SCOP 1.63: Protein: Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain

Lineage for Protein: Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain

Root: SCOP 1.63
Class f: Membrane and cell surface proteins and peptides [56835] (34 folds)
Fold f.21: Heme-binding four-helical bundle [81344] (2 superfamilies)
core: four transmembrane helices, up-and-down bundle, binds one or two heme groups in between the helices
Superfamily f.21.1: Transmembrane di-heme cytochromes [81342] (2 families)
Three of the four heme-ligands are conserved between the two families; both heme groups bind similarly but not identically

Family f.21.1.2: Cytochrome b of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase) [81642] (1 protein)
a part (domain) of a larger mitochondrial cytochrome b subunit, separate subunit in plants and cyanobacteria

Protein Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain [81641] (3 species)
also includes extra transmembrane (linker) helix absent in plants and cyanobacteria subunits

Species:

Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [81640] (3 PDB entries)

Domain for 1ezv:

Domain d1ezvc3: 1ezv C:1-261 [75834]
Other proteins in same PDB: d1ezva1, d1ezva2, d1ezvb1, d1ezvb2, d1ezvc2, d1ezvd1, d1ezvd2, d1ezve1, d1ezve2, d1ezvf_, d1ezvg_, d1ezvh_, d1ezvi_, d1ezvx_, d1ezvy_
complexed with fes, hem, sma, uq6

Domain for 1kb9:

Domain d1kb9c2: 1kb9 C:1-261 [77316]
Other proteins in same PDB: d1kb9a1, d1kb9a2, d1kb9b1, d1kb9b2, d1kb9c1, d1kb9d1, d1kb9d2, d1kb9e1, d1kb9e2, d1kb9f_, d1kb9g_, d1kb9h_, d1kb9i_, d1kb9j_, d1kb9k_
complexed with cdl, fes, hem, pcf, pef, pie, sma, umq, uq6

Domains for 1kyo:

Domain d1kyoc3: 1kyo C:1-261 [75905]
Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_

Domain d1kyon3: 1kyo N:1-261 [75907]
Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
complexed with fes, hem, m3l, sma

Chicken (Gallus gallus) [TaxId:9031] [81639] (3 PDB entries)

Domain for 1bcc:

Domain d1bccc3: 1bcc C:2-261 [75804]
Other proteins in same PDB: d1bcca1, d1bcca2, d1bccb1, d1bccb2, d1bccc2, d1bccd2, d1bccd3, d1bcce1, d1bcce2, d1bccf_, d1bccg_, d1bcch_, d1bccj_
complexed with bog, fes, hem, pee, u10

Domain for 2bcc:

Domain d2bccc3: 2bcc C:2-261 [75988]
Other proteins in same PDB: d2bcca1, d2bcca2, d2bccb1, d2bccb2, d2bccc2, d2bccd2, d2bccd3, d2bcce1, d2bcce2, d2bccf_, d2bccg_, d2bcch_, d2bccj_
complexed with bog, fes, hem, pee, sig, u10

Domain for 3bcc:

Domain d3bccc3: 3bcc C:2-261 [75999]
Other proteins in same PDB: d3bcca1, d3bcca2, d3bccb1, d3bccb2, d3bccc2, d3bccd2, d3bccd3, d3bcce1, d3bcce2, d3bccf_, d3bccg_, d3bcch_, d3bccj_
complexed with amy, fes, hem, sig

Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [81638] (3 PDB entries)

Domain for 1be3:

Domain d1be3c3: 1be3 C:1-260 [75806]
Other proteins in same PDB: d1be3a1, d1be3a2, d1be3b1, d1be3b2, d1be3c2, d1be3d2, d1be3d3, d1be3e1, d1be3e2, d1be3f_, d1be3g_, d1be3h_, d1be3j_, d1be3k_
complexed with fes, hec, hem

Domains for 1bgy:

Domain d1bgyc3: 1bgy C:1-260 [75808]
Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyb1, d1bgyb2, d1bgyc2, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyn1, d1bgyn2, d1bgyo2, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyv_, d1bgyw_

Domain d1bgyo3: 1bgy O:1-260 [75810]
Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyb1, d1bgyb2, d1bgyc2, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyn1, d1bgyn2, d1bgyo2, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyv_, d1bgyw_
complexed with fes, hec, hem

Domain for 1qcr:

Domain d1qcrc3: 1qcr C:2-260 [75932]
Other proteins in same PDB: d1qcra1, d1qcra2, d1qcrb1, d1qcrb2, d1qcrc2, d1qcrd2, d1qcrd3, d1qcre1, d1qcre2, d1qcrf_, d1qcrg_, d1qcrh_, d1qcrj_, d1qcrk_
complexed with hem

More info for Protein Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain from f.21.1.2: Cytochrome b of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase)

Timeline for Protein Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain from f.21.1.2: Cytochrome b of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase):

Protein Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain from f.21.1.2: Cytochrome b of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase) is new in SCOP 1.63
Protein Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain from f.21.1.2: Cytochrome b of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase) appears in SCOP 1.65
Protein Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain from f.21.1.2: Cytochrome b of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase) appears in the current release, SCOPe 2.08