Lineage for Species: Human (Homo sapiens)

  1. Root: SCOP 1.65
  2. 287094Class b: All beta proteins [48724] (126 folds)
  3. 287095Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (20 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 287096Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (4 families) (S)
  5. 288543Family b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) [48942] (22 proteins)
  6. 289615Protein Immunoglobulin light chain kappa constant domain, CL-kappa [88566] (3 species)
  7. 289616Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] [88569] (62 PDB entries)
    including humanized antibodies (chimeric proteins with human constant domains)

PDB entries in Species: Human (Homo sapiens):

  1. Domain(s) for 1a4j:
    1. 289649Domain d1a4ja2: 1a4j A:113-217 [21244]
      Other proteins in same PDB: d1a4ja1, d1a4jb1, d1a4jb2, d1a4jh1, d1a4jh2, d1a4jl1
      part of humanized Diels-Alder catalytic Fab
    2. 289650Domain d1a4jl2: 1a4j L:113-217 [21242]
      Other proteins in same PDB: d1a4ja1, d1a4jb1, d1a4jb2, d1a4jh1, d1a4jh2, d1a4jl1
  2. Domain(s) for 1a4k:
    1. 289657Domain d1a4ka2: 1a4k A:113-211 [21248]
      Other proteins in same PDB: d1a4ka1, d1a4kb1, d1a4kb2, d1a4kh1, d1a4kh2, d1a4kl1
      part of humanized Diels-Alder catalytic Fab
      complexed with cd, fra
    2. 289658Domain d1a4kl2: 1a4k L:113-212 [21246]
      Other proteins in same PDB: d1a4ka1, d1a4kb1, d1a4kb2, d1a4kh1, d1a4kh2, d1a4kl1
  3. Domain(s) for 1ad0:
    1. 289651Domain d1ad0a2: 1ad0 A:108-213 [21154]
      Other proteins in same PDB: d1ad0a1, d1ad0b1, d1ad0b2, d1ad0c1, d1ad0d1, d1ad0d2
    2. 289652Domain d1ad0c2: 1ad0 C:108-213 [21156]
      Other proteins in same PDB: d1ad0a1, d1ad0b1, d1ad0b2, d1ad0c1, d1ad0d1, d1ad0d2
      part of humanized Fab A5B7
  4. Domain(s) for 1ad9:
    1. 289680Domain d1ad9a2: 1ad9 A:108-213 [21226]
      Other proteins in same PDB: d1ad9a1, d1ad9b1, d1ad9b2, d1ad9h1, d1ad9h2, d1ad9l1
      part of humanized Fab CTM01
      complexed with so4
    2. 289681Domain d1ad9l2: 1ad9 L:108-213 [21224]
      Other proteins in same PDB: d1ad9a1, d1ad9b1, d1ad9b2, d1ad9h1, d1ad9h2, d1ad9l1
  5. Domain(s) for 1aj7:
  6. Domain(s) for 1axs:
    1. 289675Domain d1axsa2: 1axs A:108-211 [21216]
      Other proteins in same PDB: d1axsa1, d1axsb1, d1axsb2, d1axsh1, d1axsh2, d1axsl1
      part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28
      complexed with cd, hop
    2. 289676Domain d1axsl2: 1axs L:108-211 [21214]
      Other proteins in same PDB: d1axsa1, d1axsb1, d1axsb2, d1axsh1, d1axsh2, d1axsl1
  7. Domain(s) for 1b2w:
  8. Domain(s) for 1b4j:
  9. Domain(s) for 1b6d:
    1. 289665Domain d1b6da2: 1b6d A:108-212 [21510]
      Other proteins in same PDB: d1b6da1, d1b6db1
    2. 289666Domain d1b6db2: 1b6d B:108-212 [21511]
      Other proteins in same PDB: d1b6da1, d1b6db1
      part of Bence-Jones protein DEL
  10. Domain(s) for 1bbj:
  11. Domain(s) for 1bey:
  12. Domain(s) for 1bj1:
    1. 289643Domain d1bj1j2: 1bj1 J:108-213 [21316]
      Other proteins in same PDB: d1bj1h1, d1bj1h2, d1bj1j1, d1bj1k1, d1bj1k2, d1bj1l1, d1bj1v_, d1bj1w_
      part of humanized Fab-12 neutralizing VEGF
      complexed with so4
    2. 289644Domain d1bj1l2: 1bj1 L:108-213 [21314]
      Other proteins in same PDB: d1bj1h1, d1bj1h2, d1bj1j1, d1bj1k1, d1bj1k2, d1bj1l1, d1bj1v_, d1bj1w_
  13. Domain(s) for 1bz7:
  14. Domain(s) for 1c5b:
  15. Domain(s) for 1c5c:
  16. Domain(s) for 1ce1:
  17. Domain(s) for 1cly:
  18. Domain(s) for 1cz8:
    1. 289654Domain d1cz8l2: 1cz8 L:108-213 [21318]
      Other proteins in same PDB: d1cz8h1, d1cz8h2, d1cz8l1, d1cz8v_, d1cz8w_, d1cz8x1, d1cz8y1, d1cz8y2
    2. 289655Domain d1cz8x2: 1cz8 X:108-213 [21320]
      Other proteins in same PDB: d1cz8h1, d1cz8h2, d1cz8l1, d1cz8v_, d1cz8w_, d1cz8x1, d1cz8y1, d1cz8y2
      part of humanized Fab-12 neutralizing VEGF; affinity matured
      complexed with so4; mutant
  19. Domain(s) for 1d5b:
    1. 289690Domain d1d5ba2: 1d5b A:108-211 [21220]
      Other proteins in same PDB: d1d5ba1, d1d5bb1, d1d5bb2, d1d5bh1, d1d5bh2, d1d5bl1
      part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28
    2. 289691Domain d1d5bl2: 1d5b L:108-211 [21218]
      Other proteins in same PDB: d1d5ba1, d1d5bb1, d1d5bb2, d1d5bh1, d1d5bh2, d1d5bl1
  20. Domain(s) for 1d5i:
  21. Domain(s) for 1d6v:
  22. Domain(s) for 1dee:
    1. 289667Domain d1deea2: 1dee A:108-214 [21408]
      Other proteins in same PDB: d1deea1, d1deeb1, d1deeb2, d1deec1, d1deed1, d1deed2, d1deee1, d1deef1, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_
    2. 289668Domain d1deec2: 1dee C:1108-1214 [21410]
      Other proteins in same PDB: d1deea1, d1deeb1, d1deeb2, d1deec1, d1deed1, d1deed2, d1deee1, d1deef1, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_
    3. 289669Domain d1deee2: 1dee E:2108-2214 [21412]
      Other proteins in same PDB: d1deea1, d1deeb1, d1deeb2, d1deec1, d1deed1, d1deed2, d1deee1, d1deef1, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_
      part of IgM RF 2A2
  23. Domain(s) for 1dfb:
  24. Domain(s) for 1dn0:
    1. 289637Domain d1dn0a2: 1dn0 A:108-215 [20934]
      Other proteins in same PDB: d1dn0a1, d1dn0b1, d1dn0b2, d1dn0c1, d1dn0d1, d1dn0d2
    2. 289638Domain d1dn0c2: 1dn0 C:108-215 [20936]
      Other proteins in same PDB: d1dn0a1, d1dn0b1, d1dn0b2, d1dn0c1, d1dn0d1, d1dn0d2
      part of Fab Kau cold agglutinin IgM
  25. Domain(s) for 1fl5:
    1. 289635Domain d1fl5a2: 1fl5 A:108-212 [65016]
      Other proteins in same PDB: d1fl5a1, d1fl5b1, d1fl5b2, d1fl5h1, d1fl5h2, d1fl5l1
      part of humanized catalytic Fab Fab 28b4 with a sulfide oxidase activity
      complexed with so4; mutant
    2. 289636Domain d1fl5l2: 1fl5 L:108-212 [65022]
      Other proteins in same PDB: d1fl5a1, d1fl5b1, d1fl5b2, d1fl5h1, d1fl5h2, d1fl5l1
  26. Domain(s) for 1fl6:
    1. 289677Domain d1fl6a2: 1fl6 A:108-212 [65024]
      Other proteins in same PDB: d1fl6a1, d1fl6b1, d1fl6b2, d1fl6h1, d1fl6h2, d1fl6l1
      part of humanized catalytic Fab Fab 28b4 with a sulfide oxidase activity
      complexed with aah; mutant
    2. 289678Domain d1fl6l2: 1fl6 L:108-212 [65030]
      Other proteins in same PDB: d1fl6a1, d1fl6b1, d1fl6b2, d1fl6h1, d1fl6h2, d1fl6l1
  27. Domain(s) for 1fvd:
    1. 289645Domain d1fvda2: 1fvd A:108-214 [20962]
      Other proteins in same PDB: d1fvda1, d1fvdb1, d1fvdb2, d1fvdc1, d1fvdd1, d1fvdd2
    2. 289646Domain d1fvdc2: 1fvd C:108-214 [20964]
      Other proteins in same PDB: d1fvda1, d1fvdb1, d1fvdb2, d1fvdc1, d1fvdd1, d1fvdd2
      part of humanized Fab 4D5, herceptin
  28. Domain(s) for 1fve:
    1. 289662Domain d1fvea2: 1fve A:108-214 [20966]
      Other proteins in same PDB: d1fvea1, d1fveb1, d1fveb2, d1fvec1, d1fved1, d1fved2
    2. 289663Domain d1fvec2: 1fve C:108-214 [20968]
      Other proteins in same PDB: d1fvea1, d1fveb1, d1fveb2, d1fvec1, d1fved1, d1fved2
      part of humanized Fab 4D5, herceptin
  29. Domain(s) for 1g9m:
  30. Domain(s) for 1g9n:
  31. Domain(s) for 1gaf:
  32. Domain(s) for 1gc1:
  33. Domain(s) for 1hez:
    1. 289671Domain d1heza2: 1hez A:108-214 [60984]
      Other proteins in same PDB: d1heza1, d1hezb1, d1hezb2, d1hezc1, d1hezd1, d1hezd2, d1heze_
    2. 289672Domain d1hezc2: 1hez C:108-214 [60988]
      Other proteins in same PDB: d1heza1, d1hezb1, d1hezb2, d1hezc1, d1hezd1, d1hezd2, d1heze_
      part of IgM RF 2A2
      complexed with imd
  34. Domain(s) for 1hkl:
  35. Domain(s) for 1hzh:
    1. 289685Domain d1hzhl2: 1hzh L:108-214 [61446]
      Other proteins in same PDB: d1hzhh1, d1hzhh2, d1hzhh3, d1hzhh4, d1hzhk1, d1hzhk2, d1hzhk3, d1hzhk4, d1hzhl1, d1hzhm1
    2. 289686Domain d1hzhm2: 1hzh M:108-214 [61448]
      Other proteins in same PDB: d1hzhh1, d1hzhh2, d1hzhh3, d1hzhh4, d1hzhk1, d1hzhk2, d1hzhk3, d1hzhk4, d1hzhl1, d1hzhm1
      part of intact IgG B12 antibody
      complexed with fuc, gal, man, nag
  36. Domain(s) for 1i7z:
    1. 289647Domain d1i7za2: 1i7z A:108-214 [61920]
      Other proteins in same PDB: d1i7za1, d1i7zb1, d1i7zb2, d1i7zc1, d1i7zd1, d1i7zd2
    2. 289648Domain d1i7zc2: 1i7z C:108-214 [61924]
      Other proteins in same PDB: d1i7za1, d1i7zb1, d1i7zb2, d1i7zc1, d1i7zd1, d1i7zd2
      part of humanized Fab GNC92H2
      complexed with coc
  37. Domain(s) for 1i9r:
    1. 289696Domain d1i9rl2: 1i9r L:112-215 [71156]
      Other proteins in same PDB: d1i9ra_, d1i9rb_, d1i9rc_, d1i9rh1, d1i9rh2, d1i9rk1, d1i9rk2, d1i9rl1, d1i9rm1, d1i9rx1, d1i9rx2, d1i9ry1
    2. 289697Domain d1i9rm2: 1i9r M:112-215 [71158]
      Other proteins in same PDB: d1i9ra_, d1i9rb_, d1i9rc_, d1i9rh1, d1i9rh2, d1i9rk1, d1i9rk2, d1i9rl1, d1i9rm1, d1i9rx1, d1i9rx2, d1i9ry1
    3. 289698Domain d1i9ry2: 1i9r Y:112-215 [71162]
      Other proteins in same PDB: d1i9ra_, d1i9rb_, d1i9rc_, d1i9rh1, d1i9rh2, d1i9rk1, d1i9rk2, d1i9rl1, d1i9rm1, d1i9rx1, d1i9rx2, d1i9ry1
      part of Fab 5C8 against C40 ligand
      complexed with zn
  38. Domain(s) for 1iqd:
  39. Domain(s) for 1it9:
  40. Domain(s) for 1jps:
  41. Domain(s) for 1jpt:
  42. Domain(s) for 1l7i:
  43. Domain(s) for 1mhp:
  44. Domain(s) for 1mim:
  45. Domain(s) for 1n7m:
  46. Domain(s) for 1n8z:
  47. Domain(s) for 1ngw:
    1. 289706Domain d1ngwa2: 1ngw A:108-213 [80489]
      Other proteins in same PDB: d1ngwa1, d1ngwb1, d1ngwb2, d1ngwh1, d1ngwh2, d1ngwl1
    2. 289707Domain d1ngwl2: 1ngw L:108-213 [80495]
      Other proteins in same PDB: d1ngwa1, d1ngwb1, d1ngwb2, d1ngwh1, d1ngwh2, d1ngwl1
      part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric affinity matured antibody
      complexed with mmp
  48. Domain(s) for 1ngx:
    1. 289702Domain d1ngxa2: 1ngx A:108-213 [85703]
      Other proteins in same PDB: d1ngxa1, d1ngxb1, d1ngxb2, d1ngxh1, d1ngxh2, d1ngxl1
    2. 289703Domain d1ngxl2: 1ngx L:108-213 [85709]
      Other proteins in same PDB: d1ngxa1, d1ngxb1, d1ngxb2, d1ngxh1, d1ngxh2, d1ngxl1
      part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric germline antibody
      complexed with jef
  49. Domain(s) for 1ngy:
  50. Domain(s) for 1ngz:
  51. Domain(s) for 1om3:
    1. 289639Domain d1om3l2: 1om3 L:108-213 [87064]
      Other proteins in same PDB: d1om3h1, d1om3h2, d1om3k1, d1om3k2, d1om3l1, d1om3m1
    2. 289640Domain d1om3m2: 1om3 M:108-213 [87066]
      Other proteins in same PDB: d1om3h1, d1om3h2, d1om3k1, d1om3k2, d1om3l1, d1om3m1
      part of Fab 2G12
  52. Domain(s) for 1op3:
    1. 289622Domain d1op3k2: 1op3 K:108-212 [87211]
      Other proteins in same PDB: d1op3h1, d1op3h2, d1op3k1, d1op3l1, d1op3m1, d1op3m2
    2. 289623Domain d1op3l2: 1op3 L:108-212 [87213]
      Other proteins in same PDB: d1op3h1, d1op3h2, d1op3k1, d1op3l1, d1op3m1, d1op3m2
      part of Fab 2G12
      complexed with box, man
  53. Domain(s) for 1op5:
    1. 289699Domain d1op5k2: 1op5 K:108-213 [87219]
      Other proteins in same PDB: d1op5h1, d1op5h2, d1op5k1, d1op5l1, d1op5m1, d1op5m2
    2. 289700Domain d1op5l2: 1op5 L:108-213 [87221]
      Other proteins in same PDB: d1op5h1, d1op5h2, d1op5k1, d1op5l1, d1op5m1, d1op5m2
      part of Fab 2G12
      complexed with man, nag
  54. Domain(s) for 1pkq:
    1. 289693Domain d1pkqa2: 1pkq A:108-213 [88149]
      Other proteins in same PDB: d1pkqa1, d1pkqb1, d1pkqb2, d1pkqe_, d1pkqf1, d1pkqg1, d1pkqg2, d1pkqj_
    2. 289694Domain d1pkqf2: 1pkq F:108-210 [88154]
      Other proteins in same PDB: d1pkqa1, d1pkqb1, d1pkqb2, d1pkqe_, d1pkqf1, d1pkqg1, d1pkqg2, d1pkqj_
      part of humanized Fab 8-18c5
  55. Domain(s) for 1qlr:
    1. 289687Domain d1qlra2: 1qlr A:108-214 [20938]
      Other proteins in same PDB: d1qlra1, d1qlrb1, d1qlrb2, d1qlrc1, d1qlrd1, d1qlrd2
    2. 289688Domain d1qlrc2: 1qlr C:108-214 [20940]
      Other proteins in same PDB: d1qlra1, d1qlrb1, d1qlrb2, d1qlrc1, d1qlrd1, d1qlrd2
      part of Fab Kau cold agglutinin IgM
      complexed with fuc, nag
  56. Domain(s) for 1ucb:
  57. Domain(s) for 1vge:
  58. Domain(s) for 2f5a:
  59. Domain(s) for 2f5b:
  60. Domain(s) for 2fgw:
  61. Domain(s) for 2rcs:
  62. Domain(s) for 3fct:
    1. 289641Domain d3fcta2: 3fct A:108-213 [21366]
      Other proteins in same PDB: d3fcta1, d3fctb1, d3fctb2, d3fctc1, d3fctd1, d3fctd2
    2. 289642Domain d3fctc2: 3fct C:108-213 [21368]
      Other proteins in same PDB: d3fcta1, d3fctb1, d3fctb2, d3fctc1, d3fctd1, d3fctd2
      part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; mature antibody
      complexed with ca, cd, mg, mmp, na

More info for Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] from b.1.1.2 Immunoglobulin light chain kappa constant domain, CL-kappa

Timeline for Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] from b.1.1.2 Immunoglobulin light chain kappa constant domain, CL-kappa: