Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (376 folds) |
Fold d.3: Cysteine proteinases [54000] (1 superfamily) consists of one alpha-helix and 4 strands of antiparallel beta-sheet and contains the catalytic triad Cys-His-Asn |
Superfamily d.3.1: Cysteine proteinases [54001] (22 families) the constitute families differ by insertion into and circular permutation of the common catalytic core made of one alpha-helix and 3-strands of beta-sheet |
Family d.3.1.4: Transglutaminase core [54044] (2 proteins) |
Protein Transglutaminase catalytic domain [54045] (4 species) |
Human (Homo sapiens), blood isozyme [TaxId:9606] [54046] (8 PDB entries) Coagulation factor XIII |
Human (Homo sapiens), TGase E3 [TaxId:9606] [75334] (8 PDB entries) |
Human (Homo sapiens), tissue isozyme [TaxId:9606] [75333] (2 PDB entries) GDP-binding protein |
Domain d1kv3a4: 1kv3 A:146-468 [73030] Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a2, d1kv3a3, d1kv3b1, d1kv3b2, d1kv3b3, d1kv3c1, d1kv3c2, d1kv3c3, d1kv3d1, d1kv3d2, d1kv3d3, d1kv3e1, d1kv3e2, d1kv3e3, d1kv3f1, d1kv3f2, d1kv3f3 |
Domain d1kv3b4: 1kv3 B:146-468 [73034] Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a2, d1kv3a3, d1kv3b1, d1kv3b2, d1kv3b3, d1kv3c1, d1kv3c2, d1kv3c3, d1kv3d1, d1kv3d2, d1kv3d3, d1kv3e1, d1kv3e2, d1kv3e3, d1kv3f1, d1kv3f2, d1kv3f3 |
Domain d1kv3c4: 1kv3 C:146-468 [73038] Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a2, d1kv3a3, d1kv3b1, d1kv3b2, d1kv3b3, d1kv3c1, d1kv3c2, d1kv3c3, d1kv3d1, d1kv3d2, d1kv3d3, d1kv3e1, d1kv3e2, d1kv3e3, d1kv3f1, d1kv3f2, d1kv3f3 |
Domain d1kv3d4: 1kv3 D:146-468 [73042] Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a2, d1kv3a3, d1kv3b1, d1kv3b2, d1kv3b3, d1kv3c1, d1kv3c2, d1kv3c3, d1kv3d1, d1kv3d2, d1kv3d3, d1kv3e1, d1kv3e2, d1kv3e3, d1kv3f1, d1kv3f2, d1kv3f3 |
Domain d1kv3e4: 1kv3 E:146-468 [73046] Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a2, d1kv3a3, d1kv3b1, d1kv3b2, d1kv3b3, d1kv3c1, d1kv3c2, d1kv3c3, d1kv3d1, d1kv3d2, d1kv3d3, d1kv3e1, d1kv3e2, d1kv3e3, d1kv3f1, d1kv3f2, d1kv3f3 |
Domain d1kv3f4: 1kv3 F:146-468 [73050] Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a2, d1kv3a3, d1kv3b1, d1kv3b2, d1kv3b3, d1kv3c1, d1kv3c2, d1kv3c3, d1kv3d1, d1kv3d2, d1kv3d3, d1kv3e1, d1kv3e2, d1kv3e3, d1kv3f1, d1kv3f2, d1kv3f3 complexed with gdp |
Domain d2q3za4: 2q3z A:146-461 [150040] Other proteins in same PDB: d2q3za1, d2q3za2, d2q3za3 automatically matched to d1kv3a4 complexed with ace, nh2, onl, so4 |
Red sea bream (Chrysophrys major) [TaxId:143350] [64204] (1 PDB entry) |
Domain d1g0da4: 1g0d A:141-461 [60169] Other proteins in same PDB: d1g0da1, d1g0da2, d1g0da3 complexed with so4 |
Timeline for Protein Transglutaminase catalytic domain from d.3.1.4: Transglutaminase core: