PDB entries in Species: Human (Homo sapiens), cluster 1 [TaxId: 9606]:

1. Domain(s) for 1g9m:

   • Domain d1g9mh1: 1g9m H:1-129 [20263] Other proteins in same PDB: d1g9mc1, d1g9mc2, d1g9mg_, d1g9mh2, d1g9ml1, d1g9ml2 part of HIV-1 neutralizing Fab 17B; binds to the CD4-induced state of gp120 complexed with fuc, ipa, nag, ndg

2. Domain(s) for 1g9n:

   • Domain d1g9nh1: 1g9n H:1-129 [20267] Other proteins in same PDB: d1g9nc1, d1g9nc2, d1g9ng_, d1g9nh2, d1g9nl1, d1g9nl2 part of HIV-1 neutralizing Fab 17B; binds to the CD4-induced state of gp120 complexed with nag, ndg

3. Domain(s) for 1gc1:

   • Domain d1gc1h1: 1gc1 H:1-129 [20265] Other proteins in same PDB: d1gc1c1, d1gc1c2, d1gc1g_, d1gc1h2, d1gc1l1, d1gc1l2 part of HIV-1 neutralizing Fab 17B; binds to the CD4-induced state of gp120 complexed with fuc, nag, ndg

4. Domain(s) for 1hzh:

   1. Domain d1hzhh1: 1hzh H:1-113 [61437] Other proteins in same PDB: d1hzhh2, d1hzhh3, d1hzhh4, d1hzhk2, d1hzhk3, d1hzhk4, d1hzhl1, d1hzhl2, d1hzhm1, d1hzhm2 part of intact IgG B12 antibody complexed with bma, fuc, gal, man, nag

   2. Domain d1hzhk1: 1hzh K:1-113 [61441] Other proteins in same PDB: d1hzhh2, d1hzhh3, d1hzhh4, d1hzhk2, d1hzhk3, d1hzhk4, d1hzhl1, d1hzhl2, d1hzhm1, d1hzhm2 part of intact IgG B12 antibody complexed with bma, fuc, gal, man, nag

5. Domain(s) for 1iqd:

   • Domain d1iqdb1: 1iqd B:1-114 [62646] Other proteins in same PDB: d1iqda1, d1iqda2, d1iqdb2, d1iqdc_ part of intact IgG B12 antibody

6. Domain(s) for 1n0x:

   1. Domain d1n0xh1: 1n0x H:1-113 [91528] Other proteins in same PDB: d1n0xh2, d1n0xk2, d1n0xl1, d1n0xl2, d1n0xm1, d1n0xm2 part of an anti HIV-1 Fab complexed with cxs, gol, k, so4

   2. Domain d1n0xk1: 1n0x K:1-113 [91530] Other proteins in same PDB: d1n0xh2, d1n0xk2, d1n0xl1, d1n0xl2, d1n0xm1, d1n0xm2 part of an anti HIV-1 Fab complexed with cxs, gol, k, so4

7. Domain(s) for 1rhh:

   1. Domain d1rhhb1: 1rhh B:3-113 [97475] Other proteins in same PDB: d1rhha1, d1rhha2, d1rhhb2, d1rhhc1, d1rhhc2, d1rhhd2 part of HIV-1 neutralizing Fab x5

   2. Domain d1rhhd1: 1rhh D:4-113 [97479] Other proteins in same PDB: d1rhha1, d1rhha2, d1rhhb2, d1rhhc1, d1rhhc2, d1rhhd2 part of HIV-1 neutralizing Fab x5

8. Domain(s) for 1rz7:

   • Domain d1rz7h1: 1rz7 H:1-113 [98133] Other proteins in same PDB: d1rz7h2, d1rz7l1, d1rz7l2 part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 48D complexed with gol

9. Domain(s) for 1rz8:

   1. Domain d1rz8b1: 1rz8 B:1-113 [98139] Other proteins in same PDB: d1rz8a1, d1rz8a2, d1rz8b2, d1rz8c1, d1rz8c2, d1rz8d2 part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 17B

   2. Domain d1rz8d1: 1rz8 D:1-113 [98143] Other proteins in same PDB: d1rz8a1, d1rz8a2, d1rz8b2, d1rz8c1, d1rz8c2, d1rz8d2 part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 17B

10. Domain(s) for 1rzf:

    • Domain d1rzfh1: 1rzf H:2-113 [98150] Other proteins in same PDB: d1rzfh2, d1rzfl1, d1rzfl2 part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab E51 complexed with gol, ipa

11. Domain(s) for 1rzg:

    1. Domain d1rzga1: 1rzg A:1-113 [98154] Other proteins in same PDB: d1rzga2, d1rzgb1, d1rzgb2, d1rzgc2, d1rzgd1, d1rzgd2 part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 412D complexed with cys, suc

    2. Domain d1rzgc1: 1rzg C:2-113 [98158] Other proteins in same PDB: d1rzga2, d1rzgb1, d1rzgb2, d1rzgc2, d1rzgd1, d1rzgd2 part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 412D complexed with cys, suc

12. Domain(s) for 1rzi:

    1. Domain d1rzib1: 1rzi B:1-113 [98168] Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2 part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E

    2. Domain d1rzid1: 1rzi D:1-113 [98172] Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2 part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E

    3. Domain d1rzif1: 1rzi F:1-113 [98176] Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2 part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E

    4. Domain d1rzih1: 1rzi H:1-113 [98180] Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2 part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E

    5. Domain d1rzij1: 1rzi J:1-113 [98184] Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2 part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E

    6. Domain d1rzil1: 1rzi L:1-113 [98188] Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2 part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E

    7. Domain d1rzin1: 1rzi N:1-113 [98192] Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2 part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E

    8. Domain d1rzip1: 1rzi P:1-113 [98196] Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2 part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E

13. Domain(s) for 1rzj:

    • Domain d1rzjh1: 1rzj H:1-113 [98201] Other proteins in same PDB: d1rzjc1, d1rzjc2, d1rzjg_, d1rzjh2, d1rzjl1, d1rzjl2 part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 17B complexed with ipa, nag, ndg

14. Domain(s) for 1rzk:

    • Domain d1rzkh1: 1rzk H:1-113 [98208] Other proteins in same PDB: d1rzkc1, d1rzkc2, d1rzkg_, d1rzkh2, d1rzkl1, d1rzkl2 part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 17B complexed with nag, ndg

15. Domain(s) for 1tzg:

    1. Domain d1tzgh1: 1tzg H:1-113 [119396] Other proteins in same PDB: d1tzgh2, d1tzgi2, d1tzgl1, d1tzgl2, d1tzgm1, d1tzgm2 automatically matched to d1hzhh1 complexed with gol

    2. Domain d1tzgi1: 1tzg I:1-113 [119398] Other proteins in same PDB: d1tzgh2, d1tzgi2, d1tzgl1, d1tzgl2, d1tzgm1, d1tzgm2 automatically matched to d1hzhh1 complexed with gol

16. Domain(s) for 1vge:

    • Domain d1vgeh1: 1vge H:1-122 [20095] Other proteins in same PDB: d1vgeh2, d1vgel1, d1vgel2 part of humanized Fab TR1.9

17. Domain(s) for 1yyl:

    1. Domain d1yylh1: 1yyl H:1-113 [124223] Other proteins in same PDB: d1yylg_, d1yylh2, d1yyll1, d1yyll2, d1yylm1, d1yylp_, d1yylq1, d1yylq2, d1yylr2, d1yyls1 automatically matched to d1rz8b1 complexed with nag, ndg

    2. Domain d1yylr1: 1yyl R:1001-1113 [124230] Other proteins in same PDB: d1yylg_, d1yylh2, d1yyll1, d1yyll2, d1yylm1, d1yylp_, d1yylq1, d1yylq2, d1yylr2, d1yyls1 automatically matched to d1rz8b1 complexed with nag, ndg

18. Domain(s) for 1yym:

    1. Domain d1yymh1: 1yym H:1-113 [124233] Other proteins in same PDB: d1yymg_, d1yymh2, d1yyml1, d1yyml2, d1yymm1, d1yymp_, d1yymq1, d1yymq2, d1yymr2, d1yyms1 automatically matched to d1rz8b1 complexed with edo, ipa, nag, ndg

    2. Domain d1yymr1: 1yym R:1001-1113 [124240] Other proteins in same PDB: d1yymg_, d1yymh2, d1yyml1, d1yyml2, d1yymm1, d1yymp_, d1yymq1, d1yymq2, d1yymr2, d1yyms1 automatically matched to d1rz8b1 complexed with edo, ipa, nag, ndg

19. Domain(s) for 2dd8:

    • Domain d2dd8h1: 2dd8 H:9-113 [145073] Other proteins in same PDB: d2dd8h2, d2dd8h3, d2dd8l1, d2dd8l2, d2dd8s1 complexed with nag, po4

20. Domain(s) for 2fx7:

    • Domain d2fx7h1: 2fx7 H:1-113 [134276] Other proteins in same PDB: d2fx7h2, d2fx7l1, d2fx7l2 automatically matched to d1hzhh1 complexed with gol

21. Domain(s) for 2fx8:

    1. Domain d2fx8h1: 2fx8 H:1-113 [134280] Other proteins in same PDB: d2fx8h2, d2fx8i2, d2fx8j2, d2fx8k2, d2fx8l1, d2fx8l2, d2fx8m1, d2fx8m2, d2fx8n1, d2fx8n2, d2fx8o1, d2fx8o2 automatically matched to d1hzhh1

    2. Domain d2fx8i1: 2fx8 I:1-113 [134282] Other proteins in same PDB: d2fx8h2, d2fx8i2, d2fx8j2, d2fx8k2, d2fx8l1, d2fx8l2, d2fx8m1, d2fx8m2, d2fx8n1, d2fx8n2, d2fx8o1, d2fx8o2 automatically matched to d1hzhh1

    3. Domain d2fx8j1: 2fx8 J:1-113 [134284] Other proteins in same PDB: d2fx8h2, d2fx8i2, d2fx8j2, d2fx8k2, d2fx8l1, d2fx8l2, d2fx8m1, d2fx8m2, d2fx8n1, d2fx8n2, d2fx8o1, d2fx8o2 automatically matched to d1hzhh1

    4. Domain d2fx8k1: 2fx8 K:1-113 [134286] Other proteins in same PDB: d2fx8h2, d2fx8i2, d2fx8j2, d2fx8k2, d2fx8l1, d2fx8l2, d2fx8m1, d2fx8m2, d2fx8n1, d2fx8n2, d2fx8o1, d2fx8o2 automatically matched to d1hzhh1

22. Domain(s) for 2fx9:

    1. Domain d2fx9h1: 2fx9 H:1-113 [134296] Other proteins in same PDB: d2fx9h2, d2fx9i2, d2fx9l1, d2fx9l2, d2fx9m1, d2fx9m2 automatically matched to d1hzhh1

    2. Domain d2fx9i1: 2fx9 I:1-113 [134298] Other proteins in same PDB: d2fx9h2, d2fx9i2, d2fx9l1, d2fx9l2, d2fx9m1, d2fx9m2 automatically matched to d1hzhh1

23. Domain(s) for 2g75:

    1. Domain d2g75a1: 2g75 A:9-113 [147086] Other proteins in same PDB: d2g75a2, d2g75a3, d2g75b1, d2g75b2, d2g75c2, d2g75c3, d2g75d1, d2g75d2 automated match to d2dd8h1

    2. Domain d2g75c1: 2g75 C:9-113 [147090] Other proteins in same PDB: d2g75a2, d2g75a3, d2g75b1, d2g75b2, d2g75c2, d2g75c3, d2g75d1, d2g75d2 automated match to d2dd8h1

24. Domain(s) for 2i5y:

    1. Domain d2i5yh1: 2i5y H:1-113 [137072] Other proteins in same PDB: d2i5yg2, d2i5yg3, d2i5yh2, d2i5yl1, d2i5yl2, d2i5ym1, d2i5yp2, d2i5yp3, d2i5yq1, d2i5yq2, d2i5yr2, d2i5ys1 automatically matched to d1rz8b1 complexed with nag, ndg

    2. Domain d2i5yr1: 2i5y R:1-113 [137079] Other proteins in same PDB: d2i5yg2, d2i5yg3, d2i5yh2, d2i5yl1, d2i5yl2, d2i5ym1, d2i5yp2, d2i5yp3, d2i5yq1, d2i5yq2, d2i5yr2, d2i5ys1 automatically matched to d1rz8b1 complexed with nag, ndg

25. Domain(s) for 2i60:

    1. Domain d2i60h1: 2i60 H:2-113 [137082] Other proteins in same PDB: d2i60g_, d2i60h2, d2i60l1, d2i60l2, d2i60m1, d2i60p2, d2i60p3, d2i60q1, d2i60q2, d2i60r2, d2i60s1 automatically matched to d1rz8b1 complexed with ipa, nag, ndg

    2. Domain d2i60r1: 2i60 R:1-113 [137089] Other proteins in same PDB: d2i60g_, d2i60h2, d2i60l1, d2i60l2, d2i60m1, d2i60p2, d2i60p3, d2i60q1, d2i60q2, d2i60r2, d2i60s1 automatically matched to d1rz8b1 complexed with ipa, nag, ndg

26. Domain(s) for 2nxy:

    • Domain d2nxyd1: 2nxy D:3001-3128 [138749] Other proteins in same PDB: d2nxya1, d2nxyb1, d2nxyb2, d2nxyc1, d2nxyc2, d2nxyd2 automated match to d1rzjh1 complexed with hez, nag, trs

27. Domain(s) for 2nxz:

    • Domain d2nxzd1: 2nxz D:3001-3128 [138755] Other proteins in same PDB: d2nxza1, d2nxzb1, d2nxzb2, d2nxzc1, d2nxzc2, d2nxzd2 automated match to d1rzjh1 complexed with edo, hez, ipa, nag, suc

28. Domain(s) for 2ny0:

    • Domain d2ny0d1: 2ny0 D:3001-3128 [138762] Other proteins in same PDB: d2ny0a1, d2ny0b1, d2ny0b2, d2ny0c1, d2ny0c2, d2ny0d2 automated match to d1rzjh1 complexed with hez, nag

29. Domain(s) for 2ny1:

    • Domain d2ny1d1: 2ny1 D:3001-3128 [138768] Other proteins in same PDB: d2ny1a1, d2ny1b1, d2ny1b2, d2ny1c1, d2ny1c2, d2ny1d2 automated match to d1rzjh1 complexed with nag, suc

30. Domain(s) for 2ny2:

    • Domain d2ny2d1: 2ny2 D:3001-3128 [138774] Other proteins in same PDB: d2ny2a1, d2ny2b1, d2ny2b2, d2ny2c1, d2ny2c2, d2ny2d2 automated match to d1rzjh1 complexed with edo, hez, nag, suc

31. Domain(s) for 2ny3:

    • Domain d2ny3d1: 2ny3 D:3001-3128 [138780] Other proteins in same PDB: d2ny3a1, d2ny3b1, d2ny3b2, d2ny3c1, d2ny3c2, d2ny3d2 automated match to d1rzjh1 complexed with nag, suc

32. Domain(s) for 2ny4:

    • Domain d2ny4d1: 2ny4 D:3001-3128 [138786] Other proteins in same PDB: d2ny4a1, d2ny4b1, d2ny4b2, d2ny4c1, d2ny4c2, d2ny4d2 automated match to d1rzjh1 complexed with hez, nag, suc

33. Domain(s) for 2ny5:

    • Domain d2ny5h1: 2ny5 H:3001-3128 [138790] Other proteins in same PDB: d2ny5c1, d2ny5c2, d2ny5g1, d2ny5h2, d2ny5l1, d2ny5l2 automated match to d1rzjh1 complexed with nag, suc

34. Domain(s) for 2ny6:

    • Domain d2ny6d1: 2ny6 D:3001-3128 [138798] Other proteins in same PDB: d2ny6a1, d2ny6b1, d2ny6b2, d2ny6c1, d2ny6c2, d2ny6d2 automated match to d1rzjh1 complexed with nag, suc

35. Domain(s) for 2ny7:

    • Domain d2ny7h1: 2ny7 H:1-113 [138800] Other proteins in same PDB: d2ny7g_, d2ny7h2, d2ny7l1, d2ny7l2 automatically matched to d1hzhh1 complexed with nag

36. Domain(s) for 2qad:

    1. Domain d2qadd1: 2qad D:1-113 [150205] Other proteins in same PDB: d2qadb1, d2qadb2, d2qadd2, d2qadf1, d2qadf2, d2qadh2 automatically matched to d1rzga1 complexed with edo, mla, nag

    2. Domain d2qadh1: 2qad H:1-113 [150209] Other proteins in same PDB: d2qadb1, d2qadb2, d2qadd2, d2qadf1, d2qadf2, d2qadh2 automatically matched to d1rzga1 complexed with edo, mla, nag

37. Domain(s) for 4dvr:

    • Domain d4dvrh1: 4dvr H:1-119 [201742] Other proteins in same PDB: d4dvrg_, d4dvrh2, d4dvrl1, d4dvrl2 automated match to d1rz7h1 complexed with 0ly, nag

More info for Species Human (Homo sapiens), cluster 1 [TaxId:9606] from b.1.1.1 Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH

Timeline for Species Human (Homo sapiens), cluster 1 [TaxId:9606] from b.1.1.1 Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH:

• Species Human (Homo sapiens), cluster 1 [TaxId:9606] from b.1.1.1 Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH first appeared in SCOP 1.65
  
• Species Human (Homo sapiens), cluster 1 [TaxId:9606] from b.1.1.1 Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH appears in SCOPe 2.06
  
• Species Human (Homo sapiens), cluster 1 [TaxId:9606] from b.1.1.1 Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH appears in the current release, SCOPe 2.08