Lineage for Protein: MHC class II, N-terminal domains of alpha and beta chains

  1. Root: SCOP 1.59
  2. 128814Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (208 folds)
  3. 131823Fold d.19: MHC antigen-recognition domain [54451] (1 superfamily)
  4. 131824Superfamily d.19.1: MHC antigen-recognition domain [54452] (1 family) (S)
  5. 131825Family d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain [54453] (9 proteins)
  6. 131977Protein MHC class II, N-terminal domains of alpha and beta chains [54458] (11 species)

Species:

  1. 131978Human (Homo sapiens), HLA-DM [TaxId:9606] [54459] (1 PDB entry)
  2. 131981Human (Homo sapiens), HLA-DQ8 [TaxId:9606] [64238] (1 PDB entry)
  3. 131984Human (Homo sapiens), HLA-DR1 [TaxId:9606] [54460] (6 PDB entries)
    1. Domains for 1aqd:
      1. 131985Domain d1aqda2: 1aqd A:3-81 [38159]
        Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
      2. 131986Domain d1aqdb2: 1aqd B:4-92 [38160]
        Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
      3. 131987Domain d1aqdd2: 1aqd D:3-81 [38161]
        Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
      4. 131988Domain d1aqde2: 1aqd E:4-92 [38162]
        Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
      5. 131989Domain d1aqdg2: 1aqd G:3-81 [38163]
        Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
      6. 131990Domain d1aqdh2: 1aqd H:4-92 [38164]
        Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
      7. 131991Domain d1aqdj2: 1aqd J:3-81 [38165]
        Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
      8. 131992Domain d1aqdk2: 1aqd K:4-92 [38166]
        Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
    2. Domains for 1dlh:
      1. 131997Domain d1dlha2: 1dlh A:3-81 [38171]
        Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlhb1, d1dlhd1, d1dlhe1
      2. 131998Domain d1dlhb2: 1dlh B:3-92 [38172]
        Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlhb1, d1dlhd1, d1dlhe1
      3. 131999Domain d1dlhd2: 1dlh D:3-81 [38173]
        Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlhb1, d1dlhd1, d1dlhe1
      4. 132000Domain d1dlhe2: 1dlh E:3-92 [38174]
        Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlhb1, d1dlhd1, d1dlhe1
    3. Domains for 1fyt:
      1. 132001Domain d1fyta2: 1fyt A:2-81 [38169]
        Other proteins in same PDB: d1fyta1, d1fytb1, d1fytd1, d1fytd2, d1fyte1, d1fyte2
      2. 132002Domain d1fytb2: 1fyt B:3-92 [38170]
        Other proteins in same PDB: d1fyta1, d1fytb1, d1fytd1, d1fytd2, d1fyte1, d1fyte2
    4. Domains for 1hxy:
      1. 131993Domain d1hxya2: 1hxy A:3-81 [61387]
        Other proteins in same PDB: d1hxya1, d1hxyb1, d1hxyd1, d1hxyd2
      2. 131994Domain d1hxyb2: 1hxy B:3-92 [61389]
        Other proteins in same PDB: d1hxya1, d1hxyb1, d1hxyd1, d1hxyd2
    5. Domains for 1seb:
      1. 132003Domain d1seba2: 1seb A:1-81 [38175]
        Other proteins in same PDB: d1seba1, d1sebb1, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebf1, d1sebh1, d1sebh2
      2. 132004Domain d1sebb2: 1seb B:1-92 [38176]
        Other proteins in same PDB: d1seba1, d1sebb1, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebf1, d1sebh1, d1sebh2
      3. 132005Domain d1sebe2: 1seb E:1-81 [38177]
        Other proteins in same PDB: d1seba1, d1sebb1, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebf1, d1sebh1, d1sebh2
      4. 132006Domain d1sebf2: 1seb F:1-92 [38178]
        Other proteins in same PDB: d1seba1, d1sebb1, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebf1, d1sebh1, d1sebh2
    6. Domains for 2seb:
      1. 131995Domain d2seba2: 2seb A:1-81 [38167]
        Other proteins in same PDB: d2seba1, d2sebb1, d2sebd1, d2sebd2
      2. 131996Domain d2sebb2: 2seb B:2-92 [38168]
        Other proteins in same PDB: d2seba1, d2sebb1, d2sebd1, d2sebd2
  4. 132007Human (Homo sapiens), HLA-DR2 [TaxId:9606] [54461] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1bx2:
      1. 132012Domain d1bx2a2: 1bx2 A:2-81 [38183]
        Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2b1, d1bx2d1, d1bx2e1
      2. 132013Domain d1bx2b2: 1bx2 B:3-92 [38184]
        Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2b1, d1bx2d1, d1bx2e1
      3. 132014Domain d1bx2d2: 1bx2 D:2-81 [38185]
        Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2b1, d1bx2d1, d1bx2e1
      4. 132015Domain d1bx2e2: 1bx2 E:3-92 [38186]
        Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2b1, d1bx2d1, d1bx2e1
    2. Domains for 1fv1:
      1. 132008Domain d1fv1a2: 1fv1 A:3-81 [38179]
        Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1b1, d1fv1d1, d1fv1e1
      2. 132009Domain d1fv1b2: 1fv1 B:1-92 [38180]
        Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1b1, d1fv1d1, d1fv1e1
      3. 132010Domain d1fv1d2: 1fv1 D:4-81 [38181]
        Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1b1, d1fv1d1, d1fv1e1
      4. 132011Domain d1fv1e2: 1fv1 E:1-92 [38182]
        Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1b1, d1fv1d1, d1fv1e1
    3. Domains for 1hqr:
      1. 132016Domain d1hqra2: 1hqr A:3-81 [38187]
        Other proteins in same PDB: d1hqra1, d1hqrb1, d1hqrd1, d1hqrd2
      2. 132017Domain d1hqrb2: 1hqr B:202-292 [38188]
        Other proteins in same PDB: d1hqra1, d1hqrb1, d1hqrd1, d1hqrd2
  5. 132018Human (Homo sapiens), HLA-DR3 [TaxId:9606] [54462] (1 PDB entry)
  6. 132021Human (Homo sapiens), HLA-DR4 [TaxId:9606] [54463] (4 PDB entries)
    1. Domains for 1d5m:
      1. 132024Domain d1d5ma2: 1d5m A:4-81 [38191]
        Other proteins in same PDB: d1d5ma1, d1d5mb1, d1d5mc1, d1d5mc2
      2. 132025Domain d1d5mb2: 1d5m B:2-92 [38192]
        Other proteins in same PDB: d1d5ma1, d1d5mb1, d1d5mc1, d1d5mc2
    2. Domains for 1d5x:
      1. 132028Domain d1d5xa2: 1d5x A:3-81 [38197]
        Other proteins in same PDB: d1d5xa1, d1d5xb1, d1d5xc1, d1d5xc2
      2. 132029Domain d1d5xb2: 1d5x B:1-92 [38198]
        Other proteins in same PDB: d1d5xa1, d1d5xb1, d1d5xc1, d1d5xc2
    3. Domains for 1d5z:
      1. 132022Domain d1d5za2: 1d5z A:3-81 [38193]
        Other proteins in same PDB: d1d5za1, d1d5zb1, d1d5zc1, d1d5zc2
      2. 132023Domain d1d5zb2: 1d5z B:1-92 [38194]
        Other proteins in same PDB: d1d5za1, d1d5zb1, d1d5zc1, d1d5zc2
    4. Domains for 1d6e:
      1. 132026Domain d1d6ea2: 1d6e A:4-81 [38195]
        Other proteins in same PDB: d1d6ea1, d1d6eb1, d1d6ec1, d1d6ec2
      2. 132027Domain d1d6eb2: 1d6e B:3-92 [38196]
        Other proteins in same PDB: d1d6ea1, d1d6eb1, d1d6ec1, d1d6ec2
  7. 132030Mouse (Mus musculus), H2-DM [TaxId:10090] [69679] (1 PDB entry)
  8. 132033Mouse (Mus musculus), I-A(G7) [TaxId:10090] [54467] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1es0:
      1. 132034Domain d1es0a2: 1es0 A:1B-82 [38217]
        Other proteins in same PDB: d1es0a1, d1es0b1
      2. 132035Domain d1es0b2: 1es0 B:5-93 [38218]
        Other proteins in same PDB: d1es0a1, d1es0b1
    2. Domains for 1f3j:
      1. 132036Domain d1f3ja2: 1f3j A:1-82 [38219]
        Other proteins in same PDB: d1f3ja1, d1f3jb1, d1f3jd1, d1f3je1
      2. 132037Domain d1f3jb2: 1f3j B:4-93 [38220]
        Other proteins in same PDB: d1f3ja1, d1f3jb1, d1f3jd1, d1f3je1
      3. 132038Domain d1f3jd2: 1f3j D:1-82 [38221]
        Other proteins in same PDB: d1f3ja1, d1f3jb1, d1f3jd1, d1f3je1
      4. 132039Domain d1f3je2: 1f3j E:4-93 [38222]
        Other proteins in same PDB: d1f3ja1, d1f3jb1, d1f3jd1, d1f3je1
  9. 132040Mouse (Mus musculus), I-AD [TaxId:10090] [54466] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1iao:
      1. 132043Domain d1iaoa2: 1iao A:1-82 [38215]
        Other proteins in same PDB: d1iaoa1, d1iaob1
      2. 132044Domain d1iaob2: 1iao B:6-93 [38216]
        Other proteins in same PDB: d1iaoa1, d1iaob1
    2. Domains for 2iad:
      1. 132041Domain d2iada2: 2iad A:1A-82 [38213]
        Other proteins in same PDB: d2iada1, d2iadb1
      2. 132042Domain d2iadb2: 2iad B:5-93 [38214]
        Other proteins in same PDB: d2iada1, d2iadb1
  10. 132045Mouse (Mus musculus), I-AK [TaxId:10090] [54464] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1d9k:
      1. 132048Domain d1d9kc2: 1d9k C:1-81 [38201]
        Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc1, d1d9kd1, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg1, d1d9kh1
      2. 132049Domain d1d9kd2: 1d9k D:2-92 [38202]
        Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc1, d1d9kd1, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg1, d1d9kh1
      3. 132050Domain d1d9kg2: 1d9k G:1-81 [38203]
        Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc1, d1d9kd1, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg1, d1d9kh1
      4. 132051Domain d1d9kh2: 1d9k H:2-92 [38204]
        Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc1, d1d9kd1, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg1, d1d9kh1
    2. Domains for 1iak:
      1. 132046Domain d1iaka2: 1iak A:1-81 [38199]
        Other proteins in same PDB: d1iaka1, d1iakb1
      2. 132047Domain d1iakb2: 1iak B:5-92 [38200]
        Other proteins in same PDB: d1iaka1, d1iakb1
    3. Domains for 1jl4:
      1. 132052Domain d1jl4a2: 1jl4 A:5-81 [63158]
        Other proteins in same PDB: d1jl4a1, d1jl4b1, d1jl4d1, d1jl4d2
      2. 132053Domain d1jl4b2: 1jl4 B:5-92 [63160]
        Other proteins in same PDB: d1jl4a1, d1jl4b1, d1jl4d1, d1jl4d2
  11. 132054Mouse (Mus musculus), I-EK [TaxId:10090] [54465] (5 PDB entries)
    1. Domains for 1fne:
      1. 132059Domain d1fnea2: 1fne A:1-81 [59897]
        Other proteins in same PDB: d1fnea1, d1fneb1, d1fnec1, d1fned1
      2. 132060Domain d1fneb2: 1fne B:4-92 [59899]
        Other proteins in same PDB: d1fnea1, d1fneb1, d1fnec1, d1fned1
      3. 132061Domain d1fnec2: 1fne C:1-81 [59901]
        Other proteins in same PDB: d1fnea1, d1fneb1, d1fnec1, d1fned1
      4. 132062Domain d1fned2: 1fne D:4-92 [59903]
        Other proteins in same PDB: d1fnea1, d1fneb1, d1fnec1, d1fned1
    2. Domains for 1fng:
      1. 132055Domain d1fnga2: 1fng A:1-81 [59905]
        Other proteins in same PDB: d1fnga1, d1fngb1, d1fngc1, d1fngd1
      2. 132056Domain d1fngb2: 1fng B:4-92 [59907]
        Other proteins in same PDB: d1fnga1, d1fngb1, d1fngc1, d1fngd1
      3. 132057Domain d1fngc2: 1fng C:1-81 [59909]
        Other proteins in same PDB: d1fnga1, d1fngb1, d1fngc1, d1fngd1
      4. 132058Domain d1fngd2: 1fng D:4-92 [59911]
        Other proteins in same PDB: d1fnga1, d1fngb1, d1fngc1, d1fngd1
    3. Domains for 1i3r:
      1. 132067Domain d1i3ra2: 1i3r A:1-81 [61621]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rh1
      2. 132068Domain d1i3rb2: 1i3r B:1-120 [61623]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rh1
      3. 132069Domain d1i3rc2: 1i3r C:1-81 [61625]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rh1
      4. 132070Domain d1i3rd2: 1i3r D:1-120 [61627]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rh1
      5. 132071Domain d1i3re2: 1i3r E:1-81 [61629]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rh1
      6. 132072Domain d1i3rf2: 1i3r F:1-120 [61631]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rh1
      7. 132073Domain d1i3rg2: 1i3r G:1-81 [61633]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rh1
      8. 132074Domain d1i3rh2: 1i3r H:1-120 [61635]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rh1
    4. Domains for 1iea:
      1. 132063Domain d1ieaa2: 1iea A:1-81 [38205]
        Other proteins in same PDB: d1ieaa1, d1ieab1, d1ieac1, d1iead1
      2. 132064Domain d1ieab2: 1iea B:4-92 [38206]
        Other proteins in same PDB: d1ieaa1, d1ieab1, d1ieac1, d1iead1
      3. 132065Domain d1ieac2: 1iea C:1-81 [38207]
        Other proteins in same PDB: d1ieaa1, d1ieab1, d1ieac1, d1iead1
      4. 132066Domain d1iead2: 1iea D:4-92 [38208]
        Other proteins in same PDB: d1ieaa1, d1ieab1, d1ieac1, d1iead1
    5. Domains for 1ieb:
      1. 132075Domain d1ieba2: 1ieb A:1-81 [38209]
        Other proteins in same PDB: d1ieba1, d1iebb1, d1iebc1, d1iebd1
      2. 132076Domain d1iebb2: 1ieb B:4-92 [38210]
        Other proteins in same PDB: d1ieba1, d1iebb1, d1iebc1, d1iebd1
      3. 132077Domain d1iebc2: 1ieb C:1-81 [38211]
        Other proteins in same PDB: d1ieba1, d1iebb1, d1iebc1, d1iebd1
      4. 132078Domain d1iebd2: 1ieb D:4-92 [38212]
        Other proteins in same PDB: d1ieba1, d1iebb1, d1iebc1, d1iebd1

More info for Protein MHC class II, N-terminal domains of alpha and beta chains from d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain

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  • Protein MHC class II, N-terminal domains of alpha and beta chains from d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
  • Protein MHC class II, N-terminal domains of alpha and beta chains from d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain appears in SCOP 1.57
  • Protein MHC class II, N-terminal domains of alpha and beta chains from d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain appears in SCOP 1.61
  • Protein MHC class II, N-terminal domains of alpha and beta chains from d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain last appears in SCOP 1.63