PDB entries in Species: Mouse (Mus musculus), cluster 2.2:

1. Domain(s) for 1ar1:

   • Domain d1ar1c_: 1ar1 C: [20207] Other proteins in same PDB: d1ar1a_, d1ar1b1, d1ar1b2, d1ar1d_ part of Fv against Paracoccus denitrificans cytochrome c oxidase complexed with ca, cu, hea, lda, mg

2. Domain(s) for 1bfv:

   • Domain d1bfvh_: 1bfv H: [20163] Other proteins in same PDB: d1bfvl_ part of Fv 4155 complexed with stg, zn

3. Domain(s) for 1bln:

   1. Domain d1blnb1: 1bln B:1-113 [20331] Other proteins in same PDB: d1blna1, d1blna2, d1blnb2, d1blnc1, d1blnc2, d1blnd2

   2. Domain d1blnd1: 1bln D:1-113 [20333] Other proteins in same PDB: d1blna1, d1blna2, d1blnb2, d1blnc1, d1blnc2, d1blnd2 part of anti-P-glycoprotein Fab MRK-16

4. Domain(s) for 1bm3:

   • Domain d1bm3h1: 1bm3 H:1-125 [20067] Other proteins in same PDB: d1bm3h2, d1bm3l1, d1bm3l2 part of anti-integrin Fab OPG2

5. Domain(s) for 1bz7:

   • Domain d1bz7b1: 1bz7 B:1-122 [20403] Other proteins in same PDB: d1bz7a1, d1bz7a2, d1bz7b2 part of humanized Fab R24 from murine ascites

6. Domain(s) for 1cfv:

   • Domain d1cfvh_: 1cfv H: [20161] Other proteins in same PDB: d1cfvl_ part of Fv 4155 complexed with e3g, zn

7. Domain(s) for 1cly:

   • Domain d1clyh1: 1cly H:1-113 [20103] Other proteins in same PDB: d1clyh2, d1clyl1, d1clyl2 part of humanized Fab CBR96 complexed with fuc, gal, nag, non

8. Domain(s) for 1clz:

   • Domain d1clzh1: 1clz H:1-113 [20105] Other proteins in same PDB: d1clzh2, d1clzl1, d1clzl2 part of Fab MBR96 complexed with fuc, gal, nag, non

9. Domain(s) for 1dsf:

   • Domain d1dsfh_: 1dsf H: [20247] Other proteins in same PDB: d1dsfl_ part of anticancer Fv B1; disulfide-stabilized mutant

10. Domain(s) for 1ejo:

    • Domain d1ejoh1: 1ejo H:2501-2619 [20429] Other proteins in same PDB: d1ejoh2, d1ejol1, d1ejol2 part of anti-FMDV Fab 4C4

11. Domain(s) for 1f4w:

    • Domain d1f4wh1: 1f4w H:1-117 [20453] Other proteins in same PDB: d1f4wh2, d1f4wl1, d1f4wl2 part of anti-carbohydrate Fab S-20-4

12. Domain(s) for 1f4x:

    • Domain d1f4xh1: 1f4x H:1-117 [20451] Other proteins in same PDB: d1f4xh2, d1f4xl1, d1f4xl2 part of anti-carbohydrate Fab S-20-4 complexed with mgs

13. Domain(s) for 1f4y:

    • Domain d1f4yh1: 1f4y H:1-117 [20455] Other proteins in same PDB: d1f4yh2, d1f4yl1, d1f4yl2 part of anti-carbohydrate Fab S-20-4 complexed with mgu

14. Domain(s) for 1fh5:

    • Domain d1fh5h1: 1fh5 H:4-120 [20465] Other proteins in same PDB: d1fh5h2, d1fh5l1, d1fh5l2 part of Fab MAK33; conflict: annotated in PDB as human protein

15. Domain(s) for 1frg:

    • Domain d1frgh1: 1frg H:218-336 [19925] Other proteins in same PDB: d1frgh2, d1frgl1, d1frgl2 part of Fab 26/9 complexed with nh2

16. Domain(s) for 1h0d:

    • Domain d1h0db1: 1h0d B:1-113 [83427] Other proteins in same PDB: d1h0da1, d1h0da2, d1h0db2, d1h0dc_ part of anti-angiogenin FAB; conflict: annotated in PDB as human complexed with gol, pca, so4

17. Domain(s) for 1h3p:

    • Domain d1h3ph1: 1h3p H:1-113 [76648] Other proteins in same PDB: d1h3ph2, d1h3pl1, d1h3pl2 part of anti-hepatitis B Fab (against PRES1 region)

18. Domain(s) for 1hil:

    1. Domain d1hilb1: 1hil B:1-112 [19787] Other proteins in same PDB: d1hila1, d1hila2, d1hilb2, d1hilc1, d1hilc2, d1hild2

    2. Domain d1hild1: 1hil D:1-112 [19789] Other proteins in same PDB: d1hila1, d1hila2, d1hilb2, d1hilc1, d1hilc2, d1hild2 part of Fab 17/9

19. Domain(s) for 1him:

    1. Domain d1himl1: 1him L:1-112 [19792] Other proteins in same PDB: d1himh1, d1himh2, d1himj1, d1himj2, d1himl2, d1himm2

    2. Domain d1himm1: 1him M:1-112 [19794] Other proteins in same PDB: d1himh1, d1himh2, d1himj1, d1himj2, d1himl2, d1himm2 part of Fab 17/9; chain identifiers are mixed up complexed with nh2

20. Domain(s) for 1hin:

    • Domain d1hinh1: 1hin H:1-112 [19797] Other proteins in same PDB: d1hinh2, d1hinl1, d1hinl2 part of Fab 17/9

21. Domain(s) for 1i8i:

    • Domain d1i8ib_: 1i8i B: [71129] Other proteins in same PDB: d1i8ia_ part of dsFv MR1; complex with a EGFR-VIII peptide mutant

22. Domain(s) for 1i8k:

    • Domain d1i8kb_: 1i8k B: [71131] Other proteins in same PDB: d1i8ka_ part of dsFv MR1; complex with a EGFR-VIII peptide mutant

23. Domain(s) for 1ifh:

    • Domain d1ifhh1: 1ifh H:1-112 [19791] Other proteins in same PDB: d1ifhh2, d1ifhl1, d1ifhl2 part of Fab 17/9

24. Domain(s) for 1igc:

    • Domain d1igch1: 1igc H:1-119 [20047] Other proteins in same PDB: d1igca_, d1igch2, d1igcl1, d1igcl2 part of Fab MoPC21

25. Domain(s) for 1igf:

    1. Domain d1igfh1: 1igf H:1-113 [19813] Other proteins in same PDB: d1igfh2, d1igfj2, d1igfl1, d1igfl2, d1igfm1, d1igfm2

    2. Domain d1igfj1: 1igf J:1-113 [19815] Other proteins in same PDB: d1igfh2, d1igfj2, d1igfl1, d1igfl2, d1igfm1, d1igfm2 part of Fab B13I2 complexed with nag

26. Domain(s) for 1igt:

    1. Domain d1igtb1: 1igt B:1-114 [19765] Other proteins in same PDB: d1igta1, d1igta2, d1igtb2, d1igtb3, d1igtb4, d1igtc1, d1igtc2, d1igtd2, d1igtd3, d1igtd4

    2. Domain d1igtd1: 1igt D:1-114 [19767] Other proteins in same PDB: d1igta1, d1igta2, d1igtb2, d1igtb3, d1igtb4, d1igtc1, d1igtc2, d1igtd2, d1igtd3, d1igtd4 part of intact IgG2a antibody Mab231 complexed with fuc, gal, man, nag

27. Domain(s) for 1ikf:

    • Domain d1ikfh1: 1ikf H:1-126 [20033] Other proteins in same PDB: d1ikfh2, d1ikfl1, d1ikfl2 part of an anti-cyclosporin A Fab complexed with aba

