Lineage for Species: Thermoplasma acidophilum [TaxId: 2303]

  1. Root: SCOPe 2.07
  2. 2494617Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (388 folds)
  3. 2548740Fold d.153: Ntn hydrolase-like [56234] (2 superfamilies)
    4 layers: alpha/beta/beta/alpha; has an unusual sheet-to-sheet packing
  4. 2548741Superfamily d.153.1: N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) [56235] (8 families) (S)
    N-terminal residue provides two catalytic groups, nucleophile and proton donor
  5. 2548925Family d.153.1.4: Proteasome subunits [56251] (4 proteins)
  6. 2549037Protein Proteasome alpha subunit (non-catalytic) [56255] (9 species)
    contains an extension to the common fold at the N-terminus
  7. 2550647Species Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] [56256] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Thermoplasma acidophilum [TaxId: 2303]:

  1. Domain(s) for 1pma:
    1. 2550648Domain d1pmaa_: 1pma A: [41918]
      Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
    2. 2550649Domain d1pmac_: 1pma C: [41919]
      Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
    3. 2550650Domain d1pmad_: 1pma D: [41920]
      Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
    4. 2550651Domain d1pmae_: 1pma E: [41921]
      Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
    5. 2550652Domain d1pmaf_: 1pma F: [41922]
      Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
    6. 2550653Domain d1pmag_: 1pma G: [41923]
      Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
    7. 2550654Domain d1pmah_: 1pma H: [41924]
      Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
    8. 2550655Domain d1pmai_: 1pma I: [41925]
      Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
    9. 2550656Domain d1pmaj_: 1pma J: [41926]
      Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
    10. 2550657Domain d1pmak_: 1pma K: [41927]
      Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
    11. 2550658Domain d1pmal_: 1pma L: [41928]
      Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
    12. 2550659Domain d1pmam_: 1pma M: [41929]
      Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
    13. 2550660Domain d1pman_: 1pma N: [41930]
      Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
    14. 2550661Domain d1pmao_: 1pma O: [41931]
      Other proteins in same PDB: d1pma1_, d1pma2_, d1pmab_, d1pmap_, d1pmaq_, d1pmar_, d1pmas_, d1pmat_, d1pmau_, d1pmav_, d1pmaw_, d1pmax_, d1pmay_, d1pmaz_
  2. Domain(s) for 3c91:
    1. 2550662Domain d3c91a1: 3c91 A:13-233 [156066]
      Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
      automatically matched to d1pmaa_
    2. 2550663Domain d3c91b1: 3c91 B:13-233 [156067]
      Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
      automatically matched to d1pmaa_
    3. 2550664Domain d3c91c1: 3c91 C:13-233 [156068]
      Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
      automatically matched to d1pmaa_
    4. 2550665Domain d3c91d1: 3c91 D:13-233 [156069]
      Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
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    5. 2550666Domain d3c91e1: 3c91 E:13-233 [156070]
      Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
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    6. 2550667Domain d3c91f1: 3c91 F:13-233 [156071]
      Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
      automatically matched to d1pmaa_
    7. 2550668Domain d3c91g1: 3c91 G:13-233 [156072]
      Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
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    8. 2550669Domain d3c91o1: 3c91 O:13-233 [156080]
      Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
      automatically matched to d1pmaa_
    9. 2550670Domain d3c91p1: 3c91 P:13-233 [156081]
      Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
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    10. 2550671Domain d3c91q1: 3c91 Q:13-233 [156082]
      Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
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    11. 2550672Domain d3c91r1: 3c91 R:13-233 [156083]
      Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
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    12. 2550673Domain d3c91s1: 3c91 S:13-233 [156084]
      Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
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    13. 2550674Domain d3c91t1: 3c91 T:13-233 [156085]
      Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
      automatically matched to d1pmaa_
    14. 2550675Domain d3c91u1: 3c91 U:13-233 [156086]
      Other proteins in same PDB: d3c9111, d3c9121, d3c91h1, d3c91i1, d3c91j1, d3c91k1, d3c91l1, d3c91m1, d3c91n1, d3c91v1, d3c91w1, d3c91x1, d3c91y1, d3c91z1
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  3. Domain(s) for 3c92:
    1. 2550676Domain d3c92a1: 3c92 A:13-233 [156094]
      Other proteins in same PDB: d3c9211, d3c9221, d3c92h1, d3c92i1, d3c92j1, d3c92k1, d3c92l1, d3c92m1, d3c92n1, d3c92v1, d3c92w1, d3c92x1, d3c92y1, d3c92z1
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    2. 2550677Domain d3c92b1: 3c92 B:13-233 [156095]
      Other proteins in same PDB: d3c9211, d3c9221, d3c92h1, d3c92i1, d3c92j1, d3c92k1, d3c92l1, d3c92m1, d3c92n1, d3c92v1, d3c92w1, d3c92x1, d3c92y1, d3c92z1
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    3. 2550678Domain d3c92c1: 3c92 C:13-233 [156096]
      Other proteins in same PDB: d3c9211, d3c9221, d3c92h1, d3c92i1, d3c92j1, d3c92k1, d3c92l1, d3c92m1, d3c92n1, d3c92v1, d3c92w1, d3c92x1, d3c92y1, d3c92z1
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    4. 2550679Domain d3c92d1: 3c92 D:13-233 [156097]
      Other proteins in same PDB: d3c9211, d3c9221, d3c92h1, d3c92i1, d3c92j1, d3c92k1, d3c92l1, d3c92m1, d3c92n1, d3c92v1, d3c92w1, d3c92x1, d3c92y1, d3c92z1
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    5. 2550680Domain d3c92e1: 3c92 E:13-233 [156098]
      Other proteins in same PDB: d3c9211, d3c9221, d3c92h1, d3c92i1, d3c92j1, d3c92k1, d3c92l1, d3c92m1, d3c92n1, d3c92v1, d3c92w1, d3c92x1, d3c92y1, d3c92z1
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    6. 2550681Domain d3c92f1: 3c92 F:13-233 [156099]
      Other proteins in same PDB: d3c9211, d3c9221, d3c92h1, d3c92i1, d3c92j1, d3c92k1, d3c92l1, d3c92m1, d3c92n1, d3c92v1, d3c92w1, d3c92x1, d3c92y1, d3c92z1
      automatically matched to d1pmaa_
    7. 2550682Domain d3c92g1: 3c92 G:13-233 [156100]
      Other proteins in same PDB: d3c9211, d3c9221, d3c92h1, d3c92i1, d3c92j1, d3c92k1, d3c92l1, d3c92m1, d3c92n1, d3c92v1, d3c92w1, d3c92x1, d3c92y1, d3c92z1
      automatically matched to d1pmaa_
    8. 2550683Domain d3c92o1: 3c92 O:13-233 [156108]
      Other proteins in same PDB: d3c9211, d3c9221, d3c92h1, d3c92i1, d3c92j1, d3c92k1, d3c92l1, d3c92m1, d3c92n1, d3c92v1, d3c92w1, d3c92x1, d3c92y1, d3c92z1
      automatically matched to d1pmaa_
    9. 2550684Domain d3c92p1: 3c92 P:13-233 [156109]
      Other proteins in same PDB: d3c9211, d3c9221, d3c92h1, d3c92i1, d3c92j1, d3c92k1, d3c92l1, d3c92m1, d3c92n1, d3c92v1, d3c92w1, d3c92x1, d3c92y1, d3c92z1
      automatically matched to d1pmaa_
    10. 2550685Domain d3c92q1: 3c92 Q:13-233 [156110]
      Other proteins in same PDB: d3c9211, d3c9221, d3c92h1, d3c92i1, d3c92j1, d3c92k1, d3c92l1, d3c92m1, d3c92n1, d3c92v1, d3c92w1, d3c92x1, d3c92y1, d3c92z1
      automatically matched to d1pmaa_
    11. 2550686Domain d3c92r1: 3c92 R:13-233 [156111]
      Other proteins in same PDB: d3c9211, d3c9221, d3c92h1, d3c92i1, d3c92j1, d3c92k1, d3c92l1, d3c92m1, d3c92n1, d3c92v1, d3c92w1, d3c92x1, d3c92y1, d3c92z1
      automatically matched to d1pmaa_
    12. 2550687Domain d3c92s1: 3c92 S:13-233 [156112]
      Other proteins in same PDB: d3c9211, d3c9221, d3c92h1, d3c92i1, d3c92j1, d3c92k1, d3c92l1, d3c92m1, d3c92n1, d3c92v1, d3c92w1, d3c92x1, d3c92y1, d3c92z1
      automatically matched to d1pmaa_
    13. 2550688Domain d3c92t1: 3c92 T:13-233 [156113]
      Other proteins in same PDB: d3c9211, d3c9221, d3c92h1, d3c92i1, d3c92j1, d3c92k1, d3c92l1, d3c92m1, d3c92n1, d3c92v1, d3c92w1, d3c92x1, d3c92y1, d3c92z1
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    14. 2550689Domain d3c92u1: 3c92 U:13-233 [156114]
      Other proteins in same PDB: d3c9211, d3c9221, d3c92h1, d3c92i1, d3c92j1, d3c92k1, d3c92l1, d3c92m1, d3c92n1, d3c92v1, d3c92w1, d3c92x1, d3c92y1, d3c92z1
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  4. Domain(s) for 6bdf:
    1. 3049449Domain d6bdfo_: 6bdf O: [349511]
      Other proteins in same PDB: d6bdf1_, d6bdfb_, d6bdfd_, d6bdff_, d6bdfh_, d6bdfj_, d6bdfl_, d6bdfn_, d6bdfp_, d6bdfr_, d6bdft_, d6bdfv_, d6bdfx_, d6bdfz_
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    2. 3049483Domain d6bdfq_: 6bdf Q: [349545]
      Other proteins in same PDB: d6bdf1_, d6bdfb_, d6bdfd_, d6bdff_, d6bdfh_, d6bdfj_, d6bdfl_, d6bdfn_, d6bdfp_, d6bdfr_, d6bdft_, d6bdfv_, d6bdfx_, d6bdfz_
      automated match to d1pmaa_
    3. 3049487Domain d6bdfs_: 6bdf S: [349549]
      Other proteins in same PDB: d6bdf1_, d6bdfb_, d6bdfd_, d6bdff_, d6bdfh_, d6bdfj_, d6bdfl_, d6bdfn_, d6bdfp_, d6bdfr_, d6bdft_, d6bdfv_, d6bdfx_, d6bdfz_
      automated match to d1pmaa_
    4. 3049504Domain d6bdfe_: 6bdf E: [349566]
      Other proteins in same PDB: d6bdf1_, d6bdfb_, d6bdfd_, d6bdff_, d6bdfh_, d6bdfj_, d6bdfl_, d6bdfn_, d6bdfp_, d6bdfr_, d6bdft_, d6bdfv_, d6bdfx_, d6bdfz_
      automated match to d1pmaa_
    5. 3049506Domain d6bdfu_: 6bdf U: [349568]
      Other proteins in same PDB: d6bdf1_, d6bdfb_, d6bdfd_, d6bdff_, d6bdfh_, d6bdfj_, d6bdfl_, d6bdfn_, d6bdfp_, d6bdfr_, d6bdft_, d6bdfv_, d6bdfx_, d6bdfz_
      automated match to d1pmaa_
    6. 3049552Domain d6bdfw_: 6bdf W: [349614]
      Other proteins in same PDB: d6bdf1_, d6bdfb_, d6bdfd_, d6bdff_, d6bdfh_, d6bdfj_, d6bdfl_, d6bdfn_, d6bdfp_, d6bdfr_, d6bdft_, d6bdfv_, d6bdfx_, d6bdfz_
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More info for Species Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome alpha subunit (non-catalytic)

Timeline for Species Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome alpha subunit (non-catalytic):