Lineage for Protein: Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH

  1. Root: SCOPe 2.02
  2. 1103260Class b: All beta proteins [48724] (174 folds)
  3. 1103261Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (28 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 1103262Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (5 families) (S)
  5. 1103263Family b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) [48727] (33 proteins)
  6. 1103461Protein Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH [88543] (21 species)
    VH domains of human and mouse antibodies are clustered by the sequence similarity within the germline encoded segment and then by the size of the complementarity determining regions CDR1 and CDR2, so the clusters may correspond to putative germline families in the species genomes; VH domains with artificial or grafted exogenous CDRs are listed as engineered species

Species:

  1. 1103462Chinese hamster (Cricetulus griseus) [TaxId:10029] [88561] (1 PDB entry)
  2. 1103465Engineered (including hybrid species) [88562] (67 PDB entries)
    SQ NA # humanized antidoby; bactericidal Fab-h6831 ! SQ NA # humanized antibody ! SQ NA # Humanized antibody ! SQ NA # engineered antibody
    1. Domains for 1ad0:
      1. 1103504Domain d1ad0b1: 1ad0 B:1-113 [20125]
        Other proteins in same PDB: d1ad0a1, d1ad0a2, d1ad0b2, d1ad0c1, d1ad0c2, d1ad0d2
        part of humanized Fab A5B7
      2. 1103505Domain d1ad0d1: 1ad0 D:1-113 [20127]
        Other proteins in same PDB: d1ad0a1, d1ad0a2, d1ad0b2, d1ad0c1, d1ad0c2, d1ad0d2
        part of humanized Fab A5B7
    2. Domains for 1ad9:
      1. 1103543Domain d1ad9b1: 1ad9 B:1-113 [20215]
        Other proteins in same PDB: d1ad9a1, d1ad9a2, d1ad9b2, d1ad9h2, d1ad9l1, d1ad9l2
        part of humanized Fab CTM01
        complexed with so4
      2. 1103544Domain d1ad9h1: 1ad9 H:1-113 [20213]
        Other proteins in same PDB: d1ad9a1, d1ad9a2, d1ad9b2, d1ad9h2, d1ad9l1, d1ad9l2
        part of humanized Fab CTM01
        complexed with so4
    3. Domain for 1b2w:
    4. Domains for 1bvk:
      1. 1103546Domain d1bvkb_: 1bvk B: [20279]
        Other proteins in same PDB: d1bvka_, d1bvkc_, d1bvkd_, d1bvkf_
        part of humanized anti-lysozyme Fv HuLys11
      2. 1103547Domain d1bvke_: 1bvk E: [20281]
        Other proteins in same PDB: d1bvka_, d1bvkc_, d1bvkd_, d1bvkf_
        part of humanized anti-lysozyme Fv HuLys11
    5. Domains for 1bvl:
      1. 1103553Domain d1bvla_: 1bvl A: [20282]
        Other proteins in same PDB: d1bvlb_, d1bvld_
        part of humanized anti-lysozyme Fv HuLys11
      2. 1103554Domain d1bvlc_: 1bvl C: [20284]
        Other proteins in same PDB: d1bvlb_, d1bvld_
        part of humanized anti-lysozyme Fv HuLys11
    6. Domain for 1fgv:
    7. Domains for 1fvc:
      1. 1103488Domain d1fvcb_: 1fvc B: [19863]
        Other proteins in same PDB: d1fvca_, d1fvcc_
        part of humanized Fv 4D5, herceptin
      2. 1103489Domain d1fvcd_: 1fvc D: [19865]
        Other proteins in same PDB: d1fvca_, d1fvcc_
        part of humanized Fv 4D5, herceptin
    8. Domains for 1fvd:
      1. 1103502Domain d1fvdb1: 1fvd B:1-120 [19867]
        Other proteins in same PDB: d1fvda1, d1fvda2, d1fvdb2, d1fvdc1, d1fvdc2, d1fvdd2
        part of humanized Fab 4D5, herceptin
      2. 1103503Domain d1fvdd1: 1fvd D:1-120 [19869]
        Other proteins in same PDB: d1fvda1, d1fvda2, d1fvdb2, d1fvdc1, d1fvdc2, d1fvdd2
        part of humanized Fab 4D5, herceptin
    9. Domains for 1fve:
      1. 1103515Domain d1fveb1: 1fve B:1-120 [19871]
        Other proteins in same PDB: d1fvea1, d1fvea2, d1fveb2, d1fvec1, d1fvec2, d1fved2
        part of humanized Fab 4D5, herceptin
      2. 1103516Domain d1fved1: 1fve D:1-120 [19873]
        Other proteins in same PDB: d1fvea1, d1fvea2, d1fveb2, d1fvec1, d1fvec2, d1fved2
        part of humanized Fab 4D5, herceptin
    10. Domains for 1gpo:
      1. 1103480Domain d1gpoh1: 1gpo H:1-113 [20225]
        Other proteins in same PDB: d1gpoh2, d1gpoi2, d1gpol1, d1gpol2, d1gpom1, d1gpom2
        part of Fab M41 (artificial design)
        complexed with so4
      2. 1103481Domain d1gpoi1: 1gpo I:1-113 [20227]
        Other proteins in same PDB: d1gpoh2, d1gpoi2, d1gpol1, d1gpol2, d1gpom1, d1gpom2
        part of Fab M41 (artificial design)
        complexed with so4
    11. Domains for 1i9r:
      1. 1103555Domain d1i9rh1: 1i9r H:1-118 [71151]
        Other proteins in same PDB: d1i9ra_, d1i9rb_, d1i9rc_, d1i9rh2, d1i9rk2, d1i9rl1, d1i9rl2, d1i9rm1, d1i9rm2, d1i9rx2, d1i9ry1, d1i9ry2
        complexed with zn
      2. 1103556Domain d1i9rk1: 1i9r K:1-118 [71153]
        Other proteins in same PDB: d1i9ra_, d1i9rb_, d1i9rc_, d1i9rh2, d1i9rk2, d1i9rl1, d1i9rl2, d1i9rm1, d1i9rm2, d1i9rx2, d1i9ry1, d1i9ry2
        complexed with zn
      3. 1103557Domain d1i9rx1: 1i9r X:1-118 [71159]
        Other proteins in same PDB: d1i9ra_, d1i9rb_, d1i9rc_, d1i9rh2, d1i9rk2, d1i9rl1, d1i9rl2, d1i9rm1, d1i9rm2, d1i9rx2, d1i9ry1, d1i9ry2
        complexed with zn
    12. Domain for 1it9:
    13. Domain for 1jps:
    14. Domain for 1jpt:
    15. Domain for 1jv5:
    16. Domain for 1l7i:
    17. Domains for 1mhp:
      1. 1103539Domain d1mhph1: 1mhp H:1-118 [84967]
        Other proteins in same PDB: d1mhpa_, d1mhpb_, d1mhph2, d1mhpl1, d1mhpl2, d1mhpy_
        part of humanized anti-alpha1 integrin I-domain Fab
        complexed with mn
      2. 1103540Domain d1mhpx_: 1mhp X: [84971]
        Other proteins in same PDB: d1mhpa_, d1mhpb_, d1mhph2, d1mhpl1, d1mhpl2, d1mhpy_
        part of humanized anti-alpha1 integrin I-domain Fab; only V domain is ordered
        complexed with mn
    18. Domain for 1n8z:
    19. Domains for 1ohq:
      1. 1103476Domain d1ohqa_: 1ohq A: [93027]
        soluble VH Hel4, resistant to aggregation
      2. 1103477Domain d1ohqb_: 1ohq B: [93028]
        soluble VH Hel4, resistant to aggregation
    20. Domains for 1ol0:
      1. 1103466Domain d1ol0a_: 1ol0 A: [93296]
        camelized human VH
        complexed with gol, so4
      2. 1103467Domain d1ol0b_: 1ol0 B: [93297]
        camelized human VH
        complexed with gol, so4
    21. Domains for 1om3:
      1. 1103495Domain d1om3h1: 1om3 H:1-115 [87059]
        Other proteins in same PDB: d1om3h2, d1om3k2, d1om3l1, d1om3l2, d1om3m1, d1om3m2
        part of engineered Fab 2G12
      2. 1103496Domain d1om3k1: 1om3 K:1-115 [87061]
        Other proteins in same PDB: d1om3h2, d1om3k2, d1om3l1, d1om3l2, d1om3m1, d1om3m2
        part of engineered Fab 2G12
    22. Domains for 1op3:
      1. 1103473Domain d1op3h1: 1op3 H:1-115 [87208]
        Other proteins in same PDB: d1op3h2, d1op3k1, d1op3k2, d1op3l1, d1op3l2, d1op3m2
        part of engineered Fab 2G12
        complexed with bez, man
      2. 1103474Domain d1op3m1: 1op3 M:1-115 [87214]
        Other proteins in same PDB: d1op3h2, d1op3k1, d1op3k2, d1op3l1, d1op3l2, d1op3m2
        part of engineered Fab 2G12
        complexed with bez, man
    23. Domains for 1op5:
      1. 1103560Domain d1op5h1: 1op5 H:1-115 [87216]
        Other proteins in same PDB: d1op5h2, d1op5k1, d1op5k2, d1op5l1, d1op5l2, d1op5m2
        part of engineered Fab 2G12
        complexed with man
      2. 1103561Domain d1op5m1: 1op5 M:1-115 [87222]
        Other proteins in same PDB: d1op5h2, d1op5k1, d1op5k2, d1op5l1, d1op5l2, d1op5m2
        part of engineered Fab 2G12
        complexed with man
    24. Domains for 1pg7:
      1. 1103511Domain d1pg7h1: 1pg7 H:1-117 [94674]
        Other proteins in same PDB: d1pg7h2, d1pg7i2, d1pg7l1, d1pg7l2, d1pg7m1, d1pg7m2, d1pg7w1, d1pg7w2, d1pg7x2, d1pg7y1, d1pg7y2, d1pg7z2
        part of humanized Fab D3H44 against human tissue factor
      2. 1103512Domain d1pg7i1: 1pg7 I:1-117 [94676]
        Other proteins in same PDB: d1pg7h2, d1pg7i2, d1pg7l1, d1pg7l2, d1pg7m1, d1pg7m2, d1pg7w1, d1pg7w2, d1pg7x2, d1pg7y1, d1pg7y2, d1pg7z2
        part of humanized Fab D3H44 against human tissue factor
    25. Domain for 1rjl:
    26. Domains for 1s78:
      1. 1103563Domain d1s78d1: 1s78 D:1-113 [98626]
        Other proteins in same PDB: d1s78a1, d1s78a2, d1s78a3, d1s78a4, d1s78b1, d1s78b2, d1s78b3, d1s78b4, d1s78c1, d1s78c2, d1s78d2, d1s78e1, d1s78e2, d1s78f2
        part of anti-ERBb2 Fab Pertuzumab
        complexed with nag
      2. 1103564Domain d1s78f1: 1s78 F:1-113 [98630]
        Other proteins in same PDB: d1s78a1, d1s78a2, d1s78a3, d1s78a4, d1s78b1, d1s78b2, d1s78b3, d1s78b4, d1s78c1, d1s78c2, d1s78d2, d1s78e1, d1s78e2, d1s78f2
        part of anti-ERBb2 Fab Pertuzumab
        complexed with nag
    27. Domains for 1t04:
      1. 1103551Domain d1t04b1: 1t04 B:1-118 [112184]
        Other proteins in same PDB: d1t04a1, d1t04a2, d1t04b2, d1t04c1, d1t04c2, d1t04d2
      2. 1103552Domain d1t04d1: 1t04 D:1-118 [112188]
        Other proteins in same PDB: d1t04a1, d1t04a2, d1t04b2, d1t04c1, d1t04c2, d1t04d2
    28. Domain for 1t3f:
    29. Domain for 1tjg:
    30. Domain for 1tjh:
    31. Domain for 1tji:
    32. Domains for 1tzh:
      1. 1103518Domain d1tzhb1: 1tzh B:1-113 [107479]
        Other proteins in same PDB: d1tzha1, d1tzha2, d1tzhb2, d1tzhh2, d1tzhl1, d1tzhl2, d1tzhv_, d1tzhw_
      2. 1103519Domain d1tzhh1: 1tzh H:1-113 [107481]
        Other proteins in same PDB: d1tzha1, d1tzha2, d1tzhb2, d1tzhh2, d1tzhl1, d1tzhl2, d1tzhv_, d1tzhw_
    33. Domain for 1tzi:
    34. Domain for 1u8h:
    35. Domain for 1u8i:
    36. Domain for 1u8j:
    37. Domain for 1u8k:
    38. Domain for 1u8l:
    39. Domain for 1u8m:
    40. Domain for 1u8n:
    41. Domain for 1u8o:
    42. Domain for 1u8p:
    43. Domain for 1u8q:
    44. Domain for 1u91:
    45. Domain for 1u92:
    46. Domain for 1u93:
    47. Domain for 1u95:
    48. Domain for 1uj3:
    49. Domain for 1vhp:
    50. Domain for 2agj:
    51. Domain for 2b0s:
    52. Domain for 2b1a:
    53. Domain for 2b1h:
    54. Domain for 2f5a:
    55. Domain for 2f5b:
    56. Domain for 2fgw:
    57. Domains for 2fjf:
      1. 1103521Domain d2fjfb1: 2fjf B:1-120 [133579]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      2. 1103522Domain d2fjfd1: 2fjf D:1-120 [133581]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      3. 1103523Domain d2fjff1: 2fjf F:1-120 [133583]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      4. 1103524Domain d2fjfh1: 2fjf H:1-120 [133585]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      5. 1103525Domain d2fjfi1: 2fjf I:1-120 [133587]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      6. 1103526Domain d2fjfk1: 2fjf K:1-120 [133589]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      7. 1103527Domain d2fjfn1: 2fjf N:1-120 [133591]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      8. 1103528Domain d2fjfp1: 2fjf P:1-120 [133593]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      9. 1103529Domain d2fjfr1: 2fjf R:1-120 [133595]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      10. 1103530Domain d2fjft1: 2fjf T:1-120 [133597]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      11. 1103531Domain d2fjfv1: 2fjf V:1-120 [133599]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      12. 1103532Domain d2fjfx1: 2fjf X:1-120 [133601]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
    58. Domains for 2fjg:
      1. 1103536Domain d2fjgb1: 2fjg B:1-120 [133603]
        Other proteins in same PDB: d2fjgb2, d2fjgh2, d2fjgv_, d2fjgw_
        automatically matched to d1fvcb_
        complexed with so4
      2. 1103537Domain d2fjgh1: 2fjg H:1-120 [133605]
        Other proteins in same PDB: d2fjgb2, d2fjgh2, d2fjgv_, d2fjgw_
        automatically matched to d1fvcb_
        complexed with so4
    59. Domains for 2h9g:
      1. 1103508Domain d2h9gb1: 2h9g B:1-113 [136257]
        Other proteins in same PDB: d2h9gb2, d2h9gh2, d2h9gr1, d2h9gr2, d2h9gr3
        automatically matched to d1fvcb_
      2. 1103509Domain d2h9gh1: 2h9g H:1-113 [136259]
        Other proteins in same PDB: d2h9gb2, d2h9gh2, d2h9gr1, d2h9gr2, d2h9gr3
        automatically matched to d1fvcb_
    60. Domain for 2nyy:
    61. Domains for 2nz9:
      1. 1103558Domain d2nz9d1: 2nz9 D:2-118 [138842]
        Other proteins in same PDB: d2nz9c1, d2nz9c2, d2nz9d2, d2nz9e1, d2nz9e2, d2nz9f2
        automatically matched to d1mhph1
        complexed with ca, zn
      2. 1103559Domain d2nz9f1: 2nz9 F:2-118 [138846]
        Other proteins in same PDB: d2nz9c1, d2nz9c2, d2nz9d2, d2nz9e1, d2nz9e2, d2nz9f2
        automatically matched to d1mhph1
        complexed with ca, zn
    62. Domain for 2p8l:
    63. Domain for 2p8m:
    64. Domain for 2p8p:
    65. Domain for 2pr4:
    66. Domain for 2pw1:
    67. Domain for 2pw2:
  3. 1103567Human (Homo sapiens), cluster 1 [TaxId:9606] [88544] (36 PDB entries)
    1. Domain for 1g9m:
    2. Domain for 1g9n:
    3. Domain for 1gc1:
    4. Domains for 1hzh:
      1. 1103613Domain d1hzhh1: 1hzh H:1-113 [61437]
        Other proteins in same PDB: d1hzhh2, d1hzhh3, d1hzhh4, d1hzhk2, d1hzhk3, d1hzhk4, d1hzhl1, d1hzhl2, d1hzhm1, d1hzhm2
        part of intact IgG B12 antibody
      2. 1103614Domain d1hzhk1: 1hzh K:1-113 [61441]
        Other proteins in same PDB: d1hzhh2, d1hzhh3, d1hzhh4, d1hzhk2, d1hzhk3, d1hzhk4, d1hzhl1, d1hzhl2, d1hzhm1, d1hzhm2
        part of intact IgG B12 antibody
    5. Domain for 1iqd:
    6. Domains for 1n0x:
      1. 1103570Domain d1n0xh1: 1n0x H:1-113 [91528]
        Other proteins in same PDB: d1n0xh2, d1n0xk2, d1n0xl1, d1n0xl2, d1n0xm1, d1n0xm2
        part of an anti HIV-1 Fab
        complexed with cxs, gol, k, so4
      2. 1103571Domain d1n0xk1: 1n0x K:1-113 [91530]
        Other proteins in same PDB: d1n0xh2, d1n0xk2, d1n0xl1, d1n0xl2, d1n0xm1, d1n0xm2
        part of an anti HIV-1 Fab
        complexed with cxs, gol, k, so4
    7. Domains for 1rhh:
      1. 1103581Domain d1rhhb1: 1rhh B:3-113 [97475]
        Other proteins in same PDB: d1rhha1, d1rhha2, d1rhhb2, d1rhhc1, d1rhhc2, d1rhhd2
        part of HIV-1 neutralizing Fab x5
      2. 1103582Domain d1rhhd1: 1rhh D:4-113 [97479]
        Other proteins in same PDB: d1rhha1, d1rhha2, d1rhhb2, d1rhhc1, d1rhhc2, d1rhhd2
        part of HIV-1 neutralizing Fab x5
    8. Domain for 1rz7:
    9. Domains for 1rz8:
      1. 1103600Domain d1rz8b1: 1rz8 B:1-113 [98139]
        Other proteins in same PDB: d1rz8a1, d1rz8a2, d1rz8b2, d1rz8c1, d1rz8c2, d1rz8d2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 17B
      2. 1103601Domain d1rz8d1: 1rz8 D:1-113 [98143]
        Other proteins in same PDB: d1rz8a1, d1rz8a2, d1rz8b2, d1rz8c1, d1rz8c2, d1rz8d2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 17B
    10. Domain for 1rzf:
    11. Domains for 1rzg:
      1. 1103575Domain d1rzga1: 1rzg A:1-113 [98154]
        Other proteins in same PDB: d1rzga2, d1rzgb1, d1rzgb2, d1rzgc2, d1rzgd1, d1rzgd2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 412D
        complexed with cys, suc
      2. 1103576Domain d1rzgc1: 1rzg C:2-113 [98158]
        Other proteins in same PDB: d1rzga2, d1rzgb1, d1rzgb2, d1rzgc2, d1rzgd1, d1rzgd2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 412D
        complexed with cys, suc
    12. Domains for 1rzi:
      1. 1103619Domain d1rzib1: 1rzi B:1-113 [98168]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E
      2. 1103620Domain d1rzid1: 1rzi D:1-113 [98172]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E
      3. 1103621Domain d1rzif1: 1rzi F:1-113 [98176]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E
      4. 1103622Domain d1rzih1: 1rzi H:1-113 [98180]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E
      5. 1103623Domain d1rzij1: 1rzi J:1-113 [98184]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E
      6. 1103624Domain d1rzil1: 1rzi L:1-113 [98188]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E
      7. 1103625Domain d1rzin1: 1rzi N:1-113 [98192]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E
      8. 1103626Domain d1rzip1: 1rzi P:1-113 [98196]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E
    13. Domain for 1rzj:
    14. Domain for 1rzk:
    15. Domains for 1tzg:
      1. 1103587Domain d1tzgh1: 1tzg H:1-113 [119396]
        Other proteins in same PDB: d1tzgh2, d1tzgi2, d1tzgl1, d1tzgl2, d1tzgm1, d1tzgm2
        automatically matched to d1hzhh1
        complexed with gol
      2. 1103588Domain d1tzgi1: 1tzg I:1-113 [119398]
        Other proteins in same PDB: d1tzgh2, d1tzgi2, d1tzgl1, d1tzgl2, d1tzgm1, d1tzgm2
        automatically matched to d1hzhh1
        complexed with gol
    16. Domain for 1vge:
    17. Domains for 1yyl:
      1. 1103610Domain d1yylh1: 1yyl H:1-113 [124223]
        Other proteins in same PDB: d1yylg_, d1yylh2, d1yyll1, d1yyll2, d1yylm1, d1yylp_, d1yylq1, d1yylq2, d1yylr2, d1yyls1
        automatically matched to d1rz8b1
        complexed with nag, ndg
      2. 1103611Domain d1yylr1: 1yyl R:1001-1113 [124230]
        Other proteins in same PDB: d1yylg_, d1yylh2, d1yyll1, d1yyll2, d1yylm1, d1yylp_, d1yylq1, d1yylq2, d1yylr2, d1yyls1
        automatically matched to d1rz8b1
        complexed with nag, ndg
    18. Domains for 1yym:
      1. 1103590Domain d1yymh1: 1yym H:1-113 [124233]
        Other proteins in same PDB: d1yymg_, d1yymh2, d1yyml1, d1yyml2, d1yymm1, d1yymp_, d1yymq1, d1yymq2, d1yymr2, d1yyms1
        automatically matched to d1rz8b1
        complexed with edo, ipa, nag, ndg
      2. 1103591Domain d1yymr1: 1yym R:1001-1113 [124240]
        Other proteins in same PDB: d1yymg_, d1yymh2, d1yyml1, d1yyml2, d1yymm1, d1yymp_, d1yymq1, d1yymq2, d1yymr2, d1yyms1
        automatically matched to d1rz8b1
        complexed with edo, ipa, nag, ndg
    19. Domain for 2dd8:
    20. Domain for 2fx7:
    21. Domains for 2fx8:
      1. 1103594Domain d2fx8h1: 2fx8 H:1-113 [134280]
        Other proteins in same PDB: d2fx8h2, d2fx8i2, d2fx8j2, d2fx8k2, d2fx8l1, d2fx8l2, d2fx8m1, d2fx8m2, d2fx8n1, d2fx8n2, d2fx8o1, d2fx8o2
        automatically matched to d1hzhh1
      2. 1103595Domain d2fx8i1: 2fx8 I:1-113 [134282]
        Other proteins in same PDB: d2fx8h2, d2fx8i2, d2fx8j2, d2fx8k2, d2fx8l1, d2fx8l2, d2fx8m1, d2fx8m2, d2fx8n1, d2fx8n2, d2fx8o1, d2fx8o2
        automatically matched to d1hzhh1
      3. 1103596Domain d2fx8j1: 2fx8 J:1-113 [134284]
        Other proteins in same PDB: d2fx8h2, d2fx8i2, d2fx8j2, d2fx8k2, d2fx8l1, d2fx8l2, d2fx8m1, d2fx8m2, d2fx8n1, d2fx8n2, d2fx8o1, d2fx8o2
        automatically matched to d1hzhh1
      4. 1103597Domain d2fx8k1: 2fx8 K:1-113 [134286]
        Other proteins in same PDB: d2fx8h2, d2fx8i2, d2fx8j2, d2fx8k2, d2fx8l1, d2fx8l2, d2fx8m1, d2fx8m2, d2fx8n1, d2fx8n2, d2fx8o1, d2fx8o2
        automatically matched to d1hzhh1
    22. Domains for 2fx9:
      1. 1103585Domain d2fx9h1: 2fx9 H:1-113 [134296]
        Other proteins in same PDB: d2fx9h2, d2fx9i2, d2fx9l1, d2fx9l2, d2fx9m1, d2fx9m2
        automatically matched to d1hzhh1
      2. 1103586Domain d2fx9i1: 2fx9 I:1-113 [134298]
        Other proteins in same PDB: d2fx9h2, d2fx9i2, d2fx9l1, d2fx9l2, d2fx9m1, d2fx9m2
        automatically matched to d1hzhh1
    23. Domains for 2g75:
      1. 1103602Domain d2g75a1: 2g75 A:2-113 [147086]
        Other proteins in same PDB: d2g75a2, d2g75b1, d2g75b2, d2g75c2, d2g75d1, d2g75d2
        automatically matched to 2DD8 H:2-113
      2. 1103603Domain d2g75c1: 2g75 C:2-113 [147090]
        Other proteins in same PDB: d2g75a2, d2g75b1, d2g75b2, d2g75c2, d2g75d1, d2g75d2
        automatically matched to 2DD8 H:2-113
    24. Domains for 2i5y:
      1. 1103592Domain d2i5yh1: 2i5y H:1-113 [137072]
        Other proteins in same PDB: d2i5yg_, d2i5yh2, d2i5yl1, d2i5yl2, d2i5ym1, d2i5yp_, d2i5yq1, d2i5yq2, d2i5yr2, d2i5ys1
        automatically matched to d1rz8b1
        complexed with nag, ndg
      2. 1103593Domain d2i5yr1: 2i5y R:1-113 [137079]
        Other proteins in same PDB: d2i5yg_, d2i5yh2, d2i5yl1, d2i5yl2, d2i5ym1, d2i5yp_, d2i5yq1, d2i5yq2, d2i5yr2, d2i5ys1
        automatically matched to d1rz8b1
        complexed with nag, ndg
    25. Domains for 2i60:
      1. 1103604Domain d2i60h1: 2i60 H:2-113 [137082]
        Other proteins in same PDB: d2i60g_, d2i60h2, d2i60l1, d2i60l2, d2i60m1, d2i60p_, d2i60q1, d2i60q2, d2i60r2, d2i60s1
        automatically matched to d1rz8b1
        complexed with ipa, nag, ndg
      2. 1103605Domain d2i60r1: 2i60 R:1-113 [137089]
        Other proteins in same PDB: d2i60g_, d2i60h2, d2i60l1, d2i60l2, d2i60m1, d2i60p_, d2i60q1, d2i60q2, d2i60r2, d2i60s1
        automatically matched to d1rz8b1
        complexed with ipa, nag, ndg
    26. Domain for 2nxy:
    27. Domain for 2nxz:
    28. Domain for 2ny0:
    29. Domain for 2ny1:
    30. Domain for 2ny2:
    31. Domain for 2ny3:
    32. Domain for 2ny4:
    33. Domain for 2ny5:
    34. Domain for 2ny6:
    35. Domain for 2ny7:
    36. Domains for 2qad:
      1. 1103617Domain d2qadd1: 2qad D:1-113 [150205]
        Other proteins in same PDB: d2qadb1, d2qadb2, d2qadd2, d2qadf1, d2qadf2, d2qadh2
        automatically matched to d1rzga1
        complexed with edo, mla, nag
      2. 1103618Domain d2qadh1: 2qad H:1-113 [150209]
        Other proteins in same PDB: d2qadb1, d2qadb2, d2qadd2, d2qadf1, d2qadf2, d2qadh2
        automatically matched to d1rzga1
        complexed with edo, mla, nag
  4. 1103627Human (Homo sapiens), cluster 2.1 [TaxId:9606] [88545] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1dn0:
      1. 1103629Domain d1dn0b1: 1dn0 B:1-120 [19831]
        Other proteins in same PDB: d1dn0a1, d1dn0a2, d1dn0b2, d1dn0c1, d1dn0c2, d1dn0d2
        part of Fab Kau cold agglutinin IgM
      2. 1103630Domain d1dn0d1: 1dn0 D:1-120 [19833]
        Other proteins in same PDB: d1dn0a1, d1dn0a2, d1dn0b2, d1dn0c1, d1dn0c2, d1dn0d2
        part of Fab Kau cold agglutinin IgM
    2. Domains for 1qlr:
      1. 1103631Domain d1qlrb1: 1qlr B:1-120 [19835]
        Other proteins in same PDB: d1qlra1, d1qlra2, d1qlrb2, d1qlrc1, d1qlrc2, d1qlrd2
        part of Fab Kau cold agglutinin IgM
      2. 1103632Domain d1qlrd1: 1qlr D:1-120 [19837]
        Other proteins in same PDB: d1qlra1, d1qlra2, d1qlrb2, d1qlrc1, d1qlrc2, d1qlrd2
        part of Fab Kau cold agglutinin IgM
    3. Domain for 7fab:
  5. 1103633Human (Homo sapiens), cluster 2.2 [TaxId:9606] [88546] (2 PDB entries)
    1. Domain for 1mco:
    2. Domains for 2j6e:
      1. 1103634Domain d2j6eh1: 2j6e H:1-113 [145665]
        Other proteins in same PDB: d2j6ea1, d2j6ea2, d2j6eb1, d2j6eb2, d2j6eh2, d2j6ei2, d2j6el1, d2j6el2, d2j6em1, d2j6em2
        complexed with act, cac, cd, mpd, zn
      2. 1103635Domain d2j6ei1: 2j6e I:1-113 [145667]
        Other proteins in same PDB: d2j6ea1, d2j6ea2, d2j6eb1, d2j6eb2, d2j6eh2, d2j6ei2, d2j6el1, d2j6el2, d2j6em1, d2j6em2
        automatically matched to 2J6E H:1-113
        complexed with act, cac, cd, mpd, zn
  6. 1103637Human (Homo sapiens), cluster 3 [TaxId:9606] [88547] (33 PDB entries)
    Uniprot Q6N089 20-243 # 95% sequence identity; natural chimera: antibody heavy chain (Fab HYB3)
    1. Domain for 1adq:
    2. Domain for 1aqk:
    3. Domains for 1dee:
      1. 1103680Domain d1deeb1: 1dee B:501-621 [20443]
        Other proteins in same PDB: d1deea1, d1deea2, d1deeb2, d1deec1, d1deec2, d1deed2, d1deee1, d1deee2, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_
        part of IgM RF 2A2
      2. 1103681Domain d1deed1: 1dee D:1501-1621 [20445]
        Other proteins in same PDB: d1deea1, d1deea2, d1deeb2, d1deec1, d1deec2, d1deed2, d1deee1, d1deee2, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_
        part of IgM RF 2A2
      3. 1103682Domain d1deef1: 1dee F:2501-2621 [20447]
        Other proteins in same PDB: d1deea1, d1deea2, d1deeb2, d1deec1, d1deec2, d1deed2, d1deee1, d1deee2, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_
        part of IgM RF 2A2
    4. Domain for 1dfb:
    5. Domain for 1dql:
    6. Domains for 1hez:
      1. 1103685Domain d1hezb1: 1hez B:1-121 [60985]
        Other proteins in same PDB: d1heza1, d1heza2, d1hezb2, d1hezc1, d1hezc2, d1hezd2, d1heze_
        part of IgM RF 2A2
        complexed with imd
      2. 1103686Domain d1hezd1: 1hez D:1-121 [60989]
        Other proteins in same PDB: d1heza1, d1heza2, d1hezb2, d1hezc1, d1hezc2, d1hezd2, d1heze_
        part of IgM RF 2A2
        complexed with imd
    7. Domain for 1igm:
    8. Domain for 1nl0:
    9. Domain for 1u6a:
    10. Domains for 1w72:
      1. 1103643Domain d1w72h1: 1w72 H:1-113 [114299]
        Other proteins in same PDB: d1w72a1, d1w72a2, d1w72b_, d1w72d1, d1w72d2, d1w72e_, d1w72h2, d1w72i2, d1w72l1, d1w72l2, d1w72m1, d1w72m2
        complexed with gol
      2. 1103644Domain d1w72i1: 1w72 I:1-113 [114301]
        Other proteins in same PDB: d1w72a1, d1w72a2, d1w72b_, d1w72d1, d1w72d2, d1w72e_, d1w72h2, d1w72i2, d1w72l1, d1w72l2, d1w72m1, d1w72m2
        complexed with gol
    11. Domains for 1y0l:
      1. 1103650Domain d1y0lb1: 1y0l B:1-113 [122488]
        Other proteins in same PDB: d1y0la1, d1y0la2, d1y0lb2, d1y0lc1, d1y0lc2, d1y0ld2, d1y0le1, d1y0le2, d1y0lf2, d1y0lh2, d1y0ll1, d1y0ll2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with cl, han
      2. 1103651Domain d1y0ld1: 1y0l D:1-113 [122492]
        Other proteins in same PDB: d1y0la1, d1y0la2, d1y0lb2, d1y0lc1, d1y0lc2, d1y0ld2, d1y0le1, d1y0le2, d1y0lf2, d1y0lh2, d1y0ll1, d1y0ll2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with cl, han
      3. 1103652Domain d1y0lf1: 1y0l F:1-113 [122496]
        Other proteins in same PDB: d1y0la1, d1y0la2, d1y0lb2, d1y0lc1, d1y0lc2, d1y0ld2, d1y0le1, d1y0le2, d1y0lf2, d1y0lh2, d1y0ll1, d1y0ll2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with cl, han
      4. 1103653Domain d1y0lh1: 1y0l H:1-113 [122498]
        Other proteins in same PDB: d1y0la1, d1y0la2, d1y0lb2, d1y0lc1, d1y0lc2, d1y0ld2, d1y0le1, d1y0le2, d1y0lf2, d1y0lh2, d1y0ll1, d1y0ll2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with cl, han
    12. Domains for 1y18:
      1. 1103689Domain d1y18b1: 1y18 B:1-113 [122523]
        Other proteins in same PDB: d1y18a1, d1y18a2, d1y18b2, d1y18c1, d1y18c2, d1y18d2, d1y18e1, d1y18e2, d1y18f2, d1y18h2, d1y18l1, d1y18l2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with cl, han; mutant
      2. 1103690Domain d1y18d1: 1y18 D:1-113 [122527]
        Other proteins in same PDB: d1y18a1, d1y18a2, d1y18b2, d1y18c1, d1y18c2, d1y18d2, d1y18e1, d1y18e2, d1y18f2, d1y18h2, d1y18l1, d1y18l2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with cl, han; mutant
      3. 1103691Domain d1y18f1: 1y18 F:1-113 [122531]
        Other proteins in same PDB: d1y18a1, d1y18a2, d1y18b2, d1y18c1, d1y18c2, d1y18d2, d1y18e1, d1y18e2, d1y18f2, d1y18h2, d1y18l1, d1y18l2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with cl, han; mutant
      4. 1103692Domain d1y18h1: 1y18 H:1-113 [122533]
        Other proteins in same PDB: d1y18a1, d1y18a2, d1y18b2, d1y18c1, d1y18c2, d1y18d2, d1y18e1, d1y18e2, d1y18f2, d1y18h2, d1y18l1, d1y18l2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with cl, han; mutant
    13. Domain for 1zls:
    14. Domains for 1zlu:
      1. 1103702Domain d1zluh1: 1zlu H:1-112 [125258]
        Other proteins in same PDB: d1zluh2, d1zlum2
        automatically matched to d1aqkh1
      2. 1103703Domain d1zlum1: 1zlu M:1-112 [125260]
        Other proteins in same PDB: d1zluh2, d1zlum2
        automatically matched to d1aqkh1
    15. Domains for 1zlv:
      1. 1103647Domain d1zlvh1: 1zlv H:1-112 [125262]
        Other proteins in same PDB: d1zlvh2, d1zlvm2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with man
      2. 1103648Domain d1zlvm1: 1zlv M:1-112 [125264]
        Other proteins in same PDB: d1zlvh2, d1zlvm2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with man
    16. Domains for 1zlw:
      1. 1103698Domain d1zlwh1: 1zlw H:1-112 [125266]
        Other proteins in same PDB: d1zlwh2, d1zlwm2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with man
      2. 1103699Domain d1zlwm1: 1zlw M:1-112 [125268]
        Other proteins in same PDB: d1zlwh2, d1zlwm2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with man
    17. Domain for 2fb4:
    18. Domains for 2ghw:
      1. 1103668Domain d2ghwb2: 2ghw B:1-117 [145199]
        Other proteins in same PDB: d2ghwa_, d2ghwb1, d2ghwc_, d2ghwd1
        complexed with cl
      2. 1103669Domain d2ghwd2: 2ghw D:1-117 [145201]
        Other proteins in same PDB: d2ghwa_, d2ghwb1, d2ghwc_, d2ghwd1
        automatically matched to 2GHW B:1-117
        complexed with cl
    19. Domain for 2ig2:
    20. Domain for 2jb5:
    21. Domains for 2jb6:
      1. 1103700Domain d2jb6b1: 2jb6 B:3-120 [147957]
        Other proteins in same PDB: d2jb6b2, d2jb6h2
        automatically matched to d1nl0h1
        complexed with t5c
      2. 1103701Domain d2jb6h1: 2jb6 H:3-120 [147959]
        Other proteins in same PDB: d2jb6b2, d2jb6h2
        automatically matched to d1nl0h1
        complexed with t5c
    22. Domains for 2oqj:
      1. 1103694Domain d2oqjb1: 2oqj B:1-112 [148984]
        Other proteins in same PDB: d2oqjb2, d2oqje2, d2oqjh2, d2oqjk2
        automatically matched to d1aqkh1
      2. 1103695Domain d2oqje1: 2oqj E:1-112 [148986]
        Other proteins in same PDB: d2oqjb2, d2oqje2, d2oqjh2, d2oqjk2
        automatically matched to d1aqkh1
      3. 1103696Domain d2oqjh1: 2oqj H:1-112 [148988]
        Other proteins in same PDB: d2oqjb2, d2oqje2, d2oqjh2, d2oqjk2
        automatically matched to d1aqkh1
      4. 1103697Domain d2oqjk1: 2oqj K:1-112 [148990]
        Other proteins in same PDB: d2oqjb2, d2oqje2, d2oqjh2, d2oqjk2
        automatically matched to d1aqkh1
    23. Domain for 2qqn:
    24. Domains for 3b2u:
      1. 1103672Domain d3b2uc1: 3b2u C:1-121 [154774]
        Other proteins in same PDB: d3b2ua1, d3b2ua2, d3b2ub1, d3b2ub2, d3b2uc2, d3b2ue1, d3b2ue2, d3b2uf2, d3b2uh2, d3b2ui1, d3b2ui2, d3b2uj2, d3b2um1, d3b2um2, d3b2un2, d3b2up1, d3b2up2, d3b2uq2, d3b2us1, d3b2us2, d3b2ut2, d3b2uv1, d3b2uv2, d3b2uw2
        automatically matched to d1deeb1
        complexed with nag, so4
      2. 1103673Domain d3b2uf1: 3b2u F:1-121 [154778]
        Other proteins in same PDB: d3b2ua1, d3b2ua2, d3b2ub1, d3b2ub2, d3b2uc2, d3b2ue1, d3b2ue2, d3b2uf2, d3b2uh2, d3b2ui1, d3b2ui2, d3b2uj2, d3b2um1, d3b2um2, d3b2un2, d3b2up1, d3b2up2, d3b2uq2, d3b2us1, d3b2us2, d3b2ut2, d3b2uv1, d3b2uv2, d3b2uw2
        automatically matched to d1deeb1
        complexed with nag, so4
      3. 1103674Domain d3b2uh1: 3b2u H:1-121 [154780]
        Other proteins in same PDB: d3b2ua1, d3b2ua2, d3b2ub1, d3b2ub2, d3b2uc2, d3b2ue1, d3b2ue2, d3b2uf2, d3b2uh2, d3b2ui1, d3b2ui2, d3b2uj2, d3b2um1, d3b2um2, d3b2un2, d3b2up1, d3b2up2, d3b2uq2, d3b2us1, d3b2us2, d3b2ut2, d3b2uv1, d3b2uv2, d3b2uw2
        automatically matched to d1deeb1
        complexed with nag, so4
      4. 1103675Domain d3b2uj1: 3b2u J:1-121 [154784]
        Other proteins in same PDB: d3b2ua1, d3b2ua2, d3b2ub1, d3b2ub2, d3b2uc2, d3b2ue1, d3b2ue2, d3b2uf2, d3b2uh2, d3b2ui1, d3b2ui2, d3b2uj2, d3b2um1, d3b2um2, d3b2un2, d3b2up1, d3b2up2, d3b2uq2, d3b2us1, d3b2us2, d3b2ut2, d3b2uv1, d3b2uv2, d3b2uw2
        automatically matched to d1deeb1
        complexed with nag, so4
      5. 1103676Domain d3b2un1: 3b2u N:1-121 [154788]
        Other proteins in same PDB: d3b2ua1, d3b2ua2, d3b2ub1, d3b2ub2, d3b2uc2, d3b2ue1, d3b2ue2, d3b2uf2, d3b2uh2, d3b2ui1, d3b2ui2, d3b2uj2, d3b2um1, d3b2um2, d3b2un2, d3b2up1, d3b2up2, d3b2uq2, d3b2us1, d3b2us2, d3b2ut2, d3b2uv1, d3b2uv2, d3b2uw2
        automatically matched to d1deeb1
        complexed with nag, so4
      6. 1103677Domain d3b2uq1: 3b2u Q:1-121 [154792]
        Other proteins in same PDB: d3b2ua1, d3b2ua2, d3b2ub1, d3b2ub2, d3b2uc2, d3b2ue1, d3b2ue2, d3b2uf2, d3b2uh2, d3b2ui1, d3b2ui2, d3b2uj2, d3b2um1, d3b2um2, d3b2un2, d3b2up1, d3b2up2, d3b2uq2, d3b2us1, d3b2us2, d3b2ut2, d3b2uv1, d3b2uv2, d3b2uw2
        automatically matched to d1deeb1
        complexed with nag, so4
      7. 1103678Domain d3b2ut1: 3b2u T:1-121 [154796]
        Other proteins in same PDB: d3b2ua1, d3b2ua2, d3b2ub1, d3b2ub2, d3b2uc2, d3b2ue1, d3b2ue2, d3b2uf2, d3b2uh2, d3b2ui1, d3b2ui2, d3b2uj2, d3b2um1, d3b2um2, d3b2un2, d3b2up1, d3b2up2, d3b2uq2, d3b2us1, d3b2us2, d3b2ut2, d3b2uv1, d3b2uv2, d3b2uw2
        automatically matched to d1deeb1
        complexed with nag, so4
      8. 1103679Domain d3b2uw1: 3b2u W:1-121 [154800]
        Other proteins in same PDB: d3b2ua1, d3b2ua2, d3b2ub1, d3b2ub2, d3b2uc2, d3b2ue1, d3b2ue2, d3b2uf2, d3b2uh2, d3b2ui1, d3b2ui2, d3b2uj2, d3b2um1, d3b2um2, d3b2un2, d3b2up1, d3b2up2, d3b2uq2, d3b2us1, d3b2us2, d3b2ut2, d3b2uv1, d3b2uv2, d3b2uw2
        automatically matched to d1deeb1
        complexed with nag, so4
    25. Domain for 3b2v:
    26. Domain for 3bky:
    27. Domain for 3c08:
    28. Domains for 3c09:
      1. 1103706Domain d3c09c1: 3c09 C:2-121 [155813]
        Other proteins in same PDB: d3c09a1, d3c09a2, d3c09c2, d3c09d1, d3c09d2, d3c09h2
        automatically matched to d8fabb1
        complexed with bma, man, nag
      2. 1103707Domain d3c09h1: 3c09 H:2-121 [155817]
        Other proteins in same PDB: d3c09a1, d3c09a2, d3c09c2, d3c09d1, d3c09d2, d3c09h2
        automatically matched to d8fabb1
        complexed with bma, man, nag
    29. Domains for 3cfj:
      1. 1103656Domain d3cfjb1: 3cfj B:1-113 [156567]
        Other proteins in same PDB: d3cfja1, d3cfja2, d3cfjb2, d3cfjc1, d3cfjc2, d3cfjd2, d3cfje1, d3cfje2, d3cfjf2, d3cfjh2, d3cfjl1, d3cfjl2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with gol, so4
      2. 1103657Domain d3cfjd1: 3cfj D:1-113 [156571]
        Other proteins in same PDB: d3cfja1, d3cfja2, d3cfjb2, d3cfjc1, d3cfjc2, d3cfjd2, d3cfje1, d3cfje2, d3cfjf2, d3cfjh2, d3cfjl1, d3cfjl2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with gol, so4
      3. 1103658Domain d3cfjf1: 3cfj F:1-113 [156575]
        Other proteins in same PDB: d3cfja1, d3cfja2, d3cfjb2, d3cfjc1, d3cfjc2, d3cfjd2, d3cfje1, d3cfje2, d3cfjf2, d3cfjh2, d3cfjl1, d3cfjl2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with gol, so4
      4. 1103659Domain d3cfjh1: 3cfj H:1-113 [156577]
        Other proteins in same PDB: d3cfja1, d3cfja2, d3cfjb2, d3cfjc1, d3cfjc2, d3cfjd2, d3cfje1, d3cfje2, d3cfjf2, d3cfjh2, d3cfjl1, d3cfjl2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with gol, so4
    30. Domains for 3cfk:
      1. 1103660Domain d3cfkb1: 3cfk B:1-113 [156583]
        Other proteins in same PDB: d3cfka1, d3cfka2, d3cfkb2, d3cfkc1, d3cfkc2, d3cfkd2, d3cfke1, d3cfke2, d3cfkf2, d3cfkg1, d3cfkg2, d3cfkh2, d3cfki2, d3cfkj1, d3cfkj2, d3cfkk2, d3cfkl1, d3cfkl2, d3cfkm1, d3cfkm2, d3cfkn2, d3cfko1, d3cfko2, d3cfkp2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with b3p, cd, gol
      2. 1103661Domain d3cfkd1: 3cfk D:1-113 [156587]
        Other proteins in same PDB: d3cfka1, d3cfka2, d3cfkb2, d3cfkc1, d3cfkc2, d3cfkd2, d3cfke1, d3cfke2, d3cfkf2, d3cfkg1, d3cfkg2, d3cfkh2, d3cfki2, d3cfkj1, d3cfkj2, d3cfkk2, d3cfkl1, d3cfkl2, d3cfkm1, d3cfkm2, d3cfkn2, d3cfko1, d3cfko2, d3cfkp2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with b3p, cd, gol
      3. 1103662Domain d3cfkf1: 3cfk F:1-113 [156591]
        Other proteins in same PDB: d3cfka1, d3cfka2, d3cfkb2, d3cfkc1, d3cfkc2, d3cfkd2, d3cfke1, d3cfke2, d3cfkf2, d3cfkg1, d3cfkg2, d3cfkh2, d3cfki2, d3cfkj1, d3cfkj2, d3cfkk2, d3cfkl1, d3cfkl2, d3cfkm1, d3cfkm2, d3cfkn2, d3cfko1, d3cfko2, d3cfkp2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with b3p, cd, gol
      4. 1103663Domain d3cfkh1: 3cfk H:1-113 [156595]
        Other proteins in same PDB: d3cfka1, d3cfka2, d3cfkb2, d3cfkc1, d3cfkc2, d3cfkd2, d3cfke1, d3cfke2, d3cfkf2, d3cfkg1, d3cfkg2, d3cfkh2, d3cfki2, d3cfkj1, d3cfkj2, d3cfkk2, d3cfkl1, d3cfkl2, d3cfkm1, d3cfkm2, d3cfkn2, d3cfko1, d3cfko2, d3cfkp2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with b3p, cd, gol
      5. 1103664Domain d3cfki1: 3cfk I:1-113 [156597]
        Other proteins in same PDB: d3cfka1, d3cfka2, d3cfkb2, d3cfkc1, d3cfkc2, d3cfkd2, d3cfke1, d3cfke2, d3cfkf2, d3cfkg1, d3cfkg2, d3cfkh2, d3cfki2, d3cfkj1, d3cfkj2, d3cfkk2, d3cfkl1, d3cfkl2, d3cfkm1, d3cfkm2, d3cfkn2, d3cfko1, d3cfko2, d3cfkp2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with b3p, cd, gol
      6. 1103665Domain d3cfkk1: 3cfk K:1-113 [156601]
        Other proteins in same PDB: d3cfka1, d3cfka2, d3cfkb2, d3cfkc1, d3cfkc2, d3cfkd2, d3cfke1, d3cfke2, d3cfkf2, d3cfkg1, d3cfkg2, d3cfkh2, d3cfki2, d3cfkj1, d3cfkj2, d3cfkk2, d3cfkl1, d3cfkl2, d3cfkm1, d3cfkm2, d3cfkn2, d3cfko1, d3cfko2, d3cfkp2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with b3p, cd, gol
      7. 1103666Domain d3cfkn1: 3cfk N:1-113 [156607]
        Other proteins in same PDB: d3cfka1, d3cfka2, d3cfkb2, d3cfkc1, d3cfkc2, d3cfkd2, d3cfke1, d3cfke2, d3cfkf2, d3cfkg1, d3cfkg2, d3cfkh2, d3cfki2, d3cfkj1, d3cfkj2, d3cfkk2, d3cfkl1, d3cfkl2, d3cfkm1, d3cfkm2, d3cfkn2, d3cfko1, d3cfko2, d3cfkp2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with b3p, cd, gol
      8. 1103667Domain d3cfkp1: 3cfk P:1-113 [156611]
        Other proteins in same PDB: d3cfka1, d3cfka2, d3cfkb2, d3cfkc1, d3cfkc2, d3cfkd2, d3cfke1, d3cfke2, d3cfkf2, d3cfkg1, d3cfkg2, d3cfkh2, d3cfki2, d3cfkj1, d3cfkj2, d3cfkk2, d3cfkl1, d3cfkl2, d3cfkm1, d3cfkm2, d3cfkn2, d3cfko1, d3cfko2, d3cfkp2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with b3p, cd, gol
    31. Domain for 3dvg:
    32. Domains for 3dvn:
      1. 1103683Domain d3dvnb1: 3dvn B:2-120 [157896]
        Other proteins in same PDB: d3dvna1, d3dvna2, d3dvnb2, d3dvnh2, d3dvnl1, d3dvnl2, d3dvnu_, d3dvnv_, d3dvnx_, d3dvny_
        automatically matched to d1nl0h1
      2. 1103684Domain d3dvnh1: 3dvn H:2-120 [157898]
        Other proteins in same PDB: d3dvna1, d3dvna2, d3dvnb2, d3dvnh2, d3dvnl1, d3dvnl2, d3dvnu_, d3dvnv_, d3dvnx_, d3dvny_
        automatically matched to d1nl0h1
    33. Domains for 8fab:
      1. 1103638Domain d8fabb1: 8fab B:1-121 [19773]
        Other proteins in same PDB: d8faba1, d8faba2, d8fabb2, d8fabc1, d8fabc2, d8fabd2
        part of Fab HIL
      2. 1103639Domain d8fabd1: 8fab D:1-121 [19775]
        Other proteins in same PDB: d8faba1, d8faba2, d8fabb2, d8fabc1, d8fabc2, d8fabd2
        part of Fab HIL
  7. 1103709Human (Homo sapiens), cluster 4 [TaxId:9606] [101505] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1q1j:
      1. 1103712Domain d1q1jh1: 1q1j H:1-113 [95581]
        Other proteins in same PDB: d1q1jh2, d1q1ji2, d1q1jl1, d1q1jl2, d1q1jm1, d1q1jm2
        part of anti HIV-1 Fab 447-52d
      2. 1103713Domain d1q1ji1: 1q1j I:1-113 [95583]
        Other proteins in same PDB: d1q1jh2, d1q1ji2, d1q1jl1, d1q1jl2, d1q1jm1, d1q1jm2
        part of anti HIV-1 Fab 447-52d
    2. Domain for 2b4c:
    3. Domains for 3c2a:
      1. 1103710Domain d3c2ah1: 3c2a H:1-113 [155872]
        Other proteins in same PDB: d3c2ah2, d3c2ai2
        automatically matched to d1q1jh1
      2. 1103711Domain d3c2ai1: 3c2a I:1-113 [155874]
        Other proteins in same PDB: d3c2ah2, d3c2ai2
        automatically matched to d1q1jh1
  8. 1103715Mouse (Mus musculus), cluster 1 [TaxId:10090] [88548] (46 PDB entries)
    Uniprot P01796 # ! HV27_MOUSE Ig heavy chain V-III region A4
    1. Domains for 1aif:
      1. 1103775Domain d1aifb1: 1aif B:1-121 [20077]
        Other proteins in same PDB: d1aifa1, d1aifa2, d1aifb2, d1aifh2, d1aifl1, d1aifl2
        part of Fab 409.5.3
      2. 1103776Domain d1aifh1: 1aif H:1-121 [20079]
        Other proteins in same PDB: d1aifa1, d1aifa2, d1aifb2, d1aifh2, d1aifl1, d1aifl2
        part of Fab 409.5.3
    2. Domain for 1axt:
    3. Domain for 1cbv:
    4. Domain for 1ck0:
    5. Domain for 1clo:
    6. Domain for 1dlf:
    7. Domains for 1fl5:
      1. 1103740Domain d1fl5b1: 1fl5 B:1-113 [65017]
        Other proteins in same PDB: d1fl5a1, d1fl5a2, d1fl5b2, d1fl5h2, d1fl5l1, d1fl5l2
        part of humanized catalytic Fab 28b4 with a sulfide oxidase activity
        complexed with so4
      2. 1103741Domain d1fl5h1: 1fl5 H:1-113 [65019]
        Other proteins in same PDB: d1fl5a1, d1fl5a2, d1fl5b2, d1fl5h2, d1fl5l1, d1fl5l2
        part of humanized catalytic Fab 28b4 with a sulfide oxidase activity
        complexed with so4
    8. Domains for 1fl6:
      1. 1103758Domain d1fl6b1: 1fl6 B:1-113 [65025]
        Other proteins in same PDB: d1fl6a1, d1fl6a2, d1fl6b2, d1fl6h2, d1fl6l1, d1fl6l2
        part of humanized catalytic Fab 28b4 with a sulfide oxidase activity
        complexed with aah
      2. 1103759Domain d1fl6h1: 1fl6 H:1-113 [65027]
        Other proteins in same PDB: d1fl6a1, d1fl6a2, d1fl6b2, d1fl6h2, d1fl6l1, d1fl6l2
        part of humanized catalytic Fab 28b4 with a sulfide oxidase activity
        complexed with aah
    9. Domain for 1flr:
    10. Domain for 1iai:
    11. Domain for 1kel:
    12. Domain for 1kem:
    13. Domain for 1m71:
    14. Domain for 1m7d:
    15. Domain for 1m7i:
    16. Domain for 1mam:
    17. Domain for 1mcp:
    18. Domain for 1nbv:
    19. Domain for 1pz5:
    20. Domain for 1q72:
    21. Domain for 1q9k:
    22. Domains for 1q9l:
      1. 1103747Domain d1q9lb1: 1q9l B:1-111 [96282]
        Other proteins in same PDB: d1q9la1, d1q9la2, d1q9lb2, d1q9lc1, d1q9lc2, d1q9ld2
        part of Fab s25-2
        complexed with mg, zn
      2. 1103748Domain d1q9ld1: 1q9l D:1-111 [96286]
        Other proteins in same PDB: d1q9la1, d1q9la2, d1q9lb2, d1q9lc1, d1q9lc2, d1q9ld2
        part of Fab s25-2
        complexed with mg, zn
    23. Domains for 1q9o:
      1. 1103727Domain d1q9ob1: 1q9o B:1-111 [96294]
        Other proteins in same PDB: d1q9oa1, d1q9oa2, d1q9ob2, d1q9oc1, d1q9oc2, d1q9od2
        part of Fab s45-18
        complexed with mg
      2. 1103728Domain d1q9od1: 1q9o D:1-111 [96298]
        Other proteins in same PDB: d1q9oa1, d1q9oa2, d1q9ob2, d1q9oc1, d1q9oc2, d1q9od2
        part of Fab s45-18
        complexed with mg
    24. Domains for 1q9w:
      1. 1103723Domain d1q9wb1: 1q9w B:1-111 [96322]
        Other proteins in same PDB: d1q9wa1, d1q9wa2, d1q9wb2, d1q9wc1, d1q9wc2, d1q9wd2
        part of Fab s45-18
        complexed with mg
      2. 1103724Domain d1q9wd1: 1q9w D:1-111 [96326]
        Other proteins in same PDB: d1q9wa1, d1q9wa2, d1q9wb2, d1q9wc1, d1q9wc2, d1q9wd2
        part of Fab s45-18
        complexed with mg
    25. Domain for 1qyg:
    26. Domain for 1rfd:
    27. Domain for 1riu:
    28. Domain for 1riv:
    29. Domain for 1sbs:
    30. Domain for 1sm3:
    31. Domains for 1t66:
      1. 1103743Domain d1t66d1: 1t66 D:1-118 [106547]
        Other proteins in same PDB: d1t66c1, d1t66c2, d1t66d2, d1t66h2, d1t66l1, d1t66l2
        complexed with flu
      2. 1103744Domain d1t66h1: 1t66 H:1-118 [106549]
        Other proteins in same PDB: d1t66c1, d1t66c2, d1t66d2, d1t66h2, d1t66l1, d1t66l2
        complexed with flu
    32. Domains for 1v7m:
      1. 1103760Domain d1v7mh1: 1v7m H:1-116 [100450]
        Other proteins in same PDB: d1v7mh2, d1v7mi2, d1v7ml1, d1v7ml2, d1v7mm1, d1v7mm2, d1v7mv_, d1v7mx_
        part of anti-trombopoetin Fab tn1
      2. 1103761Domain d1v7mi1: 1v7m I:1-116 [100452]
        Other proteins in same PDB: d1v7mh2, d1v7mi2, d1v7ml1, d1v7ml2, d1v7mm1, d1v7mm2, d1v7mv_, d1v7mx_
        part of anti-trombopoetin Fab tn1
    33. Domains for 1v7n:
      1. 1103771Domain d1v7nh1: 1v7n H:1-116 [100460]
        Other proteins in same PDB: d1v7nh2, d1v7ni2, d1v7nj2, d1v7nk2, d1v7nl1, d1v7nl2, d1v7nm1, d1v7nm2, d1v7nn1, d1v7nn2, d1v7no1, d1v7no2, d1v7nv_, d1v7nx_, d1v7ny_, d1v7nz_
        part of anti-trombopoetin Fab tn1
      2. 1103772Domain d1v7ni1: 1v7n I:1-116 [100462]
        Other proteins in same PDB: d1v7nh2, d1v7ni2, d1v7nj2, d1v7nk2, d1v7nl1, d1v7nl2, d1v7nm1, d1v7nm2, d1v7nn1, d1v7nn2, d1v7no1, d1v7no2, d1v7nv_, d1v7nx_, d1v7ny_, d1v7nz_
        part of anti-trombopoetin Fab tn1
      3. 1103773Domain d1v7nj1: 1v7n J:1-116 [100464]
        Other proteins in same PDB: d1v7nh2, d1v7ni2, d1v7nj2, d1v7nk2, d1v7nl1, d1v7nl2, d1v7nm1, d1v7nm2, d1v7nn1, d1v7nn2, d1v7no1, d1v7no2, d1v7nv_, d1v7nx_, d1v7ny_, d1v7nz_
        part of anti-trombopoetin Fab tn1
      4. 1103774Domain d1v7nk1: 1v7n K:1-116 [100466]
        Other proteins in same PDB: d1v7nh2, d1v7ni2, d1v7nj2, d1v7nk2, d1v7nl1, d1v7nl2, d1v7nm1, d1v7nm2, d1v7nn1, d1v7nn2, d1v7no1, d1v7no2, d1v7nv_, d1v7nx_, d1v7ny_, d1v7nz_
        part of anti-trombopoetin Fab tn1
    34. Domains for 1wc7:
      1. 1103756Domain d1wc7b1: 1wc7 B:1-113 [144550]
        Other proteins in same PDB: d1wc7a1, d1wc7a2, d1wc7b2, d1wc7h2, d1wc7l1, d1wc7l2
        complexed with iod, pp3
      2. 1103757Domain d1wc7h1: 1wc7 H:1-113 [144552]
        Other proteins in same PDB: d1wc7a1, d1wc7a2, d1wc7b2, d1wc7h2, d1wc7l1, d1wc7l2
        automatically matched to 1WC7 B:1-113
        complexed with iod, pp3
    35. Domains for 1wcb:
      1. 1103753Domain d1wcbb1: 1wcb B:1-113 [144554]
        Other proteins in same PDB: d1wcba1, d1wcba2, d1wcbb2, d1wcbh2, d1wcbl1, d1wcbl2
        automatically matched to 1WC7 B:1-113
        complexed with iod, pe1
      2. 1103754Domain d1wcbh1: 1wcb H:1-113 [144556]
        Other proteins in same PDB: d1wcba1, d1wcba2, d1wcbb2, d1wcbh2, d1wcbl1, d1wcbl2
        automatically matched to 1WC7 B:1-113
        complexed with iod, pe1
    36. Domains for 2bmk:
      1. 1103745Domain d2bmkb1: 2bmk B:1-113 [144992]
        Other proteins in same PDB: d2bmka1, d2bmka2, d2bmkb2, d2bmkh2, d2bmkl1, d2bmkl2
        automatically matched to 1WC7 B:1-113
        complexed with iod, pdd
      2. 1103746Domain d2bmkh1: 2bmk H:1-113 [144994]
        Other proteins in same PDB: d2bmka1, d2bmka2, d2bmkb2, d2bmkh2, d2bmkl1, d2bmkl2
        automatically matched to 1WC7 B:1-113
        complexed with iod, pdd
    37. Domain for 2ck0:
    38. Domain for 2dlf:
    39. Domain for 2mcp:
    40. Domains for 2uud:
      1. 1103768Domain d2uudh1: 2uud H:1-113 [152181]
        complexed with phx
      2. 1103769Domain d2uudj1: 2uud J:1-113 [152182]
        complexed with phx
    41. Domain for 3ck0:
    42. Domain for 3sy0:
    43. Domain for 3t4y:
    44. Domain for 3t65:
    45. Domain for 3t77:
    46. Domain for 4fab:
  9. 1103777Mouse (Mus musculus), cluster 2.1 [TaxId:10090] [88549] (14 PDB entries)
    Uniprot P18527 # HV56_MOUSE Ig heavy chain V region 914; 90% sequence identity
    1. Domains for 1fl3:
      1. 1103792Domain d1fl3a1: 1fl3 A:2-116 [20486]
        Other proteins in same PDB: d1fl3a2, d1fl3b1, d1fl3b2, d1fl3h2, d1fl3l1, d1fl3l2
        part of blue fluorescent Fab 19G2
        complexed with spb
      2. 1103793Domain d1fl3h1: 1fl3 H:2-116 [20484]
        Other proteins in same PDB: d1fl3a2, d1fl3b1, d1fl3b2, d1fl3h2, d1fl3l1, d1fl3l2
        part of blue fluorescent Fab 19G2
        complexed with spb
    2. Domain for 1i9i:
    3. Domain for 1i9j:
    4. Domain for 1jgu:
    5. Domain for 1jgv:
    6. Domains for 1kfa:
      1. 1103796Domain d1kfah1: 1kfa H:2-121 [77361]
        Other proteins in same PDB: d1kfah2, d1kfai2, d1kfal1, d1kfal2, d1kfam1, d1kfam2
        part of anti-gibberellin A4 Fab 4-B8(8)/E9; conflict: annotated in PDB as human protein
        complexed with ga4
      2. 1103797Domain d1kfai1: 1kfa I:3-121 [77363]
        Other proteins in same PDB: d1kfah2, d1kfai2, d1kfal1, d1kfal2, d1kfam1, d1kfam2
        part of anti-gibberellin A4 Fab 4-B8(8)/E9; conflict: annotated in PDB as human protein
        complexed with ga4
    7. Domain for 1l7t:
    8. Domains for 1lo0:
      1. 1103780Domain d1lo0h1: 1lo0 H:1-119 [74115]
        Other proteins in same PDB: d1lo0h2, d1lo0l1, d1lo0l2, d1lo0x1, d1lo0x2, d1lo0y2
        part of retro Diels-Alder catalytic Fab 9D9
        complexed with bc1
      2. 1103781Domain d1lo0y1: 1lo0 Y:1-119 [74121]
        Other proteins in same PDB: d1lo0h2, d1lo0l1, d1lo0l2, d1lo0x1, d1lo0x2, d1lo0y2
        part of retro Diels-Alder catalytic Fab 9D9
        complexed with bc1
    9. Domains for 1lo2:
      1. 1103782Domain d1lo2h1: 1lo2 H:1-119 [74123]
        Other proteins in same PDB: d1lo2h2, d1lo2l1, d1lo2l2, d1lo2x1, d1lo2x2, d1lo2y2
        part of retro Diels-Alder catalytic Fab 9D9
        complexed with ox1
      2. 1103783Domain d1lo2y1: 1lo2 Y:1-119 [74129]
        Other proteins in same PDB: d1lo2h2, d1lo2l1, d1lo2l2, d1lo2x1, d1lo2x2, d1lo2y2
        part of retro Diels-Alder catalytic Fab 9D9
        complexed with ox1
    10. Domains for 1lo3:
      1. 1103787Domain d1lo3h1: 1lo3 H:1-119 [74131]
        Other proteins in same PDB: d1lo3h2, d1lo3l1, d1lo3l2, d1lo3x1, d1lo3x2, d1lo3y2
        part of retro Diels-Alder catalytic Fab 9D9
        complexed with an1
      2. 1103788Domain d1lo3y1: 1lo3 Y:1-119 [74137]
        Other proteins in same PDB: d1lo3h2, d1lo3l1, d1lo3l2, d1lo3x1, d1lo3x2, d1lo3y2
        part of retro Diels-Alder catalytic Fab 9D9
        complexed with an1
    11. Domain for 1lo4:
    12. Domains for 1ub5:
      1. 1103785Domain d1ub5a1: 1ub5 A:1-116 [99143]
        Other proteins in same PDB: d1ub5a2, d1ub5b1, d1ub5b2, d1ub5h2, d1ub5l1, d1ub5l2
        part of blue fluorescent Fab 19G2
        part of anti-testosterone Fab 77
        complexed with spb
      2. 1103786Domain d1ub5h1: 1ub5 H:1-116 [99147]
        Other proteins in same PDB: d1ub5a2, d1ub5b1, d1ub5b2, d1ub5h2, d1ub5l1, d1ub5l2
        part of blue fluorescent Fab 19G2
        part of anti-testosterone Fab 77
        complexed with spb
    13. Domains for 1ub6:
      1. 1103790Domain d1ub6a1: 1ub6 A:2-116 [99151]
        Other proteins in same PDB: d1ub6a2, d1ub6b1, d1ub6b2, d1ub6h2, d1ub6l1, d1ub6l2
        part of blue fluorescent Fab 19G2
      2. 1103791Domain d1ub6h1: 1ub6 H:2-116 [99155]
        Other proteins in same PDB: d1ub6a2, d1ub6b1, d1ub6b2, d1ub6h2, d1ub6l1, d1ub6l2
        part of blue fluorescent Fab 19G2
    14. Domain for 1vpo:
  10. 1103799Mouse (Mus musculus), cluster 2.2 [TaxId:10090] [88550] (53 PDB entries)
    Uniprot P01811 # HV41_MOUSE (P01811) Ig heavy chain V region UPC10
    1. Domain for 1ar1:
    2. Domain for 1bfv:
    3. Domains for 1bln:
      1. 1103839Domain d1blnb1: 1bln B:1-113 [20331]
        Other proteins in same PDB: d1blna1, d1blna2, d1blnb2, d1blnc1, d1blnc2, d1blnd2
        part of anti-P-glycoprotein Fab MRK-16
      2. 1103840Domain d1blnd1: 1bln D:1-113 [20333]
        Other proteins in same PDB: d1blna1, d1blna2, d1blnb2, d1blnc1, d1blnc2, d1blnd2
        part of anti-P-glycoprotein Fab MRK-16
    4. Domain for 1bm3:
    5. Domain for 1bz7:
    6. Domain for 1cfv:
    7. Domain for 1cly:
    8. Domain for 1clz:
    9. Domain for 1dsf:
      • 1103804Domain d1dsfh_: 1dsf H: [20247]
        Other proteins in same PDB: d1dsfl_
        part of anticancer Fv B1; disulfide-stabilized
    10. Domain for 1ejo:
    11. Domain for 1f4w:
    12. Domain for 1f4x:
    13. Domain for 1f4y:
    14. Domain for 1fh5:
    15. Domain for 1frg:
    16. Domain for 1h0d:
    17. Domain for 1h3p:
    18. Domains for 1hil:
      1. 1103806Domain d1hilb1: 1hil B:1-112 [19787]
        Other proteins in same PDB: d1hila1, d1hila2, d1hilb2, d1hilc1, d1hilc2, d1hild2
        part of Fab 17/9
      2. 1103807Domain d1hild1: 1hil D:1-112 [19789]
        Other proteins in same PDB: d1hila1, d1hila2, d1hilb2, d1hilc1, d1hilc2, d1hild2
        part of Fab 17/9
    19. Domains for 1him:
      1. 1103845Domain d1himl1: 1him L:1-112 [19792]
        Other proteins in same PDB: d1himh1, d1himh2, d1himj1, d1himj2, d1himl2, d1himm2
        part of Fab 17/9; chain identifiers are mixed up
      2. 1103846Domain d1himm1: 1him M:1-112 [19794]
        Other proteins in same PDB: d1himh1, d1himh2, d1himj1, d1himj2, d1himl2, d1himm2
        part of Fab 17/9; chain identifiers are mixed up
    20. Domain for 1hin:
    21. Domain for 1i8i:
      • 1103814Domain d1i8ib_: 1i8i B: [71129]
        Other proteins in same PDB: d1i8ia_
        part of dsFv MR1; complex with a EGFR-VIII peptide
        mutant
    22. Domain for 1i8k:
      • 1103801Domain d1i8kb_: 1i8k B: [71131]
        Other proteins in same PDB: d1i8ka_
        part of dsFv MR1; complex with a EGFR-VIII peptide
        mutant
    23. Domain for 1ifh:
    24. Domain for 1igc:
    25. Domains for 1igf:
      1. 1103837Domain d1igfh1: 1igf H:1-113 [19813]
        Other proteins in same PDB: d1igfh2, d1igfj2, d1igfl1, d1igfl2, d1igfm1, d1igfm2
        part of Fab B13I2
        complexed with nag
      2. 1103838Domain d1igfj1: 1igf J:1-113 [19815]
        Other proteins in same PDB: d1igfh2, d1igfj2, d1igfl1, d1igfl2, d1igfm1, d1igfm2
        part of Fab B13I2
        complexed with nag
    26. Domains for 1igt:
      1. 1103842Domain d1igtb1: 1igt B:1-114 [19765]
        Other proteins in same PDB: d1igta1, d1igta2, d1igtb2, d1igtb3, d1igtb4, d1igtc1, d1igtc2, d1igtd2, d1igtd3, d1igtd4
        part of intact IgG2a antibody Mab231
      2. 1103843Domain d1igtd1: 1igt D:1-114 [19767]
        Other proteins in same PDB: d1igta1, d1igta2, d1igtb2, d1igtb3, d1igtb4, d1igtc1, d1igtc2, d1igtd2, d1igtd3, d1igtd4
        part of intact IgG2a antibody Mab231
    27. Domain for 1ikf:
    28. Domain for 1ind:
    29. Domain for 1ine:
    30. Domains for 1kno:
      1. 1103854Domain d1knob1: 1kno B:1-119 [20009]
        Other proteins in same PDB: d1knoa1, d1knoa2, d1knob2, d1knoc1, d1knoc2, d1knod2, d1knoe1, d1knoe2, d1knof2
        part of Fab CNJ206
        complexed with pnp, zn
      2. 1103855Domain d1knod1: 1kno D:1-119 [20011]
        Other proteins in same PDB: d1knoa1, d1knoa2, d1knob2, d1knoc1, d1knoc2, d1knod2, d1knoe1, d1knoe2, d1knof2
        part of Fab CNJ206
        complexed with pnp, zn
      3. 1103856Domain d1knof1: 1kno F:1-119 [20013]
        Other proteins in same PDB: d1knoa1, d1knoa2, d1knob2, d1knoc1, d1knoc2, d1knod2, d1knoe1, d1knoe2, d1knof2
        part of Fab CNJ206
        complexed with pnp, zn
    31. Domains for 1mf2:
      1. 1103828Domain d1mf2h1: 1mf2 H:1-113 [20175]
        Other proteins in same PDB: d1mf2h2, d1mf2l1, d1mf2l2, d1mf2m1, d1mf2m2, d1mf2n2
        part of Fab F11.2.32 against HIV-1 protease
      2. 1103829Domain d1mf2n1: 1mf2 N:1-113 [20177]
        Other proteins in same PDB: d1mf2h2, d1mf2l1, d1mf2l2, d1mf2m1, d1mf2m2, d1mf2n2
        part of Fab F11.2.32 against HIV-1 protease
    32. Domain for 1mqk:
      • 1103800Domain d1mqkh_: 1mqk H: [85053]
        Other proteins in same PDB: d1mqkl_
        part of Fv against Paracoccus denitrificans cytochrome c oxidase
    33. Domain for 1opg:
    34. Domains for 1ots:
      1. 1103847Domain d1otsc1: 1ots C:2-121 [87417]
        Other proteins in same PDB: d1otsa_, d1otsb_, d1otsc2, d1otsd1, d1otsd2, d1otse2, d1otsf1, d1otsf2
        part of anti-CLC chloride channel Fab
        complexed with cl
      2. 1103848Domain d1otse1: 1ots E:2-121 [87421]
        Other proteins in same PDB: d1otsa_, d1otsb_, d1otsc2, d1otsd1, d1otsd2, d1otse2, d1otsf1, d1otsf2
        part of anti-CLC chloride channel Fab
        complexed with cl
    35. Domains for 1ott:
      1. 1103857Domain d1ottc1: 1ott C:2-121 [87427]
        Other proteins in same PDB: d1otta_, d1ottb_, d1ottc2, d1ottd1, d1ottd2, d1otte2, d1ottf1, d1ottf2
        part of anti-CLC chloride channel Fab
        complexed with cl; mutant
      2. 1103858Domain d1otte1: 1ott E:2-121 [87431]
        Other proteins in same PDB: d1otta_, d1ottb_, d1ottc2, d1ottd1, d1ottd2, d1otte2, d1ottf1, d1ottf2
        part of anti-CLC chloride channel Fab
        complexed with cl; mutant
    36. Domains for 1otu:
      1. 1103862Domain d1otuc1: 1otu C:2-121 [87437]
        Other proteins in same PDB: d1otua_, d1otub_, d1otuc2, d1otud1, d1otud2, d1otue2, d1otuf1, d1otuf2
        part of anti-CLC chloride channel Fab
        complexed with cl; mutant
      2. 1103863Domain d1otue1: 1otu E:2-121 [87441]
        Other proteins in same PDB: d1otua_, d1otub_, d1otuc2, d1otud1, d1otud2, d1otue2, d1otuf1, d1otuf2
        part of anti-CLC chloride channel Fab
        complexed with cl; mutant
    37. Domain for 1qfw:
    38. Domain for 1qkz:
    39. Domain for 1qle:
    40. Domains for 1r24:
      1. 1103859Domain d1r24b1: 1r24 B:1-122 [20405]
        Other proteins in same PDB: d1r24a1, d1r24a2, d1r24b2, d1r24c1, d1r24c2, d1r24d2
        part of humanized Fab R24 from murine ascites
      2. 1103860Domain d1r24d1: 1r24 D:1-122 [20407]
        Other proteins in same PDB: d1r24a1, d1r24a2, d1r24b2, d1r24c1, d1r24c2, d1r24d2
        part of humanized Fab R24 from murine ascites
    41. Domain for 1ucb:
    42. Domains for 1uz6:
      1. 1103866Domain d1uz6f1: 1uz6 F:1-113 [108152]
        Other proteins in same PDB: d1uz6e1, d1uz6e2, d1uz6f2, d1uz6h2, d1uz6l1, d1uz6l2, d1uz6m1, d1uz6m2, d1uz6p2, d1uz6v1, d1uz6v2, d1uz6w2
        MQ P01811 P22436 # ! natural chimera
        complexed with so4
      2. 1103867Domain d1uz6h1: 1uz6 H:1-113 [108154]
        Other proteins in same PDB: d1uz6e1, d1uz6e2, d1uz6f2, d1uz6h2, d1uz6l1, d1uz6l2, d1uz6m1, d1uz6m2, d1uz6p2, d1uz6v1, d1uz6v2, d1uz6w2
        MQ P01811 P22436 # ! natural chimera
        complexed with so4
      3. 1103868Domain d1uz6p1: 1uz6 P:1-113 [108160]
        Other proteins in same PDB: d1uz6e1, d1uz6e2, d1uz6f2, d1uz6h2, d1uz6l1, d1uz6l2, d1uz6m1, d1uz6m2, d1uz6p2, d1uz6v1, d1uz6v2, d1uz6w2
        MQ P01811 P22436 # ! natural chimera
        complexed with so4
      4. 1103869Domain d1uz6w1: 1uz6 W:1-113 [108164]
        Other proteins in same PDB: d1uz6e1, d1uz6e2, d1uz6f2, d1uz6h2, d1uz6l1, d1uz6l2, d1uz6m1, d1uz6m2, d1uz6p2, d1uz6v1, d1uz6v2, d1uz6w2
        MQ P01811 P22436 # ! natural chimera
        complexed with so4
    43. Domains for 1uz8:
      1. 1103864Domain d1uz8b1: 1uz8 B:1-113 [108168]
        Other proteins in same PDB: d1uz8a1, d1uz8a2, d1uz8b2, d1uz8h2, d1uz8l1, d1uz8l2
        MQ P01811 P22436 # ! natural chimera
      2. 1103865Domain d1uz8h1: 1uz8 H:1-113 [108170]
        Other proteins in same PDB: d1uz8a1, d1uz8a2, d1uz8b2, d1uz8h2, d1uz8l1, d1uz8l2
        MQ P01811 P22436 # ! natural chimera
    44. Domain for 2bfv:
    45. Domain for 2fbj:
    46. Domains for 2gfb:
      1. 1103870Domain d2gfbb1: 2gfb B:1-119 [19993]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
        part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
      2. 1103871Domain d2gfbd1: 2gfb D:1-119 [19995]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
        part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
      3. 1103872Domain d2gfbf1: 2gfb F:1-119 [19997]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
        part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
      4. 1103873Domain d2gfbh1: 2gfb H:1-119 [19999]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
        part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
      5. 1103874Domain d2gfbj1: 2gfb J:1-119 [20001]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
        part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
      6. 1103875Domain d2gfbl1: 2gfb L:1-119 [20003]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
        part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
      7. 1103876Domain d2gfbn1: 2gfb N:1-119 [20005]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
        part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
      8. 1103877Domain d2gfbp1: 2gfb P:1-119 [20007]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
        part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
    47. Domain for 2h1p:
    48. Domains for 2hff:
      1. 1103802Domain d2hffb1: 2hff B:1-113 [136379]
        Other proteins in same PDB: d2hffb2, d2hffh2
        automatically matched to d1mf2h1
      2. 1103803Domain d2hffh1: 2hff H:1-113 [136381]
        Other proteins in same PDB: d2hffb2, d2hffh2
        automatically matched to d1mf2h1
    49. Domain for 2hfg:
    50. Domains for 2hrp:
      1. 1103815Domain d2hrph1: 2hrp H:1-113 [20171]
        Other proteins in same PDB: d2hrph2, d2hrpl1, d2hrpl2, d2hrpm1, d2hrpm2, d2hrpn2
        part of Fab F11.2.32 against HIV-1 protease
      2. 1103816Domain d2hrpn1: 2hrp N:1-113 [20173]
        Other proteins in same PDB: d2hrph2, d2hrpl1, d2hrpl2, d2hrpm1, d2hrpm2, d2hrpn2
        part of Fab F11.2.32 against HIV-1 protease
    51. Domain for 2igf:
    52. Domain for 2j4w:
    53. Domain for 2j5l:
  11. 1103878Mouse (Mus musculus), cluster 3.1 [TaxId:10090] [88551] (31 PDB entries)
    SQ NA # natural chimera; best hits are: Uniprot P01751 (Ig heavy chain V region B1-8/186-2) and Uniprot P01864 (Ig gamma-2A chain C region secreted form)
    1. Domains for 12e8:
      1. 1103883Domain d12e8h1: 12e8 H:1-114 [20269]
        Other proteins in same PDB: d12e8h2, d12e8l1, d12e8l2, d12e8m1, d12e8m2, d12e8p2
        part of Fab 2E8 specific to the low density lipoprotein receptor binding region of apolipoprotein E
      2. 1103884Domain d12e8p1: 12e8 P:1-114 [20271]
        Other proteins in same PDB: d12e8h2, d12e8l1, d12e8l2, d12e8m1, d12e8m2, d12e8p2
        part of Fab 2E8 specific to the low density lipoprotein receptor binding region of apolipoprotein E
    2. Domain for 15c8:
    3. Domain for 1a3r:
    4. Domain for 1a5f:
    5. Domains for 1ahw:
      1. 1103916Domain d1ahwb1: 1ahw B:1-117 [20219]
        Other proteins in same PDB: d1ahwa1, d1ahwa2, d1ahwb2, d1ahwc1, d1ahwc2, d1ahwd1, d1ahwd2, d1ahwe2, d1ahwf1, d1ahwf2
        part of anti-human tissue factor Fab 5G9
      2. 1103917Domain d1ahwe1: 1ahw E:1-117 [20221]
        Other proteins in same PDB: d1ahwa1, d1ahwa2, d1ahwb2, d1ahwc1, d1ahwc2, d1ahwd1, d1ahwd2, d1ahwe2, d1ahwf1, d1ahwf2
        part of anti-human tissue factor Fab 5G9
    6. Domain for 1aj7:
    7. Domains for 1ap2:
      1. 1103904Domain d1ap2b_: 1ap2 B: [20183]
        Other proteins in same PDB: d1ap2a_, d1ap2c_
        part of P-glycoprotein-specific scFv C219
      2. 1103905Domain d1ap2d_: 1ap2 D: [20185]
        Other proteins in same PDB: d1ap2a_, d1ap2c_
        part of P-glycoprotein-specific scFv C219
    8. Domain for 1bbd:
    9. Domain for 1cr9:
    10. Domain for 1cu4:
    11. Domain for 1dvf:
      • 1103882Domain d1dvfd_: 1dvf D: [20107]
        Other proteins in same PDB: d1dvfa_, d1dvfc_
        part of Fv E5.2, anti-idiotopic antibody to D1.3
        CASP1
        complexed with zn
    12. Domains for 1dzb:
      1. 1103889Domain d1dzba1: 1dzb A:1-117 [20488]
        Other proteins in same PDB: d1dzba2, d1dzbb2, d1dzbx_, d1dzby_
        part of anti-lysozyme scFv 1F9
      2. 1103890Domain d1dzbb1: 1dzb B:1-117 [20490]
        Other proteins in same PDB: d1dzba2, d1dzbb2, d1dzbx_, d1dzby_
        part of anti-lysozyme scFv 1F9
    13. Domain for 1fgn:
    14. Domain for 1gaf:
    15. Domain for 1hkl:
    16. Domain for 1il1:
    17. Domain for 1jnl:
    18. Domain for 1jnn:
    19. Domain for 1k6q:
    20. Domains for 1moe:
      1. 1103906Domain d1moea2: 1moe A:120-240 [85031]
        Other proteins in same PDB: d1moea1, d1moeb1
        part of anti-CEA scFv T84.66; VL to VH linkage: linker residues 112-119; assembles as a diabody
        complexed with so4
      2. 1103907Domain d1moeb2: 1moe B:120-240 [85033]
        Other proteins in same PDB: d1moea1, d1moeb1
        part of anti-CEA scFv T84.66; VL to VH linkage: linker residues 112-119; assembles as a diabody
        complexed with so4
    21. Domain for 1qbl:
    22. Domain for 1qbm:
    23. Domain for 1qok:
    24. Domain for 1wej:
    25. Domain for 25c8:
    26. Domains for 2ap2:
      1. 1103902Domain d2ap2b_: 2ap2 B: [20179]
        Other proteins in same PDB: d2ap2a_, d2ap2c_
        part of P-glycoprotein-specific scFv C219
      2. 1103903Domain d2ap2d_: 2ap2 D: [20181]
        Other proteins in same PDB: d2ap2a_, d2ap2c_
        part of P-glycoprotein-specific scFv C219
    27. Domain for 2bdn:
    28. Domains for 2gsi:
      1. 1103908Domain d2gsib1: 2gsi B:2-114 [145221]
        Other proteins in same PDB: d2gsia1, d2gsia2, d2gsib2, d2gsic1, d2gsic2, d2gsid2, d2gsie1, d2gsie2, d2gsif2, d2gsig1, d2gsig2, d2gsih2
        complexed with na
      2. 1103909Domain d2gsid1: 2gsi D:2-114 [145223]
        Other proteins in same PDB: d2gsia1, d2gsia2, d2gsib2, d2gsic1, d2gsic2, d2gsid2, d2gsie1, d2gsie2, d2gsif2, d2gsig1, d2gsig2, d2gsih2
        automatically matched to 2GSI B:2-114
        complexed with na
      3. 1103910Domain d2gsif1: 2gsi F:2-114 [145225]
        Other proteins in same PDB: d2gsia1, d2gsia2, d2gsib2, d2gsic1, d2gsic2, d2gsid2, d2gsie1, d2gsie2, d2gsif2, d2gsig1, d2gsig2, d2gsih2
        automatically matched to 2GSI B:2-114
        complexed with na
      4. 1103911Domain d2gsih1: 2gsi H:2-114 [145227]
        Other proteins in same PDB: d2gsia1, d2gsia2, d2gsib2, d2gsic1, d2gsic2, d2gsid2, d2gsie1, d2gsie2, d2gsif2, d2gsig1, d2gsig2, d2gsih2
        automatically matched to 2GSI B:2-114
        complexed with na
    29. Domain for 2hh0:
    30. Domain for 2rcs:
    31. Domain for 35c8:
  12. 1103919Mouse (Mus musculus), cluster 3.2 [TaxId:10090] [88552] (152 PDB entries)
    Uniprot P01756 1-117 # 78% sequense identity; HV12_MOUSE Ig heavy chain V region MOPC 104E ! SQ NA # humanized antibody ! Uniprot P01750 # HV06_MOUSE Ig heavy chain V region 102 precursor ! Uniprot P01750 20-116 # ! HV06_MOUSE Ig heavy chain V region 102 precursor
    1. Domain for 1a0q:
    2. Domain for 1a14:
      • 1104026Domain d1a14h_: 1a14 H: [20061]
        Other proteins in same PDB: d1a14l_, d1a14n_
        part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
        complexed with ca, man, nag, ndg
    3. Domain for 1a3l:
    4. Domains for 1a6t:
      1. 1104014Domain d1a6tb1: 1a6t B:1-113 [20249]
        Other proteins in same PDB: d1a6ta1, d1a6ta2, d1a6tb2, d1a6tc1, d1a6tc2, d1a6td2
        part of human rhinovirus 14 neutralizing Fab Mab1-IA
      2. 1104015Domain d1a6td1: 1a6t D:1-113 [20251]
        Other proteins in same PDB: d1a6ta1, d1a6ta2, d1a6tb2, d1a6tc1, d1a6tc2, d1a6td2
        part of human rhinovirus 14 neutralizing Fab Mab1-IA
    5. Domain for 1a6u:
      • 1103969Domain d1a6uh_: 1a6u H: [20255]
        Other proteins in same PDB: d1a6ul_
        part of Fv B1-8; this domain is identical to the N-terminal domain of scFv 1NQB
    6. Domains for 1a6v:
      1. 1104005Domain d1a6vh_: 1a6v H: [20257]
        Other proteins in same PDB: d1a6vl_, d1a6vm_, d1a6vn_
        part of Fv B1-8; this domain is identical to the N-terminal domain of scFv 1NQB
        complexed with npc
      2. 1104006Domain d1a6vi_: 1a6v I: [20259]
        Other proteins in same PDB: d1a6vl_, d1a6vm_, d1a6vn_
        part of Fv B1-8; this domain is identical to the N-terminal domain of scFv 1NQB
        complexed with npc
      3. 1104007Domain d1a6vj_: 1a6v J: [20261]
        Other proteins in same PDB: d1a6vl_, d1a6vm_, d1a6vn_
        part of Fv B1-8; this domain is identical to the N-terminal domain of scFv 1NQB
        complexed with npc
    7. Domain for 1a6w:
      • 1103938Domain d1a6wh_: 1a6w H: [20253]
        Other proteins in same PDB: d1a6wl_
        part of Fv B1-8; this domain is identical to the N-terminal domain of scFv 1NQB
        complexed with nip
    8. Domain for 1ae6:
    9. Domains for 1afv:
      1. 1104106Domain d1afvh1: 1afv H:1-120 [20131]
        Other proteins in same PDB: d1afva_, d1afvb_, d1afvh2, d1afvk2, d1afvl1, d1afvl2, d1afvm1, d1afvm2
        part of Fab 25.3 against HIV-1 capsid protein (p24)
        complexed with pb
      2. 1104107Domain d1afvk1: 1afv K:1-120 [20133]
        Other proteins in same PDB: d1afva_, d1afvb_, d1afvh2, d1afvk2, d1afvl1, d1afvl2, d1afvm1, d1afvm2
        part of Fab 25.3 against HIV-1 capsid protein (p24)
        complexed with pb
    10. Domains for 1axs:
      1. 1104054Domain d1axsb1: 1axs B:1-113 [20201]
        Other proteins in same PDB: d1axsa1, d1axsa2, d1axsb2, d1axsh2, d1axsl1, d1axsl2
        part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28
        complexed with cd, hop
      2. 1104055Domain d1axsh1: 1axs H:1-113 [20199]
        Other proteins in same PDB: d1axsa1, d1axsa2, d1axsb2, d1axsh2, d1axsl1, d1axsl2
        part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28
        complexed with cd, hop
    11. Domain for 1b4j:
    12. Domains for 1bbj:
      1. 1104071Domain d1bbjb1: 1bbj B:1-115 [118420]
        Other proteins in same PDB: d1bbja1, d1bbja2, d1bbjb2, d1bbjh2, d1bbjl1, d1bbjl2
        duplicate of 1BBJ H:1-115
      2. 1104072Domain d1bbjh1: 1bbj H:1-115 [19785]
        Other proteins in same PDB: d1bbja1, d1bbja2, d1bbjb2, d1bbjh2, d1bbjl1, d1bbjl2
        part of humanized Fab B72.3
    13. Domain for 1bog:
    14. Domain for 1bql:
    15. Domain for 1c5b:
    16. Domain for 1c5c:
    17. Domain for 1cfn:
    18. Domain for 1cfq:
    19. Domain for 1cfs:
    20. Domain for 1cft:
    21. Domain for 1cgs:
    22. Domain for 1cic:
    23. Domains for 1d5b:
      1. 1104081Domain d1d5bb1: 1d5b B:1-113 [20205]
        Other proteins in same PDB: d1d5ba1, d1d5ba2, d1d5bb2, d1d5bh2, d1d5bl1, d1d5bl2
        part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28
        complexed with cd
      2. 1104082Domain d1d5bh1: 1d5b H:1-113 [20203]
        Other proteins in same PDB: d1d5ba1, d1d5ba2, d1d5bb2, d1d5bh2, d1d5bl1, d1d5bl2
        part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28
        complexed with cd
    24. Domain for 1d5i:
    25. Domain for 1d6v:
    26. Domain for 1e4w:
    27. Domains for 1e4x:
      1. 1103974Domain d1e4xh1: 1e4x H:1-110 [59236]
        Other proteins in same PDB: d1e4xh2, d1e4xi2, d1e4xl1, d1e4xl2, d1e4xm1, d1e4xm2
        part of anti-TGFalpha Fab TAB2
      2. 1103975Domain d1e4xi1: 1e4x I:1-110 [59238]
        Other proteins in same PDB: d1e4xh2, d1e4xi2, d1e4xl1, d1e4xl2, d1e4xm1, d1e4xm2
        part of anti-TGFalpha Fab TAB2
    28. Domain for 1e6j:
    29. Domain for 1e6o:
    30. Domain for 1eap:
    31. Domain for 1egj:
    32. Domain for 1ehl:
    33. Domain for 1emt:
    34. Domain for 1eo8:
    35. Domains for 1f11:
      1. 1104063Domain d1f11b1: 1f11 B:1-113 [20457]
        Other proteins in same PDB: d1f11a1, d1f11a2, d1f11b2, d1f11c1, d1f11c2, d1f11d2
        part of anti-Pres2 Fab F124
      2. 1104064Domain d1f11d1: 1f11 D:1-113 [20459]
        Other proteins in same PDB: d1f11a1, d1f11a2, d1f11b2, d1f11c1, d1f11c2, d1f11d2
        part of anti-Pres2 Fab F124
    36. Domains for 1f3d:
      1. 1103933Domain d1f3dh1: 1f3d H:1-121 [20462]
        Other proteins in same PDB: d1f3dh2, d1f3dj1, d1f3dj2, d1f3dk2, d1f3dl1, d1f3dl2
        part of catalytic Fab 4B2
        complexed with so4, tpm
      2. 1103934Domain d1f3dk1: 1f3d K:1-121 [20463]
        Other proteins in same PDB: d1f3dh2, d1f3dj1, d1f3dj2, d1f3dk2, d1f3dl1, d1f3dl2
        part of catalytic Fab 4B2
        complexed with so4, tpm
    37. Domain for 1fai:
    38. Domains for 1fbi:
      1. 1104074Domain d1fbih1: 1fbi H:1-121 [20025]
        Other proteins in same PDB: d1fbih2, d1fbil1, d1fbil2, d1fbip1, d1fbip2, d1fbiq2, d1fbix_, d1fbiy_
        part of Fab F9.13.7
      2. 1104075Domain d1fbiq1: 1fbi Q:1-121 [20027]
        Other proteins in same PDB: d1fbih2, d1fbil1, d1fbil2, d1fbip1, d1fbip2, d1fbiq2, d1fbix_, d1fbiy_
        part of Fab F9.13.7
    39. Domain for 1fig:
    40. Domain for 1for:
    41. Domain for 1fpt:
    42. Domains for 1fsk:
      1. 1104100Domain d1fskc1: 1fsk C:1-118 [20467]
        Other proteins in same PDB: d1fska_, d1fskb1, d1fskb2, d1fskc2, d1fskd_, d1fske1, d1fske2, d1fskf2, d1fskg_, d1fskh1, d1fskh2, d1fski2, d1fskj_, d1fskk1, d1fskk2, d1fskl2
        part of anti-bet v1 Fab BV16
      2. 1104101Domain d1fskf1: 1fsk F:1-118 [20469]
        Other proteins in same PDB: d1fska_, d1fskb1, d1fskb2, d1fskc2, d1fskd_, d1fske1, d1fske2, d1fskf2, d1fskg_, d1fskh1, d1fskh2, d1fski2, d1fskj_, d1fskk1, d1fskk2, d1fskl2
        part of anti-bet v1 Fab BV16
      3. 1104102Domain d1fski1: 1fsk I:1-118 [20471]
        Other proteins in same PDB: d1fska_, d1fskb1, d1fskb2, d1fskc2, d1fskd_, d1fske1, d1fske2, d1fskf2, d1fskg_, d1fskh1, d1fskh2, d1fski2, d1fskj_, d1fskk1, d1fskk2, d1fskl2
        part of anti-bet v1 Fab BV16
      4. 1104103Domain d1fskl1: 1fsk L:1-118 [20473]
        Other proteins in same PDB: d1fska_, d1fskb1, d1fskb2, d1fskc2, d1fskd_, d1fske1, d1fske2, d1fskf2, d1fskg_, d1fskh1, d1fskh2, d1fski2, d1fskj_, d1fskk1, d1fskk2, d1fskl2
        part of anti-bet v1 Fab BV16
    43. Domain for 1h8n:
    44. Domains for 1h8o:
      1. 1104027Domain d1h8oa2: 1h8o A:132-243 [60786]
        Other proteins in same PDB: d1h8oa1, d1h8ob1
        part of anti-ampicillin scFv
        complexed with so4; mutant
      2. 1104028Domain d1h8ob2: 1h8o B:133-243 [60788]
        Other proteins in same PDB: d1h8oa1, d1h8ob1
        part of anti-ampicillin scFv
        complexed with so4; mutant
    45. Domains for 1h8s:
      1. 1104002Domain d1h8sa2: 1h8s A:132-243 [60790]
        Other proteins in same PDB: d1h8sa1, d1h8sb1
        part of anti-ampicillin scFv
        complexed with aic, so4; mutant
      2. 1104003Domain d1h8sb2: 1h8s B:133-243 [60792]
        Other proteins in same PDB: d1h8sa1, d1h8sb1
        part of anti-ampicillin scFv
        complexed with aic, so4; mutant
    46. Domain for 1hh6:
    47. Domain for 1hh9:
    48. Domain for 1hi6:
    49. Domain for 1i3g:
      • 1103989Domain d1i3gh_: 1i3g H: [66018]
        Other proteins in same PDB: d1i3gl_
        part of anti-ampicillin scFv
        complexed with mpd
    50. Domains for 1i8m:
      1. 1103977Domain d1i8mb1: 1i8m B:1-113 [66084]
        Other proteins in same PDB: d1i8ma1, d1i8ma2, d1i8mb2, d1i8mh2, d1i8ml1, d1i8ml2
        part of anti-ssDNA Fab
        protein/DNA complex; complexed with so4
      2. 1103978Domain d1i8mh1: 1i8m H:1-113 [66086]
        Other proteins in same PDB: d1i8ma1, d1i8ma2, d1i8mb2, d1i8mh2, d1i8ml1, d1i8ml2
        part of anti-ssDNA Fab
        protein/DNA complex; complexed with so4
    51. Domain for 1igi:
    52. Domains for 1igj:
      1. 1104018Domain d1igjb1: 1igj B:2-114 [19819]
        Other proteins in same PDB: d1igja1, d1igja2, d1igjb2, d1igjc1, d1igjc2, d1igjd2
        part of Fab 26-10
        complexed with dgx
      2. 1104019Domain d1igjd1: 1igj D:2-114 [19821]
        Other proteins in same PDB: d1igja1, d1igja2, d1igjb2, d1igjc1, d1igjc2, d1igjd2
        part of Fab 26-10
        complexed with dgx
    53. Domains for 1igy:
      1. 1104098Domain d1igyb1: 1igy B:2-113 [19769]
        Other proteins in same PDB: d1igya1, d1igya2, d1igyb2, d1igyb3, d1igyb4, d1igyc1, d1igyc2, d1igyd2, d1igyd3, d1igyd4
        part of intact IgG1 antibody Mab61.1.3
      2. 1104099Domain d1igyd1: 1igy D:2-113 [19771]
        Other proteins in same PDB: d1igya1, d1igya2, d1igyb2, d1igyb3, d1igyb4, d1igyc1, d1igyc2, d1igyd2, d1igyd3, d1igyd4
        part of intact IgG1 antibody Mab61.1.3
    54. Domain for 1iqw:
    55. Domains for 1j05:
      1. 1103922Domain d1j05b_: 1j05 B: [90736]
        Other proteins in same PDB: d1j05a_, d1j05l_
        part of anti-CEA Fv T84.66
        complexed with gol, po4
      2. 1103923Domain d1j05h_: 1j05 H: [90737]
        Other proteins in same PDB: d1j05a_, d1j05l_
        part of anti-CEA Fv T84.66
        complexed with gol, po4
    56. Domain for 1jfq:
    57. Domain for 1jhl:
    58. Domain for 1jn6:
    59. Domains for 1jnh:
      1. 1104056Domain d1jnhb1: 1jnh B:1-117 [66941]
        Other proteins in same PDB: d1jnha1, d1jnha2, d1jnhb2, d1jnhc1, d1jnhc2, d1jnhd2, d1jnhe1, d1jnhe2, d1jnhf2, d1jnhg1, d1jnhg2, d1jnhh2
        part of anti-estradiol Fab 10G6D6
        complexed with eco
      2. 1104057Domain d1jnhd1: 1jnh D:1-117 [66945]
        Other proteins in same PDB: d1jnha1, d1jnha2, d1jnhb2, d1jnhc1, d1jnhc2, d1jnhd2, d1jnhe1, d1jnhe2, d1jnhf2, d1jnhg1, d1jnhg2, d1jnhh2
        part of anti-estradiol Fab 10G6D6
        complexed with eco
      3. 1104058Domain d1jnhf1: 1jnh F:1-117 [66949]
        Other proteins in same PDB: d1jnha1, d1jnha2, d1jnhb2, d1jnhc1, d1jnhc2, d1jnhd2, d1jnhe1, d1jnhe2, d1jnhf2, d1jnhg1, d1jnhg2, d1jnhh2
        part of anti-estradiol Fab 10G6D6
        complexed with eco
      4. 1104059Domain d1jnhh1: 1jnh H:1-117 [66953]
        Other proteins in same PDB: d1jnha1, d1jnha2, d1jnhb2, d1jnhc1, d1jnhc2, d1jnhd2, d1jnhe1, d1jnhe2, d1jnhf2, d1jnhg1, d1jnhg2, d1jnhh2
        part of anti-estradiol Fab 10G6D6
        complexed with eco
    60. Domain for 1k4c:
    61. Domain for 1k4d:
    62. Domain for 1kb5:
    63. Domain for 1keg:
    64. Domain for 1kn2:
    65. Domain for 1kn4:
    66. Domain for 1ktr:
    67. Domains for 1lmk:
      1. 1104043Domain d1lmka1: 1lmk A:2-127 [20034]
        Other proteins in same PDB: d1lmka2, d1lmkc2, d1lmke2, d1lmkg2
        part of scFv diabody L5MK16
      2. 1104044Domain d1lmkc1: 1lmk C:2-127 [20036]
        Other proteins in same PDB: d1lmka2, d1lmkc2, d1lmke2, d1lmkg2
        part of scFv diabody L5MK16
      3. 1104045Domain d1lmke1: 1lmk E:2-127 [20038]
        Other proteins in same PDB: d1lmka2, d1lmkc2, d1lmke2, d1lmkg2
        part of scFv diabody L5MK16
      4. 1104046Domain d1lmkg1: 1lmk G:2-127 [20040]
        Other proteins in same PDB: d1lmka2, d1lmkc2, d1lmke2, d1lmkg2
        part of scFv diabody L5MK16
    68. Domain for 1mex:
    69. Domain for 1mfa:
    70. Domain for 1mfb:
    71. Domain for 1mfc:
    72. Domain for 1mfd:
    73. Domain for 1mfe:
    74. Domains for 1mh5:
      1. 1103980Domain d1mh5b1: 1mh5 B:2-113 [91268]
        Other proteins in same PDB: d1mh5a1, d1mh5a2, d1mh5b2, d1mh5h2, d1mh5l1, d1mh5l2
        part of the esterolytic Fab ms6-164
        complexed with hal, so4
      2. 1103981Domain d1mh5h1: 1mh5 H:2-113 [91270]
        Other proteins in same PDB: d1mh5a1, d1mh5a2, d1mh5b2, d1mh5h2, d1mh5l1, d1mh5l2
        part of the esterolytic Fab ms6-164
        complexed with hal, so4
    75. Domain for 1mie:
    76. Domain for 1mim:
    77. Domain for 1mj7:
    78. Domain for 1mj8:
    79. Domains for 1mjj:
      1. 1103953Domain d1mjjb1: 1mjj B:1-113 [91296]
        Other proteins in same PDB: d1mjja1, d1mjja2, d1mjjb2, d1mjjh2, d1mjjl1, d1mjjl2
        part of the esterolytic Fab ms6-164
        complexed with hal, so4
      2. 1103954Domain d1mjjh1: 1mjj H:1-113 [91298]
        Other proteins in same PDB: d1mjja1, d1mjja2, d1mjjb2, d1mjjh2, d1mjjl1, d1mjjl2
        part of the esterolytic Fab ms6-164
        complexed with hal, so4
    80. Domain for 1mju:
    81. Domain for 1mlb:
    82. Domains for 1mlc:
      1. 1104038Domain d1mlcb1: 1mlc B:1-118 [20053]
        Other proteins in same PDB: d1mlca1, d1mlca2, d1mlcb2, d1mlcc1, d1mlcc2, d1mlcd2, d1mlce_, d1mlcf_
        part of Fab D44.1
      2. 1104039Domain d1mlcd1: 1mlc D:1-118 [20055]
        Other proteins in same PDB: d1mlca1, d1mlca2, d1mlcb2, d1mlcc1, d1mlcc2, d1mlcd2, d1mlce_, d1mlcf_
        part of Fab D44.1
    83. Domain for 1mnu:
    84. Domain for 1mpa:
    85. Domain for 1mrc:
    86. Domain for 1mrd:
    87. Domain for 1mre:
    88. Domain for 1mrf:
    89. Domain for 1mvu:
      • 1103932Domain d1mvub_: 1mvu B: [91475]
        Other proteins in same PDB: d1mvua_
        part of P-glycoprotein-specific scFv C219; complexed with synthetic epitope peptide, chain P
        complexed with so4; mutant
    90. Domain for 1n7m:
      • 1103935Domain d1n7ml1: 1n7m L:1-114 [80254]
        Other proteins in same PDB: d1n7mh1, d1n7mh2, d1n7ml2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; germline antibody; chain identifiers are probably mixed up
        complexed with mmp
    91. Domain for 1ngp:
    92. Domain for 1ngq:
    93. Domains for 1ngw:
      1. 1104119Domain d1ngwb1: 1ngw B:1-114 [80490]
        Other proteins in same PDB: d1ngwa1, d1ngwa2, d1ngwb2, d1ngwh2, d1ngwl1, d1ngwl2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric affinity matured antibody
        complexed with mmp
      2. 1104120Domain d1ngwh1: 1ngw H:1-114 [80492]
        Other proteins in same PDB: d1ngwa1, d1ngwa2, d1ngwb2, d1ngwh2, d1ngwl1, d1ngwl2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric affinity matured antibody
        complexed with mmp
    94. Domains for 1ngx:
      1. 1104114Domain d1ngxb1: 1ngx B:1-114 [85704]
        Other proteins in same PDB: d1ngxa1, d1ngxa2, d1ngxb2, d1ngxh2, d1ngxl1, d1ngxl2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric germline antibody
        complexed with jef
      2. 1104115Domain d1ngxh1: 1ngx H:1-114 [85706]
        Other proteins in same PDB: d1ngxa1, d1ngxa2, d1ngxb2, d1ngxh2, d1ngxl1, d1ngxl2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric germline antibody
        complexed with jef
    95. Domain for 1ngy:
    96. Domain for 1ngz:
    97. Domains for 1nj9:
      1. 1104033Domain d1nj9b1: 1nj9 B:1-113 [91899]
        Other proteins in same PDB: d1nj9a1, d1nj9a2, d1nj9b2, d1nj9h2, d1nj9l1, d1nj9l2
        part of cocaine hydrolytic Fab 15a10
        complexed with na
      2. 1104034Domain d1nj9h1: 1nj9 H:1-113 [91901]
        Other proteins in same PDB: d1nj9a1, d1nj9a2, d1nj9b2, d1nj9h2, d1nj9l1, d1nj9l2
        part of cocaine hydrolytic Fab 15a10
        complexed with na
    98. Domain for 1nma:
      • 1104077Domain d1nmah_: 1nma H: [20065]
        Other proteins in same PDB: d1nmal_, d1nman_
        part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
        complexed with nag; mutant
    99. Domain for 1nmb:
      • 1103994Domain d1nmbh_: 1nmb H: [20063]
        Other proteins in same PDB: d1nmbl_, d1nmbn_
        part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
        complexed with ca, nag
    100. Domains for 1nmc:
      1. 1104035Domain d1nmcb_: 1nmc B: [20058]
        Other proteins in same PDB: d1nmca_, d1nmcc_, d1nmcl_, d1nmcn_
        part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
        complexed with ca, man, nag
      2. 1104036Domain d1nmch_: 1nmc H: [20057]
        Other proteins in same PDB: d1nmca_, d1nmcc_, d1nmcl_, d1nmcn_
        part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
        complexed with ca, man, nag
    101. Domains for 1nqb:
      1. 1103943Domain d1nqba1: 1nqb A:2-120 [20042]
        Other proteins in same PDB: d1nqba2, d1nqbc2
        part of scFv trivalent antibody; N-terminal, VH domain is from B1-8 antibody (1A6U CH H); C-terminal, VL domain is from NQ11 antibody
      2. 1103944Domain d1nqbc1: 1nqb C:2-120 [20044]
        Other proteins in same PDB: d1nqba2, d1nqbc2
        part of scFv trivalent antibody; N-terminal, VH domain is from B1-8 antibody (1A6U CH H); C-terminal, VL domain is from NQ11 antibody
    102. Domains for 1p2c:
      1. 1103957Domain d1p2cb1: 1p2c B:301-413 [93917]
        Other proteins in same PDB: d1p2ca1, d1p2ca2, d1p2cb2, d1p2cc_, d1p2cd1, d1p2cd2, d1p2ce2, d1p2cf_
        part of anti-lysozyme Fab F10.6.6
      2. 1103958Domain d1p2ce1: 1p2c E:1201-1313 [93922]
        Other proteins in same PDB: d1p2ca1, d1p2ca2, d1p2cb2, d1p2cc_, d1p2cd1, d1p2cd2, d1p2ce2, d1p2cf_
        part of anti-lysozyme Fab F10.6.6
    103. Domains for 1p7k:
      1. 1103930Domain d1p7kb1: 1p7k B:1-113 [94289]
        Other proteins in same PDB: d1p7ka1, d1p7ka2, d1p7kb2, d1p7kh2, d1p7kl1, d1p7kl2
        part of anti-ssDNA Fab
        complexed with 1pe, epe, gol, peg, so4
      2. 1103931Domain d1p7kh1: 1p7k H:1-113 [94291]
        Other proteins in same PDB: d1p7ka1, d1p7ka2, d1p7kb2, d1p7kh2, d1p7kl1, d1p7kl2
        part of anti-ssDNA Fab
        complexed with 1pe, epe, gol, peg, so4
    104. Domains for 1pg7:
      1. 1104024Domain d1pg7x1: 1pg7 X:1-113 [94684]
        Other proteins in same PDB: d1pg7h2, d1pg7i2, d1pg7l1, d1pg7l2, d1pg7m1, d1pg7m2, d1pg7w1, d1pg7w2, d1pg7x2, d1pg7y1, d1pg7y2, d1pg7z2
        part of Fab 6A6
      2. 1104025Domain d1pg7z1: 1pg7 Z:1-113 [94688]
        Other proteins in same PDB: d1pg7h2, d1pg7i2, d1pg7l1, d1pg7l2, d1pg7m1, d1pg7m2, d1pg7w1, d1pg7w2, d1pg7x2, d1pg7y1, d1pg7y2, d1pg7z2
        part of Fab 6A6
    105. Domains for 1pkq:
      1. 1104104Domain d1pkqb1: 1pkq B:1-113 [88150]
        Other proteins in same PDB: d1pkqa1, d1pkqa2, d1pkqb2, d1pkqe_, d1pkqf1, d1pkqf2, d1pkqg2, d1pkqj_
        part of humanized Fab 8-18c5
      2. 1104105Domain d1pkqg1: 1pkq G:1-113 [88155]
        Other proteins in same PDB: d1pkqa1, d1pkqa2, d1pkqb2, d1pkqe_, d1pkqf1, d1pkqf2, d1pkqg2, d1pkqj_
        part of humanized Fab 8-18c5
    106. Domain for 1plg:
    107. Domain for 1psk:
    108. Domain for 1q0x:
    109. Domain for 1q0y:
    110. Domain for 1qfu:
    111. Domain for 1qfw:
    112. Domain for 1qnz:
    113. Domain for 1r3i:
    114. Domain for 1r3j:
    115. Domain for 1r3k:
    116. Domain for 1r3l:
    117. Domain for 1rih:
    118. Domain for 1rmf:
    119. Domain for 1ruq:
    120. Domain for 1rur:
    121. Domain for 1rvf:
    122. Domain for 1s5h:
    123. Domain for 1sy6:
    124. Domain for 1um4:
    125. Domain for 1um5:
    126. Domain for 1um6:
    127. Domains for 1uwe:
      1. 1104066Domain d1uweh1: 1uwe H:4-113 [100103]
        Other proteins in same PDB: d1uweh2, d1uwel1, d1uwel2, d1uweu1, d1uweu2, d1uwev2, d1uwex1, d1uwex2, d1uwey2
        part of catalytic Fab 14d9
      2. 1104067Domain d1uwev1: 1uwe V:4-113 [100109]
        Other proteins in same PDB: d1uweh2, d1uwel1, d1uwel2, d1uweu1, d1uweu2, d1uwev2, d1uwex1, d1uwex2, d1uwey2
        part of catalytic Fab 14d9
      3. 1104068Domain d1uwey1: 1uwe Y:4-113 [100113]
        Other proteins in same PDB: d1uweh2, d1uwel1, d1uwel2, d1uweu1, d1uweu2, d1uwev2, d1uwex1, d1uwex2, d1uwey2
        part of catalytic Fab 14d9
    128. Domains for 1uwg:
      1. 1104060Domain d1uwgh1: 1uwg H:3-113 [100115]
        Other proteins in same PDB: d1uwgh2, d1uwgl1, d1uwgl2, d1uwgx1, d1uwgx2, d1uwgy2
        part of catalytic Fab 14d9
        complexed with kha, po4
      2. 1104061Domain d1uwgy1: 1uwg Y:3-113 [100121]
        Other proteins in same PDB: d1uwgh2, d1uwgl1, d1uwgl2, d1uwgx1, d1uwgx2, d1uwgy2
        part of catalytic Fab 14d9
        complexed with kha, po4
    129. Domains for 1xiw:
      1. 1103939Domain d1xiwd_: 1xiw D: [115370]
        Other proteins in same PDB: d1xiwa_, d1xiwb_, d1xiwc_, d1xiwe_, d1xiwf_, d1xiwg_
      2. 1103940Domain d1xiwh_: 1xiw H: [115374]
        Other proteins in same PDB: d1xiwa_, d1xiwb_, d1xiwc_, d1xiwe_, d1xiwf_, d1xiwg_
    130. Domain for 1yec:
    131. Domains for 1yed:
      1. 1104079Domain d1yedb1: 1yed B:1-113 [20151]
        Other proteins in same PDB: d1yeda1, d1yeda2, d1yedb2, d1yedh2, d1yedl1, d1yedl2
        part of Fab D2.4
        complexed with pnb
      2. 1104080Domain d1yedh1: 1yed H:1-113 [20149]
        Other proteins in same PDB: d1yeda1, d1yeda2, d1yedb2, d1yedh2, d1yedl1, d1yedl2
        part of Fab D2.4
        complexed with pnb
    132. Domain for 1yee:
    133. Domain for 1yef:
    134. Domain for 1yeg:
    135. Domain for 1yeh:
    136. Domain for 1yei:
    137. Domain for 1yej:
    138. Domain for 1yek:
    139. Domains for 1yuh:
      1. 1104092Domain d1yuhb1: 1yuh B:1-118 [20099]
        Other proteins in same PDB: d1yuha1, d1yuha2, d1yuhb2, d1yuhh2, d1yuhl1, d1yuhl2
        part of an anti-nitrophenol Fab
        complexed with np
      2. 1104093Domain d1yuhh1: 1yuh H:1-118 [20097]
        Other proteins in same PDB: d1yuha1, d1yuha2, d1yuhb2, d1yuhh2, d1yuhl1, d1yuhl2
        part of an anti-nitrophenol Fab
        complexed with np
    140. Domains for 1za6:
      1. 1104087Domain d1za6b1: 1za6 B:2-115 [124806]
        Other proteins in same PDB: d1za6b2, d1za6b3, d1za6d2, d1za6d3, d1za6f2, d1za6f3, d1za6h2, d1za6h3
        automatically matched to d1igyb1
      2. 1104088Domain d1za6d1: 1za6 D:2-115 [124809]
        Other proteins in same PDB: d1za6b2, d1za6b3, d1za6d2, d1za6d3, d1za6f2, d1za6f3, d1za6h2, d1za6h3
        automatically matched to d1igyb1
      3. 1104089Domain d1za6f1: 1za6 F:2-115 [124812]
        Other proteins in same PDB: d1za6b2, d1za6b3, d1za6d2, d1za6d3, d1za6f2, d1za6f3, d1za6h2, d1za6h3
        automatically matched to d1igyb1
      4. 1104090Domain d1za6h1: 1za6 H:2-115 [124815]
        Other proteins in same PDB: d1za6b2, d1za6b3, d1za6d2, d1za6d3, d1za6f2, d1za6f3, d1za6h2, d1za6h3
        automatically matched to d1igyb1
    141. Domain for 2cgr:
    142. Domain for 2dtg:
    143. Domain for 2f19:
    144. Domain for 2fat:
    145. Domain for 2fd6:
    146. Domain for 2iff:
    147. Domain for 2jel:
    148. Domain for 2mpa:
    149. Domains for 2pcp:
      1. 1104008Domain d2pcpb1: 2pcp B:1-113 [20371]
        Other proteins in same PDB: d2pcpa1, d2pcpa2, d2pcpb2, d2pcpc1, d2pcpc2, d2pcpd2
        part of Fab 6B5
        complexed with 1pc
      2. 1104009Domain d2pcpd1: 2pcp D:1-113 [20373]
        Other proteins in same PDB: d2pcpa1, d2pcpa2, d2pcpb2, d2pcpc1, d2pcpc2, d2pcpd2
        part of Fab 6B5
        complexed with 1pc
    150. Domain for 3bt2:
    151. Domains for 3fct:
      1. 1103997Domain d3fctb1: 3fct B:1-114 [20375]
        Other proteins in same PDB: d3fcta1, d3fcta2, d3fctb2, d3fctc1, d3fctc2, d3fctd2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; mature antibody
        complexed with ca, cd, mg, mmp, na
      2. 1103998Domain d3fctd1: 3fct D:1-114 [20377]
        Other proteins in same PDB: d3fcta1, d3fcta2, d3fctb2, d3fctc1, d3fctc2, d3fctd2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; mature antibody
        complexed with ca, cd, mg, mmp, na
    152. Domain for 6fab:
  13. 1104121Mouse (Mus musculus), cluster 3.3 [TaxId:10090] [88553] (1 PDB entry)
  14. 1104124Mouse (Mus musculus), cluster 4 [TaxId:10090] [88554] (32 PDB entries)
    Uniprot P06327 20-117 # HV52_MOUSE (P06327) Ig heavy chain V region VH558 A1/A4 precursor; 57% sequence identity ! Uniprot P01631 # KV2G_MOUSE (P01631) Ig kappa chain V-II region 26-10
    1. Domains for 1a4j:
      1. 1104139Domain d1a4jb1: 1a4j B:1-119 [20233]
        Other proteins in same PDB: d1a4ja1, d1a4ja2, d1a4jb2, d1a4jh2, d1a4jl1, d1a4jl2
        part of humanized Diels-Alder catalytic Fab
      2. 1104140Domain d1a4jh1: 1a4j H:1-119 [20231]
        Other proteins in same PDB: d1a4ja1, d1a4ja2, d1a4jb2, d1a4jh2, d1a4jl1, d1a4jl2
        part of humanized Diels-Alder catalytic Fab
    2. Domains for 1a4k:
      1. 1104145Domain d1a4kb1: 1a4k B:1-119 [20237]
        Other proteins in same PDB: d1a4ka1, d1a4ka2, d1a4kb2, d1a4kh2, d1a4kl1, d1a4kl2
        part of humanized Diels-Alder catalytic Fab
        complexed with cd, fra
      2. 1104146Domain d1a4kh1: 1a4k H:1-119 [20235]
        Other proteins in same PDB: d1a4ka1, d1a4ka2, d1a4kb2, d1a4kh2, d1a4kl1, d1a4kl2
        part of humanized Diels-Alder catalytic Fab
        complexed with cd, fra
    3. Domains for 1bj1:
      1. 1104135Domain d1bj1h1: 1bj1 H:1-123 [20323]
        Other proteins in same PDB: d1bj1h2, d1bj1j1, d1bj1j2, d1bj1k2, d1bj1l1, d1bj1l2, d1bj1v_, d1bj1w_
        part of humanized Fab-12 neutralizing VEGF
        complexed with so4
      2. 1104136Domain d1bj1k1: 1bj1 K:1-123 [20325]
        Other proteins in same PDB: d1bj1h2, d1bj1j1, d1bj1j2, d1bj1k2, d1bj1l1, d1bj1l2, d1bj1v_, d1bj1w_
        part of humanized Fab-12 neutralizing VEGF
        complexed with so4
    4. Domain for 1c1e:
    5. Domain for 1cl7:
    6. Domains for 1cz8:
      1. 1104142Domain d1cz8h1: 1cz8 H:1-123 [20327]
        Other proteins in same PDB: d1cz8h2, d1cz8l1, d1cz8l2, d1cz8v_, d1cz8w_, d1cz8x1, d1cz8x2, d1cz8y2
        part of humanized Fab-12 neutralizing VEGF; affinity matured
        complexed with so4
      2. 1104143Domain d1cz8y1: 1cz8 Y:1-123 [20329]
        Other proteins in same PDB: d1cz8h2, d1cz8l1, d1cz8l2, d1cz8v_, d1cz8w_, d1cz8x1, d1cz8x2, d1cz8y2
        part of humanized Fab-12 neutralizing VEGF; affinity matured
        complexed with so4
    7. Domain for 1dba:
    8. Domain for 1dbb:
    9. Domain for 1dbj:
    10. Domain for 1dbk:
    11. Domain for 1dbm:
    12. Domains for 1fj1:
      1. 1104151Domain d1fj1b1: 1fj1 B:1-114 [20119]
        Other proteins in same PDB: d1fj1a1, d1fj1a2, d1fj1b2, d1fj1c1, d1fj1c2, d1fj1d2, d1fj1e_, d1fj1f_
        part of Fab LA-2 against OspA
      2. 1104152Domain d1fj1d1: 1fj1 D:1-114 [20121]
        Other proteins in same PDB: d1fj1a1, d1fj1a2, d1fj1b2, d1fj1c1, d1fj1c2, d1fj1d2, d1fj1e_, d1fj1f_
        part of Fab LA-2 against OspA
    13. Domain for 1ghf:
    14. Domains for 1i7z:
      1. 1104137Domain d1i7zb1: 1i7z B:1-113 [61921]
        Other proteins in same PDB: d1i7za1, d1i7za2, d1i7zb2, d1i7zc1, d1i7zc2, d1i7zd2
        part of humanized Fab GNC92H2
        complexed with coc
      2. 1104138Domain d1i7zd1: 1i7z D:1-113 [61925]
        Other proteins in same PDB: d1i7za1, d1i7za2, d1i7zb2, d1i7zc1, d1i7zc2, d1i7zd2
        part of humanized Fab GNC92H2
        complexed with coc
    15. Domain for 1iai:
    16. Domain for 1jgl:
    17. Domain for 1jhk:
    18. Domains for 1jp5:
      1. 1104149Domain d1jp5a2: 1jp5 A:128-247 [67002]
        Other proteins in same PDB: d1jp5a1, d1jp5b1
        part of scFv 1695; complexed with the epitope peptide from HIV-1 protease
      2. 1104150Domain d1jp5b2: 1jp5 B:128-247 [67004]
        Other proteins in same PDB: d1jp5a1, d1jp5b1
        part of scFv 1695; complexed with the epitope peptide from HIV-1 protease
    19. Domains for 1mhh:
      1. 1104128Domain d1mhhb1: 1mhh B:1-113 [79121]
        Other proteins in same PDB: d1mhha1, d1mhha2, d1mhhb2, d1mhhc1, d1mhhc2, d1mhhd2, d1mhhe_, d1mhhf_
        part of anti-HCV Fab 19D9D6
        complexed with edo
      2. 1104129Domain d1mhhd1: 1mhh D:1-113 [79125]
        Other proteins in same PDB: d1mhha1, d1mhha2, d1mhhb2, d1mhhc1, d1mhhc2, d1mhhd2, d1mhhe_, d1mhhf_
        part of anti-HCV Fab 19D9D6
        complexed with edo
    20. Domains for 1n4x:
      1. 1104126Domain d1n4xh_: 1n4x H: [85324]
        Other proteins in same PDB: d1n4xl_, d1n4xm_
        part of scFv 1695
        complexed with cl
      2. 1104127Domain d1n4xi_: 1n4x I: [85325]
        Other proteins in same PDB: d1n4xl_, d1n4xm_
        part of scFv 1695
        complexed with cl
    21. Domain for 1n64:
    22. Domain for 1nca:
    23. Domain for 1ncb:
    24. Domain for 1ncc:
    25. Domain for 1ncd:
    26. Domain for 1nlb:
    27. Domains for 1ob1:
      1. 1104162Domain d1ob1b1: 1ob1 B:1-113 [86750]
        Other proteins in same PDB: d1ob1a1, d1ob1a2, d1ob1b2, d1ob1c1, d1ob1c2, d1ob1d1, d1ob1d2, d1ob1e2, d1ob1f1, d1ob1f2
        part of anti-Pf MSP1 Fab
        complexed with cac
      2. 1104163Domain d1ob1e1: 1ob1 E:1-113 [86756]
        Other proteins in same PDB: d1ob1a1, d1ob1a2, d1ob1b2, d1ob1c1, d1ob1c2, d1ob1d1, d1ob1d2, d1ob1e2, d1ob1f1, d1ob1f2
        part of anti-Pf MSP1 Fab
        complexed with cac
    28. Domain for 1tet:
    29. Domains for 1tpx:
      1. 1104166Domain d1tpxb1: 1tpx B:1-113 [107190]
        Other proteins in same PDB: d1tpxa_, d1tpxb2, d1tpxc2
        MQ P06327 P01864 # ! natural chimera
      2. 1104167Domain d1tpxc1: 1tpx C:1-107 [107192]
        Other proteins in same PDB: d1tpxa_, d1tpxb2, d1tpxc2
        MQ P01631 P01837 # ! natural chimera
    30. Domains for 1tqb:
      1. 1104164Domain d1tqbb1: 1tqb B:1-113 [107213]
        Other proteins in same PDB: d1tqba_, d1tqbb2, d1tqbc2
        MQ P06327 P01864 # ! natural chimera
      2. 1104165Domain d1tqbc1: 1tqb C:1-107 [107215]
        Other proteins in same PDB: d1tqba_, d1tqbb2, d1tqbc2
        MQ P01631 P01837 # ! natural chimera
    31. Domains for 1tqc:
      1. 1104168Domain d1tqcb1: 1tqc B:1-113 [107218]
        Other proteins in same PDB: d1tqca_, d1tqcb2, d1tqcc2
        MQ P06327 P01864 # ! natural chimera
      2. 1104169Domain d1tqcc1: 1tqc C:1-107 [107220]
        Other proteins in same PDB: d1tqca_, d1tqcb2, d1tqcc2
        MQ P01631 P01837 # ! natural chimera
    32. Domain for 2dbl:
  15. 1104170Mouse (Mus musculus), cluster 5 [TaxId:10090] [88555] (36 PDB entries)
    1. Domain for 1a2y:
    2. Domain for 1a7n:
    3. Domain for 1a7o:
    4. Domain for 1a7p:
    5. Domain for 1a7q:
    6. Domain for 1a7r:
    7. Domain for 1cic:
    8. Domain for 1dl7:
      • 1104209Domain d1dl7h_: 1dl7 H: [20499]
        Other proteins in same PDB: d1dl7l_
        part of Fv M3C65; conflict: annotated in PDB as human protein
        complexed with nch
    9. Domain for 1dvf:
    10. Domain for 1fdl:
    11. Domains for 1fe8:
      1. 1104189Domain d1fe8h1: 1fe8 H:1-115 [59786]
        Other proteins in same PDB: d1fe8a_, d1fe8b_, d1fe8c_, d1fe8h2, d1fe8i2, d1fe8j2, d1fe8l1, d1fe8l2, d1fe8m1, d1fe8m2, d1fe8n1, d1fe8n2
        part of Fab RU5 inhibiting the collagen binding by the von willebrand factor a3 domain
        complexed with cac, nag
      2. 1104190Domain d1fe8i1: 1fe8 I:1-115 [59788]
        Other proteins in same PDB: d1fe8a_, d1fe8b_, d1fe8c_, d1fe8h2, d1fe8i2, d1fe8j2, d1fe8l1, d1fe8l2, d1fe8m1, d1fe8m2, d1fe8n1, d1fe8n2
        part of Fab RU5 inhibiting the collagen binding by the von willebrand factor a3 domain
        complexed with cac, nag
      3. 1104191Domain d1fe8j1: 1fe8 J:1-115 [59790]
        Other proteins in same PDB: d1fe8a_, d1fe8b_, d1fe8c_, d1fe8h2, d1fe8i2, d1fe8j2, d1fe8l1, d1fe8l2, d1fe8m1, d1fe8m2, d1fe8n1, d1fe8n2
        part of Fab RU5 inhibiting the collagen binding by the von willebrand factor a3 domain
        complexed with cac, nag
    12. Domain for 1fns:
    13. Domain for 1g7h:
    14. Domain for 1g7i:
    15. Domain for 1g7j:
    16. Domain for 1g7l:
    17. Domain for 1g7m:
    18. Domain for 1gig:
    19. Domain for 1ibg:
    20. Domain for 1kip:
    21. Domain for 1kiq:
    22. Domain for 1kir:
    23. Domains for 1nc2:
      1. 1104192Domain d1nc2b1: 1nc2 B:1-120 [91783]
        Other proteins in same PDB: d1nc2a1, d1nc2a2, d1nc2b2, d1nc2c1, d1nc2c2, d1nc2d2
        part of Fab 2d12.5
        complexed with cl, doe, nag, yt3
      2. 1104193Domain d1nc2d1: 1nc2 D:1-120 [91787]
        Other proteins in same PDB: d1nc2a1, d1nc2a2, d1nc2b2, d1nc2c1, d1nc2c2, d1nc2d2
        part of Fab 2d12.5
        complexed with cl, doe, nag, yt3
    24. Domains for 1nc4:
      1. 1104199Domain d1nc4b1: 1nc4 B:1-120 [91791]
        Other proteins in same PDB: d1nc4a1, d1nc4a2, d1nc4b2, d1nc4c1, d1nc4c2, d1nc4d2
        part of Fab 2d12.5
        complexed with cl, dof, gd3, nag
      2. 1104200Domain d1nc4d1: 1nc4 D:1-120 [91795]
        Other proteins in same PDB: d1nc4a1, d1nc4a2, d1nc4b2, d1nc4c1, d1nc4c2, d1nc4d2
        part of Fab 2d12.5
        complexed with cl, dof, gd3, nag
    25. Domain for 1nld:
    26. Domain for 1oak:
    27. Domain for 1p4b:
    28. Domain for 1p4i:
    29. Domains for 1t4k:
      1. 1104216Domain d1t4kb1: 1t4k B:1-113 [112237]
        Other proteins in same PDB: d1t4ka1, d1t4ka2, d1t4kb2, d1t4kc1, d1t4kc2, d1t4kd2
        MQ P018119 P01868 # natural chimera; catalytic antibody with aldolase activity
        complexed with zn
      2. 1104217Domain d1t4kd1: 1t4k D:1-113 [112241]
        Other proteins in same PDB: d1t4ka1, d1t4ka2, d1t4kb2, d1t4kc1, d1t4kc2, d1t4kd2
        MQ P018119 P01868 # natural chimera; catalytic antibody with aldolase activity
        complexed with zn
    30. Domain for 1vfa:
    31. Domain for 1vfb:
    32. Domain for 2vir:
    33. Domain for 2vis:
    34. Domain for 2vit:
    35. Domains for 43c9:
      1. 1104195Domain d43c9b_: 43c9 B: [20387]
        Other proteins in same PDB: d43c9a_, d43c9c_, d43c9e_, d43c9g_
        part of sterolytic and amidolytic Fv 43c9
      2. 1104196Domain d43c9d_: 43c9 D: [20389]
        Other proteins in same PDB: d43c9a_, d43c9c_, d43c9e_, d43c9g_
        part of sterolytic and amidolytic Fv 43c9
      3. 1104197Domain d43c9f_: 43c9 F: [20391]
        Other proteins in same PDB: d43c9a_, d43c9c_, d43c9e_, d43c9g_
        part of sterolytic and amidolytic Fv 43c9
      4. 1104198Domain d43c9h_: 43c9 H: [20393]
        Other proteins in same PDB: d43c9a_, d43c9c_, d43c9e_, d43c9g_
        part of sterolytic and amidolytic Fv 43c9
    36. Domains for 43ca:
      1. 1104201Domain d43cab_: 43ca B: [20395]
        Other proteins in same PDB: d43caa_, d43cac_, d43cae_, d43cag_
        part of sterolytic and amidolytic Fv 43c9
        complexed with npo
      2. 1104202Domain d43cad_: 43ca D: [20397]
        Other proteins in same PDB: d43caa_, d43cac_, d43cae_, d43cag_
        part of sterolytic and amidolytic Fv 43c9
        complexed with npo
      3. 1104203Domain d43caf_: 43ca F: [20399]
        Other proteins in same PDB: d43caa_, d43cac_, d43cae_, d43cag_
        part of sterolytic and amidolytic Fv 43c9
        complexed with npo
      4. 1104204Domain d43cah_: 43ca H: [20401]
        Other proteins in same PDB: d43caa_, d43cac_, d43cae_, d43cag_
        part of sterolytic and amidolytic Fv 43c9
        complexed with npo
  16. 1104218Mouse (Mus musculus), cluster 6 [TaxId:10090] [88556] (12 PDB entries)
    SQ NA # part of Fab 28 against HIV-1 RT
    1. Domains for 1etz:
      1. 1104219Domain d1etzb1: 1etz B:1-126 [20481]
        Other proteins in same PDB: d1etza1, d1etza2, d1etzb2, d1etzh2, d1etzl1, d1etzl2
        part of anti-sweetener Fab NC10.14
        complexed with gas
      2. 1104220Domain d1etzh1: 1etz H:1-126 [20479]
        Other proteins in same PDB: d1etza1, d1etza2, d1etzb2, d1etzh2, d1etzl1, d1etzl2
        part of anti-sweetener Fab NC10.14
        complexed with gas
    2. Domain for 1ggb:
    3. Domain for 1ggc:
    4. Domains for 1ggi:
      1. 1104223Domain d1ggih1: 1ggi H:1-112 [19877]
        Other proteins in same PDB: d1ggih2, d1ggij2, d1ggil1, d1ggil2, d1ggim1, d1ggim2
        part of Fab 50.1
      2. 1104224Domain d1ggij1: 1ggi J:1-112 [19879]
        Other proteins in same PDB: d1ggih2, d1ggij2, d1ggil1, d1ggil2, d1ggim1, d1ggim2
        part of Fab 50.1
    5. Domain for 1hys:
    6. Domain for 1j5o:
    7. Domain for 1jrh:
    8. Domain for 1n5y:
    9. Domain for 1n6q:
    10. Domain for 1r0a:
    11. Domain for 1t03:
    12. Domain for 2hmi:
  17. 1104233Mouse (Mus musculus), cluster 7.1 [TaxId:10090] [88557] (38 PDB entries)
    Uniprot P18532 # HV61_MOUSE Ig heavy chain V region 1B43 precursor
    1. Domain for 1ay1:
    2. Domain for 1baf:
    3. Domain for 1bgx:
    4. Domain for 1c12:
    5. Domain for 1cf8:
    6. Domain for 1ezv:
    7. Domain for 1f58:
    8. Domain for 1f8t:
    9. Domain for 1f90:
    10. Domains for 1hq4:
      1. 1104268Domain d1hq4b1: 1hq4 B:1-113 [83623]
        Other proteins in same PDB: d1hq4a1, d1hq4a2, d1hq4b2, d1hq4c1, d1hq4c2, d1hq4d2
        part of catalytic Fab HA-19A4 with a polyene cyclase activity
        complexed with cd
      2. 1104269Domain d1hq4d1: 1hq4 D:1-113 [83627]
        Other proteins in same PDB: d1hq4a1, d1hq4a2, d1hq4b2, d1hq4c1, d1hq4c2, d1hq4d2
        part of catalytic Fab HA-19A4 with a polyene cyclase activity
        complexed with cd
    11. Domain for 1kb9:
    12. Domain for 1kc5:
    13. Domain for 1kcr:
    14. Domain for 1kcs:
    15. Domain for 1kcu:
    16. Domain for 1kcv:
    17. Domains for 1ken:
      1. 1104276Domain d1kenh1: 1ken H:1-120 [72379]
        Other proteins in same PDB: d1kena_, d1kenb_, d1kenc_, d1kend_, d1kene_, d1kenf_, d1kenh2, d1kenl1, d1kenl2, d1kent2, d1kenu1, d1kenu2
        part of Fab against influenza virus hemagglutinin
      2. 1104277Domain d1kent1: 1ken T:1-120 [72383]
        Other proteins in same PDB: d1kena_, d1kenb_, d1kenc_, d1kend_, d1kene_, d1kenf_, d1kenh2, d1kenl1, d1kenl2, d1kent2, d1kenu1, d1kenu2
        part of Fab against influenza virus hemagglutinin
    18. Domains for 1kyo:
      1. 1104272Domain d1kyoj_: 1kyo J: [73262]
        Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyov_, d1kyow_
        part of Fv against Rieske protein from the yeast cytochrome bc1 complex
        complexed with fes, hem, sma
      2. 1104273Domain d1kyou_: 1kyo U: [73277]
        Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyov_, d1kyow_
        part of Fv against Rieske protein from the yeast cytochrome bc1 complex
        complexed with fes, hem, sma
    19. Domain for 1ncw:
    20. Domains for 1nd0:
      1. 1104261Domain d1nd0b1: 1nd0 B:1-113 [85561]
        Other proteins in same PDB: d1nd0a1, d1nd0a2, d1nd0b2, d1nd0c1, d1nd0c2, d1nd0d2, d1nd0e1, d1nd0e2, d1nd0f2, d1nd0g1, d1nd0g2, d1nd0h2
        part of cationic cyclization catalytic Fab 4C6
        complexed with dp4, so4
      2. 1104262Domain d1nd0d1: 1nd0 D:1-113 [85565]
        Other proteins in same PDB: d1nd0a1, d1nd0a2, d1nd0b2, d1nd0c1, d1nd0c2, d1nd0d2, d1nd0e1, d1nd0e2, d1nd0f2, d1nd0g1, d1nd0g2, d1nd0h2
        part of cationic cyclization catalytic Fab 4C6
        complexed with dp4, so4
      3. 1104263Domain d1nd0f1: 1nd0 F:1-113 [85569]
        Other proteins in same PDB: d1nd0a1, d1nd0a2, d1nd0b2, d1nd0c1, d1nd0c2, d1nd0d2, d1nd0e1, d1nd0e2, d1nd0f2, d1nd0g1, d1nd0g2, d1nd0h2
        part of cationic cyclization catalytic Fab 4C6
        complexed with dp4, so4
      4. 1104264Domain d1nd0h1: 1nd0 H:1-113 [85573]
        Other proteins in same PDB: d1nd0a1, d1nd0a2, d1nd0b2, d1nd0c1, d1nd0c2, d1nd0d2, d1nd0e1, d1nd0e2, d1nd0f2, d1nd0g1, d1nd0g2, d1nd0h2
        part of cationic cyclization catalytic Fab 4C6
        complexed with dp4, so4
    21. Domain for 1nsn:
    22. Domain for 1orq:
    23. Domain for 1ors:
    24. Domain for 1p84:
    25. Domain for 1ru9:
    26. Domain for 1rua:
    27. Domain for 1ruk:
    28. Domain for 1rul:
    29. Domain for 1rum:
    30. Domain for 1rup:
    31. Domain for 1s5i:
    32. Domains for 2a0l:
      1. 1104278Domain d2a0ld1: 2a0l D:1-116 [125957]
        Other proteins in same PDB: d2a0la1, d2a0lb1, d2a0lc1, d2a0le1
        automatically matched to d1orsb1
        complexed with k
      2. 1104279Domain d2a0lf1: 2a0l F:1-116 [125959]
        Other proteins in same PDB: d2a0la1, d2a0lb1, d2a0lc1, d2a0le1
        automatically matched to d1orsb1
        complexed with k
    33. Domain for 2f58:
    34. Domain for 2ibz:
    35. Domain for 32c2:
    36. Domains for 3cx5:
      1. 1104244Domain d3cx5j_: 3cx5 J: [157090]
        Other proteins in same PDB: d3cx5a1, d3cx5a2, d3cx5b1, d3cx5b2, d3cx5c1, d3cx5c2, d3cx5d1, d3cx5d2, d3cx5e1, d3cx5e2, d3cx5f1, d3cx5g_, d3cx5h_, d3cx5i_, d3cx5k_, d3cx5l1, d3cx5l2, d3cx5m1, d3cx5m2, d3cx5n1, d3cx5n2, d3cx5o1, d3cx5o2, d3cx5p1, d3cx5p2, d3cx5q1, d3cx5r_, d3cx5s_, d3cx5t_, d3cx5v_, d3cx5w_
        automated match to d1ezvx_
        complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn3, cn5, fes, hem, sma, suc, umq
      2. 1104245Domain d3cx5u_: 3cx5 U: [157106]
        Other proteins in same PDB: d3cx5a1, d3cx5a2, d3cx5b1, d3cx5b2, d3cx5c1, d3cx5c2, d3cx5d1, d3cx5d2, d3cx5e1, d3cx5e2, d3cx5f1, d3cx5g_, d3cx5h_, d3cx5i_, d3cx5k_, d3cx5l1, d3cx5l2, d3cx5m1, d3cx5m2, d3cx5n1, d3cx5n2, d3cx5o1, d3cx5o2, d3cx5p1, d3cx5p2, d3cx5q1, d3cx5r_, d3cx5s_, d3cx5t_, d3cx5v_, d3cx5w_
        automated match to d1ezvx_
        complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn3, cn5, fes, hem, sma, suc, umq
    37. Domains for 3cxh:
      1. 1104257Domain d3cxhj_: 3cxh J: [157123]
        Other proteins in same PDB: d3cxha1, d3cxha2, d3cxhb1, d3cxhb2, d3cxhc1, d3cxhc2, d3cxhd1, d3cxhd2, d3cxhe1, d3cxhe2, d3cxhf1, d3cxhg_, d3cxhh_, d3cxhi_, d3cxhk_, d3cxhl1, d3cxhl2, d3cxhm1, d3cxhm2, d3cxhn1, d3cxhn2, d3cxho1, d3cxho2, d3cxhp1, d3cxhp2, d3cxhq1, d3cxhr_, d3cxhs_, d3cxht_, d3cxhv_, d3cxhw_
        automated match to d1ezvx_
        complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn6, fes, hem, sma, suc, umq
      2. 1104258Domain d3cxhu_: 3cxh U: [157139]
        Other proteins in same PDB: d3cxha1, d3cxha2, d3cxhb1, d3cxhb2, d3cxhc1, d3cxhc2, d3cxhd1, d3cxhd2, d3cxhe1, d3cxhe2, d3cxhf1, d3cxhg_, d3cxhh_, d3cxhi_, d3cxhk_, d3cxhl1, d3cxhl2, d3cxhm1, d3cxhm2, d3cxhn1, d3cxhn2, d3cxho1, d3cxho2, d3cxhp1, d3cxhp2, d3cxhq1, d3cxhr_, d3cxhs_, d3cxht_, d3cxhv_, d3cxhw_
        automated match to d1ezvx_
        complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn6, fes, hem, sma, suc, umq
    38. Domain for 3f58:
  18. 1104281Mouse (Mus musculus), cluster 7.2 [TaxId:10090] [88558] (31 PDB entries)
    1. Domain for 1c08:
    2. Domain for 1dqd:
    3. Domain for 1dqj:
    4. Domain for 1dqm:
    5. Domains for 1dqq:
      1. 1104292Domain d1dqqb1: 1dqq B:1-113 [20421]
        Other proteins in same PDB: d1dqqa1, d1dqqa2, d1dqqb2, d1dqqc1, d1dqqc2, d1dqqd2
        part of anti-lysozyme Fab HYHEL-63
      2. 1104293Domain d1dqqd1: 1dqq D:1-113 [20423]
        Other proteins in same PDB: d1dqqa1, d1dqqa2, d1dqqb2, d1dqqc1, d1dqqc2, d1dqqd2
        part of anti-lysozyme Fab HYHEL-63
    6. Domain for 1ic4:
    7. Domain for 1ic5:
    8. Domain for 1ic7:
    9. Domain for 1j1o:
    10. Domain for 1j1p:
    11. Domain for 1j1x:
    12. Domains for 1nak:
      1. 1104313Domain d1nakh1: 1nak H:1-113 [91753]
        Other proteins in same PDB: d1nakh2, d1naki2, d1nakl1, d1nakl2, d1nakm1, d1nakm2
        part of Fab 83.1 against HIV-1 gp120
      2. 1104314Domain d1naki1: 1nak I:1-113 [91755]
        Other proteins in same PDB: d1nakh2, d1naki2, d1nakl1, d1nakl2, d1nakm1, d1nakm2
        part of Fab 83.1 against HIV-1 gp120
    13. Domain for 1nby:
    14. Domain for 1nbz:
    15. Domain for 1ndg:
    16. Domain for 1ndm:
    17. Domain for 1osp:
    18. Domain for 1ua6:
    19. Domain for 1uac:
    20. Domain for 2dqc:
    21. Domain for 2dqd:
    22. Domain for 2dqe:
    23. Domains for 2dqf:
      1. 1104311Domain d2dqfb1: 2dqf B:1-114 [145083]
        Other proteins in same PDB: d2dqfa_, d2dqfc1, d2dqfd_, d2dqff1
        mutant
      2. 1104312Domain d2dqfe_: 2dqf E: [145084]
        Other proteins in same PDB: d2dqfa_, d2dqfc1, d2dqfd_, d2dqff1
        automated match to d2dqfb1
        mutant
    24. Domain for 2dqg:
    25. Domain for 2dqh:
    26. Domain for 2dqi:
    27. Domain for 2dqj:
    28. Domain for 3a67:
    29. Domain for 3a6b:
    30. Domain for 3a6c:
    31. Domain for 3hfm:
  19. 1104316Mouse (Mus musculus), cluster 7.3 [TaxId:10090] [88559] (2 PDB entries)
    1. Domain for 1acy:
    2. Domain for 1ai1:
  20. 1104319Norway rat (Rattus norvegicus) [TaxId:10116] [88560] (16 PDB entries)
    1. Domain for 1bey:
    2. Domains for 1bfo:
      1. 1104332Domain d1bfob1: 1bfo B:1-121 [20311]
        Other proteins in same PDB: d1bfoa1, d1bfoa2, d1bfob2, d1bfoc1, d1bfoc2, d1bfod2, d1bfoe1, d1bfoe2, d1bfof2, d1bfog1, d1bfog2, d1bfoh2
        part of therapeutic monoclonal antibody CAMPATH-1G
      2. 1104333Domain d1bfod1: 1bfo D:1-121 [20313]
        Other proteins in same PDB: d1bfoa1, d1bfoa2, d1bfob2, d1bfoc1, d1bfoc2, d1bfod2, d1bfoe1, d1bfoe2, d1bfof2, d1bfog1, d1bfog2, d1bfoh2
        part of therapeutic monoclonal antibody CAMPATH-1G
      3. 1104334Domain d1bfof1: 1bfo F:1-121 [20315]
        Other proteins in same PDB: d1bfoa1, d1bfoa2, d1bfob2, d1bfoc1, d1bfoc2, d1bfod2, d1bfoe1, d1bfoe2, d1bfof2, d1bfog1, d1bfog2, d1bfoh2
        part of therapeutic monoclonal antibody CAMPATH-1G
      4. 1104335Domain d1bfoh1: 1bfo H:1-121 [20317]
        Other proteins in same PDB: d1bfoa1, d1bfoa2, d1bfob2, d1bfoc1, d1bfoc2, d1bfod2, d1bfoe1, d1bfoe2, d1bfof2, d1bfog1, d1bfog2, d1bfoh2
        part of therapeutic monoclonal antibody CAMPATH-1G
    3. Domains for 1c5d:
      1. 1104336Domain d1c5db1: 1c5d B:1-117 [20415]
        Other proteins in same PDB: d1c5da1, d1c5da2, d1c5db2, d1c5dh2, d1c5dl1, d1c5dl2
        part of antibody against the main immunogenic region of the human muscle acetylcholine receptor
      2. 1104337Domain d1c5dh1: 1c5d H:1-117 [20413]
        Other proteins in same PDB: d1c5da1, d1c5da2, d1c5db2, d1c5dh2, d1c5dl1, d1c5dl2
        part of antibody against the main immunogenic region of the human muscle acetylcholine receptor
    4. Domain for 1ce1:
    5. Domain for 1f3r:
      • 1104349Domain d1f3rb1: 1f3r B:1-123 [20416]
        Other proteins in same PDB: d1f3rb2
        part of scFv MAB198 against the main immunogenic region of the human muscle acetylcholine receptor; order: VH-linker-VL
    6. Domains for 1fn4:
      1. 1104346Domain d1fn4b1: 1fn4 B:1-106 [59886]
        Other proteins in same PDB: d1fn4a1, d1fn4a2, d1fn4b2, d1fn4c1, d1fn4c2, d1fn4d2
        part of Fab 198 against acetylcholine receptor
      2. 1104347Domain d1fn4d1: 1fn4 D:1-106 [59890]
        Other proteins in same PDB: d1fn4a1, d1fn4a2, d1fn4b2, d1fn4c1, d1fn4c2, d1fn4d2
        part of Fab 198 against acetylcholine receptor
    7. Domains for 1lk3:
      1. 1104321Domain d1lk3h1: 1lk3 H:1-119 [73952]
        Other proteins in same PDB: d1lk3a_, d1lk3b_, d1lk3h2, d1lk3i2, d1lk3l1, d1lk3l2, d1lk3m1, d1lk3m2
        part of anti-IL-10 Fab 9D7
      2. 1104322Domain d1lk3i1: 1lk3 I:1-119 [73954]
        Other proteins in same PDB: d1lk3a_, d1lk3b_, d1lk3h2, d1lk3i2, d1lk3l1, d1lk3l2, d1lk3m1, d1lk3m2
        part of anti-IL-10 Fab 9D7
    8. Domain for 1oaq:
    9. Domains for 1oar:
      1. 1104328Domain d1oarh_: 1oar H: [92709]
        Other proteins in same PDB: d1oarl_, d1oarm_, d1oarn_, d1oaro_
        part of IgE Fv spe-7
        complexed with azn, cac, cl, dms, edo, na
      2. 1104329Domain d1oari_: 1oar I: [92710]
        Other proteins in same PDB: d1oarl_, d1oarm_, d1oarn_, d1oaro_
        part of IgE Fv spe-7
        complexed with azn, cac, cl, dms, edo, na
      3. 1104330Domain d1oarj_: 1oar J: [92711]
        Other proteins in same PDB: d1oarl_, d1oarm_, d1oarn_, d1oaro_
        part of IgE Fv spe-7
        complexed with azn, cac, cl, dms, edo, na
      4. 1104331Domain d1oark_: 1oar K: [92712]
        Other proteins in same PDB: d1oarl_, d1oarm_, d1oarn_, d1oaro_
        part of IgE Fv spe-7
        complexed with azn, cac, cl, dms, edo, na
    10. Domains for 1oau:
      1. 1104323Domain d1oauh_: 1oau H: [92717]
        Other proteins in same PDB: d1oaul_, d1oaum_, d1oaun_, d1oauo_
        part of IgE Fv spe-7
        complexed with dnf, imd, ser
      2. 1104324Domain d1oaui_: 1oau I: [92718]
        Other proteins in same PDB: d1oaul_, d1oaum_, d1oaun_, d1oauo_
        part of IgE Fv spe-7
        complexed with dnf, imd, ser
      3. 1104325Domain d1oauj_: 1oau J: [92719]
        Other proteins in same PDB: d1oaul_, d1oaum_, d1oaun_, d1oauo_
        part of IgE Fv spe-7
        complexed with dnf, imd, ser
      4. 1104326Domain d1oauk_: 1oau K: [92720]
        Other proteins in same PDB: d1oaul_, d1oaum_, d1oaun_, d1oauo_
        part of IgE Fv spe-7
        complexed with dnf, imd, ser
    11. Domains for 1oax:
      1. 1104340Domain d1oaxh_: 1oax H: [92725]
        Other proteins in same PDB: d1oaxl_, d1oaxm_, d1oaxn_, d1oaxo_
        part of IgE Fv spe-7
        complexed with anq
      2. 1104341Domain d1oaxj_: 1oax J: [92727]
        Other proteins in same PDB: d1oaxl_, d1oaxm_, d1oaxn_, d1oaxo_
        part of IgE Fv spe-7
        complexed with anq
    12. Domains for 1oay:
      1. 1104342Domain d1oayh_: 1oay H: [92733]
        Other proteins in same PDB: d1oayl_, d1oaym_, d1oayn_, d1oayo_
        part of IgE Fv spe-7
        complexed with fur
      2. 1104343Domain d1oayj_: 1oay J: [92735]
        Other proteins in same PDB: d1oayl_, d1oaym_, d1oayn_, d1oayo_
        part of IgE Fv spe-7
        complexed with fur
    13. Domains for 1oaz:
      1. 1104350Domain d1oazh_: 1oaz H: [92743]
        Other proteins in same PDB: d1oaza_, d1oazb_, d1oazl_, d1oazn_
        part of IgE Fv spe-7
      2. 1104351Domain d1oazj_: 1oaz J: [92744]
        Other proteins in same PDB: d1oaza_, d1oazb_, d1oazl_, d1oazn_
        part of IgE Fv spe-7
    14. Domain for 1ocw:
    15. Domains for 2arj:
      1. 1104344Domain d2arjb1: 2arj B:1-113 [144831]
        Other proteins in same PDB: d2arja1, d2arja2, d2arjb2, d2arjh2, d2arjl1, d2arjl2, d2arjq_, d2arjr_
      2. 1104345Domain d2arjh1: 2arj H:1-113 [144833]
        Other proteins in same PDB: d2arja1, d2arja2, d2arjb2, d2arjh2, d2arjl1, d2arjl2, d2arjq_, d2arjr_
        automatically matched to 2ARJ B:1-113
    16. Domain for 2bjm:
  21. 1104352synthetic construct [TaxId:32630] [158862] (3 PDB entries)
    1. Domains for 2jix:
      1. 1104355Domain d2jixd1: 2jix D:1-116 [148111]
        Other proteins in same PDB: d2jixb1, d2jixb2, d2jixc1, d2jixc2, d2jixd2, d2jixe1, d2jixe2, d2jixf2, d2jixh2
        automatically matched to d1h3ph1
      2. 1104356Domain d2jixf1: 2jix F:1-116 [148115]
        Other proteins in same PDB: d2jixb1, d2jixb2, d2jixc1, d2jixc2, d2jixd2, d2jixe1, d2jixe2, d2jixf2, d2jixh2
        automatically matched to d1h3ph1
      3. 1104357Domain d2jixh1: 2jix H:1-116 [148117]
        Other proteins in same PDB: d2jixb1, d2jixb2, d2jixc1, d2jixc2, d2jixd2, d2jixe1, d2jixe2, d2jixf2, d2jixh2
        automatically matched to d1h3ph1
    2. Domain for 2r0k:
    3. Domain for 2r0l:

More info for Protein Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH from b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like)

Timeline for Protein Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH from b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like):

  • Protein Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH from b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) first appeared in SCOP 1.65
  • Protein Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH from b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) appears in SCOPe 2.01
  • Protein Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH from b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) appears in SCOPe 2.03
  • Protein Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH from b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) appears in the current release, SCOPe 2.08