SCOP 1.65: Protein: Ribosomal protein S4

Lineage for Protein: Ribosomal protein S4

Root: SCOP 1.65
Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (234 folds)
Fold d.66: Alpha-L RNA-binding motif [55173] (1 superfamily)
alpha(2)-beta(2)-loop-beta; 2 layers: alpha/beta
Superfamily d.66.1: Alpha-L RNA-binding motif [55174] (4 families)
common motif in otherwise different folds
Family d.66.1.2: Ribosomal protein S4 [55178] (1 protein)
has a RRF/tRNA synthetase additional domain-like fold
Protein Ribosomal protein S4 [55179] (2 species)
also contains a Zn-binding N-terminal subdomain

Species:

Bacillus stearothermophilus [TaxId:1422] [55181] (2 PDB entries)
1. Domain for 1c05:
  - Domain d1c05a_: 1c05 A: [39559]
2. Domain for 1c06:
  - Domain d1c06a_: 1c06 A: [39558]

Thermus thermophilus [TaxId:274] [55180] (14 PDB entries)

Domain for 1fjg:

Domain d1fjgd_: 1fjg D: [39553]
Other proteins in same PDB: d1fjgb_, d1fjgc1, d1fjgc2, d1fjge1, d1fjge2, d1fjgf_, d1fjgg_, d1fjgh_, d1fjgi_, d1fjgj_, d1fjgk_, d1fjgl_, d1fjgm_, d1fjgn_, d1fjgo_, d1fjgp_, d1fjgq_, d1fjgr_, d1fjgs_, d1fjgt_, d1fjgv_
complexed with mg, par, scm, sry, zn

Domain for 1hnw:

Domain d1hnwd_: 1hnw D: [39556]
Other proteins in same PDB: d1hnwb_, d1hnwc1, d1hnwc2, d1hnwe1, d1hnwe2, d1hnwf_, d1hnwg_, d1hnwh_, d1hnwi_, d1hnwj_, d1hnwk_, d1hnwl_, d1hnwm_, d1hnwn_, d1hnwo_, d1hnwp_, d1hnwq_, d1hnwr_, d1hnws_, d1hnwt_, d1hnwv_
complexed with mg, tac, zn

Domain for 1hnx:

Domain d1hnxd_: 1hnx D: [39557]
Other proteins in same PDB: d1hnxb_, d1hnxc1, d1hnxc2, d1hnxe1, d1hnxe2, d1hnxf_, d1hnxg_, d1hnxh_, d1hnxi_, d1hnxj_, d1hnxk_, d1hnxl_, d1hnxm_, d1hnxn_, d1hnxo_, d1hnxp_, d1hnxq_, d1hnxr_, d1hnxs_, d1hnxt_, d1hnxv_
complexed with mg, pcy, zn

Domain for 1hnz:

Domain d1hnzd_: 1hnz D: [39555]
Other proteins in same PDB: d1hnzb_, d1hnzc1, d1hnzc2, d1hnze1, d1hnze2, d1hnzf_, d1hnzg_, d1hnzh_, d1hnzi_, d1hnzj_, d1hnzk_, d1hnzl_, d1hnzm_, d1hnzn_, d1hnzo_, d1hnzp_, d1hnzq_, d1hnzr_, d1hnzs_, d1hnzt_, d1hnzv_
complexed with hyg, mg, zn

Domain for 1hr0:

Domain d1hr0d_: 1hr0 D: [39554]
Other proteins in same PDB: d1hr0b_, d1hr0c1, d1hr0c2, d1hr0e1, d1hr0e2, d1hr0f_, d1hr0g_, d1hr0h_, d1hr0i_, d1hr0j_, d1hr0k_, d1hr0l_, d1hr0m_, d1hr0n_, d1hr0o_, d1hr0p_, d1hr0q_, d1hr0r_, d1hr0s_, d1hr0t_, d1hr0v_, d1hr0w_
complexed with mg, zn

Domain for 1i94:

Domain d1i94d_: 1i94 D: [61994]
Other proteins in same PDB: d1i94b_, d1i94c1, d1i94c2, d1i94e1, d1i94e2, d1i94f_, d1i94g_, d1i94h_, d1i94i_, d1i94j_, d1i94k_, d1i94l_, d1i94m_, d1i94n_, d1i94o_, d1i94p_, d1i94q_, d1i94r_, d1i94s_, d1i94t_, d1i94u_
complexed with mg, wo2, zn

Domain for 1i95:

