SCOP 1.55: Protein: Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase

Lineage for Protein: Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase

Root: SCOP 1.55
Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (184 folds)
Fold d.73: RuBisCO, small subunit [55238] (1 superfamily)
Superfamily d.73.1: RuBisCO, small subunit [55239] (1 family)
Family d.73.1.1: RuBisCO, small subunit [55240] (1 protein)
Protein Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase [55241] (5 species)

Species:

Alcaligenes eutrophus [TaxId:106590] [55245] (1 PDB entry)
- Domains for 1bxn:
  1. Domain d1bxni_: 1bxn I: [39666]
    Other proteins in same PDB: d1bxna1, d1bxna2, d1bxnc1, d1bxnc2, d1bxne1, d1bxne2, d1bxng1, d1bxng2
  2. Domain d1bxnj_: 1bxn J: [39667]
    Other proteins in same PDB: d1bxna1, d1bxna2, d1bxnc1, d1bxnc2, d1bxne1, d1bxne2, d1bxng1, d1bxng2
  3. Domain d1bxnk_: 1bxn K: [39668]
    Other proteins in same PDB: d1bxna1, d1bxna2, d1bxnc1, d1bxnc2, d1bxne1, d1bxne2, d1bxng1, d1bxng2
  4. Domain d1bxnl_: 1bxn L: [39669]
    Other proteins in same PDB: d1bxna1, d1bxna2, d1bxnc1, d1bxnc2, d1bxne1, d1bxne2, d1bxng1, d1bxng2
Galdieria partita [TaxId:83374] [55244] (1 PDB entry)
- Domains for 1bwv:
  1. Domain d1bwvs_: 1bwv S: [39662]
    Other proteins in same PDB: d1bwva1, d1bwva2, d1bwvc1, d1bwvc2, d1bwve1, d1bwve2, d1bwvg1, d1bwvg2
  2. Domain d1bwvu_: 1bwv U: [39663]
    Other proteins in same PDB: d1bwva1, d1bwva2, d1bwvc1, d1bwvc2, d1bwve1, d1bwve2, d1bwvg1, d1bwvg2
  3. Domain d1bwvw_: 1bwv W: [39664]
    Other proteins in same PDB: d1bwva1, d1bwva2, d1bwvc1, d1bwvc2, d1bwve1, d1bwve2, d1bwvg1, d1bwvg2
  4. Domain d1bwvy_: 1bwv Y: [39665]
    Other proteins in same PDB: d1bwva1, d1bwva2, d1bwvc1, d1bwvc2, d1bwve1, d1bwve2, d1bwvg1, d1bwvg2

Spinach (Spinacia oleracea) [TaxId:3562] [55243] (8 PDB entries)

Domains for 1aa1:
1. Domain d1aa1c_: 1aa1 C: [39638]
  Other proteins in same PDB: d1aa1b1, d1aa1b2, d1aa1e1, d1aa1e2, d1aa1h1, d1aa1h2, d1aa1l1, d1aa1l2
2. Domain d1aa1f_: 1aa1 F: [39639]
  Other proteins in same PDB: d1aa1b1, d1aa1b2, d1aa1e1, d1aa1e2, d1aa1h1, d1aa1h2, d1aa1l1, d1aa1l2
3. Domain d1aa1i_: 1aa1 I: [39640]
  Other proteins in same PDB: d1aa1b1, d1aa1b2, d1aa1e1, d1aa1e2, d1aa1h1, d1aa1h2, d1aa1l1, d1aa1l2
4. Domain d1aa1s_: 1aa1 S: [39637]
  Other proteins in same PDB: d1aa1b1, d1aa1b2, d1aa1e1, d1aa1e2, d1aa1h1, d1aa1h2, d1aa1l1, d1aa1l2
Domain for 1aus:
- Domain d1auss_: 1aus S: [39645]
  Other proteins in same PDB: d1ausl1, d1ausl2
Domains for 1bur:
1. Domain d1burs_: 1bur S: [39625]
  Other proteins in same PDB: d1bura1, d1bura2, d1burb1, d1burb2, d1burc1, d1burc2, d1burd1, d1burd2
2. Domain d1burt_: 1bur T: [39626]
  Other proteins in same PDB: d1bura1, d1bura2, d1burb1, d1burb2, d1burc1, d1burc2, d1burd1, d1burd2
3. Domain d1buru_: 1bur U: [39627]
  Other proteins in same PDB: d1bura1, d1bura2, d1burb1, d1burb2, d1burc1, d1burc2, d1burd1, d1burd2
4. Domain d1burv_: 1bur V: [39628]
  Other proteins in same PDB: d1bura1, d1bura2, d1burb1, d1burb2, d1burc1, d1burc2, d1burd1, d1burd2
Domains for 1rbo:
1. Domain d1rboc_: 1rbo C: [39634]
  Other proteins in same PDB: d1rbob1, d1rbob2, d1rboe1, d1rboe2, d1rboh1, d1rboh2, d1rbol1, d1rbol2
2. Domain d1rbof_: 1rbo F: [39635]
  Other proteins in same PDB: d1rbob1, d1rbob2, d1rboe1, d1rboe2, d1rboh1, d1rboh2, d1rbol1, d1rbol2
3. Domain d1rboi_: 1rbo I: [39636]
  Other proteins in same PDB: d1rbob1, d1rbob2, d1rboe1, d1rboe2, d1rboh1, d1rboh2, d1rbol1, d1rbol2
4. Domain d1rbos_: 1rbo S: [39633]
  Other proteins in same PDB: d1rbob1, d1rbob2, d1rboe1, d1rboe2, d1rboh1, d1rboh2, d1rbol1, d1rbol2

Domains for 1rco:

Domain d1rcoc_: 1rco C: [39647]
Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcob2, d1rcoe1, d1rcoe2, d1rcoh1, d1rcoh2, d1rcok1, d1rcok2, d1rcol1, d1rcol2, d1rcoo1, d1rcoo2, d1rcor1, d1rcor2, d1rcov1, d1rcov2

Domain d1rcof_: 1rco F: [39648]
Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcob2, d1rcoe1, d1rcoe2, d1rcoh1, d1rcoh2, d1rcok1, d1rcok2, d1rcol1, d1rcol2, d1rcoo1, d1rcoo2, d1rcor1, d1rcor2, d1rcov1, d1rcov2

Domain d1rcoi_: 1rco I: [39649]
Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcob2, d1rcoe1, d1rcoe2, d1rcoh1, d1rcoh2, d1rcok1, d1rcok2, d1rcol1, d1rcol2, d1rcoo1, d1rcoo2, d1rcor1, d1rcor2, d1rcov1, d1rcov2

Domain d1rcom_: 1rco M: [39650]
Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcob2, d1rcoe1, d1rcoe2, d1rcoh1, d1rcoh2, d1rcok1, d1rcok2, d1rcol1, d1rcol2, d1rcoo1, d1rcoo2, d1rcor1, d1rcor2, d1rcov1, d1rcov2

Domain d1rcop_: 1rco P: [39651]
Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcob2, d1rcoe1, d1rcoe2, d1rcoh1, d1rcoh2, d1rcok1, d1rcok2, d1rcol1, d1rcol2, d1rcoo1, d1rcoo2, d1rcor1, d1rcor2, d1rcov1, d1rcov2

Domain d1rcos_: 1rco S: [39646]
Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcob2, d1rcoe1, d1rcoe2, d1rcoh1, d1rcoh2, d1rcok1, d1rcok2, d1rcol1, d1rcol2, d1rcoo1, d1rcoo2, d1rcor1, d1rcor2, d1rcov1, d1rcov2

Domain d1rcot_: 1rco T: [39652]
Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcob2, d1rcoe1, d1rcoe2, d1rcoh1, d1rcoh2, d1rcok1, d1rcok2, d1rcol1, d1rcol2, d1rcoo1, d1rcoo2, d1rcor1, d1rcor2, d1rcov1, d1rcov2

Domain d1rcow_: 1rco W: [39653]
Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcob2, d1rcoe1, d1rcoe2, d1rcoh1, d1rcoh2, d1rcok1, d1rcok2, d1rcol1, d1rcol2, d1rcoo1, d1rcoo2, d1rcor1, d1rcor2, d1rcov1, d1rcov2

Domains for 1rcx:

Domain d1rcxc_: 1rcx C: [39655]
Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxb2, d1rcxe1, d1rcxe2, d1rcxh1, d1rcxh2, d1rcxk1, d1rcxk2, d1rcxl1, d1rcxl2, d1rcxo1, d1rcxo2, d1rcxr1, d1rcxr2, d1rcxv1, d1rcxv2

Domain d1rcxf_: 1rcx F: [39656]
Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxb2, d1rcxe1, d1rcxe2, d1rcxh1, d1rcxh2, d1rcxk1, d1rcxk2, d1rcxl1, d1rcxl2, d1rcxo1, d1rcxo2, d1rcxr1, d1rcxr2, d1rcxv1, d1rcxv2

Domain d1rcxi_: 1rcx I: [39657]
Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxb2, d1rcxe1, d1rcxe2, d1rcxh1, d1rcxh2, d1rcxk1, d1rcxk2, d1rcxl1, d1rcxl2, d1rcxo1, d1rcxo2, d1rcxr1, d1rcxr2, d1rcxv1, d1rcxv2

Domain d1rcxm_: 1rcx M: [39658]
Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxb2, d1rcxe1, d1rcxe2, d1rcxh1, d1rcxh2, d1rcxk1, d1rcxk2, d1rcxl1, d1rcxl2, d1rcxo1, d1rcxo2, d1rcxr1, d1rcxr2, d1rcxv1, d1rcxv2

Domain d1rcxp_: 1rcx P: [39659]
Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxb2, d1rcxe1, d1rcxe2, d1rcxh1, d1rcxh2, d1rcxk1, d1rcxk2, d1rcxl1, d1rcxl2, d1rcxo1, d1rcxo2, d1rcxr1, d1rcxr2, d1rcxv1, d1rcxv2

Domain d1rcxs_: 1rcx S: [39654]
Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxb2, d1rcxe1, d1rcxe2, d1rcxh1, d1rcxh2, d1rcxk1, d1rcxk2, d1rcxl1, d1rcxl2, d1rcxo1, d1rcxo2, d1rcxr1, d1rcxr2, d1rcxv1, d1rcxv2

Domain d1rcxt_: 1rcx T: [39660]
Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxb2, d1rcxe1, d1rcxe2, d1rcxh1, d1rcxh2, d1rcxk1, d1rcxk2, d1rcxl1, d1rcxl2, d1rcxo1, d1rcxo2, d1rcxr1, d1rcxr2, d1rcxv1, d1rcxv2

Domain d1rcxw_: 1rcx W: [39661]
Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxb2, d1rcxe1, d1rcxe2, d1rcxh1, d1rcxh2, d1rcxk1, d1rcxk2, d1rcxl1, d1rcxl2, d1rcxo1, d1rcxo2, d1rcxr1, d1rcxr2, d1rcxv1, d1rcxv2

Domains for 1rxo:
1. Domain d1rxoc_: 1rxo C: [39642]
  Other proteins in same PDB: d1rxob1, d1rxob2, d1rxoe1, d1rxoe2, d1rxoh1, d1rxoh2, d1rxol1, d1rxol2
2. Domain d1rxof_: 1rxo F: [39643]
  Other proteins in same PDB: d1rxob1, d1rxob2, d1rxoe1, d1rxoe2, d1rxoh1, d1rxoh2, d1rxol1, d1rxol2
3. Domain d1rxoi_: 1rxo I: [39644]
  Other proteins in same PDB: d1rxob1, d1rxob2, d1rxoe1, d1rxoe2, d1rxoh1, d1rxoh2, d1rxol1, d1rxol2
4. Domain d1rxos_: 1rxo S: [39641]
  Other proteins in same PDB: d1rxob1, d1rxob2, d1rxoe1, d1rxoe2, d1rxoh1, d1rxoh2, d1rxol1, d1rxol2
Domains for 8ruc:
1. Domain d8ruci_: 8ruc I: [39629]
  Other proteins in same PDB: d8ruca1, d8ruca2, d8rucc1, d8rucc2, d8ruce1, d8ruce2, d8rucg1, d8rucg2
2. Domain d8rucj_: 8ruc J: [39630]
  Other proteins in same PDB: d8ruca1, d8ruca2, d8rucc1, d8rucc2, d8ruce1, d8ruce2, d8rucg1, d8rucg2
3. Domain d8ruck_: 8ruc K: [39631]
  Other proteins in same PDB: d8ruca1, d8ruca2, d8rucc1, d8rucc2, d8ruce1, d8ruce2, d8rucg1, d8rucg2
4. Domain d8rucl_: 8ruc L: [39632]
  Other proteins in same PDB: d8ruca1, d8ruca2, d8rucc1, d8rucc2, d8ruce1, d8ruce2, d8rucg1, d8rucg2

Synechococcus sp., strain pcc 6301 [TaxId:1131] [55246] (2 PDB entries)
1. Domain for 1rbl:
  - Domain d1rblm_: 1rbl M: [39670]
    Other proteins in same PDB: d1rbla1, d1rbla2
2. Domain for 1rsc:
  - Domain d1rscm_: 1rsc M: [39671]
    Other proteins in same PDB: d1rsca1, d1rsca2
Tobacco (Nicotiana tabacum), variant turkish samsun [TaxId:4097] [55242] (5 PDB entries)
1. Domain for 1ej7:
  - Domain d1ej7s_: 1ej7 S: [39617]
    Other proteins in same PDB: d1ej7l1, d1ej7l2
2. Domain for 1rlc:
  - Domain d1rlcs_: 1rlc S: [39620]
    Other proteins in same PDB: d1rlcl1, d1rlcl2
3. Domains for 1rld:
  1. Domain d1rlds_: 1rld S: [39618]
    Other proteins in same PDB: d1rlda1, d1rlda2, d1rldb1, d1rldb2
  2. Domain d1rldt_: 1rld T: [39619]
    Other proteins in same PDB: d1rlda1, d1rlda2, d1rldb1, d1rldb2
4. Domain for 3rub:
  - Domain d3rubs_: 3rub S: [39616]
    Other proteins in same PDB: d3rubl1, d3rubl2
5. Domains for 4rub:
  1. Domain d4rubs_: 4rub S: [39621]
    Other proteins in same PDB: d4ruba1, d4ruba2, d4rubb1, d4rubb2, d4rubc1, d4rubc2, d4rubd1, d4rubd2
  2. Domain d4rubt_: 4rub T: [39622]
    Other proteins in same PDB: d4ruba1, d4ruba2, d4rubb1, d4rubb2, d4rubc1, d4rubc2, d4rubd1, d4rubd2
  3. Domain d4rubu_: 4rub U: [39623]
    Other proteins in same PDB: d4ruba1, d4ruba2, d4rubb1, d4rubb2, d4rubc1, d4rubc2, d4rubd1, d4rubd2
  4. Domain d4rubv_: 4rub V: [39624]
    Other proteins in same PDB: d4ruba1, d4ruba2, d4rubb1, d4rubb2, d4rubc1, d4rubc2, d4rubd1, d4rubd2

More info for Protein Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase from d.73.1.1: RuBisCO, small subunit

Timeline for Protein Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase from d.73.1.1: RuBisCO, small subunit:

Protein Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase from d.73.1.1: RuBisCO, small subunit appears in SCOP 1.57
Protein Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase from d.73.1.1: RuBisCO, small subunit appears in the current release, SCOPe 2.08