Lineage for Species: Thermus aquaticus [TaxId: 271]

  1. Root: SCOP 1.73
  2. 713694Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (334 folds)
  3. 727888Fold d.81: FwdE/GAPDH domain-like [55346] (3 superfamilies)
    core: alpha-beta-alpha-beta(3); mixed sheet: 2134, strand 2 is parallel to strand 1
  4. 727889Superfamily d.81.1: Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, C-terminal domain [55347] (5 families) (S)
    N-terminal domain is the classic Rossmann-fold
  5. 727890Family d.81.1.1: GAPDH-like [55348] (6 proteins)
    has many additional secondary structures
  6. 727944Protein Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) [55349] (19 species)
  7. 728125Species Thermus aquaticus [TaxId:271] [55352] (2 PDB entries)

PDB entries in Species: Thermus aquaticus [TaxId: 271]:

  1. Domain(s) for 1cer:
    1. 728134Domain d1cera2: 1cer A:149-312 [118443]
      Other proteins in same PDB: d1cera1, d1cerb1, d1cerc1, d1cerd1, d1cero1, d1cerp1, d1cerq1, d1cerr1
      duplicate of 1CER O:149-312
      complexed with nad
    2. 728135Domain d1cerb2: 1cer B:149-312 [118445]
      Other proteins in same PDB: d1cera1, d1cerb1, d1cerc1, d1cerd1, d1cero1, d1cerp1, d1cerq1, d1cerr1
      duplicate of 1CER O:149-312
      complexed with nad
    3. 728136Domain d1cerc2: 1cer C:149-312 [118447]
      Other proteins in same PDB: d1cera1, d1cerb1, d1cerc1, d1cerd1, d1cero1, d1cerp1, d1cerq1, d1cerr1
      duplicate of 1CER O:149-312
      complexed with nad
    4. 728137Domain d1cerd2: 1cer D:149-312 [118449]
      Other proteins in same PDB: d1cera1, d1cerb1, d1cerc1, d1cerd1, d1cero1, d1cerp1, d1cerq1, d1cerr1
      duplicate of 1CER O:149-312
      complexed with nad
    5. 728138Domain d1cero2: 1cer O:149-312 [39901]
      Other proteins in same PDB: d1cera1, d1cerb1, d1cerc1, d1cerd1, d1cero1, d1cerp1, d1cerq1, d1cerr1
    6. 728139Domain d1cerp2: 1cer P:149-312 [39903]
      Other proteins in same PDB: d1cera1, d1cerb1, d1cerc1, d1cerd1, d1cero1, d1cerp1, d1cerq1, d1cerr1
    7. 728140Domain d1cerq2: 1cer Q:149-312 [39902]
      Other proteins in same PDB: d1cera1, d1cerb1, d1cerc1, d1cerd1, d1cero1, d1cerp1, d1cerq1, d1cerr1
    8. 728141Domain d1cerr2: 1cer R:149-312 [39904]
      Other proteins in same PDB: d1cera1, d1cerb1, d1cerc1, d1cerd1, d1cero1, d1cerp1, d1cerq1, d1cerr1
      complexed with nad
  2. Domain(s) for 2g82:
    1. 728126Domain d2g82a2: 2g82 A:149-310 [134747]
      Other proteins in same PDB: d2g82a1, d2g82b1, d2g82c1, d2g82d1, d2g82o1, d2g82p1, d2g82q1, d2g82r1
      automatically matched to d1cero2
      complexed with gol, ipa, na, nad, pge
    2. 728127Domain d2g82b2: 2g82 B:149-310 [134749]
      Other proteins in same PDB: d2g82a1, d2g82b1, d2g82c1, d2g82d1, d2g82o1, d2g82p1, d2g82q1, d2g82r1
      automatically matched to d1cero2
      complexed with gol, ipa, na, nad, pge
    3. 728128Domain d2g82c2: 2g82 C:149-310 [134751]
      Other proteins in same PDB: d2g82a1, d2g82b1, d2g82c1, d2g82d1, d2g82o1, d2g82p1, d2g82q1, d2g82r1
      automatically matched to d1cero2
      complexed with gol, ipa, na, nad, pge
    4. 728129Domain d2g82d2: 2g82 D:149-310 [134753]
      Other proteins in same PDB: d2g82a1, d2g82b1, d2g82c1, d2g82d1, d2g82o1, d2g82p1, d2g82q1, d2g82r1
      automatically matched to d1cero2
      complexed with gol, ipa, na, nad, pge
    5. 728130Domain d2g82o2: 2g82 O:149-310 [134755]
      Other proteins in same PDB: d2g82a1, d2g82b1, d2g82c1, d2g82d1, d2g82o1, d2g82p1, d2g82q1, d2g82r1
      automatically matched to d1cero2
      complexed with gol, ipa, na, nad, pge
    6. 728131Domain d2g82p2: 2g82 P:149-310 [134757]
      Other proteins in same PDB: d2g82a1, d2g82b1, d2g82c1, d2g82d1, d2g82o1, d2g82p1, d2g82q1, d2g82r1
      automatically matched to d1cero2
      complexed with gol, ipa, na, nad, pge
    7. 728132Domain d2g82q2: 2g82 Q:149-310 [134759]
      Other proteins in same PDB: d2g82a1, d2g82b1, d2g82c1, d2g82d1, d2g82o1, d2g82p1, d2g82q1, d2g82r1
      automatically matched to d1cero2
      complexed with gol, ipa, na, nad, pge
    8. 728133Domain d2g82r2: 2g82 R:149-310 [134761]
      Other proteins in same PDB: d2g82a1, d2g82b1, d2g82c1, d2g82d1, d2g82o1, d2g82p1, d2g82q1, d2g82r1
      automatically matched to d1cero2
      complexed with gol, ipa, na, nad, pge

More info for Species Thermus aquaticus [TaxId:271] from d.81.1.1 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH)

Timeline for Species Thermus aquaticus [TaxId:271] from d.81.1.1 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH):