SCOP 1.67: Species: Archaeon Thermoplasma acidophilum

Lineage for Species: Archaeon Thermoplasma acidophilum

Root: SCOP 1.67
Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (260 folds)
Fold d.153: Ntn hydrolase-like [56234] (2 superfamilies)
4 layers: alpha/beta/beta/alpha; has an unusual sheet-to-sheet packing
Superfamily d.153.1: N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) [56235] (5 families)
N-terminal residue provides two catalytic groups, nucleophile and proton donor
Family d.153.1.4: Proteasome subunits [56251] (3 proteins)
Protein Proteasome alpha subunit (non-catalytic) [56255] (5 species)
contains an extension to the common fold at the N-terminus
Species Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] [56256] (1 PDB entry)

PDB entry in Species: Archaeon Thermoplasma acidophilum:

Domain(s) for 1pma:
1. Domain d1pmaa_: 1pma A: [41918]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
2. Domain d1pmac_: 1pma C: [41919]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
3. Domain d1pmad_: 1pma D: [41920]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
4. Domain d1pmae_: 1pma E: [41921]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
5. Domain d1pmaf_: 1pma F: [41922]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
6. Domain d1pmag_: 1pma G: [41923]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
7. Domain d1pmah_: 1pma H: [41924]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
8. Domain d1pmai_: 1pma I: [41925]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
9. Domain d1pmaj_: 1pma J: [41926]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
10. Domain d1pmak_: 1pma K: [41927]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
11. Domain d1pmal_: 1pma L: [41928]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
12. Domain d1pmam_: 1pma M: [41929]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
13. Domain d1pman_: 1pma N: [41930]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
14. Domain d1pmao_: 1pma O: [41931]
  Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_

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Timeline for Species Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome alpha subunit (non-catalytic):

Species Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome alpha subunit (non-catalytic) first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55, called Species Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome alpha subunit (non-catalytic)
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Species Archaeon Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome alpha subunit (non-catalytic) appears in the current release, SCOPe 2.08, called Species Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome alpha subunit (non-catalytic)