SCOP 1.73: Protein: Class sigma GST

Lineage for Protein: Class sigma GST

Root: SCOP 1.73
Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (141 folds)
Fold c.47: Thioredoxin fold [52832] (2 superfamilies)
core: 3 layers, a/b/a; mixed beta-sheet of 4 strands, order 4312; strand 3 is antiparallel to the rest
Superfamily c.47.1: Thioredoxin-like [52833] (22 families)
Family c.47.1.5: Glutathione S-transferase (GST), N-terminal domain [52862] (18 proteins)
Protein Class sigma GST [81362] (5 species)

Species:

Fruit fly (Drosophila melanogaster) [TaxId:7227] [82427] (1 PDB entry)
- Domains for 1m0u:
  1. Domain d1m0ua2: 1m0u A:47-122 [78360]
    Other proteins in same PDB: d1m0ua1, d1m0ub1
  2. Domain d1m0ub2: 1m0u B:47-122 [78362]
    Other proteins in same PDB: d1m0ua1, d1m0ub1
    complexed with gtt, so4
Heligmosomoides polygyrus [TaxId:6339] [110608] (1 PDB entry)
- Domains for 1tw9:
  1. Domain d1tw9a2: 1tw9 A:1-77 [107382]
    Other proteins in same PDB: d1tw9a1, d1tw9b1, d1tw9c1, d1tw9d1, d1tw9e1, d1tw9f1, d1tw9g1, d1tw9h1
  2. Domain d1tw9b2: 1tw9 B:1-77 [107384]
    Other proteins in same PDB: d1tw9a1, d1tw9b1, d1tw9c1, d1tw9d1, d1tw9e1, d1tw9f1, d1tw9g1, d1tw9h1
  3. Domain d1tw9c2: 1tw9 C:1-77 [107386]
    Other proteins in same PDB: d1tw9a1, d1tw9b1, d1tw9c1, d1tw9d1, d1tw9e1, d1tw9f1, d1tw9g1, d1tw9h1
  4. Domain d1tw9d2: 1tw9 D:1-77 [107388]
    Other proteins in same PDB: d1tw9a1, d1tw9b1, d1tw9c1, d1tw9d1, d1tw9e1, d1tw9f1, d1tw9g1, d1tw9h1
  5. Domain d1tw9e2: 1tw9 E:1-77 [107390]
    Other proteins in same PDB: d1tw9a1, d1tw9b1, d1tw9c1, d1tw9d1, d1tw9e1, d1tw9f1, d1tw9g1, d1tw9h1
  6. Domain d1tw9f2: 1tw9 F:1-77 [107392]
    Other proteins in same PDB: d1tw9a1, d1tw9b1, d1tw9c1, d1tw9d1, d1tw9e1, d1tw9f1, d1tw9g1, d1tw9h1
  7. Domain d1tw9g2: 1tw9 G:1-77 [107394]
    Other proteins in same PDB: d1tw9a1, d1tw9b1, d1tw9c1, d1tw9d1, d1tw9e1, d1tw9f1, d1tw9g1, d1tw9h1
  8. Domain d1tw9h2: 1tw9 H:1-77 [107396]
    Other proteins in same PDB: d1tw9a1, d1tw9b1, d1tw9c1, d1tw9d1, d1tw9e1, d1tw9f1, d1tw9g1, d1tw9h1
Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] [89705] (4 PDB entries)
synonym: hematopoietic prostaglandin D synthase
1. Domains for 1iyh:
  1. Domain d1iyha2: 1iyh A:2-75 [83791]
    Other proteins in same PDB: d1iyha1, d1iyhb1, d1iyhc1, d1iyhd1
  2. Domain d1iyhb2: 1iyh B:202-275 [83793]
    Other proteins in same PDB: d1iyha1, d1iyhb1, d1iyhc1, d1iyhd1
  3. Domain d1iyhc2: 1iyh C:402-475 [83795]
    Other proteins in same PDB: d1iyha1, d1iyhb1, d1iyhc1, d1iyhd1
  4. Domain d1iyhd2: 1iyh D:602-675 [83797]
    Other proteins in same PDB: d1iyha1, d1iyhb1, d1iyhc1, d1iyhd1
    complexed with gsh, mg
2. Domains for 1iyi:
  1. Domain d1iyia2: 1iyi A:2-75 [83799]
    Other proteins in same PDB: d1iyia1, d1iyib1, d1iyic1, d1iyid1
  2. Domain d1iyib2: 1iyi B:202-275 [83801]
    Other proteins in same PDB: d1iyia1, d1iyib1, d1iyic1, d1iyid1
  3. Domain d1iyic2: 1iyi C:402-475 [83803]
    Other proteins in same PDB: d1iyia1, d1iyib1, d1iyic1, d1iyid1
  4. Domain d1iyid2: 1iyi D:602-675 [83805]
    Other proteins in same PDB: d1iyia1, d1iyib1, d1iyic1, d1iyid1
    complexed with ca, gsh
3. Domains for 1v40:
  1. Domain d1v40a2: 1v40 A:2-75 [113513]
    Other proteins in same PDB: d1v40a1, d1v40b1, d1v40c1, d1v40d1
  2. Domain d1v40b2: 1v40 B:202-275 [113515]
    Other proteins in same PDB: d1v40a1, d1v40b1, d1v40c1, d1v40d1
  3. Domain d1v40c2: 1v40 C:402-475 [113517]
    Other proteins in same PDB: d1v40a1, d1v40b1, d1v40c1, d1v40d1
  4. Domain d1v40d2: 1v40 D:602-675 [113519]
    Other proteins in same PDB: d1v40a1, d1v40b1, d1v40c1, d1v40d1
    complexed with cry, gsh, mg, o16
4. Domains for 2cvd:
  1. Domain d2cvda2: 2cvd A:2-75 [130862]
    Other proteins in same PDB: d2cvda1, d2cvdb1, d2cvdc1, d2cvdd1
    automatically matched to d1iyha2
    complexed with gol, gsh, hql, mg
  2. Domain d2cvdb2: 2cvd B:2-75 [130864]
    Other proteins in same PDB: d2cvda1, d2cvdb1, d2cvdc1, d2cvdd1
    automatically matched to d1iyha2
    complexed with gol, gsh, hql, mg
  3. Domain d2cvdc2: 2cvd C:2-75 [130866]
    Other proteins in same PDB: d2cvda1, d2cvdb1, d2cvdc1, d2cvdd1
    automatically matched to d1iyha2
    complexed with gol, gsh, hql, mg
  4. Domain d2cvdd2: 2cvd D:2-75 [130868]
    Other proteins in same PDB: d2cvda1, d2cvdb1, d2cvdc1, d2cvdd1
    automatically matched to d1iyha2
    complexed with gol, gsh, hql, mg
Rat (Rattus norvegicus) [TaxId:10116] [52875] (1 PDB entry)
synonym: hematopoietic prostaglandin D synthase
- Domains for 1pd2:
  1. Domain d1pd212: 1pd2 1:1-75 [33007]
    Other proteins in same PDB: d1pd211, d1pd221
  2. Domain d1pd222: 1pd2 2:1-75 [33008]
    Other proteins in same PDB: d1pd211, d1pd221
    complexed with gtt
Squid (Ommastrephes sloani pacificus) [TaxId:6634] [52876] (2 PDB entries)
1. Domain for 1gsq:
  - Domain d1gsqa2: 1gsq A:1-75 [33010]
    Other proteins in same PDB: d1gsqa1
    complexed with gdb
2. Domain for 2gsq:
  - Domain d2gsqa2: 2gsq A:1-75 [33009]
    Other proteins in same PDB: d2gsqa1
    complexed with gbi, so4

More info for Protein Class sigma GST from c.47.1.5: Glutathione S-transferase (GST), N-terminal domain

Timeline for Protein Class sigma GST from c.47.1.5: Glutathione S-transferase (GST), N-terminal domain:

Protein Class sigma GST from c.47.1.5: Glutathione S-transferase (GST), N-terminal domain first appeared in SCOP 1.63
Protein Class sigma GST from c.47.1.5: Glutathione S-transferase (GST), N-terminal domain appears in SCOP 1.71
Protein Class sigma GST from c.47.1.5: Glutathione S-transferase (GST), N-terminal domain appears in SCOP 1.75
Protein Class sigma GST from c.47.1.5: Glutathione S-transferase (GST), N-terminal domain appears in the current release, SCOPe 2.08