Lineage for Species: Thermus thermophilus

  1. Root: SCOP 1.69
  2. 436025Class a: All alpha proteins [46456] (218 folds)
  3. 449709Fold a.143: RPB6/omega subunit-like [63561] (1 superfamily)
    core: 2 helices and adjacent loops
  4. 449710Superfamily a.143.1: RPB6/omega subunit-like [63562] (2 families) (S)
    the bacterial omega and eukaryotic RPB6 subunits both function in polymerase assembly; the common core is involved in conserved interactions with other subunits
  5. 449711Family a.143.1.1: RNA polymerase omega subunit [63563] (1 protein)
    4 helices; irregular array
  6. 449712Protein RNA polymerase omega subunit [63564] (2 species)
  7. 449715Species Thermus thermophilus [TaxId:274] [74729] (2 PDB entries)

PDB entries in Species: Thermus thermophilus:

  1. Domain(s) for 1iw7:
    1. 449718Domain d1iw7e_: 1iw7 E: [71476]
      Other proteins in same PDB: d1iw7a1, d1iw7a2, d1iw7b1, d1iw7b2, d1iw7c_, d1iw7d_, d1iw7f1, d1iw7f2, d1iw7f3, d1iw7k1, d1iw7k2, d1iw7l1, d1iw7l2, d1iw7m_, d1iw7n_, d1iw7p1, d1iw7p2, d1iw7p3
    2. 449719Domain d1iw7o_: 1iw7 O: [71484]
      Other proteins in same PDB: d1iw7a1, d1iw7a2, d1iw7b1, d1iw7b2, d1iw7c_, d1iw7d_, d1iw7f1, d1iw7f2, d1iw7f3, d1iw7k1, d1iw7k2, d1iw7l1, d1iw7l2, d1iw7m_, d1iw7n_, d1iw7p1, d1iw7p2, d1iw7p3
  2. Domain(s) for 1smy:
    1. 449716Domain d1smye_: 1smy E: [105780]
      Other proteins in same PDB: d1smya1, d1smya2, d1smyb1, d1smyb2, d1smyc_, d1smyd_, d1smyf1, d1smyf2, d1smyf3, d1smyk1, d1smyk2, d1smyl1, d1smyl2, d1smym_, d1smyn_, d1smyp1, d1smyp2, d1smyp3
    2. 449717Domain d1smyo_: 1smy O: [105790]
      Other proteins in same PDB: d1smya1, d1smya2, d1smyb1, d1smyb2, d1smyc_, d1smyd_, d1smyf1, d1smyf2, d1smyf3, d1smyk1, d1smyk2, d1smyl1, d1smyl2, d1smym_, d1smyn_, d1smyp1, d1smyp2, d1smyp3

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