Lineage for Species: Thermoplasma acidophilum [TaxId: 2303]

  1. Root: SCOPe 2.01
  2. 1013083Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (376 folds)
  3. 1044569Fold d.153: Ntn hydrolase-like [56234] (2 superfamilies)
    4 layers: alpha/beta/beta/alpha; has an unusual sheet-to-sheet packing
  4. 1044570Superfamily d.153.1: N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) [56235] (8 families) (S)
    N-terminal residue provides two catalytic groups, nucleophile and proton donor
  5. 1044729Family d.153.1.4: Proteasome subunits [56251] (4 proteins)
  6. 1045208Protein Proteasome beta subunit (catalytic) [56252] (5 species)
  7. 1045593Species Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] [56253] (5 PDB entries)

PDB entries in Species: Thermoplasma acidophilum [TaxId: 2303]:

  1. Domain(s) for 1pma:
    1. 1045608Domain d1pma1_: 1pma 1: [41874]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    2. 1045609Domain d1pma2_: 1pma 2: [41875]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    3. 1045610Domain d1pmab_: 1pma B: [41862]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    4. 1045611Domain d1pmap_: 1pma P: [41863]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    5. 1045612Domain d1pmaq_: 1pma Q: [41864]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    6. 1045613Domain d1pmar_: 1pma R: [41865]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    7. 1045614Domain d1pmas_: 1pma S: [41866]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    8. 1045615Domain d1pmat_: 1pma T: [41867]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    9. 1045616Domain d1pmau_: 1pma U: [41868]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    10. 1045617Domain d1pmav_: 1pma V: [41869]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    11. 1045618Domain d1pmaw_: 1pma W: [41870]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    12. 1045619Domain d1pmax_: 1pma X: [41871]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    13. 1045620Domain d1pmay_: 1pma Y: [41872]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    14. 1045621Domain d1pmaz_: 1pma Z: [41873]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
  2. Domain(s) for 3c91:
    1. 1045622Domain d3c9111: 3c91 1:1-203 [156064]
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    2. 1045623Domain d3c9121: 3c91 2:1-203 [156065]
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    3. 1045624Domain d3c91h1: 3c91 H:1-203 [156073]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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    4. 1045625Domain d3c91i1: 3c91 I:1-203 [156074]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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    5. 1045626Domain d3c91j1: 3c91 J:1-203 [156075]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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    6. 1045627Domain d3c91k1: 3c91 K:1-203 [156076]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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    7. 1045628Domain d3c91l1: 3c91 L:1-203 [156077]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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    8. 1045629Domain d3c91m1: 3c91 M:1-203 [156078]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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    9. 1045630Domain d3c91n1: 3c91 N:1-203 [156079]
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    10. 1045631Domain d3c91v1: 3c91 V:1-203 [156087]
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    11. 1045632Domain d3c91w1: 3c91 W:1-203 [156088]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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    12. 1045633Domain d3c91x1: 3c91 X:1-203 [156089]
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    13. 1045634Domain d3c91y1: 3c91 Y:1-203 [156090]
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    14. 1045635Domain d3c91z1: 3c91 Z:1-203 [156091]
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  3. Domain(s) for 3c92:
    1. 1045636Domain d3c9211: 3c92 1:1-203 [156092]
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    2. 1045637Domain d3c9221: 3c92 2:1-203 [156093]
      Other proteins in same PDB: d3c92a1, d3c92b1, d3c92c1, d3c92d1, d3c92e1, d3c92f1, d3c92g1, d3c92o1, d3c92p1, d3c92q1, d3c92r1, d3c92s1, d3c92t1, d3c92u1
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    3. 1045638Domain d3c92h1: 3c92 H:1-203 [156101]
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    4. 1045639Domain d3c92i1: 3c92 I:1-203 [156102]
      Other proteins in same PDB: d3c92a1, d3c92b1, d3c92c1, d3c92d1, d3c92e1, d3c92f1, d3c92g1, d3c92o1, d3c92p1, d3c92q1, d3c92r1, d3c92s1, d3c92t1, d3c92u1
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    5. 1045640Domain d3c92j1: 3c92 J:1-203 [156103]
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    6. 1045641Domain d3c92k1: 3c92 K:1-203 [156104]
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    7. 1045642Domain d3c92l1: 3c92 L:1-203 [156105]
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    8. 1045643Domain d3c92m1: 3c92 M:1-203 [156106]
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    9. 1045644Domain d3c92n1: 3c92 N:1-203 [156107]
      Other proteins in same PDB: d3c92a1, d3c92b1, d3c92c1, d3c92d1, d3c92e1, d3c92f1, d3c92g1, d3c92o1, d3c92p1, d3c92q1, d3c92r1, d3c92s1, d3c92t1, d3c92u1
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    10. 1045645Domain d3c92v1: 3c92 V:1-203 [156115]
      Other proteins in same PDB: d3c92a1, d3c92b1, d3c92c1, d3c92d1, d3c92e1, d3c92f1, d3c92g1, d3c92o1, d3c92p1, d3c92q1, d3c92r1, d3c92s1, d3c92t1, d3c92u1
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    11. 1045646Domain d3c92w1: 3c92 W:1-203 [156116]
      Other proteins in same PDB: d3c92a1, d3c92b1, d3c92c1, d3c92d1, d3c92e1, d3c92f1, d3c92g1, d3c92o1, d3c92p1, d3c92q1, d3c92r1, d3c92s1, d3c92t1, d3c92u1
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    12. 1045647Domain d3c92x1: 3c92 X:1-203 [156117]
      Other proteins in same PDB: d3c92a1, d3c92b1, d3c92c1, d3c92d1, d3c92e1, d3c92f1, d3c92g1, d3c92o1, d3c92p1, d3c92q1, d3c92r1, d3c92s1, d3c92t1, d3c92u1
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    13. 1045648Domain d3c92y1: 3c92 Y:1-203 [156118]
      Other proteins in same PDB: d3c92a1, d3c92b1, d3c92c1, d3c92d1, d3c92e1, d3c92f1, d3c92g1, d3c92o1, d3c92p1, d3c92q1, d3c92r1, d3c92s1, d3c92t1, d3c92u1
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    14. 1045649Domain d3c92z1: 3c92 Z:1-203 [156119]
      Other proteins in same PDB: d3c92a1, d3c92b1, d3c92c1, d3c92d1, d3c92e1, d3c92f1, d3c92g1, d3c92o1, d3c92p1, d3c92q1, d3c92r1, d3c92s1, d3c92t1, d3c92u1
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  4. Domain(s) for 3jrm:
    1. 1045594Domain d3jrmh_: 3jrm H: [178731]
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    2. 1045595Domain d3jrmi_: 3jrm I: [178732]
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    3. 1045596Domain d3jrmj_: 3jrm J: [178733]
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    4. 1045597Domain d3jrmk_: 3jrm K: [178734]
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    5. 1045598Domain d3jrml_: 3jrm L: [178735]
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    6. 1045599Domain d3jrmm_: 3jrm M: [178736]
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    7. 1045600Domain d3jrmn_: 3jrm N: [178737]
      Other proteins in same PDB: d3jrma_, d3jrmb_, d3jrmc_, d3jrmd_, d3jrme_, d3jrmf_, d3jrmg_, d3jrmo_, d3jrmp_, d3jrmq_, d3jrmr_, d3jrms_, d3jrmt_, d3jrmu_
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  5. Domain(s) for 3jse:
    1. 1045601Domain d3jseh_: 3jse H: [178765]
      Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseo_, d3jsep_, d3jseq_, d3jser_, d3jses_, d3jset_, d3jseu_
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    2. 1045602Domain d3jsei_: 3jse I: [178766]
      Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseo_, d3jsep_, d3jseq_, d3jser_, d3jses_, d3jset_, d3jseu_
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    3. 1045603Domain d3jsej_: 3jse J: [178767]
      Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseo_, d3jsep_, d3jseq_, d3jser_, d3jses_, d3jset_, d3jseu_
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    4. 1045604Domain d3jsek_: 3jse K: [178768]
      Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseo_, d3jsep_, d3jseq_, d3jser_, d3jses_, d3jset_, d3jseu_
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    5. 1045605Domain d3jsel_: 3jse L: [178769]
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    6. 1045606Domain d3jsem_: 3jse M: [178770]
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    7. 1045607Domain d3jsen_: 3jse N: [178771]
      Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseo_, d3jsep_, d3jseq_, d3jser_, d3jses_, d3jset_, d3jseu_
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More info for Species Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome beta subunit (catalytic)

Timeline for Species Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome beta subunit (catalytic):