Lineage for Species: Cow (Bos taurus) [TaxId: 9913]

  1. Root: SCOP 1.73
  2. 713694Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (334 folds)
  3. 739189Fold d.185: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63410] (1 superfamily)
    core: beta-alpha-beta(2)-alpha(2); 2 layers: alpha/beta
  4. 739190Superfamily d.185.1: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63411] (2 families) (S)
    Share the same "active site motif" HxxEH located in the first core helix, but differ in one of the zinc-binding residues
  5. 739191Family d.185.1.1: MPP-like [63412] (6 proteins)
    Common fold elaborated with many additional structures; duplication: each family member consists of two similar domains of beta(2)-alpha(2)-beta(2)-alpha(5)-beta structure, but only the N-terminal domain of MPP beta chain binds the catalytic metal
  6. 739192Protein Cytochrome bc1 core subunit 1 [63408] (3 species)
  7. 739213Species Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [55997] (18 PDB entries)

PDB entries in Species: Cow (Bos taurus) [TaxId: 9913]:

  1. Domain(s) for 1be3:
    1. 739250Domain d1be3a1: 1be3 A:1-233 [58950]
      Other proteins in same PDB: d1be3b1, d1be3b2, d1be3c2, d1be3c3, d1be3d2, d1be3d3, d1be3e1, d1be3e2, d1be3f_, d1be3g_, d1be3h_, d1be3j_, d1be3k_
    2. 739251Domain d1be3a2: 1be3 A:234-446 [58951]
      Other proteins in same PDB: d1be3b1, d1be3b2, d1be3c2, d1be3c3, d1be3d2, d1be3d3, d1be3e1, d1be3e2, d1be3f_, d1be3g_, d1be3h_, d1be3j_, d1be3k_
      complexed with fes, hec, hem
  2. Domain(s) for 1bgy:
    1. 739252Domain d1bgya1: 1bgy A:1-233 [58954]
      Other proteins in same PDB: d1bgyb1, d1bgyb2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgyn1, d1bgyn2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyv_, d1bgyw_
    2. 739253Domain d1bgya2: 1bgy A:234-446 [58955]
      Other proteins in same PDB: d1bgyb1, d1bgyb2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgyn1, d1bgyn2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyv_, d1bgyw_
    3. 739254Domain d1bgym1: 1bgy M:1-233 [58958]
      Other proteins in same PDB: d1bgyb1, d1bgyb2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgyn1, d1bgyn2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyv_, d1bgyw_
    4. 739255Domain d1bgym2: 1bgy M:234-446 [58959]
      Other proteins in same PDB: d1bgyb1, d1bgyb2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgyn1, d1bgyn2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyv_, d1bgyw_
      complexed with fes, hec, hem
  3. Domain(s) for 1l0l:
    1. 739230Domain d1l0la1: 1l0l A:1-233 [84482]
      Other proteins in same PDB: d1l0lb1, d1l0lb2, d1l0lc1, d1l0lc2, d1l0ld1, d1l0ld2, d1l0le1, d1l0le2, d1l0lf_, d1l0lg_, d1l0lh_, d1l0li_, d1l0lj_, d1l0lk_
    2. 739231Domain d1l0la2: 1l0l A:234-446 [84483]
      Other proteins in same PDB: d1l0lb1, d1l0lb2, d1l0lc1, d1l0lc2, d1l0ld1, d1l0ld2, d1l0le1, d1l0le2, d1l0lf_, d1l0lg_, d1l0lh_, d1l0li_, d1l0lj_, d1l0lk_
      complexed with fes, fmx, hem
  4. Domain(s) for 1l0n:
    1. 739238Domain d1l0na1: 1l0n A:1-233 [84498]
      Other proteins in same PDB: d1l0nb1, d1l0nb2, d1l0nc1, d1l0nc2, d1l0nd1, d1l0nd2, d1l0ne1, d1l0ne2, d1l0nf_, d1l0ng_, d1l0nh_, d1l0ni_, d1l0nj_, d1l0nk_
    2. 739239Domain d1l0na2: 1l0n A:234-446 [84499]
      Other proteins in same PDB: d1l0nb1, d1l0nb2, d1l0nc1, d1l0nc2, d1l0nd1, d1l0nd2, d1l0ne1, d1l0ne2, d1l0nf_, d1l0ng_, d1l0nh_, d1l0ni_, d1l0nj_, d1l0nk_
      complexed with fes, hem
  5. Domain(s) for 1ntk:
    1. 739236Domain d1ntka1: 1ntk A:1-233 [92105]
      Other proteins in same PDB: d1ntkb1, d1ntkb2, d1ntkc1, d1ntkc2, d1ntkd1, d1ntkd2, d1ntke1, d1ntke2, d1ntkf_, d1ntkg_, d1ntkh_, d1ntki_, d1ntkj_, d1ntkk_
    2. 739237Domain d1ntka2: 1ntk A:234-446 [92106]
      Other proteins in same PDB: d1ntkb1, d1ntkb2, d1ntkc1, d1ntkc2, d1ntkd1, d1ntkd2, d1ntke1, d1ntke2, d1ntkf_, d1ntkg_, d1ntkh_, d1ntki_, d1ntkj_, d1ntkk_
      complexed with ay1, fes, hem
  6. Domain(s) for 1ntm:
    1. 739228Domain d1ntma1: 1ntm A:1-233 [92121]
      Other proteins in same PDB: d1ntmb1, d1ntmb2, d1ntmc1, d1ntmc2, d1ntmd1, d1ntmd2, d1ntme1, d1ntme2, d1ntmf_, d1ntmg_, d1ntmh_, d1ntmi_, d1ntmj_, d1ntmk_
    2. 739229Domain d1ntma2: 1ntm A:234-446 [92122]
      Other proteins in same PDB: d1ntmb1, d1ntmb2, d1ntmc1, d1ntmc2, d1ntmd1, d1ntmd2, d1ntme1, d1ntme2, d1ntmf_, d1ntmg_, d1ntmh_, d1ntmi_, d1ntmj_, d1ntmk_
      complexed with fes, hem
  7. Domain(s) for 1ntz:
    1. 739232Domain d1ntza1: 1ntz A:1-233 [92149]
      Other proteins in same PDB: d1ntzb1, d1ntzb2, d1ntzc1, d1ntzc2, d1ntzd1, d1ntzd2, d1ntze1, d1ntze2, d1ntzf_, d1ntzg_, d1ntzh_, d1ntzi_, d1ntzj_, d1ntzk_
    2. 739233Domain d1ntza2: 1ntz A:234-446 [92150]
      Other proteins in same PDB: d1ntzb1, d1ntzb2, d1ntzc1, d1ntzc2, d1ntzd1, d1ntzd2, d1ntze1, d1ntze2, d1ntzf_, d1ntzg_, d1ntzh_, d1ntzi_, d1ntzj_, d1ntzk_
      complexed with fes, hem, uq2
  8. Domain(s) for 1nu1:
    1. 739248Domain d1nu1a1: 1nu1 A:1-233 [92167]
      Other proteins in same PDB: d1nu1b1, d1nu1b2, d1nu1c1, d1nu1c2, d1nu1d1, d1nu1d2, d1nu1e1, d1nu1e2, d1nu1f_, d1nu1g_, d1nu1h_, d1nu1i_, d1nu1j_, d1nu1k_
    2. 739249Domain d1nu1a2: 1nu1 A:234-446 [92168]
      Other proteins in same PDB: d1nu1b1, d1nu1b2, d1nu1c1, d1nu1c2, d1nu1d1, d1nu1d2, d1nu1e1, d1nu1e2, d1nu1f_, d1nu1g_, d1nu1h_, d1nu1i_, d1nu1j_, d1nu1k_
      complexed with fes, hem, qno
  9. Domain(s) for 1pp9:
    1. 739222Domain d1pp9a1: 1pp9 A:1-233 [104222]
      Other proteins in same PDB: d1pp9b1, d1pp9b2, d1pp9c1, d1pp9c2, d1pp9d1, d1pp9d2, d1pp9e1, d1pp9e2, d1pp9f_, d1pp9g_, d1pp9h_, d1pp9i_, d1pp9j_, d1pp9o1, d1pp9o2, d1pp9p1, d1pp9p2, d1pp9q1, d1pp9q2, d1pp9r1, d1pp9r2, d1pp9s_, d1pp9t_, d1pp9u_, d1pp9v_, d1pp9w_
    2. 739223Domain d1pp9a2: 1pp9 A:234-442 [104223]
      Other proteins in same PDB: d1pp9b1, d1pp9b2, d1pp9c1, d1pp9c2, d1pp9d1, d1pp9d2, d1pp9e1, d1pp9e2, d1pp9f_, d1pp9g_, d1pp9h_, d1pp9i_, d1pp9j_, d1pp9o1, d1pp9o2, d1pp9p1, d1pp9p2, d1pp9q1, d1pp9q2, d1pp9r1, d1pp9r2, d1pp9s_, d1pp9t_, d1pp9u_, d1pp9v_, d1pp9w_
    3. 739224Domain d1pp9n1: 1pp9 N:1-233 [104237]
      Other proteins in same PDB: d1pp9b1, d1pp9b2, d1pp9c1, d1pp9c2, d1pp9d1, d1pp9d2, d1pp9e1, d1pp9e2, d1pp9f_, d1pp9g_, d1pp9h_, d1pp9i_, d1pp9j_, d1pp9o1, d1pp9o2, d1pp9p1, d1pp9p2, d1pp9q1, d1pp9q2, d1pp9r1, d1pp9r2, d1pp9s_, d1pp9t_, d1pp9u_, d1pp9v_, d1pp9w_
    4. 739225Domain d1pp9n2: 1pp9 N:234-442 [104238]
      Other proteins in same PDB: d1pp9b1, d1pp9b2, d1pp9c1, d1pp9c2, d1pp9d1, d1pp9d2, d1pp9e1, d1pp9e2, d1pp9f_, d1pp9g_, d1pp9h_, d1pp9i_, d1pp9j_, d1pp9o1, d1pp9o2, d1pp9p1, d1pp9p2, d1pp9q1, d1pp9q2, d1pp9r1, d1pp9r2, d1pp9s_, d1pp9t_, d1pp9u_, d1pp9v_, d1pp9w_
      complexed with azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma, uq
  10. Domain(s) for 1ppj:
    1. 739214Domain d1ppja1: 1ppj A:2-233 [104252]
      Other proteins in same PDB: d1ppjb1, d1ppjb2, d1ppjc1, d1ppjc2, d1ppjd1, d1ppjd2, d1ppje1, d1ppje2, d1ppjf_, d1ppjg_, d1ppjh_, d1ppji_, d1ppjj_, d1ppjo1, d1ppjo2, d1ppjp1, d1ppjp2, d1ppjq1, d1ppjq2, d1ppjr1, d1ppjr2, d1ppjs_, d1ppjt_, d1ppju_, d1ppjv_, d1ppjw_
    2. 739215Domain d1ppja2: 1ppj A:234-442 [104253]
      Other proteins in same PDB: d1ppjb1, d1ppjb2, d1ppjc1, d1ppjc2, d1ppjd1, d1ppjd2, d1ppje1, d1ppje2, d1ppjf_, d1ppjg_, d1ppjh_, d1ppji_, d1ppjj_, d1ppjo1, d1ppjo2, d1ppjp1, d1ppjp2, d1ppjq1, d1ppjq2, d1ppjr1, d1ppjr2, d1ppjs_, d1ppjt_, d1ppju_, d1ppjv_, d1ppjw_
    3. 739216Domain d1ppjn1: 1ppj N:2-233 [104267]
      Other proteins in same PDB: d1ppjb1, d1ppjb2, d1ppjc1, d1ppjc2, d1ppjd1, d1ppjd2, d1ppje1, d1ppje2, d1ppjf_, d1ppjg_, d1ppjh_, d1ppji_, d1ppjj_, d1ppjo1, d1ppjo2, d1ppjp1, d1ppjp2, d1ppjq1, d1ppjq2, d1ppjr1, d1ppjr2, d1ppjs_, d1ppjt_, d1ppju_, d1ppjv_, d1ppjw_
    4. 739217Domain d1ppjn2: 1ppj N:234-442 [104268]
      Other proteins in same PDB: d1ppjb1, d1ppjb2, d1ppjc1, d1ppjc2, d1ppjd1, d1ppjd2, d1ppje1, d1ppje2, d1ppjf_, d1ppjg_, d1ppjh_, d1ppji_, d1ppjj_, d1ppjo1, d1ppjo2, d1ppjp1, d1ppjp2, d1ppjq1, d1ppjq2, d1ppjr1, d1ppjr2, d1ppjs_, d1ppjt_, d1ppju_, d1ppjv_, d1ppjw_
      complexed with any, azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma
  11. Domain(s) for 1qcr:
    1. 739256Domain d1qcra1: 1qcr A:1-233 [59025]
      Other proteins in same PDB: d1qcrb1, d1qcrb2, d1qcrc2, d1qcrc3, d1qcrd2, d1qcrd3, d1qcre1, d1qcre2, d1qcrf_, d1qcrg_, d1qcrh_, d1qcrj_, d1qcrk_
    2. 739257Domain d1qcra2: 1qcr A:234-446 [59026]
      Other proteins in same PDB: d1qcrb1, d1qcrb2, d1qcrc2, d1qcrc3, d1qcrd2, d1qcrd3, d1qcre1, d1qcre2, d1qcrf_, d1qcrg_, d1qcrh_, d1qcrj_, d1qcrk_
      complexed with hem
  12. Domain(s) for 1sqb:
    1. 739240Domain d1sqba1: 1sqb A:1-233 [105890]
      Other proteins in same PDB: d1sqbb1, d1sqbb2, d1sqbc1, d1sqbc2, d1sqbd1, d1sqbd2, d1sqbe1, d1sqbe2, d1sqbf_, d1sqbg_, d1sqbh_, d1sqbi_, d1sqbj_, d1sqbk_
    2. 739241Domain d1sqba2: 1sqb A:234-446 [105891]
      Other proteins in same PDB: d1sqbb1, d1sqbb2, d1sqbc1, d1sqbc2, d1sqbd1, d1sqbd2, d1sqbe1, d1sqbe2, d1sqbf_, d1sqbg_, d1sqbh_, d1sqbi_, d1sqbj_, d1sqbk_
      complexed with azo, fes, hem
  13. Domain(s) for 1sqp:
    1. 739244Domain d1sqpa1: 1sqp A:1-233 [118995]
      Other proteins in same PDB: d1sqpb1, d1sqpb2, d1sqpc1, d1sqpc2, d1sqpd1, d1sqpd2, d1sqpg1, d1sqph1, d1sqpi1, d1sqpj1
      automatically matched to d1be3a1
      complexed with cdl, fes, hem, myx, pee, plx
    2. 739245Domain d1sqpa2: 1sqp A:234-446 [118996]
      Other proteins in same PDB: d1sqpb1, d1sqpb2, d1sqpc1, d1sqpc2, d1sqpd1, d1sqpd2, d1sqpg1, d1sqph1, d1sqpi1, d1sqpj1
      automatically matched to d1be3a2
      complexed with cdl, fes, hem, myx, pee, plx
  14. Domain(s) for 1sqq:
    1. 739246Domain d1sqqa1: 1sqq A:1-233 [119007]
      Other proteins in same PDB: d1sqqb1, d1sqqb2, d1sqqc1, d1sqqc2, d1sqqd1, d1sqqd2, d1sqqf1, d1sqqg1, d1sqqh1, d1sqqi1, d1sqqj1
      automatically matched to d1be3a1
      complexed with fes, hem, ost, uq2
    2. 739247Domain d1sqqa2: 1sqq A:234-446 [119008]
      Other proteins in same PDB: d1sqqb1, d1sqqb2, d1sqqc1, d1sqqc2, d1sqqd1, d1sqqd2, d1sqqf1, d1sqqg1, d1sqqh1, d1sqqi1, d1sqqj1
      automatically matched to d1be3a2
      complexed with fes, hem, ost, uq2
  15. Domain(s) for 1sqv:
    1. 739242Domain d1sqva1: 1sqv A:1-233 [119020]
      Other proteins in same PDB: d1sqvb1, d1sqvb2, d1sqvc1, d1sqvc2, d1sqvd1, d1sqvd2, d1sqvf1, d1sqvg1, d1sqvh1, d1sqvi1, d1sqvj1
      automatically matched to d1be3a1
      complexed with fes, hem, uhd, uq2
    2. 739243Domain d1sqva2: 1sqv A:234-446 [119021]
      Other proteins in same PDB: d1sqvb1, d1sqvb2, d1sqvc1, d1sqvc2, d1sqvd1, d1sqvd2, d1sqvf1, d1sqvg1, d1sqvh1, d1sqvi1, d1sqvj1
      automatically matched to d1be3a2
      complexed with fes, hem, uhd, uq2
  16. Domain(s) for 1sqx:
