Lineage for Protein: Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase

  1. Root: SCOP 1.59
  2. 128814Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (208 folds)
  3. 133319Fold d.58: Ferredoxin-like [54861] (39 superfamilies)
  4. 133756Superfamily d.58.9: RuBisCO, large subunit, small (N-terminal) domain [54966] (1 family) (S)
  5. 133757Family d.58.9.1: Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase [54967] (1 protein)
  6. 133758Protein Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase [54968] (8 species)

Species:

  1. 133759Alcaligenes eutrophus [TaxId:106590] [54972] (1 PDB entry)
  2. 133764Archaeon Thermococcus kodakaraensis [TaxId:311400] [69731] (1 PDB entry)
  3. 133770Chlamydomonas reinhardtii [TaxId:3055] [69730] (1 PDB entry)
  4. 133775Galdieria partita [TaxId:83374] [54971] (1 PDB entry)
  5. 133780Rhodospirillum rubrum [TaxId:1085] [54974] (5 PDB entries)
    1. Domains for 1rba:
      1. 133789Domain d1rbaa2: 1rba A:5-137 [39296]
        Other proteins in same PDB: d1rbaa1, d1rbab1
      2. 133790Domain d1rbab2: 1rba B:5-137 [39297]
        Other proteins in same PDB: d1rbaa1, d1rbab1
    2. Domains for 1rus:
      1. 133787Domain d1rusa2: 1rus A:3-137 [39294]
        Other proteins in same PDB: d1rusa1, d1rusb1
      2. 133788Domain d1rusb2: 1rus B:3-137 [39295]
        Other proteins in same PDB: d1rusa1, d1rusb1
    3. Domains for 2rus:
      1. 133783Domain d2rusa2: 2rus A:2-137 [39290]
        Other proteins in same PDB: d2rusa1, d2rusb1
      2. 133784Domain d2rusb2: 2rus B:3-137 [39291]
        Other proteins in same PDB: d2rusa1, d2rusb1
    4. Domains for 5rub:
      1. 133781Domain d5ruba2: 5rub A:2-137 [39288]
        Other proteins in same PDB: d5ruba1, d5rubb1
      2. 133782Domain d5rubb2: 5rub B:2-137 [39289]
        Other proteins in same PDB: d5ruba1, d5rubb1
    5. Domains for 9rub:
      1. 133785Domain d9ruba2: 9rub A:2-137 [39292]
        Other proteins in same PDB: d9ruba1, d9rubb1
      2. 133786Domain d9rubb2: 9rub B:2-137 [39293]
        Other proteins in same PDB: d9ruba1, d9rubb1
  6. 133791Spinach (Spinacia oleracea) [TaxId:3562] [54970] (8 PDB entries)
    1. Domains for 1aa1:
      1. 133804Domain d1aa1b2: 1aa1 B:21-147 [39254]
        Other proteins in same PDB: d1aa1b1, d1aa1c_, d1aa1e1, d1aa1f_, d1aa1h1, d1aa1i_, d1aa1l1, d1aa1s_
      2. 133805Domain d1aa1e2: 1aa1 E:21-147 [39255]
        Other proteins in same PDB: d1aa1b1, d1aa1c_, d1aa1e1, d1aa1f_, d1aa1h1, d1aa1i_, d1aa1l1, d1aa1s_
      3. 133806Domain d1aa1h2: 1aa1 H:21-147 [39256]
        Other proteins in same PDB: d1aa1b1, d1aa1c_, d1aa1e1, d1aa1f_, d1aa1h1, d1aa1i_, d1aa1l1, d1aa1s_
      4. 133807Domain d1aa1l2: 1aa1 L:21-147 [39253]
        Other proteins in same PDB: d1aa1b1, d1aa1c_, d1aa1e1, d1aa1f_, d1aa1h1, d1aa1i_, d1aa1l1, d1aa1s_
    2. Domain for 1aus:
    3. Domains for 1bur:
      1. 133792Domain d1bura2: 1bur A:12-147 [39241]
        Other proteins in same PDB: d1bura1, d1burb1, d1burc1, d1burd1, d1burs_, d1burt_, d1buru_, d1burv_
      2. 133793Domain d1burb2: 1bur B:12-147 [39242]
        Other proteins in same PDB: d1bura1, d1burb1, d1burc1, d1burd1, d1burs_, d1burt_, d1buru_, d1burv_
      3. 133794Domain d1burc2: 1bur C:12-147 [39243]
        Other proteins in same PDB: d1bura1, d1burb1, d1burc1, d1burd1, d1burs_, d1burt_, d1buru_, d1burv_
      4. 133795Domain d1burd2: 1bur D:12-147 [39244]
        Other proteins in same PDB: d1bura1, d1burb1, d1burc1, d1burd1, d1burs_, d1burt_, d1buru_, d1burv_
    4. Domains for 1rbo:
      1. 133800Domain d1rbob2: 1rbo B:9-147 [39250]
        Other proteins in same PDB: d1rbob1, d1rboc_, d1rboe1, d1rbof_, d1rboh1, d1rboi_, d1rbol1, d1rbos_
      2. 133801Domain d1rboe2: 1rbo E:9-147 [39251]
        Other proteins in same PDB: d1rbob1, d1rboc_, d1rboe1, d1rbof_, d1rboh1, d1rboi_, d1rbol1, d1rbos_
      3. 133802Domain d1rboh2: 1rbo H:9-147 [39252]
        Other proteins in same PDB: d1rbob1, d1rboc_, d1rboe1, d1rbof_, d1rboh1, d1rboi_, d1rbol1, d1rbos_
      4. 133803Domain d1rbol2: 1rbo L:9-147 [39249]
        Other proteins in same PDB: d1rbob1, d1rboc_, d1rboe1, d1rbof_, d1rboh1, d1rboi_, d1rbol1, d1rbos_
    5. Domains for 1rco:
      1. 133813Domain d1rcob2: 1rco B:9-147 [39263]
        Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcoc_, d1rcoe1, d1rcof_, d1rcoh1, d1rcoi_, d1rcok1, d1rcol1, d1rcom_, d1rcoo1, d1rcop_, d1rcor1, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov1, d1rcow_
      2. 133814Domain d1rcoe2: 1rco E:9-147 [39264]
        Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcoc_, d1rcoe1, d1rcof_, d1rcoh1, d1rcoi_, d1rcok1, d1rcol1, d1rcom_, d1rcoo1, d1rcop_, d1rcor1, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov1, d1rcow_
      3. 133815Domain d1rcoh2: 1rco H:9-147 [39265]
        Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcoc_, d1rcoe1, d1rcof_, d1rcoh1, d1rcoi_, d1rcok1, d1rcol1, d1rcom_, d1rcoo1, d1rcop_, d1rcor1, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov1, d1rcow_
      4. 133816Domain d1rcok2: 1rco K:9-147 [39266]
        Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcoc_, d1rcoe1, d1rcof_, d1rcoh1, d1rcoi_, d1rcok1, d1rcol1, d1rcom_, d1rcoo1, d1rcop_, d1rcor1, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov1, d1rcow_
      5. 133817Domain d1rcol2: 1rco L:9-147 [39262]
        Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcoc_, d1rcoe1, d1rcof_, d1rcoh1, d1rcoi_, d1rcok1, d1rcol1, d1rcom_, d1rcoo1, d1rcop_, d1rcor1, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov1, d1rcow_
      6. 133818Domain d1rcoo2: 1rco O:9-147 [39267]
        Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcoc_, d1rcoe1, d1rcof_, d1rcoh1, d1rcoi_, d1rcok1, d1rcol1, d1rcom_, d1rcoo1, d1rcop_, d1rcor1, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov1, d1rcow_
      7. 133819Domain d1rcor2: 1rco R:9-147 [39268]
        Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcoc_, d1rcoe1, d1rcof_, d1rcoh1, d1rcoi_, d1rcok1, d1rcol1, d1rcom_, d1rcoo1, d1rcop_, d1rcor1, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov1, d1rcow_
      8. 133820Domain d1rcov2: 1rco V:9-147 [39269]
        Other proteins in same PDB: d1rcob1, d1rcoc_, d1rcoe1, d1rcof_, d1rcoh1, d1rcoi_, d1rcok1, d1rcol1, d1rcom_, d1rcoo1, d1rcop_, d1rcor1, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov1, d1rcow_
    6. Domains for 1rcx:
      1. 133821Domain d1rcxb2: 1rcx B:9-147 [39271]
        Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxc_, d1rcxe1, d1rcxf_, d1rcxh1, d1rcxi_, d1rcxk1, d1rcxl1, d1rcxm_, d1rcxo1, d1rcxp_, d1rcxr1, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv1, d1rcxw_
      2. 133822Domain d1rcxe2: 1rcx E:9-147 [39272]
        Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxc_, d1rcxe1, d1rcxf_, d1rcxh1, d1rcxi_, d1rcxk1, d1rcxl1, d1rcxm_, d1rcxo1, d1rcxp_, d1rcxr1, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv1, d1rcxw_
      3. 133823Domain d1rcxh2: 1rcx H:9-147 [39273]
        Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxc_, d1rcxe1, d1rcxf_, d1rcxh1, d1rcxi_, d1rcxk1, d1rcxl1, d1rcxm_, d1rcxo1, d1rcxp_, d1rcxr1, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv1, d1rcxw_
      4. 133824Domain d1rcxk2: 1rcx K:9-147 [39274]
        Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxc_, d1rcxe1, d1rcxf_, d1rcxh1, d1rcxi_, d1rcxk1, d1rcxl1, d1rcxm_, d1rcxo1, d1rcxp_, d1rcxr1, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv1, d1rcxw_
      5. 133825Domain d1rcxl2: 1rcx L:9-147 [39270]
        Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxc_, d1rcxe1, d1rcxf_, d1rcxh1, d1rcxi_, d1rcxk1, d1rcxl1, d1rcxm_, d1rcxo1, d1rcxp_, d1rcxr1, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv1, d1rcxw_
      6. 133826Domain d1rcxo2: 1rcx O:9-147 [39275]
        Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxc_, d1rcxe1, d1rcxf_, d1rcxh1, d1rcxi_, d1rcxk1, d1rcxl1, d1rcxm_, d1rcxo1, d1rcxp_, d1rcxr1, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv1, d1rcxw_
      7. 133827Domain d1rcxr2: 1rcx R:9-147 [39276]
        Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxc_, d1rcxe1, d1rcxf_, d1rcxh1, d1rcxi_, d1rcxk1, d1rcxl1, d1rcxm_, d1rcxo1, d1rcxp_, d1rcxr1, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv1, d1rcxw_
      8. 133828Domain d1rcxv2: 1rcx V:9-147 [39277]
        Other proteins in same PDB: d1rcxb1, d1rcxc_, d1rcxe1, d1rcxf_, d1rcxh1, d1rcxi_, d1rcxk1, d1rcxl1, d1rcxm_, d1rcxo1, d1rcxp_, d1rcxr1, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv1, d1rcxw_
    7. Domains for 1rxo:
      1. 133808Domain d1rxob2: 1rxo B:9-147 [39258]
        Other proteins in same PDB: d1rxob1, d1rxoc_, d1rxoe1, d1rxof_, d1rxoh1, d1rxoi_, d1rxol1, d1rxos_
      2. 133809Domain d1rxoe2: 1rxo E:9-147 [39259]
        Other proteins in same PDB: d1rxob1, d1rxoc_, d1rxoe1, d1rxof_, d1rxoh1, d1rxoi_, d1rxol1, d1rxos_
      3. 133810Domain d1rxoh2: 1rxo H:9-147 [39260]
        Other proteins in same PDB: d1rxob1, d1rxoc_, d1rxoe1, d1rxof_, d1rxoh1, d1rxoi_, d1rxol1, d1rxos_
      4. 133811Domain d1rxol2: 1rxo L:9-147 [39257]
        Other proteins in same PDB: d1rxob1, d1rxoc_, d1rxoe1, d1rxof_, d1rxoh1, d1rxoi_, d1rxol1, d1rxos_
    8. Domains for 8ruc:
      1. 133796Domain d8ruca2: 8ruc A:9-147 [39245]
        Other proteins in same PDB: d8ruca1, d8rucc1, d8ruce1, d8rucg1, d8ruci_, d8rucj_, d8ruck_, d8rucl_
      2. 133797Domain d8rucc2: 8ruc C:9-147 [39246]
        Other proteins in same PDB: d8ruca1, d8rucc1, d8ruce1, d8rucg1, d8ruci_, d8rucj_, d8ruck_, d8rucl_
      3. 133798Domain d8ruce2: 8ruc E:9-147 [39247]
        Other proteins in same PDB: d8ruca1, d8rucc1, d8ruce1, d8rucg1, d8ruci_, d8rucj_, d8ruck_, d8rucl_
      4. 133799Domain d8rucg2: 8ruc G:9-147 [39248]
        Other proteins in same PDB: d8ruca1, d8rucc1, d8ruce1, d8rucg1, d8ruci_, d8rucj_, d8ruck_, d8rucl_
  7. 133829Synechococcus sp., strain pcc 6301 [TaxId:1131] [54973] (2 PDB entries)
    1. Domain for 1rbl:
    2. Domain for 1rsc:
  8. 133832Tobacco (Nicotiana tabacum), variant turkish samsun [TaxId:4097] [54969] (5 PDB entries)
    1. Domain for 1ej7:
    2. Domain for 1rlc:
    3. Domains for 1rld:
      1. 133835Domain d1rlda2: 1rld A:22-147 [39234]
        Other proteins in same PDB: d1rlda1, d1rldb1, d1rlds_, d1rldt_
      2. 133836Domain d1rldb2: 1rld B:22-147 [39235]
        Other proteins in same PDB: d1rlda1, d1rldb1, d1rlds_, d1rldt_
    4. Domain for 3rub:
    5. Domains for 4rub:
      1. 133838Domain d4ruba2: 4rub A:9-147 [39237]
        Other proteins in same PDB: d4ruba1, d4rubb1, d4rubc1, d4rubd1, d4rubs_, d4rubt_, d4rubu_, d4rubv_
      2. 133839Domain d4rubb2: 4rub B:9-147 [39238]
        Other proteins in same PDB: d4ruba1, d4rubb1, d4rubc1, d4rubd1, d4rubs_, d4rubt_, d4rubu_, d4rubv_
      3. 133840Domain d4rubc2: 4rub C:9-147 [39239]
        Other proteins in same PDB: d4ruba1, d4rubb1, d4rubc1, d4rubd1, d4rubs_, d4rubt_, d4rubu_, d4rubv_
      4. 133841Domain d4rubd2: 4rub D:9-147 [39240]
        Other proteins in same PDB: d4ruba1, d4rubb1, d4rubc1, d4rubd1, d4rubs_, d4rubt_, d4rubu_, d4rubv_

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