SCOPe 2.07: Protein: Mitochondrial processing peptidase (MPP) alpha chain

Lineage for Protein: Mitochondrial processing peptidase (MPP) alpha chain

Root: SCOPe 2.07
Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (388 folds)
Fold d.185: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63410] (1 superfamily)
core: beta-alpha-beta(2)-alpha(2); 2 layers: alpha/beta
Superfamily d.185.1: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63411] (3 families)
Share the same "active site motif" HxxEH located in the first core helix, but differ in one of the zinc-binding residues

Family d.185.1.1: MPP-like [63412] (7 proteins)
Common fold elaborated with many additional structures; duplication: each family member consists of two similar domains of beta(2)-alpha(2)-beta(2)-alpha(5)-beta structure, but only the N-terminal domain of MPP beta chain binds the catalytic metal

Protein Mitochondrial processing peptidase (MPP) alpha chain [64302] (1 species)

Species:

Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [64303] (4 PDB entries)
1. Domains for 1hr6:
  1. Domain d1hr6a1: 1hr6 A:14-233 [61164]
    Other proteins in same PDB: d1hr6b1, d1hr6b2, d1hr6d1, d1hr6d2, d1hr6d3, d1hr6f1, d1hr6f2, d1hr6f3, d1hr6h1, d1hr6h2
    complexed with epe, zn
  2. Domain d1hr6a2: 1hr6 A:234-470 [61165]
    Other proteins in same PDB: d1hr6b1, d1hr6b2, d1hr6d1, d1hr6d2, d1hr6d3, d1hr6f1, d1hr6f2, d1hr6f3, d1hr6h1, d1hr6h2
    complexed with epe, zn
  3. Domain d1hr6c1: 1hr6 C:16-233 [61168]
    Other proteins in same PDB: d1hr6b1, d1hr6b2, d1hr6d1, d1hr6d2, d1hr6d3, d1hr6f1, d1hr6f2, d1hr6f3, d1hr6h1, d1hr6h2
    complexed with epe, zn
  4. Domain d1hr6c2: 1hr6 C:234-468 [61169]
    Other proteins in same PDB: d1hr6b1, d1hr6b2, d1hr6d1, d1hr6d2, d1hr6d3, d1hr6f1, d1hr6f2, d1hr6f3, d1hr6h1, d1hr6h2
    complexed with epe, zn
  5. Domain d1hr6e1: 1hr6 E:14-233 [61172]
    Other proteins in same PDB: d1hr6b1, d1hr6b2, d1hr6d1, d1hr6d2, d1hr6d3, d1hr6f1, d1hr6f2, d1hr6f3, d1hr6h1, d1hr6h2
    complexed with epe, zn
  6. Domain d1hr6e2: 1hr6 E:234-468 [61173]
    Other proteins in same PDB: d1hr6b1, d1hr6b2, d1hr6d1, d1hr6d2, d1hr6d3, d1hr6f1, d1hr6f2, d1hr6f3, d1hr6h1, d1hr6h2
    complexed with epe, zn
  7. Domain d1hr6g1: 1hr6 G:14-233 [61176]
    Other proteins in same PDB: d1hr6b1, d1hr6b2, d1hr6d1, d1hr6d2, d1hr6d3, d1hr6f1, d1hr6f2, d1hr6f3, d1hr6h1, d1hr6h2
    complexed with epe, zn
  8. Domain d1hr6g2: 1hr6 G:234-470 [61177]
    Other proteins in same PDB: d1hr6b1, d1hr6b2, d1hr6d1, d1hr6d2, d1hr6d3, d1hr6f1, d1hr6f2, d1hr6f3, d1hr6h1, d1hr6h2
    complexed with epe, zn
2. Domains for 1hr7:
  1. Domain d1hr7a1: 1hr7 A:14-233 [61180]
    Other proteins in same PDB: d1hr7b1, d1hr7b2, d1hr7d1, d1hr7d2, d1hr7f1, d1hr7f2, d1hr7h1, d1hr7h2
    complexed with zn; mutant
  2. Domain d1hr7a2: 1hr7 A:234-470 [61181]
    Other proteins in same PDB: d1hr7b1, d1hr7b2, d1hr7d1, d1hr7d2, d1hr7f1, d1hr7f2, d1hr7h1, d1hr7h2
    complexed with zn; mutant
  3. Domain d1hr7c1: 1hr7 C:16-233 [61184]
    Other proteins in same PDB: d1hr7b1, d1hr7b2, d1hr7d1, d1hr7d2, d1hr7f1, d1hr7f2, d1hr7h1, d1hr7h2
    complexed with zn; mutant
  4. Domain d1hr7c2: 1hr7 C:234-468 [61185]
    Other proteins in same PDB: d1hr7b1, d1hr7b2, d1hr7d1, d1hr7d2, d1hr7f1, d1hr7f2, d1hr7h1, d1hr7h2
    complexed with zn; mutant
  5. Domain d1hr7e1: 1hr7 E:14-233 [61188]
    Other proteins in same PDB: d1hr7b1, d1hr7b2, d1hr7d1, d1hr7d2, d1hr7f1, d1hr7f2, d1hr7h1, d1hr7h2
    complexed with zn; mutant
  6. Domain d1hr7e2: 1hr7 E:234-468 [61189]
    Other proteins in same PDB: d1hr7b1, d1hr7b2, d1hr7d1, d1hr7d2, d1hr7f1, d1hr7f2, d1hr7h1, d1hr7h2
    complexed with zn; mutant
  7. Domain d1hr7g1: 1hr7 G:14-233 [61192]
    Other proteins in same PDB: d1hr7b1, d1hr7b2, d1hr7d1, d1hr7d2, d1hr7f1, d1hr7f2, d1hr7h1, d1hr7h2
    complexed with zn; mutant
  8. Domain d1hr7g2: 1hr7 G:234-467 [61193]
    Other proteins in same PDB: d1hr7b1, d1hr7b2, d1hr7d1, d1hr7d2, d1hr7f1, d1hr7f2, d1hr7h1, d1hr7h2
    complexed with zn; mutant
3. Domains for 1hr8:
  1. Domain d1hr8a1: 1hr8 A:14-233 [61196]
    Other proteins in same PDB: d1hr8b1, d1hr8b2, d1hr8d1, d1hr8d2, d1hr8d3, d1hr8f1, d1hr8f2, d1hr8f3, d1hr8h1, d1hr8h2
    complexed with epe, zn; mutant
  2. Domain d1hr8a2: 1hr8 A:234-470 [61197]
    Other proteins in same PDB: d1hr8b1, d1hr8b2, d1hr8d1, d1hr8d2, d1hr8d3, d1hr8f1, d1hr8f2, d1hr8f3, d1hr8h1, d1hr8h2
    complexed with epe, zn; mutant
  3. Domain d1hr8c1: 1hr8 C:16-233 [61200]
    Other proteins in same PDB: d1hr8b1, d1hr8b2, d1hr8d1, d1hr8d2, d1hr8d3, d1hr8f1, d1hr8f2, d1hr8f3, d1hr8h1, d1hr8h2
    complexed with epe, zn; mutant
  4. Domain d1hr8c2: 1hr8 C:234-468 [61201]
    Other proteins in same PDB: d1hr8b1, d1hr8b2, d1hr8d1, d1hr8d2, d1hr8d3, d1hr8f1, d1hr8f2, d1hr8f3, d1hr8h1, d1hr8h2
    complexed with epe, zn; mutant
  5. Domain d1hr8e1: 1hr8 E:14-233 [61204]
    Other proteins in same PDB: d1hr8b1, d1hr8b2, d1hr8d1, d1hr8d2, d1hr8d3, d1hr8f1, d1hr8f2, d1hr8f3, d1hr8h1, d1hr8h2
    complexed with epe, zn; mutant
  6. Domain d1hr8e2: 1hr8 E:234-468 [61205]
    Other proteins in same PDB: d1hr8b1, d1hr8b2, d1hr8d1, d1hr8d2, d1hr8d3, d1hr8f1, d1hr8f2, d1hr8f3, d1hr8h1, d1hr8h2
    complexed with epe, zn; mutant
  7. Domain d1hr8g1: 1hr8 G:14-233 [61208]
    Other proteins in same PDB: d1hr8b1, d1hr8b2, d1hr8d1, d1hr8d2, d1hr8d3, d1hr8f1, d1hr8f2, d1hr8f3, d1hr8h1, d1hr8h2
    complexed with epe, zn; mutant
  8. Domain d1hr8g2: 1hr8 G:234-470 [61209]
    Other proteins in same PDB: d1hr8b1, d1hr8b2, d1hr8d1, d1hr8d2, d1hr8d3, d1hr8f1, d1hr8f2, d1hr8f3, d1hr8h1, d1hr8h2
    complexed with epe, zn; mutant
4. Domains for 1hr9:
  1. Domain d1hr9a1: 1hr9 A:14-233 [61212]
    Other proteins in same PDB: d1hr9b1, d1hr9b2, d1hr9d1, d1hr9d2, d1hr9f1, d1hr9f2, d1hr9f3, d1hr9h1, d1hr9h2
    complexed with epe, zn; mutant
  2. Domain d1hr9a2: 1hr9 A:234-470 [61213]
    Other proteins in same PDB: d1hr9b1, d1hr9b2, d1hr9d1, d1hr9d2, d1hr9f1, d1hr9f2, d1hr9f3, d1hr9h1, d1hr9h2
    complexed with epe, zn; mutant
  3. Domain d1hr9c1: 1hr9 C:16-233 [61216]
    Other proteins in same PDB: d1hr9b1, d1hr9b2, d1hr9d1, d1hr9d2, d1hr9f1, d1hr9f2, d1hr9f3, d1hr9h1, d1hr9h2
    complexed with epe, zn; mutant
  4. Domain d1hr9c2: 1hr9 C:234-468 [61217]
    Other proteins in same PDB: d1hr9b1, d1hr9b2, d1hr9d1, d1hr9d2, d1hr9f1, d1hr9f2, d1hr9f3, d1hr9h1, d1hr9h2
    complexed with epe, zn; mutant
  5. Domain d1hr9e1: 1hr9 E:14-233 [61220]
    Other proteins in same PDB: d1hr9b1, d1hr9b2, d1hr9d1, d1hr9d2, d1hr9f1, d1hr9f2, d1hr9f3, d1hr9h1, d1hr9h2
    complexed with epe, zn; mutant
  6. Domain d1hr9e2: 1hr9 E:234-468 [61221]
    Other proteins in same PDB: d1hr9b1, d1hr9b2, d1hr9d1, d1hr9d2, d1hr9f1, d1hr9f2, d1hr9f3, d1hr9h1, d1hr9h2
    complexed with epe, zn; mutant
  7. Domain d1hr9g1: 1hr9 G:14-233 [61224]
    Other proteins in same PDB: d1hr9b1, d1hr9b2, d1hr9d1, d1hr9d2, d1hr9f1, d1hr9f2, d1hr9f3, d1hr9h1, d1hr9h2
    complexed with epe, zn; mutant
  8. Domain d1hr9g2: 1hr9 G:234-468 [61225]
    Other proteins in same PDB: d1hr9b1, d1hr9b2, d1hr9d1, d1hr9d2, d1hr9f1, d1hr9f2, d1hr9f3, d1hr9h1, d1hr9h2
    complexed with epe, zn; mutant

More info for Protein Mitochondrial processing peptidase (MPP) alpha chain from d.185.1.1: MPP-like

Timeline for Protein Mitochondrial processing peptidase (MPP) alpha chain from d.185.1.1: MPP-like:

Protein Mitochondrial processing peptidase (MPP) alpha chain from d.185.1.1: MPP-like first appeared in SCOP 1.57
Protein Mitochondrial processing peptidase (MPP) alpha chain from d.185.1.1: MPP-like appears in SCOPe 2.06
Protein Mitochondrial processing peptidase (MPP) alpha chain from d.185.1.1: MPP-like appears in the current release, SCOPe 2.08