Class b: All beta proteins [48724] (141 folds) |
Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (22 superfamilies) sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key some members of the fold have additional strands |
Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (4 families) |
Family b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) [48942] (22 proteins) |
Protein Immunoglobulin light chain kappa constant domain, CL-kappa [88566] (3 species) |
Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] [88569] (74 PDB entries) including humanized antibodies (chimeric proteins with human constant domains) |
Domain d1a4ka2: 1a4k A:113-211 [21248] Other proteins in same PDB: d1a4ka1, d1a4kb1, d1a4kb2, d1a4kh1, d1a4kh2, d1a4kl1 part of humanized Diels-Alder catalytic Fab complexed with cd, fra |
Domain d1a4kl2: 1a4k L:113-212 [21246] Other proteins in same PDB: d1a4ka1, d1a4kb1, d1a4kb2, d1a4kh1, d1a4kh2, d1a4kl1 |
Domain d1aj7l2: 1aj7 L:110-214 [21116] Other proteins in same PDB: d1aj7h1, d1aj7h2, d1aj7l1 part of humanized Fab 48G7 complexed with npe |
Domain d1axsa2: 1axs A:108-211 [21216] Other proteins in same PDB: d1axsa1, d1axsb1, d1axsb2, d1axsh1, d1axsh2, d1axsl1 part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28 complexed with cd, hop |
Domain d1axsl2: 1axs L:108-211 [21214] Other proteins in same PDB: d1axsa1, d1axsb1, d1axsb2, d1axsh1, d1axsh2, d1axsl1 |
Domain d1b2wl2: 1b2w L:108-214 [21298] Other proteins in same PDB: d1b2wh1, d1b2wh2, d1b2wl1 part of a humanized anti-gamma-interferon Fab |
Domain d1b4jl2: 1b4j L:108-214 [21300] Other proteins in same PDB: d1b4jh1, d1b4jh2, d1b4jl1 part of a chimeric anti-gamma-interferon Fab |
Domain d1b6da2: 1b6d A:108-212 [21510] Other proteins in same PDB: d1b6da1, d1b6db1 |
Domain d1b6db2: 1b6d B:108-212 [21511] Other proteins in same PDB: d1b6da1, d1b6db1 part of Bence-Jones protein DEL |
Domain d1bbjl2: 1bbj L:110-211 [20894] Other proteins in same PDB: d1bbjh1, d1bbjh2, d1bbjl1 part of humanized Fab B72.3 |
Domain d1beyl2: 1bey L:108-214 [21312] Other proteins in same PDB: d1beyh1, d1beyh2, d1beyl1 part of antibody to CAMPATH-1H humanized Fab |
Domain d1bj1j2: 1bj1 J:108-213 [21316] Other proteins in same PDB: d1bj1h1, d1bj1h2, d1bj1j1, d1bj1k1, d1bj1k2, d1bj1l1, d1bj1v_, d1bj1w_ part of humanized Fab-12 neutralizing VEGF complexed with so4 |
Domain d1bj1l2: 1bj1 L:108-213 [21314] Other proteins in same PDB: d1bj1h1, d1bj1h2, d1bj1j1, d1bj1k1, d1bj1k2, d1bj1l1, d1bj1v_, d1bj1w_ |
Domain d1bz7a2: 1bz7 A:108-206 [21374] Other proteins in same PDB: d1bz7a1, d1bz7b1, d1bz7b2 part of humanized Fab R24 from murine ascites |
Domain d1c5bl2: 1c5b L:108-214 [21440] Other proteins in same PDB: d1c5bh1, d1c5bh2, d1c5bl1 part of humanized catalytic Fab 21D8 with a decarboxylase activity |
Domain d1c5cl2: 1c5c L:108-214 [21438] Other proteins in same PDB: d1c5ch1, d1c5ch2, d1c5cl1 part of humanized catalytic Fab 21D8 with a decarboxylase activity complexed with gol, tk4 |
Domain d1ce1l2: 1ce1 L:108-211 [21310] Other proteins in same PDB: d1ce1h1, d1ce1h2, d1ce1l1 part of humanized therapeutic antibody CAMPATH-1H |
Domain d1clyl2: 1cly L:109-214 [21134] Other proteins in same PDB: d1clyh1, d1clyh2, d1clyl1 part of humanized Fab CBR96 complexed with fuc, gal, nag, non |
Domain d1cz8l2: 1cz8 L:108-213 [21318] Other proteins in same PDB: d1cz8h1, d1cz8h2, d1cz8l1, d1cz8v_, d1cz8w_, d1cz8x1, d1cz8y1, d1cz8y2 |
Domain d1cz8x2: 1cz8 X:108-213 [21320] Other proteins in same PDB: d1cz8h1, d1cz8h2, d1cz8l1, d1cz8v_, d1cz8w_, d1cz8x1, d1cz8y1, d1cz8y2 part of humanized Fab-12 neutralizing VEGF; affinity matured complexed with so4; mutant |
Domain d1d5il2: 1d5i L:108-211 [21210] Other proteins in same PDB: d1d5ih1, d1d5ih2, d1d5il1 part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28 |
Domain d1d6vl2: 1d6v L:108-211 [21212] Other proteins in same PDB: d1d6vh1, d1d6vh2, d1d6vl1 part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28 |
Domain d1deea2: 1dee A:108-214 [21408] Other proteins in same PDB: d1deea1, d1deeb1, d1deeb2, d1deec1, d1deed1, d1deed2, d1deee1, d1deef1, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_ |
Domain d1deec2: 1dee C:1108-1214 [21410] Other proteins in same PDB: d1deea1, d1deeb1, d1deeb2, d1deec1, d1deed1, d1deed2, d1deee1, d1deef1, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_ |
Domain d1deee2: 1dee E:2108-2214 [21412] Other proteins in same PDB: d1deea1, d1deeb1, d1deeb2, d1deec1, d1deed1, d1deed2, d1deee1, d1deef1, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_ part of IgM RF 2A2 |
Domain d1dfbl2: 1dfb L:107-212 [20920] Other proteins in same PDB: d1dfbh1, d1dfbh2, d1dfbl1 part of Fab 3D6 |
Domain d1fl5a2: 1fl5 A:108-212 [65016] Other proteins in same PDB: d1fl5a1, d1fl5b1, d1fl5b2, d1fl5h1, d1fl5h2, d1fl5l1 part of humanized catalytic Fab 28b4 with a sulfide oxidase activity complexed with so4; mutant |
Domain d1fl5l2: 1fl5 L:108-212 [65022] Other proteins in same PDB: d1fl5a1, d1fl5b1, d1fl5b2, d1fl5h1, d1fl5h2, d1fl5l1 |
Domain d1fl6a2: 1fl6 A:108-212 [65024] Other proteins in same PDB: d1fl6a1, d1fl6b1, d1fl6b2, d1fl6h1, d1fl6h2, d1fl6l1 part of humanized catalytic Fab 28b4 with a sulfide oxidase activity complexed with aah; mutant |
Domain d1fl6l2: 1fl6 L:108-212 [65030] Other proteins in same PDB: d1fl6a1, d1fl6b1, d1fl6b2, d1fl6h1, d1fl6h2, d1fl6l1 |
Domain d1gafl2: 1gaf L:110-214 [21114] Other proteins in same PDB: d1gafh1, d1gafh2, d1gafl1 part of humanized Fab 48G7 complexed with npe |
Domain d1hkll2: 1hkl L:110-214 [21120] Other proteins in same PDB: d1hklh1, d1hklh2, d1hkll1 part of humanized Fab 48G7 |
Domain d1hzhl2: 1hzh L:108-214 [61446] Other proteins in same PDB: d1hzhh1, d1hzhh2, d1hzhh3, d1hzhh4, d1hzhk1, d1hzhk2, d1hzhk3, d1hzhk4, d1hzhl1, d1hzhm1 |
Domain d1hzhm2: 1hzh M:108-214 [61448] Other proteins in same PDB: d1hzhh1, d1hzhh2, d1hzhh3, d1hzhh4, d1hzhk1, d1hzhk2, d1hzhk3, d1hzhk4, d1hzhl1, d1hzhm1 part of intact IgG B12 antibody complexed with fuc, gal, man, nag |
Domain d1i9rl2: 1i9r L:112-215 [71156] Other proteins in same PDB: d1i9ra_, d1i9rb_, d1i9rc_, d1i9rh1, d1i9rh2, d1i9rk1, d1i9rk2, d1i9rl1, d1i9rm1, d1i9rx1, d1i9rx2, d1i9ry1 |
Domain d1i9rm2: 1i9r M:112-215 [71158] Other proteins in same PDB: d1i9ra_, d1i9rb_, d1i9rc_, d1i9rh1, d1i9rh2, d1i9rk1, d1i9rk2, d1i9rl1, d1i9rm1, d1i9rx1, d1i9rx2, d1i9ry1 |
Domain d1i9ry2: 1i9r Y:112-215 [71162] Other proteins in same PDB: d1i9ra_, d1i9rb_, d1i9rc_, d1i9rh1, d1i9rh2, d1i9rk1, d1i9rk2, d1i9rl1, d1i9rm1, d1i9rx1, d1i9rx2, d1i9ry1 part of Fab 5C8 against C40 ligand complexed with zn |
Domain d1iqda2: 1iqd A:109-212 [62645] Other proteins in same PDB: d1iqda1, d1iqdb1, d1iqdb2, d1iqdc_ part of Fab BO2C11 against the C2 domain of factor VIII mutant |
Domain d1it9l2: 1it9 L:112-214 [76786] Other proteins in same PDB: d1it9h1, d1it9h2, d1it9l1 part of humanized anti-human Fas Fab HFE7A |
Domain d1jptl2: 1jpt L:108-213 [67054] Other proteins in same PDB: d1jpth1, d1jpth2, d1jptl1 part of humanized Fab D3H44 against human tissue factor |
Domain d1l7il2: 1l7i L:108-214 [73659] Other proteins in same PDB: d1l7ih1, d1l7ih2, d1l7il1 part of humanized anti-ERBb2 Fab 2C4 complexed with so4 |
Domain d1miml2: 1mim L:106-210 [21158] Other proteins in same PDB: d1mimh1, d1mimh2, d1miml1 part of CD25-binding humanized Fab CHI621 |
Domain d1n0xl2: 1n0x L:108-214 [91533] Other proteins in same PDB: d1n0xh1, d1n0xh2, d1n0xk1, d1n0xk2, d1n0xl1, d1n0xm1 |
Domain d1n0xm2: 1n0x M:108-214 [91535] Other proteins in same PDB: d1n0xh1, d1n0xh2, d1n0xk1, d1n0xk2, d1n0xl1, d1n0xm1 part of an anti HIV-1 Fab complexed with cxs, gol, k, orn, so4 |
Domain d1n7mh2: 1n7m H:108-213 [80253] Other proteins in same PDB: d1n7mh1, d1n7ml1, d1n7ml2 part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; germline antibody; chain identifiers are probably mixed up complexed with mmp |
Domain d1ngwa2: 1ngw A:108-213 [80489] Other proteins in same PDB: d1ngwa1, d1ngwb1, d1ngwb2, d1ngwh1, d1ngwh2, d1ngwl1 |
Domain d1ngwl2: 1ngw L:108-213 [80495] Other proteins in same PDB: d1ngwa1, d1ngwb1, d1ngwb2, d1ngwh1, d1ngwh2, d1ngwl1 part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric affinity matured antibody complexed with mmp |
Domain d1ngxa2: 1ngx A:108-213 [85703] Other proteins in same PDB: d1ngxa1, d1ngxb1, d1ngxb2, d1ngxh1, d1ngxh2, d1ngxl1 |
Domain d1ngxl2: 1ngx L:108-213 [85709] Other proteins in same PDB: d1ngxa1, d1ngxb1, d1ngxb2, d1ngxh1, d1ngxh2, d1ngxl1 part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric germline antibody complexed with jef |
Domain d1ngya2: 1ngy A:108-213 [80497] Other proteins in same PDB: d1ngya1, d1ngyb1, d1ngyb2 part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric mature antibody |
Domain d1ngza2: 1ngz A:108-213 [80501] Other proteins in same PDB: d1ngza1, d1ngzb1, d1ngzb2 part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric germline antibody |
Domain d1pg7l2: 1pg7 L:108-213 [94679] Other proteins in same PDB: d1pg7h1, d1pg7h2, d1pg7i1, d1pg7i2, d1pg7l1, d1pg7m1, d1pg7w1, d1pg7w2, d1pg7x1, d1pg7x2, d1pg7y1, d1pg7y2, d1pg7z1, d1pg7z2 |
Domain d1pg7m2: 1pg7 M:108-213 [94681] Other proteins in same PDB: d1pg7h1, d1pg7h2, d1pg7i1, d1pg7i2, d1pg7l1, d1pg7m1, d1pg7w1, d1pg7w2, d1pg7x1, d1pg7x2, d1pg7y1, d1pg7y2, d1pg7z1, d1pg7z2 part of humanized Fab D3H44 against human tissue factor |
Domain d1pkqa2: 1pkq A:108-213 [88149] Other proteins in same PDB: d1pkqa1, d1pkqb1, d1pkqb2, d1pkqe_, d1pkqf1, d1pkqg1, d1pkqg2, d1pkqj_ |
Domain d1pkqf2: 1pkq F:108-210 [88154] Other proteins in same PDB: d1pkqa1, d1pkqb1, d1pkqb2, d1pkqe_, d1pkqf1, d1pkqg1, d1pkqg2, d1pkqj_ part of humanized Fab 8-18c5 |
Domain d1rz7l2: 1rz7 L:108-213 [98136] Other proteins in same PDB: d1rz7h1, d1rz7h2, d1rz7l1 part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 48D complexed with gol |
Domain d1rzia2: 1rzi A:108-213 [98167] Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic1, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie1, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig1, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii1, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik1, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim1, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio1, d1rzip1, d1rzip2 |
Domain d1rzic2: 1rzi C:108-213 [98171] Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic1, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie1, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig1, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii1, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik1, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim1, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio1, d1rzip1, d1rzip2 |
Domain d1rzie2: 1rzi E:108-213 [98175] Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic1, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie1, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig1, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii1, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik1, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim1, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio1, d1rzip1, d1rzip2 |
Domain d1rzig2: 1rzi G:108-213 [98179] Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic1, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie1, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig1, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii1, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik1, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim1, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio1, d1rzip1, d1rzip2 |
Domain d1rzii2: 1rzi I:108-213 [98183] Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic1, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie1, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig1, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii1, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik1, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim1, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio1, d1rzip1, d1rzip2 |
Domain d1rzik2: 1rzi K:108-213 [98187] Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic1, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie1, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig1, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii1, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik1, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim1, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio1, d1rzip1, d1rzip2 |
Domain d1rzim2: 1rzi M:108-213 [98191] Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic1, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie1, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig1, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii1, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik1, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim1, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio1, d1rzip1, d1rzip2 |
Domain d1rzio2: 1rzi O:108-213 [98195] Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic1, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie1, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig1, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii1, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik1, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim1, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio1, d1rzip1, d1rzip2 part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E |
Domain d1s78c2: 1s78 C:108-214 [98625] Other proteins in same PDB: d1s78a1, d1s78a2, d1s78a3, d1s78a4, d1s78b1, d1s78b2, d1s78b3, d1s78b4, d1s78c1, d1s78d1, d1s78d2, d1s78e1, d1s78f1, d1s78f2 |
Domain d1s78e2: 1s78 E:108-214 [98629] Other proteins in same PDB: d1s78a1, d1s78a2, d1s78a3, d1s78a4, d1s78b1, d1s78b2, d1s78b3, d1s78b4, d1s78c1, d1s78d1, d1s78d2, d1s78e1, d1s78f1, d1s78f2 part of anti-ERBb2 Fab Pertuzumab complexed with man, nag |
Domain d1ucbl2: 1ucb L:109-214 [21132] Other proteins in same PDB: d1ucbh1, d1ucbh2, d1ucbl1 part of humanized Fab CBR96 complexed with so4 |
Domain d1uwel2: 1uwe L:108-212 [100106] Other proteins in same PDB: d1uweh1, d1uweh2, d1uwel1, d1uweu1, d1uwev1, d1uwev2, d1uwex1, d1uwey1, d1uwey2 |
Domain d1uweu2: 1uwe U:108-212 [100108] Other proteins in same PDB: d1uweh1, d1uweh2, d1uwel1, d1uweu1, d1uwev1, d1uwev2, d1uwex1, d1uwey1, d1uwey2 |
Domain d1uwex2: 1uwe X:108-212 [100112] Other proteins in same PDB: d1uweh1, d1uweh2, d1uwel1, d1uweu1, d1uwev1, d1uwev2, d1uwex1, d1uwey1, d1uwey2 part of catalytic Fab 14d9 |
Domain d1vgel2: 1vge L:108-214 [21126] Other proteins in same PDB: d1vgeh1, d1vgeh2, d1vgel1 part of humanized Fab TR1.9 |
Domain d2f5al2: 2f5a L:108-213 [88505] Other proteins in same PDB: d2f5ah1, d2f5ah2, d2f5al1 part of HIV-1 neutralizing Fab 2F5 |
Domain d2f5bl2: 2f5b L:108-214 [88509] Other proteins in same PDB: d2f5bh1, d2f5bh2, d2f5bl1 part of HIV-1 neutralizing Fab 2F5 |
Domain d2fgwl2: 2fgw L:109-214 [20956] Other proteins in same PDB: d2fgwh1, d2fgwh2, d2fgwl1 part of humanized Fab H52 |
Domain d2rcsl2: 2rcs L:110-214 [21118] Other proteins in same PDB: d2rcsh1, d2rcsh2, d2rcsl1 part of humanized Fab 48G7 |
Domain d3fcta2: 3fct A:108-213 [21366] Other proteins in same PDB: d3fcta1, d3fctb1, d3fctb2, d3fctc1, d3fctd1, d3fctd2 |
Domain d3fctc2: 3fct C:108-213 [21368] Other proteins in same PDB: d3fcta1, d3fctb1, d3fctb2, d3fctc1, d3fctd1, d3fctd2 part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; mature antibody complexed with ca, cd, mg, mmp, na |
Timeline for Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] from b.1.1.2 Immunoglobulin light chain kappa constant domain, CL-kappa: