Lineage for Species: Green alga (Chlamydomonas reinhardtii) [TaxId: 3055]

  1. Root: SCOPe 2.02
  2. 1190016Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (376 folds)
  3. 1208801Fold d.73: RuBisCO, small subunit [55238] (1 superfamily)
    alpha-beta(2)-alpha-beta(2); 2 layers, alpha/beta
  4. 1208802Superfamily d.73.1: RuBisCO, small subunit [55239] (1 family) (S)
  5. 1208803Family d.73.1.1: RuBisCO, small subunit [55240] (2 proteins)
  6. 1208804Protein Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase [55241] (8 species)
  7. 1208823Species Green alga (Chlamydomonas reinhardtii) [TaxId:3055] [69758] (6 PDB entries)

PDB entries in Species: Green alga (Chlamydomonas reinhardtii) [TaxId: 3055]:

  1. Domain(s) for 1gk8:
    1. 1208824Domain d1gk8i_: 1gk8 I: [65242]
      Other proteins in same PDB: d1gk8a1, d1gk8a2, d1gk8c1, d1gk8c2, d1gk8e1, d1gk8e2, d1gk8g1, d1gk8g2
      complexed with cap, edo, mg
    2. 1208825Domain d1gk8k_: 1gk8 K: [65243]
      Other proteins in same PDB: d1gk8a1, d1gk8a2, d1gk8c1, d1gk8c2, d1gk8e1, d1gk8e2, d1gk8g1, d1gk8g2
      complexed with cap, edo, mg
    3. 1208826Domain d1gk8m_: 1gk8 M: [65244]
      Other proteins in same PDB: d1gk8a1, d1gk8a2, d1gk8c1, d1gk8c2, d1gk8e1, d1gk8e2, d1gk8g1, d1gk8g2
      complexed with cap, edo, mg
    4. 1208827Domain d1gk8o_: 1gk8 O: [65245]
      Other proteins in same PDB: d1gk8a1, d1gk8a2, d1gk8c1, d1gk8c2, d1gk8e1, d1gk8e2, d1gk8g1, d1gk8g2
      complexed with cap, edo, mg
  2. Domain(s) for 1ir2:
    1. 1208828Domain d1ir21_: 1ir2 1: [71294]
      Other proteins in same PDB: d1ir2a1, d1ir2a2, d1ir2b1, d1ir2b2, d1ir2c1, d1ir2c2, d1ir2d1, d1ir2d2, d1ir2e1, d1ir2e2, d1ir2f1, d1ir2f2, d1ir2g1, d1ir2g2, d1ir2h1, d1ir2h2, d1ir2s1, d1ir2s2, d1ir2t1, d1ir2t2, d1ir2u1, d1ir2u2, d1ir2v1, d1ir2v2, d1ir2w1, d1ir2w2, d1ir2x1, d1ir2x2, d1ir2y1, d1ir2y2, d1ir2z1, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    2. 1208829Domain d1ir22_: 1ir2 2: [71295]
      Other proteins in same PDB: d1ir2a1, d1ir2a2, d1ir2b1, d1ir2b2, d1ir2c1, d1ir2c2, d1ir2d1, d1ir2d2, d1ir2e1, d1ir2e2, d1ir2f1, d1ir2f2, d1ir2g1, d1ir2g2, d1ir2h1, d1ir2h2, d1ir2s1, d1ir2s2, d1ir2t1, d1ir2t2, d1ir2u1, d1ir2u2, d1ir2v1, d1ir2v2, d1ir2w1, d1ir2w2, d1ir2x1, d1ir2x2, d1ir2y1, d1ir2y2, d1ir2z1, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    3. 1208830Domain d1ir23_: 1ir2 3: [71296]
      Other proteins in same PDB: d1ir2a1, d1ir2a2, d1ir2b1, d1ir2b2, d1ir2c1, d1ir2c2, d1ir2d1, d1ir2d2, d1ir2e1, d1ir2e2, d1ir2f1, d1ir2f2, d1ir2g1, d1ir2g2, d1ir2h1, d1ir2h2, d1ir2s1, d1ir2s2, d1ir2t1, d1ir2t2, d1ir2u1, d1ir2u2, d1ir2v1, d1ir2v2, d1ir2w1, d1ir2w2, d1ir2x1, d1ir2x2, d1ir2y1, d1ir2y2, d1ir2z1, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    4. 1208831Domain d1ir24_: 1ir2 4: [71297]
      Other proteins in same PDB: d1ir2a1, d1ir2a2, d1ir2b1, d1ir2b2, d1ir2c1, d1ir2c2, d1ir2d1, d1ir2d2, d1ir2e1, d1ir2e2, d1ir2f1, d1ir2f2, d1ir2g1, d1ir2g2, d1ir2h1, d1ir2h2, d1ir2s1, d1ir2s2, d1ir2t1, d1ir2t2, d1ir2u1, d1ir2u2, d1ir2v1, d1ir2v2, d1ir2w1, d1ir2w2, d1ir2x1, d1ir2x2, d1ir2y1, d1ir2y2, d1ir2z1, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    5. 1208832Domain d1ir25_: 1ir2 5: [71298]
      Other proteins in same PDB: d1ir2a1, d1ir2a2, d1ir2b1, d1ir2b2, d1ir2c1, d1ir2c2, d1ir2d1, d1ir2d2, d1ir2e1, d1ir2e2, d1ir2f1, d1ir2f2, d1ir2g1, d1ir2g2, d1ir2h1, d1ir2h2, d1ir2s1, d1ir2s2, d1ir2t1, d1ir2t2, d1ir2u1, d1ir2u2, d1ir2v1, d1ir2v2, d1ir2w1, d1ir2w2, d1ir2x1, d1ir2x2, d1ir2y1, d1ir2y2, d1ir2z1, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    6. 1208833Domain d1ir26_: 1ir2 6: [71299]
      Other proteins in same PDB: d1ir2a1, d1ir2a2, d1ir2b1, d1ir2b2, d1ir2c1, d1ir2c2, d1ir2d1, d1ir2d2, d1ir2e1, d1ir2e2, d1ir2f1, d1ir2f2, d1ir2g1, d1ir2g2, d1ir2h1, d1ir2h2, d1ir2s1, d1ir2s2, d1ir2t1, d1ir2t2, d1ir2u1, d1ir2u2, d1ir2v1, d1ir2v2, d1ir2w1, d1ir2w2, d1ir2x1, d1ir2x2, d1ir2y1, d1ir2y2, d1ir2z1, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    7. 1208834Domain d1ir27_: 1ir2 7: [71300]
      Other proteins in same PDB: d1ir2a1, d1ir2a2, d1ir2b1, d1ir2b2, d1ir2c1, d1ir2c2, d1ir2d1, d1ir2d2, d1ir2e1, d1ir2e2, d1ir2f1, d1ir2f2, d1ir2g1, d1ir2g2, d1ir2h1, d1ir2h2, d1ir2s1, d1ir2s2, d1ir2t1, d1ir2t2, d1ir2u1, d1ir2u2, d1ir2v1, d1ir2v2, d1ir2w1, d1ir2w2, d1ir2x1, d1ir2x2, d1ir2y1, d1ir2y2, d1ir2z1, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    8. 1208835Domain d1ir28_: 1ir2 8: [71301]
      Other proteins in same PDB: d1ir2a1, d1ir2a2, d1ir2b1, d1ir2b2, d1ir2c1, d1ir2c2, d1ir2d1, d1ir2d2, d1ir2e1, d1ir2e2, d1ir2f1, d1ir2f2, d1ir2g1, d1ir2g2, d1ir2h1, d1ir2h2, d1ir2s1, d1ir2s2, d1ir2t1, d1ir2t2, d1ir2u1, d1ir2u2, d1ir2v1, d1ir2v2, d1ir2w1, d1ir2w2, d1ir2x1, d1ir2x2, d1ir2y1, d1ir2y2, d1ir2z1, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    9. 1208836Domain d1ir2i_: 1ir2 I: [71318]
      Other proteins in same PDB: d1ir2a1, d1ir2a2, d1ir2b1, d1ir2b2, d1ir2c1, d1ir2c2, d1ir2d1, d1ir2d2, d1ir2e1, d1ir2e2, d1ir2f1, d1ir2f2, d1ir2g1, d1ir2g2, d1ir2h1, d1ir2h2, d1ir2s1, d1ir2s2, d1ir2t1, d1ir2t2, d1ir2u1, d1ir2u2, d1ir2v1, d1ir2v2, d1ir2w1, d1ir2w2, d1ir2x1, d1ir2x2, d1ir2y1, d1ir2y2, d1ir2z1, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    10. 1208837Domain d1ir2j_: 1ir2 J: [71319]
      Other proteins in same PDB: d1ir2a1, d1ir2a2, d1ir2b1, d1ir2b2, d1ir2c1, d1ir2c2, d1ir2d1, d1ir2d2, d1ir2e1, d1ir2e2, d1ir2f1, d1ir2f2, d1ir2g1, d1ir2g2, d1ir2h1, d1ir2h2, d1ir2s1, d1ir2s2, d1ir2t1, d1ir2t2, d1ir2u1, d1ir2u2, d1ir2v1, d1ir2v2, d1ir2w1, d1ir2w2, d1ir2x1, d1ir2x2, d1ir2y1, d1ir2y2, d1ir2z1, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    11. 1208838Domain d1ir2k_: 1ir2 K: [71320]
      Other proteins in same PDB: d1ir2a1, d1ir2a2, d1ir2b1, d1ir2b2, d1ir2c1, d1ir2c2, d1ir2d1, d1ir2d2, d1ir2e1, d1ir2e2, d1ir2f1, d1ir2f2, d1ir2g1, d1ir2g2, d1ir2h1, d1ir2h2, d1ir2s1, d1ir2s2, d1ir2t1, d1ir2t2, d1ir2u1, d1ir2u2, d1ir2v1, d1ir2v2, d1ir2w1, d1ir2w2, d1ir2x1, d1ir2x2, d1ir2y1, d1ir2y2, d1ir2z1, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    12. 1208839Domain d1ir2l_: 1ir2 L: [71321]
      Other proteins in same PDB: d1ir2a1, d1ir2a2, d1ir2b1, d1ir2b2, d1ir2c1, d1ir2c2, d1ir2d1, d1ir2d2, d1ir2e1, d1ir2e2, d1ir2f1, d1ir2f2, d1ir2g1, d1ir2g2, d1ir2h1, d1ir2h2, d1ir2s1, d1ir2s2, d1ir2t1, d1ir2t2, d1ir2u1, d1ir2u2, d1ir2v1, d1ir2v2, d1ir2w1, d1ir2w2, d1ir2x1, d1ir2x2, d1ir2y1, d1ir2y2, d1ir2z1, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    13. 1208840Domain d1ir2m_: 1ir2 M: [71322]
      Other proteins in same PDB: d1ir2a1, d1ir2a2, d1ir2b1, d1ir2b2, d1ir2c1, d1ir2c2, d1ir2d1, d1ir2d2, d1ir2e1, d1ir2e2, d1ir2f1, d1ir2f2, d1ir2g1, d1ir2g2, d1ir2h1, d1ir2h2, d1ir2s1, d1ir2s2, d1ir2t1, d1ir2t2, d1ir2u1, d1ir2u2, d1ir2v1, d1ir2v2, d1ir2w1, d1ir2w2, d1ir2x1, d1ir2x2, d1ir2y1, d1ir2y2, d1ir2z1, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    14. 1208841Domain d1ir2n_: 1ir2 N: [71323]
      Other proteins in same PDB: d1ir2a1, d1ir2a2, d1ir2b1, d1ir2b2, d1ir2c1, d1ir2c2, d1ir2d1, d1ir2d2, d1ir2e1, d1ir2e2, d1ir2f1, d1ir2f2, d1ir2g1, d1ir2g2, d1ir2h1, d1ir2h2, d1ir2s1, d1ir2s2, d1ir2t1, d1ir2t2, d1ir2u1, d1ir2u2, d1ir2v1, d1ir2v2, d1ir2w1, d1ir2w2, d1ir2x1, d1ir2x2, d1ir2y1, d1ir2y2, d1ir2z1, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    15. 1208842Domain d1ir2o_: 1ir2 O: [71324]
      Other proteins in same PDB: d1ir2a1, d1ir2a2, d1ir2b1, d1ir2b2, d1ir2c1, d1ir2c2, d1ir2d1, d1ir2d2, d1ir2e1, d1ir2e2, d1ir2f1, d1ir2f2, d1ir2g1, d1ir2g2, d1ir2h1, d1ir2h2, d1ir2s1, d1ir2s2, d1ir2t1, d1ir2t2, d1ir2u1, d1ir2u2, d1ir2v1, d1ir2v2, d1ir2w1, d1ir2w2, d1ir2x1, d1ir2x2, d1ir2y1, d1ir2y2, d1ir2z1, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
    16. 1208843Domain d1ir2p_: 1ir2 P: [71325]
      Other proteins in same PDB: d1ir2a1, d1ir2a2, d1ir2b1, d1ir2b2, d1ir2c1, d1ir2c2, d1ir2d1, d1ir2d2, d1ir2e1, d1ir2e2, d1ir2f1, d1ir2f2, d1ir2g1, d1ir2g2, d1ir2h1, d1ir2h2, d1ir2s1, d1ir2s2, d1ir2t1, d1ir2t2, d1ir2u1, d1ir2u2, d1ir2v1, d1ir2v2, d1ir2w1, d1ir2w2, d1ir2x1, d1ir2x2, d1ir2y1, d1ir2y2, d1ir2z1, d1ir2z2
      complexed with cap, gol, mg
  3. Domain(s) for 1uzd:
    1. 1208868Domain d1uzdc1: 1uzd C:1-134 [144390]
      Other proteins in same PDB: d1uzda1, d1uzda2, d1uzdb1, d1uzdb2, d1uzde1, d1uzde2, d1uzdh1, d1uzdh2, d1uzdk1, d1uzdk2, d1uzdo1, d1uzdo2, d1uzdr1, d1uzdr2, d1uzdv1, d1uzdv2
      chimeric small subunit (with spinach sequence)
      complexed with cap, edo, mg
    2. 1208869Domain d1uzdf_: 1uzd F: [144391]
      Other proteins in same PDB: d1uzda1, d1uzda2, d1uzdb1, d1uzdb2, d1uzde1, d1uzde2, d1uzdh1, d1uzdh2, d1uzdk1, d1uzdk2, d1uzdo1, d1uzdo2, d1uzdr1, d1uzdr2, d1uzdv1, d1uzdv2
      automated match to d1uzdc1
      complexed with cap, edo, mg
    3. 1208870Domain d1uzdi_: 1uzd I: [144392]
      Other proteins in same PDB: d1uzda1, d1uzda2, d1uzdb1, d1uzdb2, d1uzde1, d1uzde2, d1uzdh1, d1uzdh2, d1uzdk1, d1uzdk2, d1uzdo1, d1uzdo2, d1uzdr1, d1uzdr2, d1uzdv1, d1uzdv2
      automated match to d1uzdc1
      complexed with cap, edo, mg
    4. 1208871Domain d1uzdj_: 1uzd J: [144393]
      Other proteins in same PDB: d1uzda1, d1uzda2, d1uzdb1, d1uzdb2, d1uzde1, d1uzde2, d1uzdh1, d1uzdh2, d1uzdk1, d1uzdk2, d1uzdo1, d1uzdo2, d1uzdr1, d1uzdr2, d1uzdv1, d1uzdv2
      automated match to d1uzdc1
      complexed with cap, edo, mg
    5. 1208872Domain d1uzdm_: 1uzd M: [144394]
      Other proteins in same PDB: d1uzda1, d1uzda2, d1uzdb1, d1uzdb2, d1uzde1, d1uzde2, d1uzdh1, d1uzdh2, d1uzdk1, d1uzdk2, d1uzdo1, d1uzdo2, d1uzdr1, d1uzdr2, d1uzdv1, d1uzdv2
      automated match to d1uzdc1
      complexed with cap, edo, mg
    6. 1208873Domain d1uzdp_: 1uzd P: [144395]
      Other proteins in same PDB: d1uzda1, d1uzda2, d1uzdb1, d1uzdb2, d1uzde1, d1uzde2, d1uzdh1, d1uzdh2, d1uzdk1, d1uzdk2, d1uzdo1, d1uzdo2, d1uzdr1, d1uzdr2, d1uzdv1, d1uzdv2
      automated match to d1uzdc1
      complexed with cap, edo, mg
    7. 1208874Domain d1uzdt_: 1uzd T: [144396]
      Other proteins in same PDB: d1uzda1, d1uzda2, d1uzdb1, d1uzdb2, d1uzde1, d1uzde2, d1uzdh1, d1uzdh2, d1uzdk1, d1uzdk2, d1uzdo1, d1uzdo2, d1uzdr1, d1uzdr2, d1uzdv1, d1uzdv2
      automated match to d1uzdc1
      complexed with cap, edo, mg
    8. 1208875Domain d1uzdw_: 1uzd W: [144397]
      Other proteins in same PDB: d1uzda1, d1uzda2, d1uzdb1, d1uzdb2, d1uzde1, d1uzde2, d1uzdh1, d1uzdh2, d1uzdk1, d1uzdk2, d1uzdo1, d1uzdo2, d1uzdr1, d1uzdr2, d1uzdv1, d1uzdv2
      automated match to d1uzdc1
      complexed with cap, edo, mg
  4. Domain(s) for 1uzh:
    1. 1208860Domain d1uzhc1: 1uzh C:1-122 [144398]
      Other proteins in same PDB: d1uzha1, d1uzha2, d1uzhb1, d1uzhb2, d1uzhe1, d1uzhe2, d1uzhh1, d1uzhh2, d1uzhk1, d1uzhk2, d1uzho1, d1uzho2, d1uzhr1, d1uzhr2, d1uzhv1, d1uzhv2
      chimera with Synechococcus sequence
      complexed with cap, edo, mg
    2. 1208861Domain d1uzhf_: 1uzh F: [144399]
      Other proteins in same PDB: d1uzha1, d1uzha2, d1uzhb1, d1uzhb2, d1uzhe1, d1uzhe2, d1uzhh1, d1uzhh2, d1uzhk1, d1uzhk2, d1uzho1, d1uzho2, d1uzhr1, d1uzhr2, d1uzhv1, d1uzhv2
      automated match to d1uzhc1
      complexed with cap, edo, mg
    3. 1208862Domain d1uzhi_: 1uzh I: [144400]
      Other proteins in same PDB: d1uzha1, d1uzha2, d1uzhb1, d1uzhb2, d1uzhe1, d1uzhe2, d1uzhh1, d1uzhh2, d1uzhk1, d1uzhk2, d1uzho1, d1uzho2, d1uzhr1, d1uzhr2, d1uzhv1, d1uzhv2
      automated match to d1uzhc1
      complexed with cap, edo, mg
    4. 1208863Domain d1uzhj_: 1uzh J: [144401]
      Other proteins in same PDB: d1uzha1, d1uzha2, d1uzhb1, d1uzhb2, d1uzhe1, d1uzhe2, d1uzhh1, d1uzhh2, d1uzhk1, d1uzhk2, d1uzho1, d1uzho2, d1uzhr1, d1uzhr2, d1uzhv1, d1uzhv2
      automated match to d1uzhc1
      complexed with cap, edo, mg
    5. 1208864Domain d1uzhm_: 1uzh M: [144402]
      Other proteins in same PDB: d1uzha1, d1uzha2, d1uzhb1, d1uzhb2, d1uzhe1, d1uzhe2, d1uzhh1, d1uzhh2, d1uzhk1, d1uzhk2, d1uzho1, d1uzho2, d1uzhr1, d1uzhr2, d1uzhv1, d1uzhv2
      automated match to d1uzhc1
      complexed with cap, edo, mg
    6. 1208865Domain d1uzhp_: 1uzh P: [144403]
      Other proteins in same PDB: d1uzha1, d1uzha2, d1uzhb1, d1uzhb2, d1uzhe1, d1uzhe2, d1uzhh1, d1uzhh2, d1uzhk1, d1uzhk2, d1uzho1, d1uzho2, d1uzhr1, d1uzhr2, d1uzhv1, d1uzhv2
      automated match to d1uzhc1
      complexed with cap, edo, mg
    7. 1208866Domain d1uzht_: 1uzh T: [144404]
      Other proteins in same PDB: d1uzha1, d1uzha2, d1uzhb1, d1uzhb2, d1uzhe1, d1uzhe2, d1uzhh1, d1uzhh2, d1uzhk1, d1uzhk2, d1uzho1, d1uzho2, d1uzhr1, d1uzhr2, d1uzhv1, d1uzhv2
      automated match to d1uzhc1
      complexed with cap, edo, mg
    8. 1208867Domain d1uzhw_: 1uzh W: [144405]
      Other proteins in same PDB: d1uzha1, d1uzha2, d1uzhb1, d1uzhb2, d1uzhe1, d1uzhe2, d1uzhh1, d1uzhh2, d1uzhk1, d1uzhk2, d1uzho1, d1uzho2, d1uzhr1, d1uzhr2, d1uzhv1, d1uzhv2
      automated match to d1uzhc1
      complexed with cap, edo, mg
  5. Domain(s) for 2vdh:
    1. 1208844Domain d2vdhi_: 2vdh I: [168464]
      automated match to d2v63i1
      complexed with cap, edo, mg; mutant
    2. 1208845Domain d2vdhj_: 2vdh J: [168465]
      automated match to d2v63i1
      complexed with cap, edo, mg; mutant
    3. 1208846Domain d2vdhk_: 2vdh K: [168466]
      automated match to d2v63i1
      complexed with cap, edo, mg; mutant
    4. 1208847Domain d2vdhl_: 2vdh L: [168467]
      automated match to d2v63i1
      complexed with cap, edo, mg; mutant
    5. 1208848Domain d2vdhm_: 2vdh M: [168468]
      automated match to d2v63i1
      complexed with cap, edo, mg; mutant
    6. 1208849Domain d2vdhn_: 2vdh N: [168469]
      automated match to d2v63i1
      complexed with cap, edo, mg; mutant
    7. 1208850Domain d2vdho_: 2vdh O: [168470]
      automated match to d2v63i1
      complexed with cap, edo, mg; mutant
    8. 1208851Domain d2vdhp_: 2vdh P: [168471]
      automated match to d2v63i1
      complexed with cap, edo, mg; mutant
  6. Domain(s) for 2vdi:
    1. 1208852Domain d2vdii_: 2vdi I: [168472]
      automated match to d2v63i1
      complexed with cap, edo, mg; mutant
    2. 1208853Domain d2vdij_: 2vdi J: [168473]
      automated match to d2v63i1
      complexed with cap, edo, mg; mutant
    3. 1208854Domain d2vdik_: 2vdi K: [168474]
      automated match to d2v63i1
      complexed with cap, edo, mg; mutant
    4. 1208855Domain d2vdil_: 2vdi L: [168475]
      automated match to d2v63i1
      complexed with cap, edo, mg; mutant
    5. 1208856Domain d2vdim_: 2vdi M: [168476]
      automated match to d2v63i1
      complexed with cap, edo, mg; mutant
    6. 1208857Domain d2vdin_: 2vdi N: [168477]
      automated match to d2v63i1
      complexed with cap, edo, mg; mutant
    7. 1208858Domain d2vdio_: 2vdi O: [168478]
      automated match to d2v63i1
      complexed with cap, edo, mg; mutant
    8. 1208859Domain d2vdip_: 2vdi P: [168479]
      automated match to d2v63i1
      complexed with cap, edo, mg; mutant

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Timeline for Species Green alga (Chlamydomonas reinhardtii) [TaxId:3055] from d.73.1.1 Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase: