Lineage for Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae)

  1. Root: SCOP 1.63
  2. 251695Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (224 folds)
  3. 265229Fold d.185: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63410] (1 superfamily)
    core: beta-alpha-beta(2)-alpha(2); 2 layers: alpha/beta
  4. 265230Superfamily d.185.1: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63411] (2 families) (S)
    Share the same "active site motif" HxxEH located in the first core helix, but differ in one of the zinc-binding residues
  5. 265231Family d.185.1.1: MPP-like [63412] (4 proteins)
    Common fold elaborated with many additional structures; duplication: each family member consists of two similar domains of beta(2)-alpha(2)-beta(2)-alpha(5)-beta structure, but only the N-terminal domain of MPP beta chain binds the catalytic metal
  6. 265318Protein Mitochondrial processing peptidase (MPP) beta chain [64300] (1 species)
  7. 265319Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [64301] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae):

  1. Domain(s) for 1hr6:
    1. 265320Domain d1hr6b1: 1hr6 B:24-245 [61166]
      Other proteins in same PDB: d1hr6a1, d1hr6a2, d1hr6c1, d1hr6c2, d1hr6e1, d1hr6e2, d1hr6g1, d1hr6g2
    2. 265321Domain d1hr6b2: 1hr6 B:246-462 [61167]
      Other proteins in same PDB: d1hr6a1, d1hr6a2, d1hr6c1, d1hr6c2, d1hr6e1, d1hr6e2, d1hr6g1, d1hr6g2
    3. 265322Domain d1hr6d1: 1hr6 D:20-245 [61170]
      Other proteins in same PDB: d1hr6a1, d1hr6a2, d1hr6c1, d1hr6c2, d1hr6e1, d1hr6e2, d1hr6g1, d1hr6g2
    4. 265323Domain d1hr6d2: 1hr6 D:246-462 [61171]
      Other proteins in same PDB: d1hr6a1, d1hr6a2, d1hr6c1, d1hr6c2, d1hr6e1, d1hr6e2, d1hr6g1, d1hr6g2
    5. 265324Domain d1hr6f1: 1hr6 F:20-245 [61174]
      Other proteins in same PDB: d1hr6a1, d1hr6a2, d1hr6c1, d1hr6c2, d1hr6e1, d1hr6e2, d1hr6g1, d1hr6g2
    6. 265325Domain d1hr6f2: 1hr6 F:246-462 [61175]
      Other proteins in same PDB: d1hr6a1, d1hr6a2, d1hr6c1, d1hr6c2, d1hr6e1, d1hr6e2, d1hr6g1, d1hr6g2
    7. 265326Domain d1hr6h1: 1hr6 H:23-245 [61178]
      Other proteins in same PDB: d1hr6a1, d1hr6a2, d1hr6c1, d1hr6c2, d1hr6e1, d1hr6e2, d1hr6g1, d1hr6g2
    8. 265327Domain d1hr6h2: 1hr6 H:246-462 [61179]
      Other proteins in same PDB: d1hr6a1, d1hr6a2, d1hr6c1, d1hr6c2, d1hr6e1, d1hr6e2, d1hr6g1, d1hr6g2
      complexed with epe, zn
  2. Domain(s) for 1hr7:
    1. 265328Domain d1hr7b1: 1hr7 B:24-245 [61182]
      Other proteins in same PDB: d1hr7a1, d1hr7a2, d1hr7c1, d1hr7c2, d1hr7e1, d1hr7e2, d1hr7g1, d1hr7g2
    2. 265329Domain d1hr7b2: 1hr7 B:246-462 [61183]
      Other proteins in same PDB: d1hr7a1, d1hr7a2, d1hr7c1, d1hr7c2, d1hr7e1, d1hr7e2, d1hr7g1, d1hr7g2
    3. 265330Domain d1hr7d1: 1hr7 D:22-245 [61186]
      Other proteins in same PDB: d1hr7a1, d1hr7a2, d1hr7c1, d1hr7c2, d1hr7e1, d1hr7e2, d1hr7g1, d1hr7g2
    4. 265331Domain d1hr7d2: 1hr7 D:246-462 [61187]
      Other proteins in same PDB: d1hr7a1, d1hr7a2, d1hr7c1, d1hr7c2, d1hr7e1, d1hr7e2, d1hr7g1, d1hr7g2
    5. 265332Domain d1hr7f1: 1hr7 F:23-245 [61190]
      Other proteins in same PDB: d1hr7a1, d1hr7a2, d1hr7c1, d1hr7c2, d1hr7e1, d1hr7e2, d1hr7g1, d1hr7g2
    6. 265333Domain d1hr7f2: 1hr7 F:246-462 [61191]
      Other proteins in same PDB: d1hr7a1, d1hr7a2, d1hr7c1, d1hr7c2, d1hr7e1, d1hr7e2, d1hr7g1, d1hr7g2
    7. 265334Domain d1hr7h1: 1hr7 H:23-245 [61194]
      Other proteins in same PDB: d1hr7a1, d1hr7a2, d1hr7c1, d1hr7c2, d1hr7e1, d1hr7e2, d1hr7g1, d1hr7g2
    8. 265335Domain d1hr7h2: 1hr7 H:246-462 [61195]
      Other proteins in same PDB: d1hr7a1, d1hr7a2, d1hr7c1, d1hr7c2, d1hr7e1, d1hr7e2, d1hr7g1, d1hr7g2
      complexed with zn; mutant
  3. Domain(s) for 1hr8:
    1. 265336Domain d1hr8b1: 1hr8 B:24-245 [61198]
      Other proteins in same PDB: d1hr8a1, d1hr8a2, d1hr8c1, d1hr8c2, d1hr8e1, d1hr8e2, d1hr8g1, d1hr8g2
    2. 265337Domain d1hr8b2: 1hr8 B:246-462 [61199]
      Other proteins in same PDB: d1hr8a1, d1hr8a2, d1hr8c1, d1hr8c2, d1hr8e1, d1hr8e2, d1hr8g1, d1hr8g2
    3. 265338Domain d1hr8d1: 1hr8 D:20-245 [61202]
      Other proteins in same PDB: d1hr8a1, d1hr8a2, d1hr8c1, d1hr8c2, d1hr8e1, d1hr8e2, d1hr8g1, d1hr8g2
    4. 265339Domain d1hr8d2: 1hr8 D:246-462 [61203]
      Other proteins in same PDB: d1hr8a1, d1hr8a2, d1hr8c1, d1hr8c2, d1hr8e1, d1hr8e2, d1hr8g1, d1hr8g2
    5. 265340Domain d1hr8f1: 1hr8 F:20-245 [61206]
      Other proteins in same PDB: d1hr8a1, d1hr8a2, d1hr8c1, d1hr8c2, d1hr8e1, d1hr8e2, d1hr8g1, d1hr8g2
    6. 265341Domain d1hr8f2: 1hr8 F:246-462 [61207]
      Other proteins in same PDB: d1hr8a1, d1hr8a2, d1hr8c1, d1hr8c2, d1hr8e1, d1hr8e2, d1hr8g1, d1hr8g2
    7. 265342Domain d1hr8h1: 1hr8 H:22-245 [61210]
      Other proteins in same PDB: d1hr8a1, d1hr8a2, d1hr8c1, d1hr8c2, d1hr8e1, d1hr8e2, d1hr8g1, d1hr8g2
    8. 265343Domain d1hr8h2: 1hr8 H:246-462 [61211]
      Other proteins in same PDB: d1hr8a1, d1hr8a2, d1hr8c1, d1hr8c2, d1hr8e1, d1hr8e2, d1hr8g1, d1hr8g2
      complexed with epe, zn; mutant
  4. Domain(s) for 1hr9:
    1. 265344Domain d1hr9b1: 1hr9 B:24-245 [61214]
      Other proteins in same PDB: d1hr9a1, d1hr9a2, d1hr9c1, d1hr9c2, d1hr9e1, d1hr9e2, d1hr9g1, d1hr9g2
    2. 265345Domain d1hr9b2: 1hr9 B:246-462 [61215]
      Other proteins in same PDB: d1hr9a1, d1hr9a2, d1hr9c1, d1hr9c2, d1hr9e1, d1hr9e2, d1hr9g1, d1hr9g2
    3. 265346Domain d1hr9d1: 1hr9 D:22-245 [61218]
      Other proteins in same PDB: d1hr9a1, d1hr9a2, d1hr9c1, d1hr9c2, d1hr9e1, d1hr9e2, d1hr9g1, d1hr9g2
    4. 265347Domain d1hr9d2: 1hr9 D:246-462 [61219]
      Other proteins in same PDB: d1hr9a1, d1hr9a2, d1hr9c1, d1hr9c2, d1hr9e1, d1hr9e2, d1hr9g1, d1hr9g2
    5. 265348Domain d1hr9f1: 1hr9 F:20-245 [61222]
      Other proteins in same PDB: d1hr9a1, d1hr9a2, d1hr9c1, d1hr9c2, d1hr9e1, d1hr9e2, d1hr9g1, d1hr9g2
    6. 265349Domain d1hr9f2: 1hr9 F:246-462 [61223]
      Other proteins in same PDB: d1hr9a1, d1hr9a2, d1hr9c1, d1hr9c2, d1hr9e1, d1hr9e2, d1hr9g1, d1hr9g2
    7. 265350Domain d1hr9h1: 1hr9 H:23-245 [61226]
      Other proteins in same PDB: d1hr9a1, d1hr9a2, d1hr9c1, d1hr9c2, d1hr9e1, d1hr9e2, d1hr9g1, d1hr9g2
    8. 265351Domain d1hr9h2: 1hr9 H:246-462 [61227]
      Other proteins in same PDB: d1hr9a1, d1hr9a2, d1hr9c1, d1hr9c2, d1hr9e1, d1hr9e2, d1hr9g1, d1hr9g2
      complexed with epe, zn; mutant

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