Lineage for Protein: RNA polymerase alpha

  1. Root: SCOP 1.73
  2. 713694Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (334 folds)
  3. 726910Fold d.74: DCoH-like [55247] (4 superfamilies)
    beta(2)-alpha-beta(2)-alpha; 2 layers, alpha/beta
  4. 726990Superfamily d.74.3: RBP11-like subunits of RNA polymerase [55257] (2 families) (S)
    form homo and heterodimers
  5. 726991Family d.74.3.1: RNA polymerase alpha subunit dimerisation domain [55258] (2 proteins)
  6. 726992Protein RNA polymerase alpha [55259] (3 species)

Species:

  1. 726993Escherichia coli [TaxId:562] [55260] (1 PDB entry)
  2. 726998Thermus aquaticus [TaxId:271] [64314] (4 PDB entries)
    1. Domains for 1i6v:
      1. 727003Domain d1i6va1: 1i6v A:6-49,A:173-229 [61852]
        Other proteins in same PDB: d1i6va2, d1i6vb2, d1i6vc_, d1i6vd_, d1i6ve_
      2. 727004Domain d1i6vb1: 1i6v B:3-49,B:173-232 [61854]
        Other proteins in same PDB: d1i6va2, d1i6vb2, d1i6vc_, d1i6vd_, d1i6ve_
        complexed with mg, rfp, zn
    2. Domains for 1ynj:
      1. 726999Domain d1ynja1: 1ynj A:6-49,A:173-231 [123737]
        Other proteins in same PDB: d1ynja2, d1ynjb2, d1ynjk1
        automatically matched to d1i6vb1
        complexed with srn, zn
      2. 727000Domain d1ynjb1: 1ynj B:6-49,B:173-228 [123739]
        Other proteins in same PDB: d1ynja2, d1ynjb2, d1ynjk1
        automatically matched to d1i6vb1
        complexed with srn, zn
    3. Domains for 1ynn:
      1. 727001Domain d1ynna1: 1ynn A:6-49,A:173-231 [123742]
        Other proteins in same PDB: d1ynna2, d1ynnb2, d1ynnk1
        automatically matched to d1i6vb1
        complexed with rfp, zn
      2. 727002Domain d1ynnb1: 1ynn B:6-49,B:173-228 [123744]
        Other proteins in same PDB: d1ynna2, d1ynnb2, d1ynnk1
        automatically matched to d1i6vb1
        complexed with rfp, zn
    4. Domains for 2gho:
      1. 727005Domain d2ghoa1: 2gho A:6-49,A:173-231 [135180]
        Other proteins in same PDB: d2ghoa2, d2ghob2
        automatically matched to d1i6vb1
      2. 727006Domain d2ghob1: 2gho B:6-49,B:173-228 [135182]
        Other proteins in same PDB: d2ghoa2, d2ghob2
        automatically matched to d1i6vb1
  3. 727007Thermus thermophilus [TaxId:274] [75478] (9 PDB entries)
    1. Domains for 1iw7:
      1. 727028Domain d1iw7a1: 1iw7 A:1-49,A:173-229 [71470]
        Other proteins in same PDB: d1iw7a2, d1iw7b2, d1iw7c_, d1iw7d_, d1iw7e_, d1iw7f1, d1iw7f2, d1iw7f3, d1iw7k2, d1iw7l2, d1iw7m_, d1iw7n_, d1iw7o_, d1iw7p1, d1iw7p2, d1iw7p3
      2. 727029Domain d1iw7b1: 1iw7 B:1-49,B:173-229 [71472]
        Other proteins in same PDB: d1iw7a2, d1iw7b2, d1iw7c_, d1iw7d_, d1iw7e_, d1iw7f1, d1iw7f2, d1iw7f3, d1iw7k2, d1iw7l2, d1iw7m_, d1iw7n_, d1iw7o_, d1iw7p1, d1iw7p2, d1iw7p3
      3. 727030Domain d1iw7k1: 1iw7 K:1-49,K:173-229 [71478]
        Other proteins in same PDB: d1iw7a2, d1iw7b2, d1iw7c_, d1iw7d_, d1iw7e_, d1iw7f1, d1iw7f2, d1iw7f3, d1iw7k2, d1iw7l2, d1iw7m_, d1iw7n_, d1iw7o_, d1iw7p1, d1iw7p2, d1iw7p3
      4. 727031Domain d1iw7l1: 1iw7 L:1-49,L:173-229 [71480]
        Other proteins in same PDB: d1iw7a2, d1iw7b2, d1iw7c_, d1iw7d_, d1iw7e_, d1iw7f1, d1iw7f2, d1iw7f3, d1iw7k2, d1iw7l2, d1iw7m_, d1iw7n_, d1iw7o_, d1iw7p1, d1iw7p2, d1iw7p3
        complexed with mg, pb
    2. Domains for 1smy:
      1. 727016Domain d1smya1: 1smy A:1-49,A:173-229 [105774]
        Other proteins in same PDB: d1smya2, d1smyb2, d1smyc_, d1smyd_, d1smye_, d1smyf1, d1smyf2, d1smyf3, d1smyk2, d1smyl2, d1smym_, d1smyn_, d1smyo_, d1smyp1, d1smyp2, d1smyp3
      2. 727017Domain d1smyb1: 1smy B:1-49,B:173-229 [105776]
        Other proteins in same PDB: d1smya2, d1smyb2, d1smyc_, d1smyd_, d1smye_, d1smyf1, d1smyf2, d1smyf3, d1smyk2, d1smyl2, d1smym_, d1smyn_, d1smyo_, d1smyp1, d1smyp2, d1smyp3
      3. 727018Domain d1smyk1: 1smy K:1-49,K:173-229 [105784]
        Other proteins in same PDB: d1smya2, d1smyb2, d1smyc_, d1smyd_, d1smye_, d1smyf1, d1smyf2, d1smyf3, d1smyk2, d1smyl2, d1smym_, d1smyn_, d1smyo_, d1smyp1, d1smyp2, d1smyp3
      4. 727019Domain d1smyl1: 1smy L:1-49,L:173-229 [105786]
        Other proteins in same PDB: d1smya2, d1smyb2, d1smyc_, d1smyd_, d1smye_, d1smyf1, d1smyf2, d1smyf3, d1smyk2, d1smyl2, d1smym_, d1smyn_, d1smyo_, d1smyp1, d1smyp2, d1smyp3
        complexed with g4p, mg, zn
    3. Domains for 1zyr:
      1. 727036Domain d1zyra1: 1zyr A:1-49,A:173-229 [125849]
        Other proteins in same PDB: d1zyra2, d1zyrb2, d1zyrc1, d1zyrd1, d1zyre1, d1zyrf1, d1zyrf2, d1zyrf3, d1zyrk2, d1zyrl2, d1zyrm1, d1zyrn1, d1zyro1, d1zyrp1, d1zyrp2, d1zyrp3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, std, zn
      2. 727037Domain d1zyrb1: 1zyr B:1-49,B:173-229 [125851]
        Other proteins in same PDB: d1zyra2, d1zyrb2, d1zyrc1, d1zyrd1, d1zyre1, d1zyrf1, d1zyrf2, d1zyrf3, d1zyrk2, d1zyrl2, d1zyrm1, d1zyrn1, d1zyro1, d1zyrp1, d1zyrp2, d1zyrp3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, std, zn
      3. 727038Domain d1zyrk1: 1zyr K:1-49,K:173-229 [125859]
        Other proteins in same PDB: d1zyra2, d1zyrb2, d1zyrc1, d1zyrd1, d1zyre1, d1zyrf1, d1zyrf2, d1zyrf3, d1zyrk2, d1zyrl2, d1zyrm1, d1zyrn1, d1zyro1, d1zyrp1, d1zyrp2, d1zyrp3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, std, zn
      4. 727039Domain d1zyrl1: 1zyr L:1-49,L:173-229 [125861]
        Other proteins in same PDB: d1zyra2, d1zyrb2, d1zyrc1, d1zyrd1, d1zyre1, d1zyrf1, d1zyrf2, d1zyrf3, d1zyrk2, d1zyrl2, d1zyrm1, d1zyrn1, d1zyro1, d1zyrp1, d1zyrp2, d1zyrp3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, std, zn
    4. Domains for 2a68:
      1. 727020Domain d2a68a1: 2a68 A:1-49,A:173-229 [126191]
        Other proteins in same PDB: d2a68a2, d2a68b2, d2a68c1, d2a68d1, d2a68e1, d2a68f1, d2a68f2, d2a68f3, d2a68k2, d2a68l2, d2a68m1, d2a68n1, d2a68o1, d2a68p1, d2a68p2, d2a68p3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, rbt, zn
      2. 727021Domain d2a68b1: 2a68 B:1-49,B:173-229 [126193]
        Other proteins in same PDB: d2a68a2, d2a68b2, d2a68c1, d2a68d1, d2a68e1, d2a68f1, d2a68f2, d2a68f3, d2a68k2, d2a68l2, d2a68m1, d2a68n1, d2a68o1, d2a68p1, d2a68p2, d2a68p3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, rbt, zn
      3. 727022Domain d2a68k1: 2a68 K:1-49,K:173-229 [126201]
        Other proteins in same PDB: d2a68a2, d2a68b2, d2a68c1, d2a68d1, d2a68e1, d2a68f1, d2a68f2, d2a68f3, d2a68k2, d2a68l2, d2a68m1, d2a68n1, d2a68o1, d2a68p1, d2a68p2, d2a68p3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, rbt, zn
      4. 727023Domain d2a68l1: 2a68 L:1-49,L:173-229 [126203]
        Other proteins in same PDB: d2a68a2, d2a68b2, d2a68c1, d2a68d1, d2a68e1, d2a68f1, d2a68f2, d2a68f3, d2a68k2, d2a68l2, d2a68m1, d2a68n1, d2a68o1, d2a68p1, d2a68p2, d2a68p3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, rbt, zn
    5. Domains for 2a69:
      1. 727008Domain d2a69a1: 2a69 A:1-49,A:173-229 [126211]
        Other proteins in same PDB: d2a69a2, d2a69b2, d2a69c1, d2a69d1, d2a69e1, d2a69f1, d2a69f2, d2a69f3, d2a69k2, d2a69l2, d2a69m1, d2a69n1, d2a69o1, d2a69p1, d2a69p2, d2a69p3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, rpt, zn
      2. 727009Domain d2a69b1: 2a69 B:1-49,B:173-229 [126213]
        Other proteins in same PDB: d2a69a2, d2a69b2, d2a69c1, d2a69d1, d2a69e1, d2a69f1, d2a69f2, d2a69f3, d2a69k2, d2a69l2, d2a69m1, d2a69n1, d2a69o1, d2a69p1, d2a69p2, d2a69p3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, rpt, zn
      3. 727010Domain d2a69k1: 2a69 K:1-49,K:173-229 [126221]
        Other proteins in same PDB: d2a69a2, d2a69b2, d2a69c1, d2a69d1, d2a69e1, d2a69f1, d2a69f2, d2a69f3, d2a69k2, d2a69l2, d2a69m1, d2a69n1, d2a69o1, d2a69p1, d2a69p2, d2a69p3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, rpt, zn
      4. 727011Domain d2a69l1: 2a69 L:1-49,L:173-229 [126223]
        Other proteins in same PDB: d2a69a2, d2a69b2, d2a69c1, d2a69d1, d2a69e1, d2a69f1, d2a69f2, d2a69f3, d2a69k2, d2a69l2, d2a69m1, d2a69n1, d2a69o1, d2a69p1, d2a69p2, d2a69p3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, rpt, zn
    6. Domains for 2a6e:
      1. 727032Domain d2a6ea1: 2a6e A:1-49,A:173-229 [126240]
        Other proteins in same PDB: d2a6ea2, d2a6eb2, d2a6ec1, d2a6ed1, d2a6ee1, d2a6ef1, d2a6ef2, d2a6ef3, d2a6ek2, d2a6el2, d2a6em1, d2a6en1, d2a6eo1, d2a6ep1, d2a6ep2, d2a6ep3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, zn
      2. 727033Domain d2a6eb1: 2a6e B:1-49,B:173-229 [126242]
        Other proteins in same PDB: d2a6ea2, d2a6eb2, d2a6ec1, d2a6ed1, d2a6ee1, d2a6ef1, d2a6ef2, d2a6ef3, d2a6ek2, d2a6el2, d2a6em1, d2a6en1, d2a6eo1, d2a6ep1, d2a6ep2, d2a6ep3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, zn
      3. 727034Domain d2a6ek1: 2a6e K:1-49,K:173-229 [126250]
        Other proteins in same PDB: d2a6ea2, d2a6eb2, d2a6ec1, d2a6ed1, d2a6ee1, d2a6ef1, d2a6ef2, d2a6ef3, d2a6ek2, d2a6el2, d2a6em1, d2a6en1, d2a6eo1, d2a6ep1, d2a6ep2, d2a6ep3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, zn
      4. 727035Domain d2a6el1: 2a6e L:1-49,L:173-229 [126252]
        Other proteins in same PDB: d2a6ea2, d2a6eb2, d2a6ec1, d2a6ed1, d2a6ee1, d2a6ef1, d2a6ef2, d2a6ef3, d2a6ek2, d2a6el2, d2a6em1, d2a6en1, d2a6eo1, d2a6ep1, d2a6ep2, d2a6ep3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, zn
    7. Domains for 2a6h:
      1. 727012Domain d2a6ha1: 2a6h A:1-49,A:173-229 [126260]
        Other proteins in same PDB: d2a6ha2, d2a6hb2, d2a6hc1, d2a6hd1, d2a6he1, d2a6hf1, d2a6hf2, d2a6hf3, d2a6hk2, d2a6hl2, d2a6hm1, d2a6hn1, d2a6ho1, d2a6hp1, d2a6hp2, d2a6hp3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, std, zn
      2. 727013Domain d2a6hb1: 2a6h B:1-49,B:173-229 [126262]
        Other proteins in same PDB: d2a6ha2, d2a6hb2, d2a6hc1, d2a6hd1, d2a6he1, d2a6hf1, d2a6hf2, d2a6hf3, d2a6hk2, d2a6hl2, d2a6hm1, d2a6hn1, d2a6ho1, d2a6hp1, d2a6hp2, d2a6hp3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, std, zn
      3. 727014Domain d2a6hk1: 2a6h K:1-49,K:173-229 [126270]
        Other proteins in same PDB: d2a6ha2, d2a6hb2, d2a6hc1, d2a6hd1, d2a6he1, d2a6hf1, d2a6hf2, d2a6hf3, d2a6hk2, d2a6hl2, d2a6hm1, d2a6hn1, d2a6ho1, d2a6hp1, d2a6hp2, d2a6hp3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, std, zn
      4. 727015Domain d2a6hl1: 2a6h L:1-49,L:173-229 [126272]
        Other proteins in same PDB: d2a6ha2, d2a6hb2, d2a6hc1, d2a6hd1, d2a6he1, d2a6hf1, d2a6hf2, d2a6hf3, d2a6hk2, d2a6hl2, d2a6hm1, d2a6hn1, d2a6ho1, d2a6hp1, d2a6hp2, d2a6hp3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, std, zn
    8. Domains for 2be5:
      1. 727024Domain d2be5a1: 2be5 A:1-49,A:173-229 [128351]
        Other proteins in same PDB: d2be5a2, d2be5b2, d2be5c1, d2be5d1, d2be5e1, d2be5f1, d2be5f2, d2be5f3, d2be5k2, d2be5l2, d2be5m1, d2be5n1, d2be5o1, d2be5p1, d2be5p2, d2be5p3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, tgt, zn
      2. 727025Domain d2be5b1: 2be5 B:1-49,B:173-229 [128353]
        Other proteins in same PDB: d2be5a2, d2be5b2, d2be5c1, d2be5d1, d2be5e1, d2be5f1, d2be5f2, d2be5f3, d2be5k2, d2be5l2, d2be5m1, d2be5n1, d2be5o1, d2be5p1, d2be5p2, d2be5p3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, tgt, zn
      3. 727026Domain d2be5k1: 2be5 K:1-49,K:173-229 [128361]
        Other proteins in same PDB: d2be5a2, d2be5b2, d2be5c1, d2be5d1, d2be5e1, d2be5f1, d2be5f2, d2be5f3, d2be5k2, d2be5l2, d2be5m1, d2be5n1, d2be5o1, d2be5p1, d2be5p2, d2be5p3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, tgt, zn
      4. 727027Domain d2be5l1: 2be5 L:1-49,L:173-229 [128363]
        Other proteins in same PDB: d2be5a2, d2be5b2, d2be5c1, d2be5d1, d2be5e1, d2be5f1, d2be5f2, d2be5f3, d2be5k2, d2be5l2, d2be5m1, d2be5n1, d2be5o1, d2be5p1, d2be5p2, d2be5p3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, tgt, zn
    9. Domains for 2cw0:
      1. 727040Domain d2cw0a1: 2cw0 A:1-49,A:173-229 [130898]
        Other proteins in same PDB: d2cw0a2, d2cw0b2, d2cw0c1, d2cw0d1, d2cw0e1, d2cw0f1, d2cw0f2, d2cw0f3, d2cw0k2, d2cw0l2, d2cw0m1, d2cw0n1, d2cw0o1, d2cw0p1, d2cw0p2, d2cw0p3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, zn
      2. 727041Domain d2cw0b1: 2cw0 B:1-49,B:173-229 [130900]
        Other proteins in same PDB: d2cw0a2, d2cw0b2, d2cw0c1, d2cw0d1, d2cw0e1, d2cw0f1, d2cw0f2, d2cw0f3, d2cw0k2, d2cw0l2, d2cw0m1, d2cw0n1, d2cw0o1, d2cw0p1, d2cw0p2, d2cw0p3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, zn
      3. 727042Domain d2cw0k1: 2cw0 K:1-49,K:173-229 [130908]
        Other proteins in same PDB: d2cw0a2, d2cw0b2, d2cw0c1, d2cw0d1, d2cw0e1, d2cw0f1, d2cw0f2, d2cw0f3, d2cw0k2, d2cw0l2, d2cw0m1, d2cw0n1, d2cw0o1, d2cw0p1, d2cw0p2, d2cw0p3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, zn
      4. 727043Domain d2cw0l1: 2cw0 L:1-49,L:173-229 [130910]
        Other proteins in same PDB: d2cw0a2, d2cw0b2, d2cw0c1, d2cw0d1, d2cw0e1, d2cw0f1, d2cw0f2, d2cw0f3, d2cw0k2, d2cw0l2, d2cw0m1, d2cw0n1, d2cw0o1, d2cw0p1, d2cw0p2, d2cw0p3
        automatically matched to d1iw7a1
        complexed with mg, zn

More info for Protein RNA polymerase alpha from d.74.3.1: RNA polymerase alpha subunit dimerisation domain

Timeline for Protein RNA polymerase alpha from d.74.3.1: RNA polymerase alpha subunit dimerisation domain: