1: 1u3h G:82-181 [119514]
  Other proteins in same PDB: d1u3ha1, d1u3hb1, d1u3hc2, d1u3hd1, d1u3hd2, d1u3he_, d1u3hf_, d1u3hg2, d1u3hh1, d1u3hh2
  automatically matched to d1k2da1
Domain for 1ymm:
- Domain d1ymma1: 1ymm A:83-179 [123701]
  Other proteins in same PDB: d1ymma2, d1ymmb1, d1ymmb2, d1ymmd1, d1ymme1, d1ymme2
  automatically matched to d1k2da1
  complexed with nag

Domains for 1zgl:

Domain d1zgla1: 1zgl A:83-179 [125031]
Other proteins in same PDB: d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglr1, d1zglr2, d1zglt1, d1zglt2, d1zglv1, d1zglv2
automatically matched to d1k2da1

Domain d1zgld1: 1zgl D:83-179 [125035]
Other proteins in same PDB: d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglr1, d1zglr2, d1zglt1, d1zglt2, d1zglv1, d1zglv2
automatically matched to d1k2da1

Domain d1zglg1: 1zgl G:83-179 [125039]
Other proteins in same PDB: d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglr1, d1zglr2, d1zglt1, d1zglt2, d1zglv1, d1zglv2
automatically matched to d1k2da1

Domain d1zglj1: 1zgl J:83-179 [125043]
Other proteins in same PDB: d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglr1, d1zglr2, d1zglt1, d1zglt2, d1zglv1, d1zglv2
automatically matched to d1k2da1

Domains for 2fse:
1. Domain d2fsea1: 2fse A:83-181 [134017]
  Other proteins in same PDB: d2fsea2, d2fseb1, d2fseb2, d2fsec2, d2fsed1, d2fsed2
  automatically matched to d1k2da1
2. Domain d2fsec1: 2fse C:83-180 [134021]
  Other proteins in same PDB: d2fsea2, d2fseb1, d2fseb2, d2fsec2, d2fsed1, d2fsed2
  automatically matched to d1k2da1
Domain for 2g9h:
- Domain d2g9ha1: 2g9h A:83-179 [134802]
  Other proteins in same PDB: d2g9ha2, d2g9hb1, d2g9hb2, d2g9hd1, d2g9hd2
  automatically matched to d1k2da1
  complexed with dio, epe, so4, zn
Domain for 2iad:
- Domain d2iada1: 2iad A:83-186 [21639]
  Other proteins in same PDB: d2iada2, d2iadb1, d2iadb2
  contains covalently bound peptides
Domains for 2icw:
1. Domain d2icwa1: 2icw A:83-179 [137243]
  Other proteins in same PDB: d2icwa2, d2icwb1, d2icwb2, d2icwd2, d2icwe1, d2icwe2, d2icwg_, d2icwh_, d2icwj1, d2icwl_
  automatically matched to d1k2da1
2. Domain d2icwd1: 2icw D:83-179 [137247]
  Other proteins in same PDB: d2icwa2, d2icwb1, d2icwb2, d2icwd2, d2icwe1, d2icwe2, d2icwg_, d2icwh_, d2icwj1, d2icwl_
  automatically matched to d1k2da1
Domain for 2ipk:
- Domain d2ipka1: 2ipk A:83-179 [137577]
  Other proteins in same PDB: d2ipka2, d2ipkb1, d2ipkb2, d2ipkd1, d2ipkd2
  automatically matched to d1k2da1
Domains for 2oje:
1. Domain d2ojea1: 2oje A:83-179 [139103]
  Other proteins in same PDB: d2ojea2, d2ojeb1, d2ojeb2, d2ojed1, d2ojee2, d2ojef1, d2ojef2, d2ojeh1
  automatically matched to d1k2da1
  complexed with po4
2. Domain d2ojee1: 2oje E:83-179 [139108]
  Other proteins in same PDB: d2ojea2, d2ojeb1, d2ojeb2, d2ojed1, d2ojee2, d2ojef1, d2ojef2, d2ojeh1
  automatically matched to d1k2da1
  complexed with po4
Domain for 2p24:
- Domain d2p24a1: 2p24 A:82-181 [149169]
  Other proteins in same PDB: d2p24a2
  automatically matched to d1k2da1
Domain for 2pxy:
- Domain d2pxyc1: 2pxy C:82-180 [149922]
  Other proteins in same PDB: d2pxya_, d2pxyb_, d2pxyc2, d2pxyd1, d2pxyd2
  automatically matched to d1k2da1
Domain for 2z31:
- Domain d2z31c1: 2z31 C:82-180 [153951]
  Other proteins in same PDB: d2z31a_, d2z31b_, d2z31c2, d2z31d1, d2z31d2
  automatically matched to d1k2da1

Domains for 3c5z:

Domain d3c5zc1: 3c5z C:84-182 [155953]
Other proteins in same PDB: d3c5za1, d3c5za2, d3c5zb1, d3c5zb2, d3c5zc2, d3c5zd1, d3c5zd2, d3c5ze1, d3c5ze2, d3c5zf1, d3c5zf2, d3c5zg2, d3c5zh1, d3c5zh2
automated match to d1lnua1

Domain d3c5zg1: 3c5z G:84-182 [155957]
Other proteins in same PDB: d3c5za1, d3c5za2, d3c5zb1, d3c5zb2, d3c5zc2, d3c5zd1, d3c5zd2, d3c5ze1, d3c5ze2, d3c5zf1, d3c5zf2, d3c5zg2, d3c5zh1, d3c5zh2
automated match to d1lnua1

Domains for 3c60:
1. Domain d3c60c1: 3c60 C:83-182 [155961]
  Other proteins in same PDB: d3c60c2, d3c60d1, d3c60d2, d3c60g2, d3c60h1, d3c60h2
  automatically matched to d1k2da1
2. Domain d3c60g1: 3c60 G:83-182 [155965]
  Other proteins in same PDB: d3c60c2, d3c60d1, d3c60d2, d3c60g2, d3c60h1, d3c60h2
  automatically matched to d1k2da1

Domains for 3c6l:

Domain d3c6lc1: 3c6l C:83-182 [155979]
Other proteins in same PDB: d3c6la1, d3c6la2, d3c6lc2, d3c6ld1, d3c6ld2, d3c6le1, d3c6le2, d3c6lg2, d3c6lh1, d3c6lh2
automatically matched to d1k2da1
complexed with ca

Domain d3c6lg1: 3c6l G:83-182 [155985]
Other proteins in same PDB: d3c6la1, d3c6la2, d3c6lc2, d3c6ld1, d3c6ld2, d3c6le1, d3c6le2, d3c6lg2, d3c6lh1, d3c6lh2
automatically matched to d1k2da1
complexed with ca

Mouse (Mus musculus), I-E group [TaxId:10090] [88622] (9 PDB entries)
probably orthologous to the human HLA-DR group

Domains for 1fne:
1. Domain d1fnea1: 1fne A:82-182 [59896]
  Other proteins in same PDB: d1fnea2, d1fneb1, d1fneb2, d1fnec2, d1fned1, d1fned2
  complexed with nag
2. Domain d1fnec1: 1fne C:82-182 [59900]
  Other proteins in same PDB: d1fnea2, d1fneb1, d1fneb2, d1fnec2, d1fned1, d1fned2
  complexed with nag
Domains for 1fng:
1. Domain d1fnga1: 1fng A:82-182 [59904]
  Other proteins in same PDB: d1fnga2, d1fngb1, d1fngb2, d1fngc2, d1fngd1, d1fngd2
  complexed with nag
2. Domain d1fngc1: 1fng C:82-182 [59908]
  Other proteins in same PDB: d1fnga2, d1fngb1, d1fngb2, d1fngc2, d1fngd1, d1fngd2
  complexed with nag

Domains for 1i3r:

Domain d1i3ra1: 1i3r A:82-182 [61620]
Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb1, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd1, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf1, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh1, d1i3rh2
complexed with nag, ndg; mutant

