Lineage for Protein: Cytochrome bc1 core subunit 2

  1. Root: SCOP 1.63
  2. 251695Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (224 folds)
  3. 265229Fold d.185: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63410] (1 superfamily)
    core: beta-alpha-beta(2)-alpha(2); 2 layers: alpha/beta
  4. 265230Superfamily d.185.1: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63411] (2 families) (S)
    Share the same "active site motif" HxxEH located in the first core helix, but differ in one of the zinc-binding residues
  5. 265231Family d.185.1.1: MPP-like [63412] (4 proteins)
    Common fold elaborated with many additional structures; duplication: each family member consists of two similar domains of beta(2)-alpha(2)-beta(2)-alpha(5)-beta structure, but only the N-terminal domain of MPP beta chain binds the catalytic metal
  6. 265258Protein Cytochrome bc1 core subunit 2 [63409] (3 species)

Species:

  1. 265259Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [64305] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1ezv:
      1. 265260Domain d1ezvb1: 1ezv B:17-218 [59543]
        Other proteins in same PDB: d1ezva1, d1ezva2, d1ezvc2, d1ezvc3, d1ezvd1, d1ezvd2, d1ezve1, d1ezve2, d1ezvf_, d1ezvg_, d1ezvh_, d1ezvi_, d1ezvx_, d1ezvy_
      2. 265261Domain d1ezvb2: 1ezv B:219-368 [59544]
        Other proteins in same PDB: d1ezva1, d1ezva2, d1ezvc2, d1ezvc3, d1ezvd1, d1ezvd2, d1ezve1, d1ezve2, d1ezvf_, d1ezvg_, d1ezvh_, d1ezvi_, d1ezvx_, d1ezvy_
        complexed with fes, hem, sma, uq6
    2. Domains for 1kb9:
      1. 265262Domain d1kb9b1: 1kb9 B:17-218 [77313]
        Other proteins in same PDB: d1kb9a1, d1kb9a2, d1kb9c1, d1kb9c2, d1kb9d1, d1kb9d2, d1kb9e1, d1kb9e2, d1kb9f_, d1kb9g_, d1kb9h_, d1kb9i_, d1kb9j_, d1kb9k_
      2. 265263Domain d1kb9b2: 1kb9 B:219-368 [77314]
        Other proteins in same PDB: d1kb9a1, d1kb9a2, d1kb9c1, d1kb9c2, d1kb9d1, d1kb9d2, d1kb9e1, d1kb9e2, d1kb9f_, d1kb9g_, d1kb9h_, d1kb9i_, d1kb9j_, d1kb9k_
        complexed with cdl, fes, hem, pcf, pef, pie, sma, umq, uq6
    3. Domains for 1kyo:
      1. 265264Domain d1kyob1: 1kyo B:17-218 [73251]
        Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
      2. 265265Domain d1kyob2: 1kyo B:219-368 [73252]
        Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
      3. 265266Domain d1kyom1: 1kyo M:17-218 [73266]
        Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
      4. 265267Domain d1kyom2: 1kyo M:219-368 [73267]
        Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
        complexed with fes, hem, m3l, sma
  2. 265268Chicken (Gallus gallus) [TaxId:9031] [56001] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1bcc:
      1. 265269Domain d1bccb1: 1bcc B:18-235 [58948]
        Other proteins in same PDB: d1bcca1, d1bcca2, d1bccc2, d1bccc3, d1bccd2, d1bccd3, d1bcce1, d1bcce2, d1bccf_, d1bccg_, d1bcch_, d1bccj_
      2. 265270Domain d1bccb2: 1bcc B:236-439 [58949]
        Other proteins in same PDB: d1bcca1, d1bcca2, d1bccc2, d1bccc3, d1bccd2, d1bccd3, d1bcce1, d1bcce2, d1bccf_, d1bccg_, d1bcch_, d1bccj_
        complexed with bog, fes, hem, pee, u10
    2. Domains for 2bcc:
      1. 265271Domain d2bccb1: 2bcc B:18-235 [59051]
        Other proteins in same PDB: d2bcca1, d2bcca2, d2bccc2, d2bccc3, d2bccd2, d2bccd3, d2bcce1, d2bcce2, d2bccf_, d2bccg_, d2bcch_, d2bccj_
      2. 265272Domain d2bccb2: 2bcc B:236-439 [59052]
        Other proteins in same PDB: d2bcca1, d2bcca2, d2bccc2, d2bccc3, d2bccd2, d2bccd3, d2bcce1, d2bcce2, d2bccf_, d2bccg_, d2bcch_, d2bccj_
        complexed with bog, fes, hem, pee, sig, u10
    3. Domains for 3bcc:
      1. 265273Domain d3bccb1: 3bcc B:18-235 [59058]
        Other proteins in same PDB: d3bcca1, d3bcca2, d3bccc2, d3bccc3, d3bccd2, d3bccd3, d3bcce1, d3bcce2, d3bccf_, d3bccg_, d3bcch_, d3bccj_
      2. 265274Domain d3bccb2: 3bcc B:236-439 [59059]
        Other proteins in same PDB: d3bcca1, d3bcca2, d3bccc2, d3bccc3, d3bccd2, d3bccd3, d3bcce1, d3bcce2, d3bccf_, d3bccg_, d3bcch_, d3bccj_
        complexed with amy, fes, hem, sig
  3. 265275Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [56000] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1be3:
      1. 265276Domain d1be3b1: 1be3 B:21-235 [58952]
        Other proteins in same PDB: d1be3a1, d1be3a2, d1be3c2, d1be3c3, d1be3d2, d1be3d3, d1be3e1, d1be3e2, d1be3f_, d1be3g_, d1be3h_, d1be3j_, d1be3k_
      2. 265277Domain d1be3b2: 1be3 B:236-439 [58953]
        Other proteins in same PDB: d1be3a1, d1be3a2, d1be3c2, d1be3c3, d1be3d2, d1be3d3, d1be3e1, d1be3e2, d1be3f_, d1be3g_, d1be3h_, d1be3j_, d1be3k_
        complexed with fes, hec, hem
    2. Domains for 1bgy:
      1. 265280Domain d1bgyb1: 1bgy B:21-235 [58956]
        Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyv_, d1bgyw_
      2. 265281Domain d1bgyb2: 1bgy B:236-439 [58957]
        Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyv_, d1bgyw_
      3. 265282Domain d1bgyn1: 1bgy N:21-235 [58960]
        Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyv_, d1bgyw_
      4. 265283Domain d1bgyn2: 1bgy N:236-439 [58961]
        Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyv_, d1bgyw_
        complexed with fes, hec, hem
    3. Domains for 1qcr:
      1. 265278Domain d1qcrb1: 1qcr B:17-235 [59027]
        Other proteins in same PDB: d1qcra1, d1qcra2, d1qcrc2, d1qcrc3, d1qcrd2, d1qcrd3, d1qcre1, d1qcre2, d1qcrf_, d1qcrg_, d1qcrh_, d1qcrj_, d1qcrk_
      2. 265279Domain d1qcrb2: 1qcr B:236-439 [59028]
        Other proteins in same PDB: d1qcra1, d1qcra2, d1qcrc2, d1qcrc3, d1qcrd2, d1qcrd3, d1qcre1, d1qcre2, d1qcrf_, d1qcrg_, d1qcrh_, d1qcrj_, d1qcrk_
        complexed with hem

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