Lineage for Protein: Cytochrome bc1 core subunit 1

  1. Root: SCOP 1.63
  2. 251695Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (224 folds)
  3. 265229Fold d.185: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63410] (1 superfamily)
    core: beta-alpha-beta(2)-alpha(2); 2 layers: alpha/beta
  4. 265230Superfamily d.185.1: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63411] (2 families) (S)
    Share the same "active site motif" HxxEH located in the first core helix, but differ in one of the zinc-binding residues
  5. 265231Family d.185.1.1: MPP-like [63412] (4 proteins)
    Common fold elaborated with many additional structures; duplication: each family member consists of two similar domains of beta(2)-alpha(2)-beta(2)-alpha(5)-beta structure, but only the N-terminal domain of MPP beta chain binds the catalytic metal
  6. 265232Protein Cytochrome bc1 core subunit 1 [63408] (3 species)

Species:

  1. 265233Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [64304] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1ezv:
      1. 265234Domain d1ezva1: 1ezv A:27-239 [59541]
        Other proteins in same PDB: d1ezvb1, d1ezvb2, d1ezvc2, d1ezvc3, d1ezvd1, d1ezvd2, d1ezve1, d1ezve2, d1ezvf_, d1ezvg_, d1ezvh_, d1ezvi_, d1ezvx_, d1ezvy_
      2. 265235Domain d1ezva2: 1ezv A:240-456 [59542]
        Other proteins in same PDB: d1ezvb1, d1ezvb2, d1ezvc2, d1ezvc3, d1ezvd1, d1ezvd2, d1ezve1, d1ezve2, d1ezvf_, d1ezvg_, d1ezvh_, d1ezvi_, d1ezvx_, d1ezvy_
        complexed with fes, hem, sma, uq6
    2. Domains for 1kb9:
      1. 265236Domain d1kb9a1: 1kb9 A:27-239 [77311]
        Other proteins in same PDB: d1kb9b1, d1kb9b2, d1kb9c1, d1kb9c2, d1kb9d1, d1kb9d2, d1kb9e1, d1kb9e2, d1kb9f_, d1kb9g_, d1kb9h_, d1kb9i_, d1kb9j_, d1kb9k_
      2. 265237Domain d1kb9a2: 1kb9 A:240-457 [77312]
        Other proteins in same PDB: d1kb9b1, d1kb9b2, d1kb9c1, d1kb9c2, d1kb9d1, d1kb9d2, d1kb9e1, d1kb9e2, d1kb9f_, d1kb9g_, d1kb9h_, d1kb9i_, d1kb9j_, d1kb9k_
        complexed with cdl, fes, hem, pcf, pef, pie, sma, umq, uq6
    3. Domains for 1kyo:
      1. 265238Domain d1kyoa1: 1kyo A:27-239 [73249]
        Other proteins in same PDB: d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
      2. 265239Domain d1kyoa2: 1kyo A:240-456 [73250]
        Other proteins in same PDB: d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
      3. 265240Domain d1kyol1: 1kyo L:27-239 [73264]
        Other proteins in same PDB: d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
      4. 265241Domain d1kyol2: 1kyo L:240-456 [73265]
        Other proteins in same PDB: d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
        complexed with fes, hem, m3l, sma
  2. 265242Chicken (Gallus gallus) [TaxId:9031] [55998] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1bcc:
      1. 265243Domain d1bcca1: 1bcc A:4-232 [58946]
        Other proteins in same PDB: d1bccb1, d1bccb2, d1bccc2, d1bccc3, d1bccd2, d1bccd3, d1bcce1, d1bcce2, d1bccf_, d1bccg_, d1bcch_, d1bccj_
      2. 265244Domain d1bcca2: 1bcc A:233-445 [58947]
        Other proteins in same PDB: d1bccb1, d1bccb2, d1bccc2, d1bccc3, d1bccd2, d1bccd3, d1bcce1, d1bcce2, d1bccf_, d1bccg_, d1bcch_, d1bccj_
        complexed with bog, fes, hem, pee, u10
    2. Domains for 2bcc:
      1. 265245Domain d2bcca1: 2bcc A:4-232 [59049]
        Other proteins in same PDB: d2bccb1, d2bccb2, d2bccc2, d2bccc3, d2bccd2, d2bccd3, d2bcce1, d2bcce2, d2bccf_, d2bccg_, d2bcch_, d2bccj_
      2. 265246Domain d2bcca2: 2bcc A:233-445 [59050]
        Other proteins in same PDB: d2bccb1, d2bccb2, d2bccc2, d2bccc3, d2bccd2, d2bccd3, d2bcce1, d2bcce2, d2bccf_, d2bccg_, d2bcch_, d2bccj_
        complexed with bog, fes, hem, pee, sig, u10
    3. Domains for 3bcc:
      1. 265247Domain d3bcca1: 3bcc A:4-232 [59056]
        Other proteins in same PDB: d3bccb1, d3bccb2, d3bccc2, d3bccc3, d3bccd2, d3bccd3, d3bcce1, d3bcce2, d3bccf_, d3bccg_, d3bcch_, d3bccj_
      2. 265248Domain d3bcca2: 3bcc A:233-445 [59057]
        Other proteins in same PDB: d3bccb1, d3bccb2, d3bccc2, d3bccc3, d3bccd2, d3bccd3, d3bcce1, d3bcce2, d3bccf_, d3bccg_, d3bcch_, d3bccj_
        complexed with amy, fes, hem, sig
  3. 265249Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [55997] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1be3:
      1. 265250Domain d1be3a1: 1be3 A:1-233 [58950]
        Other proteins in same PDB: d1be3b1, d1be3b2, d1be3c2, d1be3c3, d1be3d2, d1be3d3, d1be3e1, d1be3e2, d1be3f_, d1be3g_, d1be3h_, d1be3j_, d1be3k_
      2. 265251Domain d1be3a2: 1be3 A:234-446 [58951]
        Other proteins in same PDB: d1be3b1, d1be3b2, d1be3c2, d1be3c3, d1be3d2, d1be3d3, d1be3e1, d1be3e2, d1be3f_, d1be3g_, d1be3h_, d1be3j_, d1be3k_
        complexed with fes, hec, hem
    2. Domains for 1bgy:
      1. 265254Domain d1bgya1: 1bgy A:1-233 [58954]
        Other proteins in same PDB: d1bgyb1, d1bgyb2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgyn1, d1bgyn2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyv_, d1bgyw_
      2. 265255Domain d1bgya2: 1bgy A:234-446 [58955]
        Other proteins in same PDB: d1bgyb1, d1bgyb2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgyn1, d1bgyn2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyv_, d1bgyw_
      3. 265256Domain d1bgym1: 1bgy M:1-233 [58958]
        Other proteins in same PDB: d1bgyb1, d1bgyb2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgyn1, d1bgyn2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyv_, d1bgyw_
      4. 265257Domain d1bgym2: 1bgy M:234-446 [58959]
        Other proteins in same PDB: d1bgyb1, d1bgyb2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgyn1, d1bgyn2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyv_, d1bgyw_
        complexed with fes, hec, hem
    3. Domains for 1qcr:
      1. 265252Domain d1qcra1: 1qcr A:1-233 [59025]
        Other proteins in same PDB: d1qcrb1, d1qcrb2, d1qcrc2, d1qcrc3, d1qcrd2, d1qcrd3, d1qcre1, d1qcre2, d1qcrf_, d1qcrg_, d1qcrh_, d1qcrj_, d1qcrk_
      2. 265253Domain d1qcra2: 1qcr A:234-446 [59026]
        Other proteins in same PDB: d1qcrb1, d1qcrb2, d1qcrc2, d1qcrc3, d1qcrd2, d1qcrd3, d1qcre1, d1qcre2, d1qcrf_, d1qcrg_, d1qcrh_, d1qcrj_, d1qcrk_
        complexed with hem

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