    1. 739234Domain d1sqxa1: 1sqx A:1-233 [119035]
      Other proteins in same PDB: d1sqxb1, d1sqxb2, d1sqxc1, d1sqxc2, d1sqxd1, d1sqxd2, d1sqxf1, d1sqxg1, d1sqxh1, d1sqxi1, d1sqxj1
      automatically matched to d1be3a1
      complexed with fes, hem, sma, uq2
    2. 739235Domain d1sqxa2: 1sqx A:234-446 [119036]
      Other proteins in same PDB: d1sqxb1, d1sqxb2, d1sqxc1, d1sqxc2, d1sqxd1, d1sqxd2, d1sqxf1, d1sqxg1, d1sqxh1, d1sqxi1, d1sqxj1
      automatically matched to d1be3a2
      complexed with fes, hem, sma, uq2
  17. Domain(s) for 2a06:
    1. 739218Domain d2a06a1: 2a06 A:1-233 [125919]
      Other proteins in same PDB: d2a06b1, d2a06b2, d2a06d1, d2a06d2, d2a06f1, d2a06g1, d2a06h1, d2a06o1, d2a06o2, d2a06q1, d2a06q2, d2a06s1, d2a06t1, d2a06u1, d2a06w1
      automatically matched to d1be3a1
      complexed with azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma, unl, uq
    2. 739219Domain d2a06a2: 2a06 A:234-443 [125920]
      Other proteins in same PDB: d2a06b1, d2a06b2, d2a06d1, d2a06d2, d2a06f1, d2a06g1, d2a06h1, d2a06o1, d2a06o2, d2a06q1, d2a06q2, d2a06s1, d2a06t1, d2a06u1, d2a06w1
      automatically matched to d1be3a2
      complexed with azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma, unl, uq
    3. 739220Domain d2a06n1: 2a06 N:1-233 [125928]
      Other proteins in same PDB: d2a06b1, d2a06b2, d2a06d1, d2a06d2, d2a06f1, d2a06g1, d2a06h1, d2a06o1, d2a06o2, d2a06q1, d2a06q2, d2a06s1, d2a06t1, d2a06u1, d2a06w1
      automatically matched to d1be3a1
      complexed with azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma, unl, uq
    4. 739221Domain d2a06n2: 2a06 N:234-443 [125929]
      Other proteins in same PDB: d2a06b1, d2a06b2, d2a06d1, d2a06d2, d2a06f1, d2a06g1, d2a06h1, d2a06o1, d2a06o2, d2a06q1, d2a06q2, d2a06s1, d2a06t1, d2a06u1, d2a06w1
      automatically matched to d1be3a2
      complexed with azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma, unl, uq
  18. Domain(s) for 2fyu:
    1. 739226Domain d2fyua1: 2fyu A:1-233 [134392]
      Other proteins in same PDB: d2fyub1, d2fyub2, d2fyuc1, d2fyuc2, d2fyud1, d2fyud2, d2fyuf1, d2fyug1, d2fyuh1, d2fyui1, d2fyuj1
      automatically matched to d1be3a1
      complexed with fdn, fes, hem
    2. 739227Domain d2fyua2: 2fyu A:234-446 [134393]
      Other proteins in same PDB: d2fyub1, d2fyub2, d2fyuc1, d2fyuc2, d2fyud1, d2fyud2, d2fyuf1, d2fyug1, d2fyuh1, d2fyui1, d2fyuj1
      automatically matched to d1be3a2
      complexed with fdn, fes, hem

More info for Species Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] from d.185.1.1 Cytochrome bc1 core subunit 1

Timeline for Species Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] from d.185.1.1 Cytochrome bc1 core subunit 1: