Lineage for Protein: MHC class II, N-terminal domains of alpha and beta chains

  1. Root: SCOP 1.61
  2. 187024Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (212 folds)
  3. 190293Fold d.19: MHC antigen-recognition domain [54451] (1 superfamily)
  4. 190294Superfamily d.19.1: MHC antigen-recognition domain [54452] (1 family) (S)
  5. 190295Family d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain [54453] (10 proteins)
  6. 190467Protein MHC class II, N-terminal domains of alpha and beta chains [54458] (12 species)

Species:

  1. 190468Human (Homo sapiens), HLA-DM [TaxId:9606] [54459] (1 PDB entry)
  2. 190471Human (Homo sapiens), HLA-DQ8 [TaxId:9606] [64238] (1 PDB entry)
  3. 190474Human (Homo sapiens), HLA-DR1 [TaxId:9606] [54460] (9 PDB entries)
    1. Domains for 1aqd:
      1. 190479Domain d1aqda2: 1aqd A:3-81 [38159]
        Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
      2. 190480Domain d1aqdb2: 1aqd B:4-92 [38160]
        Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
      3. 190481Domain d1aqdd2: 1aqd D:3-81 [38161]
        Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
      4. 190482Domain d1aqde2: 1aqd E:4-92 [38162]
        Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
      5. 190483Domain d1aqdg2: 1aqd G:3-81 [38163]
        Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
      6. 190484Domain d1aqdh2: 1aqd H:4-92 [38164]
        Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
      7. 190485Domain d1aqdj2: 1aqd J:3-81 [38165]
        Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
      8. 190486Domain d1aqdk2: 1aqd K:4-92 [38166]
        Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
    2. Domains for 1dlh:
      1. 190491Domain d1dlha2: 1dlh A:3-81 [38171]
        Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlhb1, d1dlhd1, d1dlhe1
      2. 190492Domain d1dlhb2: 1dlh B:3-92 [38172]
        Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlhb1, d1dlhd1, d1dlhe1
      3. 190493Domain d1dlhd2: 1dlh D:3-81 [38173]
        Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlhb1, d1dlhd1, d1dlhe1
      4. 190494Domain d1dlhe2: 1dlh E:3-92 [38174]
        Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlhb1, d1dlhd1, d1dlhe1
    3. Domains for 1fyt:
      1. 190495Domain d1fyta2: 1fyt A:2-81 [38169]
        Other proteins in same PDB: d1fyta1, d1fytb1, d1fytd1, d1fytd2, d1fyte1, d1fyte2
      2. 190496Domain d1fytb2: 1fyt B:3-92 [38170]
        Other proteins in same PDB: d1fyta1, d1fytb1, d1fytd1, d1fytd2, d1fyte1, d1fyte2
    4. Domains for 1hxy:
      1. 190487Domain d1hxya2: 1hxy A:3-81 [61387]
        Other proteins in same PDB: d1hxya1, d1hxyb1, d1hxyd1, d1hxyd2
      2. 190488Domain d1hxyb2: 1hxy B:3-92 [61389]
        Other proteins in same PDB: d1hxya1, d1hxyb1, d1hxyd1, d1hxyd2
    5. Domains for 1kg0:
      1. 190501Domain d1kg0a2: 1kg0 A:3-81 [72442]
        Other proteins in same PDB: d1kg0a1, d1kg0b1, d1kg0c_
      2. 190502Domain d1kg0b2: 1kg0 B:3-92 [72444]
        Other proteins in same PDB: d1kg0a1, d1kg0b1, d1kg0c_
    6. Domains for 1klg:
      1. 190477Domain d1klga2: 1klg A:4-81 [72715]
        Other proteins in same PDB: d1klga1, d1klgb1, d1klgd1, d1klgd2
      2. 190478Domain d1klgb2: 1klg B:1-92 [72717]
        Other proteins in same PDB: d1klga1, d1klgb1, d1klgd1, d1klgd2
    7. Domains for 1klu:
      1. 190475Domain d1klua2: 1klu A:4-81 [72725]
        Other proteins in same PDB: d1klua1, d1klub1, d1klud1, d1klud2
      2. 190476Domain d1klub2: 1klu B:1-92 [72727]
        Other proteins in same PDB: d1klua1, d1klub1, d1klud1, d1klud2
    8. Domains for 1seb:
      1. 190497Domain d1seba2: 1seb A:1-81 [38175]
        Other proteins in same PDB: d1seba1, d1sebb1, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebf1, d1sebh1, d1sebh2
      2. 190498Domain d1sebb2: 1seb B:1-92 [38176]
        Other proteins in same PDB: d1seba1, d1sebb1, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebf1, d1sebh1, d1sebh2
      3. 190499Domain d1sebe2: 1seb E:1-81 [38177]
        Other proteins in same PDB: d1seba1, d1sebb1, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebf1, d1sebh1, d1sebh2
      4. 190500Domain d1sebf2: 1seb F:1-92 [38178]
        Other proteins in same PDB: d1seba1, d1sebb1, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebf1, d1sebh1, d1sebh2
    9. Domains for 2seb:
      1. 190489Domain d2seba2: 2seb A:1-81 [38167]
        Other proteins in same PDB: d2seba1, d2sebb1, d2sebd1, d2sebd2
      2. 190490Domain d2sebb2: 2seb B:2-92 [38168]
        Other proteins in same PDB: d2seba1, d2sebb1, d2sebd1, d2sebd2
  4. 190503Human (Homo sapiens), HLA-DR2 [TaxId:9606] [54461] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1bx2:
      1. 190508Domain d1bx2a2: 1bx2 A:2-81 [38183]
        Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2b1, d1bx2d1, d1bx2e1
      2. 190509Domain d1bx2b2: 1bx2 B:3-92 [38184]
        Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2b1, d1bx2d1, d1bx2e1
      3. 190510Domain d1bx2d2: 1bx2 D:2-81 [38185]
        Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2b1, d1bx2d1, d1bx2e1
      4. 190511Domain d1bx2e2: 1bx2 E:3-92 [38186]
        Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2b1, d1bx2d1, d1bx2e1
    2. Domains for 1fv1:
      1. 190504Domain d1fv1a2: 1fv1 A:3-81 [38179]
        Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1b1, d1fv1d1, d1fv1e1
      2. 190505Domain d1fv1b2: 1fv1 B:1-92 [38180]
        Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1b1, d1fv1d1, d1fv1e1
      3. 190506Domain d1fv1d2: 1fv1 D:4-81 [38181]
        Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1b1, d1fv1d1, d1fv1e1
      4. 190507Domain d1fv1e2: 1fv1 E:1-92 [38182]
        Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1b1, d1fv1d1, d1fv1e1
    3. Domains for 1hqr:
      1. 190512Domain d1hqra2: 1hqr A:3-81 [38187]
        Other proteins in same PDB: d1hqra1, d1hqrb1, d1hqrd1, d1hqrd2
      2. 190513Domain d1hqrb2: 1hqr B:202-292 [38188]
        Other proteins in same PDB: d1hqra1, d1hqrb1, d1hqrd1, d1hqrd2
  5. 190514Human (Homo sapiens), HLA-DR3 [TaxId:9606] [54462] (1 PDB entry)
  6. 190517Human (Homo sapiens), HLA-DR4 [TaxId:9606] [54463] (5 PDB entries)
    1. Domains for 1d5m:
      1. 190520Domain d1d5ma2: 1d5m A:4-81 [38191]
        Other proteins in same PDB: d1d5ma1, d1d5mb1, d1d5mc1, d1d5mc2
      2. 190521Domain d1d5mb2: 1d5m B:2-92 [38192]
        Other proteins in same PDB: d1d5ma1, d1d5mb1, d1d5mc1, d1d5mc2
    2. Domains for 1d5x:
      1. 190524Domain d1d5xa2: 1d5x A:3-81 [38197]
        Other proteins in same PDB: d1d5xa1, d1d5xb1, d1d5xc1, d1d5xc2
      2. 190525Domain d1d5xb2: 1d5x B:1-92 [38198]
        Other proteins in same PDB: d1d5xa1, d1d5xb1, d1d5xc1, d1d5xc2
    3. Domains for 1d5z:
      1. 190518Domain d1d5za2: 1d5z A:3-81 [38193]
        Other proteins in same PDB: d1d5za1, d1d5zb1, d1d5zc1, d1d5zc2
      2. 190519Domain d1d5zb2: 1d5z B:1-92 [38194]
        Other proteins in same PDB: d1d5za1, d1d5zb1, d1d5zc1, d1d5zc2
    4. Domains for 1d6e:
      1. 190522Domain d1d6ea2: 1d6e A:4-81 [38195]
        Other proteins in same PDB: d1d6ea1, d1d6eb1, d1d6ec1, d1d6ec2
      2. 190523Domain d1d6eb2: 1d6e B:3-92 [38196]
        Other proteins in same PDB: d1d6ea1, d1d6eb1, d1d6ec1, d1d6ec2
    5. Domains for 1j8h:
      1. 190526Domain d1j8ha2: 1j8h A:2-81 [71603]
        Other proteins in same PDB: d1j8ha1, d1j8hb1, d1j8hd1, d1j8hd2, d1j8he1, d1j8he2
      2. 190527Domain d1j8hb2: 1j8h B:3-92 [71605]
        Other proteins in same PDB: d1j8ha1, d1j8hb1, d1j8hd1, d1j8hd2, d1j8he1, d1j8he2
  7. 190528Mouse (Mus musculus), H2-DM [TaxId:10090] [69679] (1 PDB entry)
  8. 190531Mouse (Mus musculus), I-A(G7) [TaxId:10090] [54467] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1es0:
      1. 190532Domain d1es0a2: 1es0 A:1B-82 [38217]
        Other proteins in same PDB: d1es0a1, d1es0b1
      2. 190533Domain d1es0b2: 1es0 B:5-93 [38218]
        Other proteins in same PDB: d1es0a1, d1es0b1
    2. Domains for 1f3j:
      1. 190534Domain d1f3ja2: 1f3j A:1-82 [38219]
        Other proteins in same PDB: d1f3ja1, d1f3jb1, d1f3jd1, d1f3je1
      2. 190535Domain d1f3jb2: 1f3j B:4-93 [38220]
        Other proteins in same PDB: d1f3ja1, d1f3jb1, d1f3jd1, d1f3je1
      3. 190536Domain d1f3jd2: 1f3j D:1-82 [38221]
        Other proteins in same PDB: d1f3ja1, d1f3jb1, d1f3jd1, d1f3je1
      4. 190537Domain d1f3je2: 1f3j E:4-93 [38222]
        Other proteins in same PDB: d1f3ja1, d1f3jb1, d1f3jd1, d1f3je1
  9. 190538Mouse (Mus musculus), I-AB [TaxId:10090] [75379] (1 PDB entry)
  10. 190547Mouse (Mus musculus), I-AD [TaxId:10090] [54466] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1iao:
      1. 190550Domain d1iaoa2: 1iao A:1-82 [38215]
        Other proteins in same PDB: d1iaoa1, d1iaob1
      2. 190551Domain d1iaob2: 1iao B:6-93 [38216]
        Other proteins in same PDB: d1iaoa1, d1iaob1
    2. Domains for 2iad:
      1. 190548Domain d2iada2: 2iad A:1A-82 [38213]
        Other proteins in same PDB: d2iada1, d2iadb1
      2. 190549Domain d2iadb2: 2iad B:5-93 [38214]
        Other proteins in same PDB: d2iada1, d2iadb1
  11. 190552Mouse (Mus musculus), I-AK [TaxId:10090] [54464] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1d9k:
      1. 190555Domain d1d9kc2: 1d9k C:1-81 [38201]
        Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc1, d1d9kd1, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg1, d1d9kh1
      2. 190556Domain d1d9kd2: 1d9k D:2-92 [38202]
        Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc1, d1d9kd1, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg1, d1d9kh1
      3. 190557Domain d1d9kg2: 1d9k G:1-81 [38203]
        Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc1, d1d9kd1, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg1, d1d9kh1
      4. 190558Domain d1d9kh2: 1d9k H:2-92 [38204]
        Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc1, d1d9kd1, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg1, d1d9kh1
    2. Domains for 1iak:
      1. 190553Domain d1iaka2: 1iak A:1-81 [38199]
        Other proteins in same PDB: d1iaka1, d1iakb1
      2. 190554Domain d1iakb2: 1iak B:5-92 [38200]
        Other proteins in same PDB: d1iaka1, d1iakb1
    3. Domains for 1jl4:
      1. 190559Domain d1jl4a2: 1jl4 A:5-81 [63158]
        Other proteins in same PDB: d1jl4a1, d1jl4b1, d1jl4d1, d1jl4d2
      2. 190560Domain d1jl4b2: 1jl4 B:5-92 [63160]
        Other proteins in same PDB: d1jl4a1, d1jl4b1, d1jl4d1, d1jl4d2
  12. 190561Mouse (Mus musculus), I-EK [TaxId:10090] [54465] (7 PDB entries)
    1. Domains for 1fne:
      1. 190566Domain d1fnea2: 1fne A:1-81 [59897]
        Other proteins in same PDB: d1fnea1, d1fneb1, d1fnec1, d1fned1
      2. 190567Domain d1fneb2: 1fne B:4-92 [59899]
        Other proteins in same PDB: d1fnea1, d1fneb1, d1fnec1, d1fned1
      3. 190568Domain d1fnec2: 1fne C:1-81 [59901]
        Other proteins in same PDB: d1fnea1, d1fneb1, d1fnec1, d1fned1
      4. 190569Domain d1fned2: 1fne D:4-92 [59903]
        Other proteins in same PDB: d1fnea1, d1fneb1, d1fnec1, d1fned1
    2. Domains for 1fng:
      1. 190562Domain d1fnga2: 1fng A:1-81 [59905]
        Other proteins in same PDB: d1fnga1, d1fngb1, d1fngc1, d1fngd1
      2. 190563Domain d1fngb2: 1fng B:4-92 [59907]
        Other proteins in same PDB: d1fnga1, d1fngb1, d1fngc1, d1fngd1
      3. 190564Domain d1fngc2: 1fng C:1-81 [59909]
        Other proteins in same PDB: d1fnga1, d1fngb1, d1fngc1, d1fngd1
      4. 190565Domain d1fngd2: 1fng D:4-92 [59911]
        Other proteins in same PDB: d1fnga1, d1fngb1, d1fngc1, d1fngd1
    3. Domains for 1i3r:
      1. 190578Domain d1i3ra2: 1i3r A:1-81 [61621]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rh1
      2. 190579Domain d1i3rb2: 1i3r B:1-120 [61623]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rh1
      3. 190580Domain d1i3rc2: 1i3r C:1-81 [61625]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rh1
      4. 190581Domain d1i3rd2: 1i3r D:1-120 [61627]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rh1
      5. 190582Domain d1i3re2: 1i3r E:1-81 [61629]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rh1
      6. 190583Domain d1i3rf2: 1i3r F:1-120 [61631]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rh1
      7. 190584Domain d1i3rg2: 1i3r G:1-81 [61633]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rh1
      8. 190585Domain d1i3rh2: 1i3r H:1-120 [61635]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rh1
    4. Domains for 1iea:
      1. 190570Domain d1ieaa2: 1iea A:1-81 [38205]
        Other proteins in same PDB: d1ieaa1, d1ieab1, d1ieac1, d1iead1
      2. 190571Domain d1ieab2: 1iea B:4-92 [38206]
        Other proteins in same PDB: d1ieaa1, d1ieab1, d1ieac1, d1iead1
      3. 190572Domain d1ieac2: 1iea C:1-81 [38207]
        Other proteins in same PDB: d1ieaa1, d1ieab1, d1ieac1, d1iead1
      4. 190573Domain d1iead2: 1iea D:4-92 [38208]
        Other proteins in same PDB: d1ieaa1, d1ieab1, d1ieac1, d1iead1
    5. Domains for 1ieb:
      1. 190586Domain d1ieba2: 1ieb A:1-81 [38209]
        Other proteins in same PDB: d1ieba1, d1iebb1, d1iebc1, d1iebd1
      2. 190587Domain d1iebb2: 1ieb B:4-92 [38210]
        Other proteins in same PDB: d1ieba1, d1iebb1, d1iebc1, d1iebd1
      3. 190588Domain d1iebc2: 1ieb C:1-81 [38211]
        Other proteins in same PDB: d1ieba1, d1iebb1, d1iebc1, d1iebd1
      4. 190589Domain d1iebd2: 1ieb D:4-92 [38212]
        Other proteins in same PDB: d1ieba1, d1iebb1, d1iebc1, d1iebd1
    6. Domains for 1kt2:
      1. 190590Domain d1kt2a2: 1kt2 A:1-81 [72952]
        Other proteins in same PDB: d1kt2a1, d1kt2b1, d1kt2c1, d1kt2d1
      2. 190591Domain d1kt2b2: 1kt2 B:2-120 [72954]
        Other proteins in same PDB: d1kt2a1, d1kt2b1, d1kt2c1, d1kt2d1
      3. 190592Domain d1kt2c2: 1kt2 C:1-81 [72956]
        Other proteins in same PDB: d1kt2a1, d1kt2b1, d1kt2c1, d1kt2d1
      4. 190593Domain d1kt2d2: 1kt2 D:2-120 [72958]
        Other proteins in same PDB: d1kt2a1, d1kt2b1, d1kt2c1, d1kt2d1
    7. Domains for 1ktd:
      1. 190574Domain d1ktda2: 1ktd A:1-81 [72965]
        Other proteins in same PDB: d1ktda1, d1ktdb1, d1ktdc1, d1ktdd1
      2. 190575Domain d1ktdb2: 1ktd B:1-120 [72967]
        Other proteins in same PDB: d1ktda1, d1ktdb1, d1ktdc1, d1ktdd1
      3. 190576Domain d1ktdc2: 1ktd C:1-81 [72969]
        Other proteins in same PDB: d1ktda1, d1ktdb1, d1ktdc1, d1ktdd1
      4. 190577Domain d1ktdd2: 1ktd D:1-120 [72971]
        Other proteins in same PDB: d1ktda1, d1ktdb1, d1ktdc1, d1ktdd1

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