Lineage for Protein: Class I MHC, alpha-3 domain

  1. Root: SCOP 1.65
  2. 287094Class b: All beta proteins [48724] (126 folds)
  3. 287095Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (20 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 287096Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (4 families) (S)
  5. 288543Family b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) [48942] (22 proteins)
  6. 288747Protein Class I MHC, alpha-3 domain [88604] (3 species)

Species:

  1. 288748Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] [88605] (56 PDB entries)
    1. Domain for 1a1m:
    2. Domain for 1a1n:
    3. Domain for 1a1o:
    4. Domains for 1a9b:
      1. 288823Domain d1a9ba1: 1a9b A:182-277 [20759]
        Other proteins in same PDB: d1a9ba2, d1a9bb_, d1a9bd2, d1a9be_
      2. 288824Domain d1a9bd1: 1a9b D:182-277 [20761]
        Other proteins in same PDB: d1a9ba2, d1a9bb_, d1a9bd2, d1a9be_
    5. Domain for 1a9e:
    6. Domain for 1agb:
    7. Domain for 1agc:
    8. Domain for 1agd:
    9. Domain for 1age:
    10. Domain for 1agf:
    11. Domain for 1akj:
    12. Domain for 1ao7:
    13. Domains for 1b0g:
      1. 288803Domain d1b0ga1: 1b0g A:182-275 [20700]
        Other proteins in same PDB: d1b0ga2, d1b0gb_, d1b0gd2, d1b0ge_
      2. 288804Domain d1b0gd1: 1b0g D:182-275 [20702]
        Other proteins in same PDB: d1b0ga2, d1b0gb_, d1b0gd2, d1b0ge_
    14. Domain for 1b0r:
    15. Domain for 1bd2:
    16. Domains for 1duy:
      1. 288769Domain d1duya1: 1duy A:182-275 [20674]
        Other proteins in same PDB: d1duya2, d1duyb_, d1duyd2, d1duye_
      2. 288770Domain d1duyd1: 1duy D:182-275 [20676]
        Other proteins in same PDB: d1duya2, d1duyb_, d1duyd2, d1duye_
    17. Domains for 1duz:
      1. 288752Domain d1duza1: 1duz A:182-275 [20670]
        Other proteins in same PDB: d1duza2, d1duzb_, d1duzd2, d1duze_
      2. 288753Domain d1duzd1: 1duz D:182-275 [20672]
        Other proteins in same PDB: d1duza2, d1duzb_, d1duzd2, d1duze_
    18. Domain for 1e27:
    19. Domain for 1e28:
    20. Domains for 1eey:
      1. 288780Domain d1eeya1: 1eey A:182-275 [83170]
        Other proteins in same PDB: d1eeya2, d1eeyb_, d1eeyd2, d1eeye_
      2. 288781Domain d1eeyd1: 1eey D:182-275 [83173]
        Other proteins in same PDB: d1eeya2, d1eeyb_, d1eeyd2, d1eeye_
        mutant
    21. Domains for 1eez:
      1. 288792Domain d1eeza1: 1eez A:182-275 [83176]
        Other proteins in same PDB: d1eeza2, d1eezb_, d1eezd2, d1eeze_
      2. 288793Domain d1eezd1: 1eez D:182-275 [83179]
        Other proteins in same PDB: d1eeza2, d1eezb_, d1eezd2, d1eeze_
        mutant
    22. Domain for 1efx:
    23. Domains for 1hhg:
      1. 288813Domain d1hhga1: 1hhg A:182-275 [20716]
        Other proteins in same PDB: d1hhga2, d1hhgb_, d1hhgd2, d1hhge_
      2. 288814Domain d1hhgd1: 1hhg D:182-275 [20718]
        Other proteins in same PDB: d1hhga2, d1hhgb_, d1hhgd2, d1hhge_
    24. Domain for 1hhh:
    25. Domains for 1hhi:
      1. 288807Domain d1hhia1: 1hhi A:182-275 [20708]
        Other proteins in same PDB: d1hhia2, d1hhib_, d1hhid2, d1hhie_
      2. 288808Domain d1hhid1: 1hhi D:182-275 [20710]
        Other proteins in same PDB: d1hhia2, d1hhib_, d1hhid2, d1hhie_
    26. Domains for 1hhj:
      1. 288809Domain d1hhja1: 1hhj A:182-275 [20704]
        Other proteins in same PDB: d1hhja2, d1hhjb_, d1hhjd2, d1hhje_
      2. 288810Domain d1hhjd1: 1hhj D:182-275 [20706]
        Other proteins in same PDB: d1hhja2, d1hhjb_, d1hhjd2, d1hhje_
    27. Domains for 1hhk:
      1. 288797Domain d1hhka1: 1hhk A:182-275 [20690]
        Other proteins in same PDB: d1hhka2, d1hhkb_, d1hhkd2, d1hhke_
      2. 288798Domain d1hhkd1: 1hhk D:182-275 [20692]
        Other proteins in same PDB: d1hhka2, d1hhkb_, d1hhkd2, d1hhke_
    28. Domain for 1hla:
    29. Domains for 1hsa:
      1. 288765Domain d1hsaa1: 1hsa A:182-276 [20732]
        Other proteins in same PDB: d1hsaa2, d1hsab_, d1hsad2, d1hsae_
      2. 288766Domain d1hsad1: 1hsa D:182-276 [20734]
        Other proteins in same PDB: d1hsaa2, d1hsab_, d1hsad2, d1hsae_
    30. Domain for 1hsb:
    31. Domains for 1i1f:
      1. 288818Domain d1i1fa1: 1i1f A:182-275 [20728]
        Other proteins in same PDB: d1i1fa2, d1i1fb_, d1i1fd2, d1i1fe_
      2. 288819Domain d1i1fd1: 1i1f D:182-275 [20730]
        Other proteins in same PDB: d1i1fa2, d1i1fb_, d1i1fd2, d1i1fe_
    32. Domains for 1i1y:
      1. 288782Domain d1i1ya1: 1i1y A:182-275 [20682]
        Other proteins in same PDB: d1i1ya2, d1i1yb_, d1i1yd2, d1i1ye_
      2. 288783Domain d1i1yd1: 1i1y D:182-275 [20684]
        Other proteins in same PDB: d1i1ya2, d1i1yb_, d1i1yd2, d1i1ye_
    33. Domain for 1i4f:
    34. Domains for 1i7r:
      1. 288787Domain d1i7ra1: 1i7r A:182-275 [66050]
        Other proteins in same PDB: d1i7ra2, d1i7rb_, d1i7rd2, d1i7re_
      2. 288788Domain d1i7rd1: 1i7r D:182-275 [66053]
        Other proteins in same PDB: d1i7ra2, d1i7rb_, d1i7rd2, d1i7re_
    35. Domains for 1i7t:
      1. 288811Domain d1i7ta1: 1i7t A:182-275 [66056]
        Other proteins in same PDB: d1i7ta2, d1i7tb_, d1i7td2, d1i7te_
      2. 288812Domain d1i7td1: 1i7t D:182-275 [66059]
        Other proteins in same PDB: d1i7ta2, d1i7tb_, d1i7td2, d1i7te_
    36. Domains for 1i7u:
      1. 288756Domain d1i7ua1: 1i7u A:182-275 [66062]
        Other proteins in same PDB: d1i7ua2, d1i7ub_, d1i7ud2, d1i7ue_
      2. 288757Domain d1i7ud1: 1i7u D:182-275 [66065]
        Other proteins in same PDB: d1i7ua2, d1i7ub_, d1i7ud2, d1i7ue_
    37. Domains for 1im3:
      1. 288771Domain d1im3a1: 1im3 A:182-275 [62565]
        Other proteins in same PDB: d1im3a2, d1im3b_, d1im3d_, d1im3e2, d1im3f_, d1im3h_, d1im3i2, d1im3j_, d1im3l_, d1im3m2, d1im3n_, d1im3p_
      2. 288772Domain d1im3e1: 1im3 E:182-275 [62569]
        Other proteins in same PDB: d1im3a2, d1im3b_, d1im3d_, d1im3e2, d1im3f_, d1im3h_, d1im3i2, d1im3j_, d1im3l_, d1im3m2, d1im3n_, d1im3p_
      3. 288773Domain d1im3i1: 1im3 I:182-275 [62573]
        Other proteins in same PDB: d1im3a2, d1im3b_, d1im3d_, d1im3e2, d1im3f_, d1im3h_, d1im3i2, d1im3j_, d1im3l_, d1im3m2, d1im3n_, d1im3p_
      4. 288774Domain d1im3m1: 1im3 M:182-275 [62577]
        Other proteins in same PDB: d1im3a2, d1im3b_, d1im3d_, d1im3e2, d1im3f_, d1im3h_, d1im3i2, d1im3j_, d1im3l_, d1im3m2, d1im3n_, d1im3p_
    38. Domains for 1im9:
      1. 288799Domain d1im9a1: 1im9 A:182-275 [62582]
        Other proteins in same PDB: d1im9a2, d1im9b_, d1im9d1, d1im9d2, d1im9e2, d1im9f_
      2. 288800Domain d1im9e1: 1im9 E:182-275 [62587]
        Other proteins in same PDB: d1im9a2, d1im9b_, d1im9d1, d1im9d2, d1im9e2, d1im9f_
    39. Domain for 1jf1:
    40. Domain for 1jgd:
    41. Domain for 1jge:
    42. Domain for 1jht:
    43. Domain for 1k5n:
    44. Domains for 1kpr:
      1. 288815Domain d1kpra1: 1kpr A:182-274 [77480]
        Other proteins in same PDB: d1kpra2, d1kprb_, d1kprc2, d1kprd_
      2. 288816Domain d1kprc1: 1kpr C:182-274 [77483]
        Other proteins in same PDB: d1kpra2, d1kprb_, d1kprc2, d1kprd_
        complexed with so4; mutant
    45. Domains for 1ktl:
      1. 288825Domain d1ktla1: 1ktl A:182-274 [77535]
        Other proteins in same PDB: d1ktla2, d1ktlb_, d1ktlc2, d1ktld_
      2. 288826Domain d1ktlc1: 1ktl C:182-274 [77538]
        Other proteins in same PDB: d1ktla2, d1ktlb_, d1ktlc2, d1ktld_
        complexed with so4; mutant
    46. Domains for 1mhe:
      1. 288801Domain d1mhea1: 1mhe A:182-274 [20771]
        Other proteins in same PDB: d1mhea2, d1mheb_, d1mhec2, d1mhed_
      2. 288802Domain d1mhec1: 1mhe C:182-274 [20773]
        Other proteins in same PDB: d1mhea2, d1mheb_, d1mhec2, d1mhed_
        complexed with so4
    47. Domain for 1mi5:
    48. Domain for 1oga:
    49. Domain for 1qqd:
    50. Domains for 1qr1:
      1. 288790Domain d1qr1a1: 1qr1 A:182-275 [20712]
        Other proteins in same PDB: d1qr1a2, d1qr1b_, d1qr1d2, d1qr1e_
      2. 288791Domain d1qr1d1: 1qr1 D:182-275 [20714]
        Other proteins in same PDB: d1qr1a2, d1qr1b_, d1qr1d2, d1qr1e_
    51. Domain for 1qrn:
    52. Domain for 1qse:
    53. Domain for 1qsf:
    54. Domains for 2clr:
      1. 288777Domain d2clra1: 2clr A:182-275 [20678]
        Other proteins in same PDB: d2clra2, d2clrb_, d2clrd2, d2clre_
      2. 288778Domain d2clrd1: 2clr D:182-275 [20680]
        Other proteins in same PDB: d2clra2, d2clrb_, d2clrd2, d2clre_
    55. Domain for 2hla:
    56. Domain for 3hla:
  2. 288830Mouse (Mus musculus) [TaxId:10090] [88606] (49 PDB entries)
    1. Domain for 1bii:
    2. Domains for 1bqh:
      1. 288875Domain d1bqha1: 1bqh A:182-274 [20799]
        Other proteins in same PDB: d1bqha2, d1bqhb_, d1bqhd2, d1bqhe_, d1bqhg_, d1bqhh_, d1bqhi_, d1bqhk_
      2. 288876Domain d1bqhd1: 1bqh D:182-274 [20801]
        Other proteins in same PDB: d1bqha2, d1bqhb_, d1bqhd2, d1bqhe_, d1bqhg_, d1bqhh_, d1bqhi_, d1bqhk_
        complexed with nag
    3. Domain for 1bz9:
    4. Domain for 1ce6:
    5. Domain for 1ddh:
    6. Domains for 1ffn:
      1. 288877Domain d1ffna1: 1ffn A:182-274 [76165]
        Other proteins in same PDB: d1ffna2, d1ffnb_, d1ffnd2, d1ffne_
      2. 288878Domain d1ffnd1: 1ffn D:182-274 [76168]
        Other proteins in same PDB: d1ffna2, d1ffnb_, d1ffnd2, d1ffne_
        mutant
    7. Domains for 1ffo:
      1. 288868Domain d1ffoa1: 1ffo A:182-274 [76171]
        Other proteins in same PDB: d1ffoa2, d1ffob_, d1ffod2, d1ffoe_
      2. 288869Domain d1ffod1: 1ffo D:182-274 [76174]
        Other proteins in same PDB: d1ffoa2, d1ffob_, d1ffod2, d1ffoe_
        mutant
    8. Domains for 1ffp:
      1. 288863Domain d1ffpa1: 1ffp A:182-274 [76177]
        Other proteins in same PDB: d1ffpa2, d1ffpb_, d1ffpd2, d1ffpe_
      2. 288864Domain d1ffpd1: 1ffp D:182-274 [76180]
        Other proteins in same PDB: d1ffpa2, d1ffpb_, d1ffpd2, d1ffpe_
        mutant
    9. Domains for 1fg2:
      1. 288870Domain d1fg2a1: 1fg2 A:182-274 [20821]
        Other proteins in same PDB: d1fg2a2, d1fg2b_, d1fg2d2, d1fg2e_, d1fg2g2, d1fg2h_, d1fg2j2, d1fg2k_
      2. 288871Domain d1fg2d1: 1fg2 D:182-274 [20823]
        Other proteins in same PDB: d1fg2a2, d1fg2b_, d1fg2d2, d1fg2e_, d1fg2g2, d1fg2h_, d1fg2j2, d1fg2k_
      3. 288872Domain d1fg2g1: 1fg2 G:182-274 [20825]
        Other proteins in same PDB: d1fg2a2, d1fg2b_, d1fg2d2, d1fg2e_, d1fg2g2, d1fg2h_, d1fg2j2, d1fg2k_
      4. 288873Domain d1fg2j1: 1fg2 J:182-274 [20827]
        Other proteins in same PDB: d1fg2a2, d1fg2b_, d1fg2d2, d1fg2e_, d1fg2g2, d1fg2h_, d1fg2j2, d1fg2k_
    10. Domain for 1fo0:
    11. Domain for 1fzj:
    12. Domain for 1fzk:
    13. Domain for 1fzm:
    14. Domain for 1fzo:
    15. Domains for 1g6r:
      1. 288901Domain d1g6rh1: 1g6r H:182-274 [20811]
        Other proteins in same PDB: d1g6ra1, d1g6ra2, d1g6rb1, d1g6rb2, d1g6rc1, d1g6rc2, d1g6rd1, d1g6rd2, d1g6rh2, d1g6ri2, d1g6rl_, d1g6rm_
      2. 288902Domain d1g6ri1: 1g6r I:182-274 [20813]
        Other proteins in same PDB: d1g6ra1, d1g6ra2, d1g6rb1, d1g6rb2, d1g6rc1, d1g6rc2, d1g6rd1, d1g6rd2, d1g6rh2, d1g6ri2, d1g6rl_, d1g6rm_
    16. Domain for 1g7p:
    17. Domain for 1g7q:
    18. Domain for 1hoc:
    19. Domain for 1inq:
    20. Domain for 1jpf:
    21. Domain for 1jpg:
    22. Domain for 1juf:
    23. Domain for 1k8d:
    24. Domain for 1kbg:
    25. Domains for 1kj2:
      1. 288881Domain d1kj2h1: 1kj2 H:182-276 [72563]
        Other proteins in same PDB: d1kj2a_, d1kj2b_, d1kj2d_, d1kj2e_, d1kj2h2, d1kj2i2, d1kj2l_, d1kj2m_
      2. 288882Domain d1kj2i1: 1kj2 I:182-277 [72565]
        Other proteins in same PDB: d1kj2a_, d1kj2b_, d1kj2d_, d1kj2e_, d1kj2h2, d1kj2i2, d1kj2l_, d1kj2m_
        complexed with gal, man, nag, sia
    26. Domains for 1kj3:
      1. 288858Domain d1kj3h1: 1kj3 H:182-278 [72569]
        Other proteins in same PDB: d1kj3h2, d1kj3i2, d1kj3l_, d1kj3m_
      2. 288859Domain d1kj3i1: 1kj3 I:182-278 [72571]
        Other proteins in same PDB: d1kj3h2, d1kj3i2, d1kj3l_, d1kj3m_
    27. Domain for 1kpu:
    28. Domain for 1kpv:
    29. Domains for 1ld9:
      1. 288860Domain d1ld9a1: 1ld9 A:182-268 [20835]
        Other proteins in same PDB: d1ld9a2, d1ld9b_, d1ld9d2, d1ld9e_
      2. 288861Domain d1ld9d1: 1ld9 D:182-268 [20837]
        Other proteins in same PDB: d1ld9a2, d1ld9b_, d1ld9d2, d1ld9e_
    30. Domain for 1ldp:
    31. Domain for 1leg:
    32. Domain for 1lek:
    33. Domains for 1mhc:
      1. 288841Domain d1mhca1: 1mhc A:182-276 [20831]
        Other proteins in same PDB: d1mhca2, d1mhcb_, d1mhcd2, d1mhce_
      2. 288842Domain d1mhcd1: 1mhc D:182-276 [20833]
        Other proteins in same PDB: d1mhca2, d1mhcb_, d1mhcd2, d1mhce_
        complexed with nag; mutant
    34. Domains for 1mwa:
      1. 288888Domain d1mwah1: 1mwa H:182-274 [79566]
        Other proteins in same PDB: d1mwaa1, d1mwaa2, d1mwab1, d1mwab2, d1mwac1, d1mwac2, d1mwad1, d1mwad2, d1mwah2, d1mwai2, d1mwal_, d1mwam_
      2. 288889Domain d1mwai1: 1mwa I:182-274 [79568]
        Other proteins in same PDB: d1mwaa1, d1mwaa2, d1mwab1, d1mwab2, d1mwac1, d1mwac2, d1mwad1, d1mwad2, d1mwah2, d1mwai2, d1mwal_, d1mwam_
        complexed with acy, gol, man, nag
    35. Domains for 1n3n:
      1. 288890Domain d1n3na1: 1n3n A:182-276 [85303]
        Other proteins in same PDB: d1n3na2, d1n3nb_, d1n3nc2, d1n3nd_, d1n3ne2, d1n3nf_, d1n3ng2, d1n3nh_
      2. 288891Domain d1n3nc1: 1n3n C:182-276 [85306]
        Other proteins in same PDB: d1n3na2, d1n3nb_, d1n3nc2, d1n3nd_, d1n3ne2, d1n3nf_, d1n3ng2, d1n3nh_
      3. 288892Domain d1n3ne1: 1n3n E:182-276 [85309]
        Other proteins in same PDB: d1n3na2, d1n3nb_, d1n3nc2, d1n3nd_, d1n3ne2, d1n3nf_, d1n3ng2, d1n3nh_
      4. 288893Domain d1n3ng1: 1n3n G:182-276 [85312]
        Other proteins in same PDB: d1n3na2, d1n3nb_, d1n3nc2, d1n3nd_, d1n3ne2, d1n3nf_, d1n3ng2, d1n3nh_
        complexed with so4
    36. Domains for 1n59:
      1. 288879Domain d1n59a1: 1n59 A:182-276 [80008]
        Other proteins in same PDB: d1n59a2, d1n59b_, d1n59c2, d1n59d_
      2. 288880Domain d1n59c1: 1n59 C:182-276 [80011]
        Other proteins in same PDB: d1n59a2, d1n59b_, d1n59c2, d1n59d_
        mutant
    37. Domains for 1n5a:
      1. 288883Domain d1n5aa1: 1n5a A:182-276 [80014]
        Other proteins in same PDB: d1n5aa2, d1n5ab_, d1n5ad2, d1n5ae_, d1n5ag2, d1n5ah_, d1n5aj2, d1n5ak_
      2. 288884Domain d1n5ad1: 1n5a D:182-274 [80017]
        Other proteins in same PDB: d1n5aa2, d1n5ab_, d1n5ad2, d1n5ae_, d1n5ag2, d1n5ah_, d1n5aj2, d1n5ak_
      3. 288885Domain d1n5ag1: 1n5a G:182-274 [80020]
        Other proteins in same PDB: d1n5aa2, d1n5ab_, d1n5ad2, d1n5ae_, d1n5ag2, d1n5ah_, d1n5aj2, d1n5ak_
      4. 288886Domain d1n5aj1: 1n5a J:182-274 [80023]
        Other proteins in same PDB: d1n5aa2, d1n5ab_, d1n5ad2, d1n5ae_, d1n5ag2, d1n5ah_, d1n5aj2, d1n5ak_
        mutant
    38. Domain for 1nam:
    39. Domains for 1nan:
      1. 288865Domain d1nanh1: 1nan H:182-278 [85493]
        Other proteins in same PDB: d1nanh2, d1nani_, d1nanl2, d1nanp_
      2. 288866Domain d1nanl1: 1nan L:182-278 [85496]
        Other proteins in same PDB: d1nanh2, d1nani_, d1nanl2, d1nanp_
    40. Domain for 1nez:
    41. Domain for 1osz:
    42. Domain for 1qlf:
    43. Domain for 1qo3:
    44. Domain for 1vac:
    45. Domain for 1vad:
    46. Domains for 2ckb:
      1. 288899Domain d2ckbh1: 2ckb H:182-274 [20807]
        Other proteins in same PDB: d2ckba1, d2ckba2, d2ckbb1, d2ckbb2, d2ckbc1, d2ckbc2, d2ckbd1, d2ckbd2, d2ckbh2, d2ckbi2, d2ckbl_, d2ckbm_
      2. 288900Domain d2ckbi1: 2ckb I:182-274 [20809]
        Other proteins in same PDB: d2ckba1, d2ckba2, d2ckbb1, d2ckbb2, d2ckbc1, d2ckbc2, d2ckbd1, d2ckbd2, d2ckbh2, d2ckbi2, d2ckbl_, d2ckbm_
    47. Domains for 2mha:
      1. 288894Domain d2mhaa1: 2mha A:182-270 [20803]
        Other proteins in same PDB: d2mhaa2, d2mhab_, d2mhac2, d2mhad_
      2. 288895Domain d2mhac1: 2mha C:182-270 [20805]
        Other proteins in same PDB: d2mhaa2, d2mhab_, d2mhac2, d2mhad_
    48. Domain for 2vaa:
    49. Domain for 2vab:
  3. 288903Rat (Rattus norvegicus), RT1-AA [TaxId:10116] [88607] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1ed3:
      1. 288905Domain d1ed3a1: 1ed3 A:182-275 [20847]
        Other proteins in same PDB: d1ed3a2, d1ed3b_, d1ed3d2, d1ed3e_
      2. 288906Domain d1ed3d1: 1ed3 D:182-275 [20849]
        Other proteins in same PDB: d1ed3a2, d1ed3b_, d1ed3d2, d1ed3e_
    2. Domain for 1kjm:
    3. Domain for 1kjv:

More info for Protein Class I MHC, alpha-3 domain from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like)

Timeline for Protein Class I MHC, alpha-3 domain from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like):