SCOP 1.65: Species: Domestic pigeon (Columba livia)

Lineage for Species: Domestic pigeon (Columba livia)

Root: SCOP 1.65
Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (121 folds)

Fold c.2: NAD(P)-binding Rossmann-fold domains [51734] (1 superfamily)
core: 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456
The nucleotide-binding modes of this and the next two folds/superfamilies are similar

Superfamily c.2.1: NAD(P)-binding Rossmann-fold domains [51735] (10 families)

Family c.2.1.7: Aminoacid dehydrogenase-like, C-terminal domain [51883] (10 proteins)
extra N-terminal helix displaces the C-terminal helix (following strand 6) from its usual position creating a family nicotineamide-binding site

Protein Mitochondrial NAD(P)-dependenent malic enzyme [51898] (3 species)
includes C-terminal additional subdomains
Species Domestic pigeon (Columba livia) [TaxId:8932] [75116] (1 PDB entry)

PDB entry in Species: Domestic pigeon (Columba livia):

Domain(s) for 1gq2:

Domain d1gq2a1: 1gq2 A:280-580 [70308]
Other proteins in same PDB: d1gq2a2, d1gq2b2, d1gq2c2, d1gq2d2, d1gq2e2, d1gq2f2, d1gq2g2, d1gq2h2, d1gq2i2, d1gq2j2, d1gq2k2, d1gq2l2, d1gq2m2, d1gq2n2, d1gq2o2, d1gq2p2

Domain d1gq2b1: 1gq2 B:280-580 [70310]
Other proteins in same PDB: d1gq2a2, d1gq2b2, d1gq2c2, d1gq2d2, d1gq2e2, d1gq2f2, d1gq2g2, d1gq2h2, d1gq2i2, d1gq2j2, d1gq2k2, d1gq2l2, d1gq2m2, d1gq2n2, d1gq2o2, d1gq2p2

Domain d1gq2c1: 1gq2 C:280-580 [70312]
Other proteins in same PDB: d1gq2a2, d1gq2b2, d1gq2c2, d1gq2d2, d1gq2e2, d1gq2f2, d1gq2g2, d1gq2h2, d1gq2i2, d1gq2j2, d1gq2k2, d1gq2l2, d1gq2m2, d1gq2n2, d1gq2o2, d1gq2p2

Domain d1gq2d1: 1gq2 D:280-580 [70314]
Other proteins in same PDB: d1gq2a2, d1gq2b2, d1gq2c2, d1gq2d2, d1gq2e2, d1gq2f2, d1gq2g2, d1gq2h2, d1gq2i2, d1gq2j2, d1gq2k2, d1gq2l2, d1gq2m2, d1gq2n2, d1gq2o2, d1gq2p2

Domain d1gq2e1: 1gq2 E:280-580 [70316]
Other proteins in same PDB: d1gq2a2, d1gq2b2, d1gq2c2, d1gq2d2, d1gq2e2, d1gq2f2, d1gq2g2, d1gq2h2, d1gq2i2, d1gq2j2, d1gq2k2, d1gq2l2, d1gq2m2, d1gq2n2, d1gq2o2, d1gq2p2

Domain d1gq2f1: 1gq2 F:280-580 [70318]
Other proteins in same PDB: d1gq2a2, d1gq2b2, d1gq2c2, d1gq2d2, d1gq2e2, d1gq2f2, d1gq2g2, d1gq2h2, d1gq2i2, d1gq2j2, d1gq2k2, d1gq2l2, d1gq2m2, d1gq2n2, d1gq2o2, d1gq2p2

Domain d1gq2g1: 1gq2 G:280-580 [70320]
Other proteins in same PDB: d1gq2a2, d1gq2b2, d1gq2c2, d1gq2d2, d1gq2e2, d1gq2f2, d1gq2g2, d1gq2h2, d1gq2i2, d1gq2j2, d1gq2k2, d1gq2l2, d1gq2m2, d1gq2n2, d1gq2o2, d1gq2p2

Domain d1gq2h1: 1gq2 H:280-580 [70322]
Other proteins in same PDB: d1gq2a2, d1gq2b2, d1gq2c2, d1gq2d2, d1gq2e2, d1gq2f2, d1gq2g2, d1gq2h2, d1gq2i2, d1gq2j2, d1gq2k2, d1gq2l2, d1gq2m2, d1gq2n2, d1gq2o2, d1gq2p2

Domain d1gq2i1: 1gq2 I:280-580 [70324]
Other proteins in same PDB: d1gq2a2, d1gq2b2, d1gq2c2, d1gq2d2, d1gq2e2, d1gq2f2, d1gq2g2, d1gq2h2, d1gq2i2, d1gq2j2, d1gq2k2, d1gq2l2, d1gq2m2, d1gq2n2, d1gq2o2, d1gq2p2

Domain d1gq2j1: 1gq2 J:280-580 [70326]
Other proteins in same PDB: d1gq2a2, d1gq2b2, d1gq2c2, d1gq2d2, d1gq2e2, d1gq2f2, d1gq2g2, d1gq2h2, d1gq2i2, d1gq2j2, d1gq2k2, d1gq2l2, d1gq2m2, d1gq2n2, d1gq2o2, d1gq2p2

Domain d1gq2k1: 1gq2 K:280-580 [70328]
Other proteins in same PDB: d1gq2a2, d1gq2b2, d1gq2c2, d1gq2d2, d1gq2e2, d1gq2f2, d1gq2g2, d1gq2h2, d1gq2i2, d1gq2j2, d1gq2k2, d1gq2l2, d1gq2m2, d1gq2n2, d1gq2o2, d1gq2p2

Domain d1gq2l1: 1gq2 L:280-580 [70330]
Other proteins in same PDB: d1gq2a2, d1gq2b2, d1gq2c2, d1gq2d2, d1gq2e2, d1gq2f2, d1gq2g2, d1gq2h2, d1gq2i2, d1gq2j2, d1gq2k2, d1gq2l2, d1gq2m2, d1gq2n2, d1gq2o2, d1gq2p2

Domain d1gq2m1: 1gq2 M:280-580 [70332]
Other proteins in same PDB: d1gq2a2, d1gq2b2, d1gq2c2, d1gq2d2, d1gq2e2, d1gq2f2, d1gq2g2, d1gq2h2, d1gq2i2, d1gq2j2, d1gq2k2, d1gq2l2, d1gq2m2, d1gq2n2, d1gq2o2, d1gq2p2

Domain d1gq2n1: 1gq2 N:280-580 [70334]
Other proteins in same PDB: d1gq2a2, d1gq2b2, d1gq2c2, d1gq2d2, d1gq2e2, d1gq2f2, d1gq2g2, d1gq2h2, d1gq2i2, d1gq2j2, d1gq2k2, d1gq2l2, d1gq2m2, d1gq2n2, d1gq2o2, d1gq2p2

Domain d1gq2o1: 1gq2 O:280-580 [70336]
Other proteins in same PDB: d1gq2a2, d1gq2b2, d1gq2c2, d1gq2d2, d1gq2e2, d1gq2f2, d1gq2g2, d1gq2h2, d1gq2i2, d1gq2j2, d1gq2k2, d1gq2l2, d1gq2m2, d1gq2n2, d1gq2o2, d1gq2p2

Domain d1gq2p1: 1gq2 P:280-580 [70338]
Other proteins in same PDB: d1gq2a2, d1gq2b2, d1gq2c2, d1gq2d2, d1gq2e2, d1gq2f2, d1gq2g2, d1gq2h2, d1gq2i2, d1gq2j2, d1gq2k2, d1gq2l2, d1gq2m2, d1gq2n2, d1gq2o2, d1gq2p2
complexed with cl, mn, mse, na, nap, oxl

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Species Domestic pigeon (Columba livia) [TaxId:8932] from c.2.1.7 Mitochondrial NAD(P)-dependenent malic enzyme first appeared in SCOP 1.61
Species Domestic pigeon (Columba livia) [TaxId:8932] from c.2.1.7 Mitochondrial NAD(P)-dependenent malic enzyme appears in SCOP 1.63
Species Domestic pigeon (Columba livia) [TaxId:8932] from c.2.1.7 Mitochondrial NAD(P)-dependenent malic enzyme is called Species Domestic pigeon (Columba livia) [TaxId:8932] from c.2.1.7 Mitochondrial NAD(P)-dependent malic enzyme in SCOP 1.67
Species Domestic pigeon (Columba livia) [TaxId:8932] from c.2.1.7 Mitochondrial NAD(P)-dependenent malic enzyme appears in the current release, SCOPe 2.08, called Species Domestic pigeon (Columba livia) [TaxId:8932] from c.2.1.7 Mitochondrial NAD(P)-dependent malic enzyme