Lineage for Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]

  1. Root: SCOPe 2.01
  2. 1013083Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (376 folds)
  3. 1049845Fold d.185: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63410] (1 superfamily)
    core: beta-alpha-beta(2)-alpha(2); 2 layers: alpha/beta
  4. 1049846Superfamily d.185.1: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63411] (2 families) (S)
    Share the same "active site motif" HxxEH located in the first core helix, but differ in one of the zinc-binding residues
  5. 1049847Family d.185.1.1: MPP-like [63412] (6 proteins)
    Common fold elaborated with many additional structures; duplication: each family member consists of two similar domains of beta(2)-alpha(2)-beta(2)-alpha(5)-beta structure, but only the N-terminal domain of MPP beta chain binds the catalytic metal
  6. 1049922Protein Cytochrome bc1 core subunit 2 [63409] (3 species)
  7. 1049923Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [64305] (7 PDB entries)

PDB entries in Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]:

  1. Domain(s) for 1ezv:
    1. 1049932Domain d1ezvb1: 1ezv B:17-218 [59543]
      Other proteins in same PDB: d1ezva1, d1ezva2, d1ezvc2, d1ezvc3, d1ezvd1, d1ezvd2, d1ezve1, d1ezve2, d1ezvf_, d1ezvg_, d1ezvh_, d1ezvi_, d1ezvx_, d1ezvy_
      complexed with fes, hem, sma, uq6
    2. 1049933Domain d1ezvb2: 1ezv B:219-368 [59544]
      Other proteins in same PDB: d1ezva1, d1ezva2, d1ezvc2, d1ezvc3, d1ezvd1, d1ezvd2, d1ezve1, d1ezve2, d1ezvf_, d1ezvg_, d1ezvh_, d1ezvi_, d1ezvx_, d1ezvy_
      complexed with fes, hem, sma, uq6
  2. Domain(s) for 1kb9:
    1. 1049928Domain d1kb9b1: 1kb9 B:17-218 [77313]
      Other proteins in same PDB: d1kb9a1, d1kb9a2, d1kb9c1, d1kb9c2, d1kb9d1, d1kb9d2, d1kb9e1, d1kb9e2, d1kb9f_, d1kb9g_, d1kb9h_, d1kb9i_, d1kb9j_, d1kb9k_
      complexed with cdl, fes, hem, pcf, pef, pie, sma, umq, uq6
    2. 1049929Domain d1kb9b2: 1kb9 B:219-368 [77314]
      Other proteins in same PDB: d1kb9a1, d1kb9a2, d1kb9c1, d1kb9c2, d1kb9d1, d1kb9d2, d1kb9e1, d1kb9e2, d1kb9f_, d1kb9g_, d1kb9h_, d1kb9i_, d1kb9j_, d1kb9k_
      complexed with cdl, fes, hem, pcf, pef, pie, sma, umq, uq6
  3. Domain(s) for 1kyo:
    1. 1049940Domain d1kyob1: 1kyo B:17-218 [73251]
      Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
      complexed with fes, hem, sma
    2. 1049941Domain d1kyob2: 1kyo B:219-368 [73252]
      Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
      complexed with fes, hem, sma
    3. 1049942Domain d1kyom1: 1kyo M:17-218 [73266]
      Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
      complexed with fes, hem, sma
    4. 1049943Domain d1kyom2: 1kyo M:219-368 [73267]
      Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
      complexed with fes, hem, sma
  4. Domain(s) for 1p84:
    1. 1049938Domain d1p84b1: 1p84 B:17-218 [87852]
      Other proteins in same PDB: d1p84a1, d1p84a2, d1p84c1, d1p84c2, d1p84d1, d1p84d2, d1p84e1, d1p84e2, d1p84f_, d1p84g_, d1p84h_, d1p84i_, d1p84j_, d1p84k_
      complexed with 3pe, 3ph, cdl, dbt, fes, hem, pc1, umq, uq6
    2. 1049939Domain d1p84b2: 1p84 B:219-368 [87853]
      Other proteins in same PDB: d1p84a1, d1p84a2, d1p84c1, d1p84c2, d1p84d1, d1p84d2, d1p84e1, d1p84e2, d1p84f_, d1p84g_, d1p84h_, d1p84i_, d1p84j_, d1p84k_
      complexed with 3pe, 3ph, cdl, dbt, fes, hem, pc1, umq, uq6
  5. Domain(s) for 2ibz:
    1. 1049930Domain d2ibzb1: 2ibz B:17-218 [137217]
      Other proteins in same PDB: d2ibza1, d2ibza2, d2ibzc1, d2ibzc2, d2ibzd1, d2ibzd2, d2ibze1, d2ibze2, d2ibzf_, d2ibzg_, d2ibzh_, d2ibzi_, d2ibzx_, d2ibzy_
      automatically matched to d1ezvb1
      complexed with fes, hem, sma, uq6
    2. 1049931Domain d2ibzb2: 2ibz B:219-368 [137218]
      Other proteins in same PDB: d2ibza1, d2ibza2, d2ibzc1, d2ibzc2, d2ibzd1, d2ibzd2, d2ibze1, d2ibze2, d2ibzf_, d2ibzg_, d2ibzh_, d2ibzi_, d2ibzx_, d2ibzy_
      automatically matched to d1ezvb2
      complexed with fes, hem, sma, uq6
  6. Domain(s) for 3cx5:
    1. 1049924Domain d3cx5b1: 3cx5 B:17-218 [157078]
      Other proteins in same PDB: d3cx5a1, d3cx5a2, d3cx5c1, d3cx5c2, d3cx5d1, d3cx5d2, d3cx5e1, d3cx5e2, d3cx5f1, d3cx5g_, d3cx5h_, d3cx5i_, d3cx5j_, d3cx5k_, d3cx5l1, d3cx5l2, d3cx5n1, d3cx5n2, d3cx5o1, d3cx5o2, d3cx5p1, d3cx5p2, d3cx5q1, d3cx5r_, d3cx5s_, d3cx5t_, d3cx5u_, d3cx5v_, d3cx5w_
      automatically matched to d1ezvb1
      complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn3, cn5, fes, hem, sma, suc, umq
    2. 1049925Domain d3cx5b2: 3cx5 B:219-368 [157079]
      Other proteins in same PDB: d3cx5a1, d3cx5a2, d3cx5c1, d3cx5c2, d3cx5d1, d3cx5d2, d3cx5e1, d3cx5e2, d3cx5f1, d3cx5g_, d3cx5h_, d3cx5i_, d3cx5j_, d3cx5k_, d3cx5l1, d3cx5l2, d3cx5n1, d3cx5n2, d3cx5o1, d3cx5o2, d3cx5p1, d3cx5p2, d3cx5q1, d3cx5r_, d3cx5s_, d3cx5t_, d3cx5u_, d3cx5v_, d3cx5w_
      automatically matched to d1ezvb2
      complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn3, cn5, fes, hem, sma, suc, umq
    3. 1049926Domain d3cx5m1: 3cx5 M:17-218 [157094]
      Other proteins in same PDB: d3cx5a1, d3cx5a2, d3cx5c1, d3cx5c2, d3cx5d1, d3cx5d2, d3cx5e1, d3cx5e2, d3cx5f1, d3cx5g_, d3cx5h_, d3cx5i_, d3cx5j_, d3cx5k_, d3cx5l1, d3cx5l2, d3cx5n1, d3cx5n2, d3cx5o1, d3cx5o2, d3cx5p1, d3cx5p2, d3cx5q1, d3cx5r_, d3cx5s_, d3cx5t_, d3cx5u_, d3cx5v_, d3cx5w_
      automatically matched to d1ezvb1
      complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn3, cn5, fes, hem, sma, suc, umq
    4. 1049927Domain d3cx5m2: 3cx5 M:219-368 [157095]
      Other proteins in same PDB: d3cx5a1, d3cx5a2, d3cx5c1, d3cx5c2, d3cx5d1, d3cx5d2, d3cx5e1, d3cx5e2, d3cx5f1, d3cx5g_, d3cx5h_, d3cx5i_, d3cx5j_, d3cx5k_, d3cx5l1, d3cx5l2, d3cx5n1, d3cx5n2, d3cx5o1, d3cx5o2, d3cx5p1, d3cx5p2, d3cx5q1, d3cx5r_, d3cx5s_, d3cx5t_, d3cx5u_, d3cx5v_, d3cx5w_
      automatically matched to d1ezvb2
      complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn3, cn5, fes, hem, sma, suc, umq
  7. Domain(s) for 3cxh:
    1. 1049934Domain d3cxhb1: 3cxh B:17-218 [157111]
      Other proteins in same PDB: d3cxha1, d3cxha2, d3cxhc1, d3cxhc2, d3cxhd1, d3cxhd2, d3cxhe1, d3cxhe2, d3cxhf1, d3cxhg_, d3cxhh_, d3cxhi_, d3cxhj_, d3cxhk_, d3cxhl1, d3cxhl2, d3cxhn1, d3cxhn2, d3cxho1, d3cxho2, d3cxhp1, d3cxhp2, d3cxhq1, d3cxhr_, d3cxhs_, d3cxht_, d3cxhu_, d3cxhv_, d3cxhw_
      automatically matched to d1ezvb1
      complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn6, fes, hem, sma, suc, umq
    2. 1049935Domain d3cxhb2: 3cxh B:219-368 [157112]
      Other proteins in same PDB: d3cxha1, d3cxha2, d3cxhc1, d3cxhc2, d3cxhd1, d3cxhd2, d3cxhe1, d3cxhe2, d3cxhf1, d3cxhg_, d3cxhh_, d3cxhi_, d3cxhj_, d3cxhk_, d3cxhl1, d3cxhl2, d3cxhn1, d3cxhn2, d3cxho1, d3cxho2, d3cxhp1, d3cxhp2, d3cxhq1, d3cxhr_, d3cxhs_, d3cxht_, d3cxhu_, d3cxhv_, d3cxhw_
      automatically matched to d1ezvb2
      complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn6, fes, hem, sma, suc, umq
    3. 1049936Domain d3cxhm1: 3cxh M:17-218 [157127]
      Other proteins in same PDB: d3cxha1, d3cxha2, d3cxhc1, d3cxhc2, d3cxhd1, d3cxhd2, d3cxhe1, d3cxhe2, d3cxhf1, d3cxhg_, d3cxhh_, d3cxhi_, d3cxhj_, d3cxhk_, d3cxhl1, d3cxhl2, d3cxhn1, d3cxhn2, d3cxho1, d3cxho2, d3cxhp1, d3cxhp2, d3cxhq1, d3cxhr_, d3cxhs_, d3cxht_, d3cxhu_, d3cxhv_, d3cxhw_
      automatically matched to d1ezvb1
      complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn6, fes, hem, sma, suc, umq
    4. 1049937Domain d3cxhm2: 3cxh M:219-368 [157128]
      Other proteins in same PDB: d3cxha1, d3cxha2, d3cxhc1, d3cxhc2, d3cxhd1, d3cxhd2, d3cxhe1, d3cxhe2, d3cxhf1, d3cxhg_, d3cxhh_, d3cxhi_, d3cxhj_, d3cxhk_, d3cxhl1, d3cxhl2, d3cxhn1, d3cxhn2, d3cxho1, d3cxho2, d3cxhp1, d3cxhp2, d3cxhq1, d3cxhr_, d3cxhs_, d3cxht_, d3cxhu_, d3cxhv_, d3cxhw_
      automatically matched to d1ezvb2
      complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn6, fes, hem, sma, suc, umq

More info for Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] from d.185.1.1 Cytochrome bc1 core subunit 2

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