Domain d1i3rc1: 1i3r C:82-182 [61624]
Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb1, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd1, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf1, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh1, d1i3rh2
complexed with nag, ndg; mutant

Domain d1i3re1: 1i3r E:82-182 [61628]
Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb1, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd1, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf1, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh1, d1i3rh2
complexed with nag, ndg; mutant

Domain d1i3rg1: 1i3r G:82-182 [61632]
Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb1, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd1, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf1, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh1, d1i3rh2
complexed with nag, ndg; mutant

Domains for 1iea:
1. Domain d1ieaa1: 1iea A:82-182 [21631]
  Other proteins in same PDB: d1ieaa2, d1ieab1, d1ieab2, d1ieac2, d1iead1, d1iead2
  complexed with nag
2. Domain d1ieac1: 1iea C:82-182 [21633]
  Other proteins in same PDB: d1ieaa2, d1ieab1, d1ieab2, d1ieac2, d1iead1, d1iead2
  complexed with nag
Domains for 1ieb:
1. Domain d1ieba1: 1ieb A:82-182 [21635]
  Other proteins in same PDB: d1ieba2, d1iebb1, d1iebb2, d1iebc2, d1iebd1, d1iebd2
  complexed with nag, ndg, so4
2. Domain d1iebc1: 1ieb C:82-182 [21637]
  Other proteins in same PDB: d1ieba2, d1iebb1, d1iebb2, d1iebc2, d1iebd1, d1iebd2
  complexed with nag, ndg, so4
Domains for 1kt2:
1. Domain d1kt2a1: 1kt2 A:82-182 [72951]
  Other proteins in same PDB: d1kt2a2, d1kt2b1, d1kt2b2, d1kt2c2, d1kt2d1, d1kt2d2
  complexed with nag
2. Domain d1kt2c1: 1kt2 C:82-182 [72955]
  Other proteins in same PDB: d1kt2a2, d1kt2b1, d1kt2b2, d1kt2c2, d1kt2d1, d1kt2d2
  complexed with nag
Domains for 1ktd:
1. Domain d1ktda1: 1ktd A:82-182 [72964]
  Other proteins in same PDB: d1ktda2, d1ktdb1, d1ktdb2, d1ktdc2, d1ktdd1, d1ktdd2
  complexed with nag, so4
2. Domain d1ktdc1: 1ktd C:82-182 [72968]
  Other proteins in same PDB: d1ktda2, d1ktdb1, d1ktdb2, d1ktdc2, d1ktdd1, d1ktdd2
  complexed with nag, so4
Domains for 1r5v:
1. Domain d1r5va1: 1r5v A:82-182 [97116]
  Other proteins in same PDB: d1r5va2, d1r5vb1, d1r5vb2, d1r5vc2, d1r5vd1, d1r5vd2
2. Domain d1r5vc1: 1r5v C:82-182 [97120]
  Other proteins in same PDB: d1r5va2, d1r5vb1, d1r5vb2, d1r5vc2, d1r5vd1, d1r5vd2
Domains for 1r5w:
1. Domain d1r5wa1: 1r5w A:82-182 [97124]
  Other proteins in same PDB: d1r5wa2, d1r5wb1, d1r5wb2, d1r5wc2, d1r5wd1, d1r5wd2
2. Domain d1r5wc1: 1r5w C:82-182 [97128]
  Other proteins in same PDB: d1r5wa2, d1r5wb1, d1r5wb2, d1r5wc2, d1r5wd1, d1r5wd2

More info for Protein Class II MHC alpha chain, C-terminal domain from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like)

Timeline for Protein Class II MHC alpha chain, C-terminal domain from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like):

Protein Class II MHC alpha chain, C-terminal domain from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) first appeared in SCOP 1.65
Protein Class II MHC alpha chain, C-terminal domain from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) appears in SCOPe 2.02
Protein Class II MHC alpha chain, C-terminal domain from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) appears in SCOPe 2.04
Protein Class II MHC alpha chain, C-terminal domain from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) appears in the current release, SCOPe 2.08