Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (376 folds) |
Fold d.142: ATP-grasp [56058] (2 superfamilies) Consists of two subdomains with different alpha+beta folds shares functional and structural similarities with the PIPK and protein kinase superfamilies |
Superfamily d.142.1: Glutathione synthetase ATP-binding domain-like [56059] (10 families) |
Family d.142.1.4: Succinyl-CoA synthetase, beta-chain, N-terminal domain [56081] (1 protein) automatically mapped to Pfam PF13549 automatically mapped to Pfam PF08442 |
Protein Succinyl-CoA synthetase, beta-chain, N-terminal domain [56082] (2 species) |
Escherichia coli [TaxId:562] [56083] (11 PDB entries) |
Domain d1jkjb2: 1jkj B:1-238 [66803] Other proteins in same PDB: d1jkja1, d1jkja2, d1jkjb1, d1jkjd1, d1jkjd2, d1jkje1 complexed with coa, gol, po4, so4 |
Domain d1jkje2: 1jkj E:1-238 [66807] Other proteins in same PDB: d1jkja1, d1jkja2, d1jkjb1, d1jkjd1, d1jkjd2, d1jkje1 complexed with coa, gol, po4, so4 |
Domain d1jllb2: 1jll B:1-238 [66854] Other proteins in same PDB: d1jlla1, d1jlla2, d1jllb1, d1jlld1, d1jlld2, d1jlle1 complexed with coa, po4, so4; mutant |
Domain d1jlle2: 1jll E:1-238 [66858] Other proteins in same PDB: d1jlla1, d1jlla2, d1jllb1, d1jlld1, d1jlld2, d1jlle1 complexed with coa, po4, so4; mutant |
Domain d2nu6b2: 2nu6 B:1-238 [148399] Other proteins in same PDB: d2nu6a1, d2nu6a2, d2nu6b1, d2nu6d1, d2nu6d2, d2nu6e1 automated match to d1jkjb2 complexed with coa, so4; mutant |
Domain d2nu6e2: 2nu6 E:1-238 [148403] Other proteins in same PDB: d2nu6a1, d2nu6a2, d2nu6b1, d2nu6d1, d2nu6d2, d2nu6e1 automated match to d1jkjb2 complexed with coa, so4; mutant |
Domain d2nu7b2: 2nu7 B:1-238 [148407] Other proteins in same PDB: d2nu7a1, d2nu7a2, d2nu7b1, d2nu7d1, d2nu7d2, d2nu7e1 automated match to d1jkjb2 complexed with coa, po4, so4; mutant |
Domain d2nu7e2: 2nu7 E:1-238 [148411] Other proteins in same PDB: d2nu7a1, d2nu7a2, d2nu7b1, d2nu7d1, d2nu7d2, d2nu7e1 automated match to d1jkjb2 complexed with coa, po4, so4; mutant |
Domain d2nu8b2: 2nu8 B:1-238 [148415] Other proteins in same PDB: d2nu8a1, d2nu8a2, d2nu8b1, d2nu8d1, d2nu8d2, d2nu8e1 automated match to d1jkjb2 complexed with coa, gol, po4, so4; mutant |
Domain d2nu8e2: 2nu8 E:1-238 [148419] Other proteins in same PDB: d2nu8a1, d2nu8a2, d2nu8b1, d2nu8d1, d2nu8d2, d2nu8e1 automated match to d1jkjb2 complexed with coa, gol, po4, so4; mutant |
Domain d2nu9b2: 2nu9 B:1-238 [148423] Other proteins in same PDB: d2nu9a1, d2nu9a2, d2nu9b1, d2nu9d1, d2nu9d2, d2nu9e1, d2nu9f1, d2nu9f2, d2nu9g1, d2nu9h1, d2nu9h2, d2nu9i1 automated match to d1jkjb2 complexed with coa, so4; mutant |
Domain d2nu9e2: 2nu9 E:1-238 [148427] Other proteins in same PDB: d2nu9a1, d2nu9a2, d2nu9b1, d2nu9d1, d2nu9d2, d2nu9e1, d2nu9f1, d2nu9f2, d2nu9g1, d2nu9h1, d2nu9h2, d2nu9i1 automated match to d1jkjb2 complexed with coa, so4; mutant |
Domain d2nu9g2: 2nu9 G:1-238 [148431] Other proteins in same PDB: d2nu9a1, d2nu9a2, d2nu9b1, d2nu9d1, d2nu9d2, d2nu9e1, d2nu9f1, d2nu9f2, d2nu9g1, d2nu9h1, d2nu9h2, d2nu9i1 automated match to d1jkjb2 complexed with coa, so4; mutant |
Domain d2nu9i2: 2nu9 I:1-238 [148435] Other proteins in same PDB: d2nu9a1, d2nu9a2, d2nu9b1, d2nu9d1, d2nu9d2, d2nu9e1, d2nu9f1, d2nu9f2, d2nu9g1, d2nu9h1, d2nu9h2, d2nu9i1 automated match to d1jkjb2 complexed with coa, so4; mutant |
Domain d2nuab2: 2nua B:1-238 [148439] Other proteins in same PDB: d2nuaa1, d2nuaa2, d2nuab1, d2nuad1, d2nuad2, d2nuae1 automated match to d1jkjb2 complexed with coa, po4, so4; mutant |
Domain d2nuae2: 2nua E:1-238 [148443] Other proteins in same PDB: d2nuaa1, d2nuaa2, d2nuab1, d2nuad1, d2nuad2, d2nuae1 automated match to d1jkjb2 complexed with coa, po4, so4; mutant |
Pig (Sus scrofa) [TaxId:9823] [56084] (6 PDB entries) GTP-specific enzyme |
Domain d1eucb2: 1euc B:0-245 [41570] Other proteins in same PDB: d1euca1, d1euca2, d1eucb1 complexed with po4, so4, zn |
Domain d1eudb2: 1eud B:0-245 [41571] Other proteins in same PDB: d1euda1, d1euda2, d1eudb1 complexed with so4 |
Domain d2fp4b2: 2fp4 B:1-245 [133898] Other proteins in same PDB: d2fp4a1, d2fp4a2, d2fp4b1 automatically matched to d1eucb2 complexed with gtp, k, mg |
Domain d2fpgb2: 2fpg B:1-245 [133903] Other proteins in same PDB: d2fpga1, d2fpga2, d2fpgb1 automatically matched to d1eucb2 complexed with gdp, k, po4 |
Domain d2fpib2: 2fpi B:1-245 [133907] Other proteins in same PDB: d2fpia1, d2fpia2, d2fpib1 automatically matched to d1eucb2 complexed with so4 |
Domain d2fppb2: 2fpp B:1-245 [133918] Other proteins in same PDB: d2fppa1, d2fppa2, d2fppb1 automatically matched to d1eucb2 complexed with cl, so4 |
Timeline for Protein Succinyl-CoA synthetase, beta-chain, N-terminal domain from d.142.1.4: Succinyl-CoA synthetase, beta-chain, N-terminal domain: