SCOP 1.75: Species: Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId: 2303]

Lineage for Species: Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId: 2303]

Root: SCOP 1.75
Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (376 folds)
Fold d.153: Ntn hydrolase-like [56234] (2 superfamilies)
4 layers: alpha/beta/beta/alpha; has an unusual sheet-to-sheet packing
Superfamily d.153.1: N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) [56235] (7 families)
N-terminal residue provides two catalytic groups, nucleophile and proton donor
Family d.153.1.4: Proteasome subunits [56251] (3 proteins)
Protein Proteasome alpha subunit (non-catalytic) [56255] (5 species)
contains an extension to the common fold at the N-terminus
Species Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] [56256] (6 PDB entries)

PDB entries in Species: Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId: 2303]:

Domain(s) for 1pma:
1. Domain d1pmaa_: 1pma A: [41918]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
2. Domain d1pmac_: 1pma C: [41919]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
3. Domain d1pmad_: 1pma D: [41920]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
4. Domain d1pmae_: 1pma E: [41921]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
5. Domain d1pmaf_: 1pma F: [41922]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
6. Domain d1pmag_: 1pma G: [41923]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
7. Domain d1pmah_: 1pma H: [41924]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
8. Domain d1pmai_: 1pma I: [41925]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
9. Domain d1pmaj_: 1pma J: [41926]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
10. Domain d1pmak_: 1pma K: [41927]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
11. Domain d1pmal_: 1pma L: [41928]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
12. Domain d1pmam_: 1pma M: [41929]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
13. Domain d1pman_: 1pma N: [41930]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
14. Domain d1pmao_: 1pma O: [41931]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_

Domain(s) for 1ya7:

Domain d1ya7a1: 1ya7 A:13-233 [122790]
Other proteins in same PDB: d1ya7h1, d1ya7i1, d1ya7j1, d1ya7k1, d1ya7l1, d1ya7m1, d1ya7n1, d1ya7o1, d1ya7p1, d1ya7q1, d1ya7r1, d1ya7s1, d1ya7t1, d1ya7u1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4

Domain d1ya7b1: 1ya7 B:13-233 [122791]
Other proteins in same PDB: d1ya7h1, d1ya7i1, d1ya7j1, d1ya7k1, d1ya7l1, d1ya7m1, d1ya7n1, d1ya7o1, d1ya7p1, d1ya7q1, d1ya7r1, d1ya7s1, d1ya7t1, d1ya7u1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4

Domain d1ya7c1: 1ya7 C:13-233 [122792]
Other proteins in same PDB: d1ya7h1, d1ya7i1, d1ya7j1, d1ya7k1, d1ya7l1, d1ya7m1, d1ya7n1, d1ya7o1, d1ya7p1, d1ya7q1, d1ya7r1, d1ya7s1, d1ya7t1, d1ya7u1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4

Domain d1ya7d1: 1ya7 D:13-233 [122793]
Other proteins in same PDB: d1ya7h1, d1ya7i1, d1ya7j1, d1ya7k1, d1ya7l1, d1ya7m1, d1ya7n1, d1ya7o1, d1ya7p1, d1ya7q1, d1ya7r1, d1ya7s1, d1ya7t1, d1ya7u1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4

Domain d1ya7e1: 1ya7 E:13-233 [122794]
Other proteins in same PDB: d1ya7h1, d1ya7i1, d1ya7j1, d1ya7k1, d1ya7l1, d1ya7m1, d1ya7n1, d1ya7o1, d1ya7p1, d1ya7q1, d1ya7r1, d1ya7s1, d1ya7t1, d1ya7u1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4

Domain d1ya7f1: 1ya7 F:13-233 [122795]
Other proteins in same PDB: d1ya7h1, d1ya7i1, d1ya7j1, d1ya7k1, d1ya7l1, d1ya7m1, d1ya7n1, d1ya7o1, d1ya7p1, d1ya7q1, d1ya7r1, d1ya7s1, d1ya7t1, d1ya7u1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4

Domain d1ya7g1: 1ya7 G:13-233 [122796]
Other proteins in same PDB: d1ya7h1, d1ya7i1, d1ya7j1, d1ya7k1, d1ya7l1, d1ya7m1, d1ya7n1, d1ya7o1, d1ya7p1, d1ya7q1, d1ya7r1, d1ya7s1, d1ya7t1, d1ya7u1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4

Domain(s) for 1yar:

Domain d1yara1: 1yar A:13-233 [122837]
Other proteins in same PDB: d1yarh1, d1yari1, d1yarj1, d1yark1, d1yarl1, d1yarm1, d1yarn1, d1yaro1, d1yarp1, d1yarq1, d1yarr1, d1yars1, d1yart1, d1yaru1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4; mutant

Domain d1yarb1: 1yar B:13-233 [122838]
Other proteins in same PDB: d1yarh1, d1yari1, d1yarj1, d1yark1, d1yarl1, d1yarm1, d1yarn1, d1yaro1, d1yarp1, d1yarq1, d1yarr1, d1yars1, d1yart1, d1yaru1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4; mutant

Domain d1yarc1: 1yar C:13-233 [122839]
Other proteins in same PDB: d1yarh1, d1yari1, d1yarj1, d1yark1, d1yarl1, d1yarm1, d1yarn1, d1yaro1, d1yarp1, d1yarq1, d1yarr1, d1yars1, d1yart1, d1yaru1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4; mutant

Domain d1yard1: 1yar D:13-233 [122840]
Other proteins in same PDB: d1yarh1, d1yari1, d1yarj1, d1yark1, d1yarl1, d1yarm1, d1yarn1, d1yaro1, d1yarp1, d1yarq1, d1yarr1, d1yars1, d1yart1, d1yaru1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4; mutant

Domain d1yare1: 1yar E:13-233 [122841]
Other proteins in same PDB: d1yarh1, d1yari1, d1yarj1, d1yark1, d1yarl1, d1yarm1, d1yarn1, d1yaro1, d1yarp1, d1yarq1, d1yarr1, d1yars1, d1yart1, d1yaru1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4; mutant

Domain d1yarf1: 1yar F:13-233 [122842]
Other proteins in same PDB: d1yarh1, d1yari1, d1yarj1, d1yark1, d1yarl1, d1yarm1, d1yarn1, d1yaro1, d1yarp1, d1yarq1, d1yarr1, d1yars1, d1yart1, d1yaru1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4; mutant

Domain d1yarg1: 1yar G:13-233 [122843]
Other proteins in same PDB: d1yarh1, d1yari1, d1yarj1, d1yark1, d1yarl1, d1yarm1, d1yarn1, d1yaro1, d1yarp1, d1yarq1, d1yarr1, d1yars1, d1yart1, d1yaru1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4; mutant

Domain(s) for 1yau:

Domain d1yaua1: 1yau A:13-233 [122851]
Other proteins in same PDB: d1yauh1, d1yaui1, d1yauj1, d1yauk1, d1yaul1, d1yaum1, d1yaun1, d1yauo1, d1yaup1, d1yauq1, d1yaur1, d1yaus1, d1yaut1, d1yauu1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4; mutant

Domain d1yaub1: 1yau B:13-233 [122852]
Other proteins in same PDB: d1yauh1, d1yaui1, d1yauj1, d1yauk1, d1yaul1, d1yaum1, d1yaun1, d1yauo1, d1yaup1, d1yauq1, d1yaur1, d1yaus1, d1yaut1, d1yauu1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4; mutant

Domain d1yauc1: 1yau C:13-233 [122853]
Other proteins in same PDB: d1yauh1, d1yaui1, d1yauj1, d1yauk1, d1yaul1, d1yaum1, d1yaun1, d1yauo1, d1yaup1, d1yauq1, d1yaur1, d1yaus1, d1yaut1, d1yauu1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4; mutant

Domain d1yaud1: 1yau D:13-233 [122854]
Other proteins in same PDB: d1yauh1, d1yaui1, d1yauj1, d1yauk1, d1yaul1, d1yaum1, d1yaun1, d1yauo1, d1yaup1, d1yauq1, d1yaur1, d1yaus1, d1yaut1, d1yauu1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4; mutant

Domain d1yaue1: 1yau E:13-233 [122855]
Other proteins in same PDB: d1yauh1, d1yaui1, d1yauj1, d1yauk1, d1yaul1, d1yaum1, d1yaun1, d1yauo1, d1yaup1, d1yauq1, d1yaur1, d1yaus1, d1yaut1, d1yauu1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4; mutant

Domain d1yauf1: 1yau F:13-233 [122856]
Other proteins in same PDB: d1yauh1, d1yaui1, d1yauj1, d1yauk1, d1yaul1, d1yaum1, d1yaun1, d1yauo1, d1yaup1, d1yauq1, d1yaur1, d1yaus1, d1yaut1, d1yauu1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4; mutant

Domain d1yaug1: 1yau G:13-233 [122857]
Other proteins in same PDB: d1yauh1, d1yaui1, d1yauj1, d1yauk1, d1yaul1, d1yaum1, d1yaun1, d1yauo1, d1yaup1, d1yauq1, d1yaur1, d1yaus1, d1yaut1, d1yauu1
automatically matched to d1pmaa_
complexed with gol, so4; mutant

Domain(s) for 3c91:

Domain d3c91a1: 3c91 A:13-233 [156066]
Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
automatically matched to d1pmaa_

Domain d3c91b1: 3c91 B:13-233 [156067]
Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
automatically matched to d1pmaa_

Domain d3c91c1: 3c91 C:13-233 [156068]
Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
automatically matched to d1pmaa_

Domain d3c91d1: 3c91 D:13-233 [156069]
Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
automatically matched to d1pmaa_

Domain d3c91e1: 3c91 E:13-233 [156070]
Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
automatically matched to d1pmaa_

Domain d3c91f1: 3c91 F:13-233 [156071]
Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
automatically matched to d1pmaa_

Domain d3c91g1: 3c91 G:13-233 [156072]
Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
automatically matched to d1pmaa_

Domain d3c91o1: 3c91 O:13-233 [156080]
Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
automatically matched to d1pmaa_

Domain d3c91p1: 3c91 P:13-233 [156081]
Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
automatically matched to d1pmaa_

Domain d3c91q1: 3c91 Q:13-233 [156082]
Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
automatically matched to d1pmaa_

Domain d3c91r1: 3c91 R:13-233 [156083]
Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
automatically matched to d1pmaa_

Domain d3c91s1: 3c91 S:13-233 [156084]
Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
automatically matched to d1pmaa_

Domain d3c91t1: 3c91 T:13-233 [156085]
Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
automatically matched to d1pmaa_

Domain d3c91u1: 3c91 U:13-233 [156086]
Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
automatically matched to d1pmaa_

Domain(s) for 3c92:

Domain d3c92a1: 3c92 A:13-233 [156094]
Other proteins in same PDB: d3c9211, d3c9221, d3c92h1, d3c92i1, d3c92j1, d3c92k1, d3c92l1, d3c92m1, d3c92n1, d3c92v1, d3c92w1, d3c92x1, d3c92y1, d3c92z1
automatically matched to d1pmaa_

Domain d3c92b1: 3c92 B:13-233 [156095]
Other proteins in same PDB: d3c9211, d3c9221, d3c92h1, d3c92i1, d3c92j1, d3c92k1, d3c92l1, d3c92m1, d3c92n1, d3c92v1, d3c92w1, d3c92x1, d3c92y1, d3c92z1
automatically matched to d1pmaa_

Domain d3c92c1: 3c92 C:13-233 [156096]
Other proteins in same PDB: d3c9211, d3c9221, d3c92h1, d3c92i1, d3c92j1, d3c92k1, d3c92l1, d3c92m1, d3c92n1, d3c92v1, d3c92w1, d3c92x1, d3c92y1, d3c92z1
automatically matched to d1pmaa_

Domain d3c92d1: 3c92 D:13-233 [156097]
Other proteins in same PDB: d3c9211, d3c9221, d3c92h1, d3c92i1, d3c92j1, d3c92k1, d3c92l1, d3c92m1, d3c92n1, d3c92v1, d3c92w1, d3c92x1, d3c92y1, d3c92z1
automatically matched to d1pmaa_

Domain d3c92e1: 3c92 E:13-233 [156098]
Other proteins in same PDB: d3c9211, d3c9221, d3c92h1, d3c92i1, d3c92j1, d3c92k1, d3c92l1, d3c92m1, d3c92n1, d3c92v1, d3c92w1, d3c92x1, d3c92y1, d3c92z1
automatically matched to d1pmaa_

Domain d3c92f1: 3c92 F:13-233 [156099]
Other proteins in same PDB: d3c9211, d3c9221, d3c92h1, d3c92i1, d3c92j1, d3c92k1, d3c92l1, d3c92m1, d3c92n1, d3c92v1, d3c92w1, d3c92x1, d3c92y1, d3c92z1
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Domain d3c92g1: 3c92 G:13-233 [156100]
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More info for Species Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome alpha subunit (non-catalytic)

Timeline for Species Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome alpha subunit (non-catalytic):

Species Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome alpha subunit (non-catalytic) first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55, called Species Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome alpha subunit (non-catalytic)
Species Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome alpha subunit (non-catalytic) appears in SCOP 1.73
Species Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome alpha subunit (non-catalytic) is called Species Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome alpha subunit (non-catalytic) in SCOPe 2.01
Species Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome alpha subunit (non-catalytic) appears in the current release, SCOPe 2.08, called Species Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome alpha subunit (non-catalytic)