Domain d1i95d_: 1i95 D: [62016]
Other proteins in same PDB: d1i95b_, d1i95c1, d1i95c2, d1i95e1, d1i95e2, d1i95f_, d1i95g_, d1i95h_, d1i95i_, d1i95j_, d1i95k_, d1i95l_, d1i95m_, d1i95n_, d1i95o_, d1i95p_, d1i95q_, d1i95r_, d1i95s_, d1i95t_, d1i95u_
complexed with ede, mg, wo2, zn

Domain for 1i96:

Domain d1i96d_: 1i96 D: [62038]
Other proteins in same PDB: d1i96b_, d1i96c1, d1i96c2, d1i96e1, d1i96e2, d1i96f_, d1i96g_, d1i96h_, d1i96i_, d1i96j_, d1i96k_, d1i96l_, d1i96m_, d1i96n_, d1i96o_, d1i96p_, d1i96q_, d1i96r_, d1i96s_, d1i96t_, d1i96u_, d1i96v_
complexed with mg, wo2, zn

Domain for 1i97:

Domain d1i97d_: 1i97 D: [62061]
Other proteins in same PDB: d1i97b_, d1i97c1, d1i97c2, d1i97e1, d1i97e2, d1i97f_, d1i97g_, d1i97h_, d1i97i_, d1i97j_, d1i97k_, d1i97l_, d1i97m_, d1i97n_, d1i97o_, d1i97p_, d1i97q_, d1i97r_, d1i97s_, d1i97t_, d1i97u_
complexed with mg, tac, wo2, zn

Domain for 1j5e:

Domain d1j5ed_: 1j5e D: [71546]
Other proteins in same PDB: d1j5eb_, d1j5ec1, d1j5ec2, d1j5ee1, d1j5ee2, d1j5ef_, d1j5eg_, d1j5eh_, d1j5ei_, d1j5ej_, d1j5ek_, d1j5el_, d1j5em_, d1j5en_, d1j5eo_, d1j5ep_, d1j5eq_, d1j5er_, d1j5es_, d1j5et_, d1j5ev_
complexed with unx, zn

Domain for 1n32:

Domain d1n32d_: 1n32 D: [79872]
Other proteins in same PDB: d1n32b_, d1n32c1, d1n32c2, d1n32e1, d1n32e2, d1n32f_, d1n32g_, d1n32h_, d1n32i_, d1n32j_, d1n32k_, d1n32l_, d1n32m_, d1n32n_, d1n32o_, d1n32p_, d1n32q_, d1n32r_, d1n32s_, d1n32t_, d1n32v_
complexed with mg, par, psu, zn

Domain for 1n33:

Domain d1n33d_: 1n33 D: [79894]
Other proteins in same PDB: d1n33b_, d1n33c1, d1n33c2, d1n33e1, d1n33e2, d1n33f_, d1n33g_, d1n33h_, d1n33i_, d1n33j_, d1n33k_, d1n33l_, d1n33m_, d1n33n_, d1n33o_, d1n33p_, d1n33q_, d1n33r_, d1n33s_, d1n33t_, d1n33v_
complexed with mg, par, psu, zn

Domain for 1n34:

Domain d1n34d_: 1n34 D: [79916]
Other proteins in same PDB: d1n34b_, d1n34c1, d1n34c2, d1n34e1, d1n34e2, d1n34f_, d1n34g_, d1n34h_, d1n34i_, d1n34j_, d1n34k_, d1n34l_, d1n34m_, d1n34n_, d1n34o_, d1n34p_, d1n34q_, d1n34r_, d1n34s_, d1n34t_, d1n34v_
complexed with zn

Domain for 1n36:

Domain d1n36d_: 1n36 D: [79939]
Other proteins in same PDB: d1n36b_, d1n36c1, d1n36c2, d1n36e1, d1n36e2, d1n36f_, d1n36g_, d1n36h_, d1n36i_, d1n36j_, d1n36k_, d1n36l_, d1n36m_, d1n36n_, d1n36o_, d1n36p_, d1n36q_, d1n36r_, d1n36s_, d1n36t_, d1n36v_
complexed with zn

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Protein Ribosomal protein S4 from d.66.1.2: Ribosomal protein S4 first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
Protein Ribosomal protein S4 from d.66.1.2: Ribosomal protein S4 appears in SCOP 1.63
Protein Ribosomal protein S4 from d.66.1.2: Ribosomal protein S4 appears in SCOP 1.67
Protein Ribosomal protein S4 from d.66.1.2: Ribosomal protein S4 appears in the current release, SCOPe 2.08, called Protein Ribosomal protein S4 from d.66.1.2: Ribosomal protein S4 (bacteria)