Lineage for Species: Cow (Bos taurus)

  1. Root: SCOP 1.71
  2. 619386Class f: Membrane and cell surface proteins and peptides [56835] (49 folds)
  3. 620137Fold f.21: Heme-binding four-helical bundle [81344] (3 superfamilies)
    core: four transmembrane helices, up-and-down bundle, binds one or two heme groups in between the helices
  4. 620138Superfamily f.21.1: Transmembrane di-heme cytochromes [81342] (2 families) (S)
    Three of the four heme-ligands are conserved between the two families; both heme groups bind similarly but not identically
  5. 620144Family f.21.1.2: Cytochrome b of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase) [81642] (2 proteins)
    a part (domain) of a larger mitochondrial cytochrome b subunit, separate subunit in plants and cyanobacteria
  6. 620151Protein Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain [81641] (3 species)
    also includes extra transmembrane (linker) helix absent in plants and cyanobacteria subunits
  7. 620162Species Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [81638] (12 PDB entries)

PDB entries in Species: Cow (Bos taurus):

  1. Domain(s) for 1be3:
  2. Domain(s) for 1bgy:
    1. 620175Domain d1bgyc3: 1bgy C:1-260 [75808]
      Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyb1, d1bgyb2, d1bgyc2, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyn1, d1bgyn2, d1bgyo2, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyv_, d1bgyw_
    2. 620176Domain d1bgyo3: 1bgy O:1-260 [75810]
      Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyb1, d1bgyb2, d1bgyc2, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyn1, d1bgyn2, d1bgyo2, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyv_, d1bgyw_
      complexed with fes, hec, hem
  3. Domain(s) for 1l0l:
  4. Domain(s) for 1l0n:
  5. Domain(s) for 1ntk:
  6. Domain(s) for 1ntm:
  7. Domain(s) for 1ntz:
  8. Domain(s) for 1nu1:
  9. Domain(s) for 1pp9:
    1. 620165Domain d1pp9c2: 1pp9 C:15-260 [104227]
      Other proteins in same PDB: d1pp9a1, d1pp9a2, d1pp9b1, d1pp9b2, d1pp9c1, d1pp9d1, d1pp9d2, d1pp9e1, d1pp9e2, d1pp9f_, d1pp9g_, d1pp9h_, d1pp9i_, d1pp9j_, d1pp9n1, d1pp9n2, d1pp9o1, d1pp9o2, d1pp9p1, d1pp9q1, d1pp9q2, d1pp9r1, d1pp9r2, d1pp9s_, d1pp9t_, d1pp9u_, d1pp9v_, d1pp9w_
    2. 620166Domain d1pp9p2: 1pp9 P:15-260 [104242]
      Other proteins in same PDB: d1pp9a1, d1pp9a2, d1pp9b1, d1pp9b2, d1pp9c1, d1pp9d1, d1pp9d2, d1pp9e1, d1pp9e2, d1pp9f_, d1pp9g_, d1pp9h_, d1pp9i_, d1pp9j_, d1pp9n1, d1pp9n2, d1pp9o1, d1pp9o2, d1pp9p1, d1pp9q1, d1pp9q2, d1pp9r1, d1pp9r2, d1pp9s_, d1pp9t_, d1pp9u_, d1pp9v_, d1pp9w_
      complexed with azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma, uq
  10. Domain(s) for 1ppj:
    1. 620163Domain d1ppjc2: 1ppj C:15-260 [104257]
      Other proteins in same PDB: d1ppja1, d1ppja2, d1ppjb1, d1ppjb2, d1ppjc1, d1ppjd1, d1ppjd2, d1ppje1, d1ppje2, d1ppjf_, d1ppjg_, d1ppjh_, d1ppji_, d1ppjj_, d1ppjn1, d1ppjn2, d1ppjo1, d1ppjo2, d1ppjp1, d1ppjq1, d1ppjq2, d1ppjr1, d1ppjr2, d1ppjs_, d1ppjt_, d1ppju_, d1ppjv_, d1ppjw_
    2. 620164Domain d1ppjp2: 1ppj P:15-260 [104272]
      Other proteins in same PDB: d1ppja1, d1ppja2, d1ppjb1, d1ppjb2, d1ppjc1, d1ppjd1, d1ppjd2, d1ppje1, d1ppje2, d1ppjf_, d1ppjg_, d1ppjh_, d1ppji_, d1ppjj_, d1ppjn1, d1ppjn2, d1ppjo1, d1ppjo2, d1ppjp1, d1ppjq1, d1ppjq2, d1ppjr1, d1ppjr2, d1ppjs_, d1ppjt_, d1ppju_, d1ppjv_, d1ppjw_
      complexed with any, azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma
  11. Domain(s) for 1qcr:
  12. Domain(s) for 1sqb:

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