Lineage for Species: Thermoplasma acidophilum [TaxId: 2303]

  1. Root: SCOPe 2.07
  2. 2494617Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (388 folds)
  3. 2548740Fold d.153: Ntn hydrolase-like [56234] (2 superfamilies)
    4 layers: alpha/beta/beta/alpha; has an unusual sheet-to-sheet packing
  4. 2548741Superfamily d.153.1: N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) [56235] (8 families) (S)
    N-terminal residue provides two catalytic groups, nucleophile and proton donor
  5. 2548925Family d.153.1.4: Proteasome subunits [56251] (4 proteins)
  6. 2550690Protein Proteasome beta subunit (catalytic) [56252] (7 species)
  7. 2552634Species Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] [56253] (6 PDB entries)

PDB entries in Species: Thermoplasma acidophilum [TaxId: 2303]:

  1. Domain(s) for 1pma:
    1. 2552635Domain d1pma1_: 1pma 1: [41874]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    2. 2552636Domain d1pma2_: 1pma 2: [41875]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    3. 2552637Domain d1pmab_: 1pma B: [41862]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    4. 2552638Domain d1pmap_: 1pma P: [41863]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    5. 2552639Domain d1pmaq_: 1pma Q: [41864]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    6. 2552640Domain d1pmar_: 1pma R: [41865]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    7. 2552641Domain d1pmas_: 1pma S: [41866]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    8. 2552642Domain d1pmat_: 1pma T: [41867]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    9. 2552643Domain d1pmau_: 1pma U: [41868]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    10. 2552644Domain d1pmav_: 1pma V: [41869]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    11. 2552645Domain d1pmaw_: 1pma W: [41870]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    12. 2552646Domain d1pmax_: 1pma X: [41871]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    13. 2552647Domain d1pmay_: 1pma Y: [41872]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
    14. 2552648Domain d1pmaz_: 1pma Z: [41873]
      Other proteins in same PDB: d1pmaa_, d1pmac_, d1pmad_, d1pmae_, d1pmaf_, d1pmag_, d1pmah_, d1pmai_, d1pmaj_, d1pmak_, d1pmal_, d1pmam_, d1pman_, d1pmao_
  2. Domain(s) for 3c91:
    1. 2552663Domain d3c9111: 3c91 1:1-203 [156064]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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    2. 2552664Domain d3c9121: 3c91 2:1-203 [156065]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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    3. 2552665Domain d3c91h1: 3c91 H:1-203 [156073]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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    4. 2552666Domain d3c91i1: 3c91 I:1-203 [156074]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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    5. 2552667Domain d3c91j1: 3c91 J:1-203 [156075]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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    6. 2552668Domain d3c91k1: 3c91 K:1-203 [156076]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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    7. 2552669Domain d3c91l1: 3c91 L:1-203 [156077]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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    8. 2552670Domain d3c91m1: 3c91 M:1-203 [156078]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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    9. 2552671Domain d3c91n1: 3c91 N:1-203 [156079]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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    10. 2552672Domain d3c91v1: 3c91 V:1-203 [156087]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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    11. 2552673Domain d3c91w1: 3c91 W:1-203 [156088]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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    12. 2552674Domain d3c91x1: 3c91 X:1-203 [156089]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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    13. 2552675Domain d3c91y1: 3c91 Y:1-203 [156090]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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    14. 2552676Domain d3c91z1: 3c91 Z:1-203 [156091]
      Other proteins in same PDB: d3c91a1, d3c91b1, d3c91c1, d3c91d1, d3c91e1, d3c91f1, d3c91g1, d3c91o1, d3c91p1, d3c91q1, d3c91r1, d3c91s1, d3c91t1, d3c91u1
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  3. Domain(s) for 3c92:
    1. 2552677Domain d3c9211: 3c92 1:1-203 [156092]
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    2. 2552678Domain d3c9221: 3c92 2:1-203 [156093]
      Other proteins in same PDB: d3c92a1, d3c92b1, d3c92c1, d3c92d1, d3c92e1, d3c92f1, d3c92g1, d3c92o1, d3c92p1, d3c92q1, d3c92r1, d3c92s1, d3c92t1, d3c92u1
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    3. 2552679Domain d3c92h1: 3c92 H:1-203 [156101]
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    4. 2552680Domain d3c92i1: 3c92 I:1-203 [156102]
      Other proteins in same PDB: d3c92a1, d3c92b1, d3c92c1, d3c92d1, d3c92e1, d3c92f1, d3c92g1, d3c92o1, d3c92p1, d3c92q1, d3c92r1, d3c92s1, d3c92t1, d3c92u1
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    5. 2552681Domain d3c92j1: 3c92 J:1-203 [156103]
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    6. 2552682Domain d3c92k1: 3c92 K:1-203 [156104]
      Other proteins in same PDB: d3c92a1, d3c92b1, d3c92c1, d3c92d1, d3c92e1, d3c92f1, d3c92g1, d3c92o1, d3c92p1, d3c92q1, d3c92r1, d3c92s1, d3c92t1, d3c92u1
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    7. 2552683Domain d3c92l1: 3c92 L:1-203 [156105]
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    8. 2552684Domain d3c92m1: 3c92 M:1-203 [156106]
      Other proteins in same PDB: d3c92a1, d3c92b1, d3c92c1, d3c92d1, d3c92e1, d3c92f1, d3c92g1, d3c92o1, d3c92p1, d3c92q1, d3c92r1, d3c92s1, d3c92t1, d3c92u1
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    9. 2552685Domain d3c92n1: 3c92 N:1-203 [156107]
      Other proteins in same PDB: d3c92a1, d3c92b1, d3c92c1, d3c92d1, d3c92e1, d3c92f1, d3c92g1, d3c92o1, d3c92p1, d3c92q1, d3c92r1, d3c92s1, d3c92t1, d3c92u1
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    10. 2552686Domain d3c92v1: 3c92 V:1-203 [156115]
      Other proteins in same PDB: d3c92a1, d3c92b1, d3c92c1, d3c92d1, d3c92e1, d3c92f1, d3c92g1, d3c92o1, d3c92p1, d3c92q1, d3c92r1, d3c92s1, d3c92t1, d3c92u1
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    11. 2552687Domain d3c92w1: 3c92 W:1-203 [156116]
      Other proteins in same PDB: d3c92a1, d3c92b1, d3c92c1, d3c92d1, d3c92e1, d3c92f1, d3c92g1, d3c92o1, d3c92p1, d3c92q1, d3c92r1, d3c92s1, d3c92t1, d3c92u1
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    12. 2552688Domain d3c92x1: 3c92 X:1-203 [156117]
      Other proteins in same PDB: d3c92a1, d3c92b1, d3c92c1, d3c92d1, d3c92e1, d3c92f1, d3c92g1, d3c92o1, d3c92p1, d3c92q1, d3c92r1, d3c92s1, d3c92t1, d3c92u1
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    13. 2552689Domain d3c92y1: 3c92 Y:1-203 [156118]
      Other proteins in same PDB: d3c92a1, d3c92b1, d3c92c1, d3c92d1, d3c92e1, d3c92f1, d3c92g1, d3c92o1, d3c92p1, d3c92q1, d3c92r1, d3c92s1, d3c92t1, d3c92u1
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    14. 2552690Domain d3c92z1: 3c92 Z:1-203 [156119]
      Other proteins in same PDB: d3c92a1, d3c92b1, d3c92c1, d3c92d1, d3c92e1, d3c92f1, d3c92g1, d3c92o1, d3c92p1, d3c92q1, d3c92r1, d3c92s1, d3c92t1, d3c92u1
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  4. Domain(s) for 3jrm:
    1. 2552649Domain d3jrmh_: 3jrm H: [178731]
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    2. 2552650Domain d3jrmi_: 3jrm I: [178732]
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    3. 2552651Domain d3jrmj_: 3jrm J: [178733]
      Other proteins in same PDB: d3jrma_, d3jrmb_, d3jrmc_, d3jrmd_, d3jrme_, d3jrmf_, d3jrmg_, d3jrmo_, d3jrmp_, d3jrmq_, d3jrmr_, d3jrms_, d3jrmt_, d3jrmu_
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    4. 2552652Domain d3jrmk_: 3jrm K: [178734]
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    5. 2552653Domain d3jrml_: 3jrm L: [178735]
      Other proteins in same PDB: d3jrma_, d3jrmb_, d3jrmc_, d3jrmd_, d3jrme_, d3jrmf_, d3jrmg_, d3jrmo_, d3jrmp_, d3jrmq_, d3jrmr_, d3jrms_, d3jrmt_, d3jrmu_
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    6. 2552654Domain d3jrmm_: 3jrm M: [178736]
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      automated match to d1pma1_
    7. 2552655Domain d3jrmn_: 3jrm N: [178737]
      Other proteins in same PDB: d3jrma_, d3jrmb_, d3jrmc_, d3jrmd_, d3jrme_, d3jrmf_, d3jrmg_, d3jrmo_, d3jrmp_, d3jrmq_, d3jrmr_, d3jrms_, d3jrmt_, d3jrmu_
      automated match to d1pma1_
  5. Domain(s) for 3jse:
    1. 2552656Domain d3jseh_: 3jse H: [178765]
      Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseo_, d3jsep_, d3jseq_, d3jser_, d3jses_, d3jset_, d3jseu_
      automated match to d1pma1_
    2. 2552657Domain d3jsei_: 3jse I: [178766]
      Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseo_, d3jsep_, d3jseq_, d3jser_, d3jses_, d3jset_, d3jseu_
      automated match to d1pma1_
    3. 2552658Domain d3jsej_: 3jse J: [178767]
      Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseo_, d3jsep_, d3jseq_, d3jser_, d3jses_, d3jset_, d3jseu_
      automated match to d1pma1_
    4. 2552659Domain d3jsek_: 3jse K: [178768]
      Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseo_, d3jsep_, d3jseq_, d3jser_, d3jses_, d3jset_, d3jseu_
      automated match to d1pma1_
    5. 2552660Domain d3jsel_: 3jse L: [178769]
      Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseo_, d3jsep_, d3jseq_, d3jser_, d3jses_, d3jset_, d3jseu_
      automated match to d1pma1_
    6. 2552661Domain d3jsem_: 3jse M: [178770]
      Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseo_, d3jsep_, d3jseq_, d3jser_, d3jses_, d3jset_, d3jseu_
      automated match to d1pma1_
    7. 2552662Domain d3jsen_: 3jse N: [178771]
      Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseo_, d3jsep_, d3jseq_, d3jser_, d3jses_, d3jset_, d3jseu_
      automated match to d1pma1_
  6. Domain(s) for 6bdf:
    1. 3049472Domain d6bdfz_: 6bdf Z: [349534]
      Other proteins in same PDB: d6bdf0_, d6bdfa_, d6bdfc_, d6bdfe_, d6bdfg_, d6bdfi_, d6bdfk_, d6bdfm_, d6bdfo_, d6bdfq_, d6bdfs_, d6bdfu_, d6bdfw_, d6bdfy_
      automated match to d1pmab_
    2. 3049485Domain d6bdfr_: 6bdf R: [349547]
      Other proteins in same PDB: d6bdf0_, d6bdfa_, d6bdfc_, d6bdfe_, d6bdfg_, d6bdfi_, d6bdfk_, d6bdfm_, d6bdfo_, d6bdfq_, d6bdfs_, d6bdfu_, d6bdfw_, d6bdfy_
      automated match to d1pmab_
    3. 3049490Domain d6bdfd_: 6bdf D: [349552]
      Other proteins in same PDB: d6bdf0_, d6bdfa_, d6bdfc_, d6bdfe_, d6bdfg_, d6bdfi_, d6bdfk_, d6bdfm_, d6bdfo_, d6bdfq_, d6bdfs_, d6bdfu_, d6bdfw_, d6bdfy_
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    4. 3049518Domain d6bdfv_: 6bdf V: [349580]
      Other proteins in same PDB: d6bdf0_, d6bdfa_, d6bdfc_, d6bdfe_, d6bdfg_, d6bdfi_, d6bdfk_, d6bdfm_, d6bdfo_, d6bdfq_, d6bdfs_, d6bdfu_, d6bdfw_, d6bdfy_
      automated match to d1pmab_
    5. 3049531Domain d6bdfh_: 6bdf H: [349593]
      Other proteins in same PDB: d6bdf0_, d6bdfa_, d6bdfc_, d6bdfe_, d6bdfg_, d6bdfi_, d6bdfk_, d6bdfm_, d6bdfo_, d6bdfq_, d6bdfs_, d6bdfu_, d6bdfw_, d6bdfy_
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    6. 3049549Domain d6bdfx_: 6bdf X: [349611]
      Other proteins in same PDB: d6bdf0_, d6bdfa_, d6bdfc_, d6bdfe_, d6bdfg_, d6bdfi_, d6bdfk_, d6bdfm_, d6bdfo_, d6bdfq_, d6bdfs_, d6bdfu_, d6bdfw_, d6bdfy_
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    7. 3049550Domain d6bdff_: 6bdf F: [349612]
      Other proteins in same PDB: d6bdf0_, d6bdfa_, d6bdfc_, d6bdfe_, d6bdfg_, d6bdfi_, d6bdfk_, d6bdfm_, d6bdfo_, d6bdfq_, d6bdfs_, d6bdfu_, d6bdfw_, d6bdfy_
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    8. 3049562Domain d6bdfj_: 6bdf J: [349624]
      Other proteins in same PDB: d6bdf0_, d6bdfa_, d6bdfc_, d6bdfe_, d6bdfg_, d6bdfi_, d6bdfk_, d6bdfm_, d6bdfo_, d6bdfq_, d6bdfs_, d6bdfu_, d6bdfw_, d6bdfy_
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    9. 3049582Domain d6bdfb_: 6bdf B: [349644]
      Other proteins in same PDB: d6bdf0_, d6bdfa_, d6bdfc_, d6bdfe_, d6bdfg_, d6bdfi_, d6bdfk_, d6bdfm_, d6bdfo_, d6bdfq_, d6bdfs_, d6bdfu_, d6bdfw_, d6bdfy_
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    10. 3049601Domain d6bdfl_: 6bdf L: [349663]
      Other proteins in same PDB: d6bdf0_, d6bdfa_, d6bdfc_, d6bdfe_, d6bdfg_, d6bdfi_, d6bdfk_, d6bdfm_, d6bdfo_, d6bdfq_, d6bdfs_, d6bdfu_, d6bdfw_, d6bdfy_
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    11. 3049658Domain d6bdft_: 6bdf T: [349720]
      Other proteins in same PDB: d6bdf0_, d6bdfa_, d6bdfc_, d6bdfe_, d6bdfg_, d6bdfi_, d6bdfk_, d6bdfm_, d6bdfo_, d6bdfq_, d6bdfs_, d6bdfu_, d6bdfw_, d6bdfy_
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    12. 3049662Domain d6bdfn_: 6bdf N: [349724]
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    13. 3049667Domain d6bdf1_: 6bdf 1: [349729]
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    14. 3049888Domain d6bdfp_: 6bdf P: [349950]
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      automated match to d1pmab_

More info for Species Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome beta subunit (catalytic)

Timeline for Species Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] from d.153.1.4 Proteasome beta subunit (catalytic):