28. Domain(s) for 1ind:

    • Domain d1indh1: 1ind H:1-114 [19839] Other proteins in same PDB: d1indh2, d1indl1, d1indl2 part of Fab Cha255 complexed with eot, in

29. Domain(s) for 1ine:

    • Domain d1ineh1: 1ine H:1-114 [19841] Other proteins in same PDB: d1ineh2, d1inel1, d1inel2 part of Fab Cha255 complexed with eot, fe

30. Domain(s) for 1kno:

    1. Domain d1knob1: 1kno B:1-119 [20009] Other proteins in same PDB: d1knoa1, d1knoa2, d1knob2, d1knoc1, d1knoc2, d1knod2, d1knoe1, d1knoe2, d1knof2

    2. Domain d1knod1: 1kno D:1-119 [20011] Other proteins in same PDB: d1knoa1, d1knoa2, d1knob2, d1knoc1, d1knoc2, d1knod2, d1knoe1, d1knoe2, d1knof2

    3. Domain d1knof1: 1kno F:1-119 [20013] Other proteins in same PDB: d1knoa1, d1knoa2, d1knob2, d1knoc1, d1knoc2, d1knod2, d1knoe1, d1knoe2, d1knof2 part of Fab CNJ206 complexed with pnp, zn

31. Domain(s) for 1mf2:

    1. Domain d1mf2h1: 1mf2 H:1-113 [20175] Other proteins in same PDB: d1mf2h2, d1mf2l1, d1mf2l2, d1mf2m1, d1mf2m2, d1mf2n2

    2. Domain d1mf2n1: 1mf2 N:1-113 [20177] Other proteins in same PDB: d1mf2h2, d1mf2l1, d1mf2l2, d1mf2m1, d1mf2m2, d1mf2n2 part of Fab F11.2.32 against HIV-1 protease

32. Domain(s) for 1mqk:

    • Domain d1mqkh_: 1mqk H: [85053] Other proteins in same PDB: d1mqkl_ part of Fv against Paracoccus denitrificans cytochrome c oxidase

33. Domain(s) for 1opg:

    • Domain d1opgh1: 1opg H:1-125 [20069] Other proteins in same PDB: d1opgh2, d1opgl1, d1opgl2 part of anti-integrin Fab OPG2

34. Domain(s) for 1ots:

    1. Domain d1otsc1: 1ots C:2-121 [87417] Other proteins in same PDB: d1otsa_, d1otsb_, d1otsc2, d1otsd1, d1otsd2, d1otse2, d1otsf1, d1otsf2

    2. Domain d1otse1: 1ots E:2-121 [87421] Other proteins in same PDB: d1otsa_, d1otsb_, d1otsc2, d1otsd1, d1otsd2, d1otse2, d1otsf1, d1otsf2 part of anti-CLC chloride channel Fab complexed with cl

35. Domain(s) for 1ott:

    1. Domain d1ottc1: 1ott C:2-121 [87427] Other proteins in same PDB: d1otta_, d1ottb_, d1ottc2, d1ottd1, d1ottd2, d1otte2, d1ottf1, d1ottf2

    2. Domain d1otte1: 1ott E:2-121 [87431] Other proteins in same PDB: d1otta_, d1ottb_, d1ottc2, d1ottd1, d1ottd2, d1otte2, d1ottf1, d1ottf2 part of anti-CLC chloride channel Fab complexed with cl; mutant

36. Domain(s) for 1otu:

    1. Domain d1otuc1: 1otu C:2-121 [87437] Other proteins in same PDB: d1otua_, d1otub_, d1otuc2, d1otud1, d1otud2, d1otue2, d1otuf1, d1otuf2

    2. Domain d1otue1: 1otu E:2-121 [87441] Other proteins in same PDB: d1otua_, d1otub_, d1otuc2, d1otud1, d1otud2, d1otue2, d1otuf1, d1otuf2 part of anti-CLC chloride channel Fab complexed with cl; mutant

37. Domain(s) for 1qfw:

    • Domain d1qfwi_: 1qfw I: [20437] Other proteins in same PDB: d1qfwa_, d1qfwb_, d1qfwl_, d1qfwm_ part of anti-[gonadotropin beta subunit] Fv complexed with nag

38. Domain(s) for 1qkz:

    • Domain d1qkzh1: 1qkz H:1-113 [20137] Other proteins in same PDB: d1qkza_, d1qkzh2, d1qkzl1, d1qkzl2 part of Fab MN14C11.6

39. Domain(s) for 1qle:

    • Domain d1qleh_: 1qle H: [20209] Other proteins in same PDB: d1qlea_, d1qleb1, d1qleb2, d1qlec_, d1qled_, d1qlel_ part of Fv against Paracoccus denitrificans cytochrome c oxidase

40. Domain(s) for 1r24:

    1. Domain d1r24b1: 1r24 B:1-122 [20405] Other proteins in same PDB: d1r24a1, d1r24a2, d1r24b2, d1r24c1, d1r24c2, d1r24d2

    2. Domain d1r24d1: 1r24 D:1-122 [20407] Other proteins in same PDB: d1r24a1, d1r24a2, d1r24b2, d1r24c1, d1r24c2, d1r24d2 part of humanized Fab R24 from murine ascites

41. Domain(s) for 1ucb:

    • Domain d1ucbh1: 1ucb H:1-113 [20101] Other proteins in same PDB: d1ucbh2, d1ucbl1, d1ucbl2 part of humanized Fab CBR96 complexed with so4

42. Domain(s) for 2bfv:

    • Domain d2bfvh_: 2bfv H: [20165] Other proteins in same PDB: d2bfvl_ part of Fv 4155 complexed with stg

43. Domain(s) for 2fbj:

    • Domain d2fbjh1: 2fbj H:1-118 [19851] Other proteins in same PDB: d2fbjh2, d2fbjl1, d2fbjl2 part of Fab J539 complexed with fuc, nag, zn

44. Domain(s) for 2gfb:

    1. Domain d2gfbb1: 2gfb B:1-119 [19993] Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2

    2. Domain d2gfbd1: 2gfb D:1-119 [19995] Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2

    3. Domain d2gfbf1: 2gfb F:1-119 [19997] Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2

    4. Domain d2gfbh1: 2gfb H:1-119 [19999] Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2

    5. Domain d2gfbj1: 2gfb J:1-119 [20001] Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2

    6. Domain d2gfbl1: 2gfb L:1-119 [20003] Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2

    7. Domain d2gfbn1: 2gfb N:1-119 [20005] Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2

    8. Domain d2gfbp1: 2gfb P:1-119 [20007] Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2 part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region

45. Domain(s) for 2h1p:

    • Domain d2h1ph1: 2h1p H:301-420 [20191] Other proteins in same PDB: d2h1ph2, d2h1pl1, d2h1pl2 part of polysaccharide binding antibody 2H1

46. Domain(s) for 2hrp:

    1. Domain d2hrph1: 2hrp H:1-113 [20171] Other proteins in same PDB: d2hrph2, d2hrpl1, d2hrpl2, d2hrpm1, d2hrpm2, d2hrpn2

    2. Domain d2hrpn1: 2hrp N:1-113 [20173] Other proteins in same PDB: d2hrph2, d2hrpl1, d2hrpl2, d2hrpm1, d2hrpm2, d2hrpn2 part of Fab F11.2.32 against HIV-1 protease

47. Domain(s) for 2igf:

    • Domain d2igfh1: 2igf H:1-113 [19817] Other proteins in same PDB: d2igfh2, d2igfl1, d2igfl2 part of Fab B13I2 complexed with nag

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Timeline for Species Mouse (Mus musculus), cluster 2.2 [TaxId:10090] from b.1.1.1 Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH:

• Species Mouse (Mus musculus), cluster 2.2 [TaxId:10090] from b.1.1.1 Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH is new in SCOP 1.65
  
• Species Mouse (Mus musculus), cluster 2.2 [TaxId:10090] from b.1.1.1 Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH appears in SCOP 1.67
  
• Species Mouse (Mus musculus), cluster 2.2 [TaxId:10090] from b.1.1.1 Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH appears in the current release, SCOPe 2.08