Lineage for Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]

  1. Root: SCOPe 2.03
  2. 1396887Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (376 folds)
  3. 1401399Fold d.14: Ribosomal protein S5 domain 2-like [54210] (1 superfamily)
    core: beta(3)-alpha-beta-alpha; 2 layers: alpha/beta; left-handed crossover
  4. 1401400Superfamily d.14.1: Ribosomal protein S5 domain 2-like [54211] (13 families) (S)
  5. 1401401Family d.14.1.1: Translational machinery components [54212] (4 proteins)
  6. 1401402Protein Elongation factor 2 (eEF-2), domain IV [82575] (1 species)
  7. 1401403Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [82576] (16 PDB entries)
    Uniprot P32324

PDB entries in Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]:

  1. Domain(s) for 1n0u:
  2. Domain(s) for 1n0v:
    1. 1401415Domain d1n0vc3: 1n0v C:561-725 [79764]
      Other proteins in same PDB: d1n0vc1, d1n0vc2, d1n0vc4, d1n0vc5, d1n0vd1, d1n0vd2, d1n0vd4, d1n0vd5
    2. 1401416Domain d1n0vd3: 1n0v D:561-725 [79769]
      Other proteins in same PDB: d1n0vc1, d1n0vc2, d1n0vc4, d1n0vc5, d1n0vd1, d1n0vd2, d1n0vd4, d1n0vd5
  3. Domain(s) for 1u2r:
  4. Domain(s) for 1zm2:
    1. 1401426Domain d1zm2a3: 1zm2 A:561-725 [125282]
      Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a4, d1zm2a5, d1zm2b1, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c4, d1zm2c5, d1zm2d1, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e4, d1zm2e5, d1zm2f1
      automatically matched to d1n0ua3
      complexed with apr
    2. 1401427Domain d1zm2c3: 1zm2 C:561-725 [125288]
      Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a4, d1zm2a5, d1zm2b1, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c4, d1zm2c5, d1zm2d1, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e4, d1zm2e5, d1zm2f1
      automatically matched to d1n0ua3
      complexed with apr
    3. 1401428Domain d1zm2e3: 1zm2 E:561-725 [125294]
      Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a4, d1zm2a5, d1zm2b1, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c4, d1zm2c5, d1zm2d1, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e4, d1zm2e5, d1zm2f1
      automatically matched to d1n0ua3
      complexed with apr
  5. Domain(s) for 1zm3:
    1. 1401429Domain d1zm3a3: 1zm3 A:561-725 [125300]
      Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a4, d1zm3a5, d1zm3b1, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c4, d1zm3c5, d1zm3d1, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e4, d1zm3e5, d1zm3f1
      automatically matched to d1n0ua3
    2. 1401430Domain d1zm3c3: 1zm3 C:561-725 [125306]
      Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a4, d1zm3a5, d1zm3b1, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c4, d1zm3c5, d1zm3d1, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e4, d1zm3e5, d1zm3f1
      automatically matched to d1n0ua3
    3. 1401431Domain d1zm3e3: 1zm3 E:561-725 [125312]
      Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a4, d1zm3a5, d1zm3b1, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c4, d1zm3c5, d1zm3d1, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e4, d1zm3e5, d1zm3f1
      automatically matched to d1n0ua3
  6. Domain(s) for 1zm4:
    1. 1401423Domain d1zm4a3: 1zm4 A:561-725 [125318]
      Other proteins in same PDB: d1zm4a1, d1zm4a2, d1zm4a4, d1zm4a5, d1zm4b_, d1zm4c1, d1zm4c2, d1zm4c4, d1zm4c5, d1zm4d_, d1zm4e1, d1zm4e2, d1zm4e4, d1zm4e5, d1zm4f_
      automated match to d1n0vc3
      complexed with tad
    2. 1401424Domain d1zm4c3: 1zm4 C:561-725 [125324]
      Other proteins in same PDB: d1zm4a1, d1zm4a2, d1zm4a4, d1zm4a5, d1zm4b_, d1zm4c1, d1zm4c2, d1zm4c4, d1zm4c5, d1zm4d_, d1zm4e1, d1zm4e2, d1zm4e4, d1zm4e5, d1zm4f_
      automated match to d1n0vc3
      complexed with tad
    3. 1401425Domain d1zm4e3: 1zm4 E:561-725 [125330]
      Other proteins in same PDB: d1zm4a1, d1zm4a2, d1zm4a4, d1zm4a5, d1zm4b_, d1zm4c1, d1zm4c2, d1zm4c4, d1zm4c5, d1zm4d_, d1zm4e1, d1zm4e2, d1zm4e4, d1zm4e5, d1zm4f_
      automated match to d1n0vc3
      complexed with tad
  7. Domain(s) for 1zm9:
    1. 1401419Domain d1zm9a3: 1zm9 A:561-725 [125338]
      Other proteins in same PDB: d1zm9a1, d1zm9a2, d1zm9a4, d1zm9a5, d1zm9b_, d1zm9c1, d1zm9c2, d1zm9c4, d1zm9c5, d1zm9d_, d1zm9e1, d1zm9e2, d1zm9e4, d1zm9e5, d1zm9f_
      automated match to d1n0vc3
      complexed with p34
    2. 1401420Domain d1zm9c3: 1zm9 C:561-725 [125344]
      Other proteins in same PDB: d1zm9a1, d1zm9a2, d1zm9a4, d1zm9a5, d1zm9b_, d1zm9c1, d1zm9c2, d1zm9c4, d1zm9c5, d1zm9d_, d1zm9e1, d1zm9e2, d1zm9e4, d1zm9e5, d1zm9f_
      automated match to d1n0vc3
      complexed with p34
    3. 1401421Domain d1zm9e3: 1zm9 E:561-725 [125350]
      Other proteins in same PDB: d1zm9a1, d1zm9a2, d1zm9a4, d1zm9a5, d1zm9b_, d1zm9c1, d1zm9c2, d1zm9c4, d1zm9c5, d1zm9d_, d1zm9e1, d1zm9e2, d1zm9e4, d1zm9e5, d1zm9f_
      automated match to d1n0vc3
      complexed with p34
  8. Domain(s) for 2e1r:
  9. Domain(s) for 2npf:
    1. 1401417Domain d2npfa3: 2npf A:561-725 [138434]
      Other proteins in same PDB: d2npfa1, d2npfa2, d2npfa4, d2npfa5, d2npfb1, d2npfb2, d2npfb4, d2npfb5
      automated match to d1n0ua3
      complexed with gdp, mou
    2. 1401418Domain d2npfb3: 2npf B:561-725 [138439]
      Other proteins in same PDB: d2npfa1, d2npfa2, d2npfa4, d2npfa5, d2npfb1, d2npfb2, d2npfb4, d2npfb5
      automated match to d1n0ua3
      complexed with gdp, mou
  10. Domain(s) for 2p8w:
  11. Domain(s) for 2p8x:
  12. Domain(s) for 2p8y:
  13. Domain(s) for 2p8z:
  14. Domain(s) for 3b78:
    1. 1401408Domain d3b78a4: 3b78 A:561-725 [199033]
      Other proteins in same PDB: d3b78a1, d3b78a2, d3b78a3, d3b78a5, d3b78b_, d3b78c1, d3b78c2, d3b78c3, d3b78c5, d3b78d_, d3b78e1, d3b78e2, d3b78e3, d3b78e5, d3b78f_
      automated match to d1n0vc3
      protein/RNA complex; complexed with nad
    2. 1401409Domain d3b78c4: 3b78 C:561-725 [199038]
      Other proteins in same PDB: d3b78a1, d3b78a2, d3b78a3, d3b78a5, d3b78b_, d3b78c1, d3b78c2, d3b78c3, d3b78c5, d3b78d_, d3b78e1, d3b78e2, d3b78e3, d3b78e5, d3b78f_
      automated match to d1n0vc3
      protein/RNA complex; complexed with nad
    3. 1401410Domain d3b78e4: 3b78 E:561-725 [199043]
      Other proteins in same PDB: d3b78a1, d3b78a2, d3b78a3, d3b78a5, d3b78b_, d3b78c1, d3b78c2, d3b78c3, d3b78c5, d3b78d_, d3b78e1, d3b78e2, d3b78e3, d3b78e5, d3b78f_
      automated match to d1n0vc3
      protein/RNA complex; complexed with nad
  15. Domain(s) for 3b82:
    1. 1401405Domain d3b82a4: 3b82 A:561-725 [199048]
      Other proteins in same PDB: d3b82a1, d3b82a2, d3b82a3, d3b82a5, d3b82b_, d3b82c1, d3b82c2, d3b82c3, d3b82c5, d3b82d_, d3b82e1, d3b82e2, d3b82e3, d3b82e5, d3b82f_
      automated match to d1n0vc3
      protein/RNA complex; complexed with nad
    2. 1401406Domain d3b82c4: 3b82 C:561-725 [199053]
      Other proteins in same PDB: d3b82a1, d3b82a2, d3b82a3, d3b82a5, d3b82b_, d3b82c1, d3b82c2, d3b82c3, d3b82c5, d3b82d_, d3b82e1, d3b82e2, d3b82e3, d3b82e5, d3b82f_
      automated match to d1n0vc3
      protein/RNA complex; complexed with nad
    3. 1401407Domain d3b82e4: 3b82 E:561-725 [199058]
      Other proteins in same PDB: d3b82a1, d3b82a2, d3b82a3, d3b82a5, d3b82b_, d3b82c1, d3b82c2, d3b82c3, d3b82c5, d3b82d_, d3b82e1, d3b82e2, d3b82e3, d3b82e5, d3b82f_
      automated match to d1n0vc3
      protein/RNA complex; complexed with nad
  16. Domain(s) for 3b8h:
    1. 1401411Domain d3b8ha4: 3b8h A:561-725 [199063]
      Other proteins in same PDB: d3b8ha1, d3b8ha2, d3b8ha3, d3b8ha5, d3b8hb_, d3b8hc1, d3b8hc2, d3b8hc3, d3b8hc5, d3b8hd_, d3b8he1, d3b8he2, d3b8he3, d3b8he5, d3b8hf_
      automated match to d1n0vc3
      protein/RNA complex; complexed with nad
    2. 1401412Domain d3b8hc4: 3b8h C:561-725 [199068]
      Other proteins in same PDB: d3b8ha1, d3b8ha2, d3b8ha3, d3b8ha5, d3b8hb_, d3b8hc1, d3b8hc2, d3b8hc3, d3b8hc5, d3b8hd_, d3b8he1, d3b8he2, d3b8he3, d3b8he5, d3b8hf_
      automated match to d1n0vc3
      protein/RNA complex; complexed with nad
    3. 1401413Domain d3b8he4: 3b8h E:561-725 [199073]
      Other proteins in same PDB: d3b8ha1, d3b8ha2, d3b8ha3, d3b8ha5, d3b8hb_, d3b8hc1, d3b8hc2, d3b8hc3, d3b8hc5, d3b8hd_, d3b8he1, d3b8he2, d3b8he3, d3b8he5, d3b8hf_
      automated match to d1n0vc3
      protein/RNA complex; complexed with nad

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