Lineage for Protein: Glutamate dehydrogenase

  1. Root: SCOP 1.67
  2. 383641Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (130 folds)
  3. 398612Fold c.58: Aminoacid dehydrogenase-like, N-terminal domain [53222] (1 superfamily)
    core: 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 4 strands; 2134
  4. 398613Superfamily c.58.1: Aminoacid dehydrogenase-like, N-terminal domain [53223] (5 families) (S)
  5. 398614Family c.58.1.1: Aminoacid dehydrogenases [53224] (3 proteins)
    dimerisation domain; contains additional structures including two extra N-terminal strands in the beta-sheet
  6. 398615Protein Glutamate dehydrogenase [53225] (7 species)

Species:

  1. 398616Archaeon Pyrococcus furiosus [TaxId:2261] [53227] (1 PDB entry)
  2. 398620Archaeon Thermococcus litoralis [TaxId:2265] [53228] (1 PDB entry)
  3. 398627Archaeon Thermococcus profundus [TaxId:49899] [64106] (1 PDB entry)
  4. 398634Clostridium symbiosum [TaxId:1512] [53226] (4 PDB entries)
    1. Domain for 1aup:
    2. Domain for 1bgv:
    3. Domains for 1hrd:
      1. 398635Domain d1hrda2: 1hrd A:1-194 [33867]
        Other proteins in same PDB: d1hrda1, d1hrdb1, d1hrdc1
      2. 398636Domain d1hrdb2: 1hrd B:1-194 [33868]
        Other proteins in same PDB: d1hrda1, d1hrdb1, d1hrdc1
      3. 398637Domain d1hrdc2: 1hrd C:1-194 [33869]
        Other proteins in same PDB: d1hrda1, d1hrdb1, d1hrdc1
    4. Domain for 1k89:
  5. 398641Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [53230] (5 PDB entries)
    1. Domains for 1hwx:
      1. 398642Domain d1hwxa2: 1hwx A:1-208 [33898]
        Other proteins in same PDB: d1hwxa1, d1hwxb1, d1hwxc1, d1hwxd1, d1hwxe1, d1hwxf1
      2. 398643Domain d1hwxb2: 1hwx B:1-208 [33899]
        Other proteins in same PDB: d1hwxa1, d1hwxb1, d1hwxc1, d1hwxd1, d1hwxe1, d1hwxf1
      3. 398644Domain d1hwxc2: 1hwx C:1-208 [33900]
        Other proteins in same PDB: d1hwxa1, d1hwxb1, d1hwxc1, d1hwxd1, d1hwxe1, d1hwxf1
      4. 398645Domain d1hwxd2: 1hwx D:1-208 [33901]
        Other proteins in same PDB: d1hwxa1, d1hwxb1, d1hwxc1, d1hwxd1, d1hwxe1, d1hwxf1
      5. 398646Domain d1hwxe2: 1hwx E:1-208 [33902]
        Other proteins in same PDB: d1hwxa1, d1hwxb1, d1hwxc1, d1hwxd1, d1hwxe1, d1hwxf1
      6. 398647Domain d1hwxf2: 1hwx F:1-208 [33903]
        Other proteins in same PDB: d1hwxa1, d1hwxb1, d1hwxc1, d1hwxd1, d1hwxe1, d1hwxf1
        complexed with glu, gtp, nai
    2. Domains for 1hwy:
      1. 398666Domain d1hwya2: 1hwy A:1-208 [33910]
        Other proteins in same PDB: d1hwya1, d1hwyb1, d1hwyc1, d1hwyd1, d1hwye1, d1hwyf1
      2. 398667Domain d1hwyb2: 1hwy B:1-208 [33911]
        Other proteins in same PDB: d1hwya1, d1hwyb1, d1hwyc1, d1hwyd1, d1hwye1, d1hwyf1
      3. 398668Domain d1hwyc2: 1hwy C:1-208 [33912]
        Other proteins in same PDB: d1hwya1, d1hwyb1, d1hwyc1, d1hwyd1, d1hwye1, d1hwyf1
      4. 398669Domain d1hwyd2: 1hwy D:1-208 [33913]
        Other proteins in same PDB: d1hwya1, d1hwyb1, d1hwyc1, d1hwyd1, d1hwye1, d1hwyf1
      5. 398670Domain d1hwye2: 1hwy E:1-208 [33914]
        Other proteins in same PDB: d1hwya1, d1hwyb1, d1hwyc1, d1hwyd1, d1hwye1, d1hwyf1
      6. 398671Domain d1hwyf2: 1hwy F:1-208 [33915]
        Other proteins in same PDB: d1hwya1, d1hwyb1, d1hwyc1, d1hwyd1, d1hwye1, d1hwyf1
        complexed with akg, nad, po4
    3. Domains for 1hwz:
      1. 398660Domain d1hwza2: 1hwz A:1-208 [33904]
        Other proteins in same PDB: d1hwza1, d1hwzb1, d1hwzc1, d1hwzd1, d1hwze1, d1hwzf1
      2. 398661Domain d1hwzb2: 1hwz B:1-208 [33905]
        Other proteins in same PDB: d1hwza1, d1hwzb1, d1hwzc1, d1hwzd1, d1hwze1, d1hwzf1
      3. 398662Domain d1hwzc2: 1hwz C:1-208 [33906]
        Other proteins in same PDB: d1hwza1, d1hwzb1, d1hwzc1, d1hwzd1, d1hwze1, d1hwzf1
      4. 398663Domain d1hwzd2: 1hwz D:1-208 [33907]
        Other proteins in same PDB: d1hwza1, d1hwzb1, d1hwzc1, d1hwzd1, d1hwze1, d1hwzf1
      5. 398664Domain d1hwze2: 1hwz E:1-208 [33908]
        Other proteins in same PDB: d1hwza1, d1hwzb1, d1hwzc1, d1hwzd1, d1hwze1, d1hwzf1
      6. 398665Domain d1hwzf2: 1hwz F:1-208 [33909]
        Other proteins in same PDB: d1hwza1, d1hwzb1, d1hwzc1, d1hwzd1, d1hwze1, d1hwzf1
        complexed with glu, gtp, ndp
    4. Domains for 1nqt:
      1. 398672Domain d1nqta2: 1nqt A:6-208 [86053]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
      2. 398673Domain d1nqtb2: 1nqt B:6-208 [86055]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
      3. 398674Domain d1nqtc2: 1nqt C:6-208 [86057]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
      4. 398675Domain d1nqtd2: 1nqt D:6-208 [86059]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
      5. 398676Domain d1nqte2: 1nqt E:6-208 [86061]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
      6. 398677Domain d1nqtf2: 1nqt F:6-208 [86063]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
      7. 398678Domain d1nqtg2: 1nqt G:6-208 [86065]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
      8. 398679Domain d1nqth2: 1nqt H:6-208 [86067]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
      9. 398680Domain d1nqti2: 1nqt I:6-208 [86069]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
      10. 398681Domain d1nqtj2: 1nqt J:6-208 [86071]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
      11. 398682Domain d1nqtk2: 1nqt K:6-208 [86073]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
      12. 398683Domain d1nqtl2: 1nqt L:6-208 [86075]
        Other proteins in same PDB: d1nqta1, d1nqtb1, d1nqtc1, d1nqtd1, d1nqte1, d1nqtf1, d1nqtg1, d1nqth1, d1nqti1, d1nqtj1, d1nqtk1, d1nqtl1
        complexed with adp
    5. Domains for 1nr7:
      1. 398648Domain d1nr7a2: 1nr7 A:6-208 [86096]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      2. 398649Domain d1nr7b2: 1nr7 B:6-208 [86098]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      3. 398650Domain d1nr7c2: 1nr7 C:6-208 [86100]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      4. 398651Domain d1nr7d2: 1nr7 D:6-208 [86102]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      5. 398652Domain d1nr7e2: 1nr7 E:6-208 [86104]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      6. 398653Domain d1nr7f2: 1nr7 F:6-208 [86106]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      7. 398654Domain d1nr7g2: 1nr7 G:6-208 [86108]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      8. 398655Domain d1nr7h2: 1nr7 H:6-208 [86110]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      9. 398656Domain d1nr7i2: 1nr7 I:6-208 [86112]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      10. 398657Domain d1nr7j2: 1nr7 J:6-208 [86114]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      11. 398658Domain d1nr7k2: 1nr7 K:6-208 [86116]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
      12. 398659Domain d1nr7l2: 1nr7 L:6-208 [86118]
        Other proteins in same PDB: d1nr7a1, d1nr7b1, d1nr7c1, d1nr7d1, d1nr7e1, d1nr7f1, d1nr7g1, d1nr7h1, d1nr7i1, d1nr7j1, d1nr7k1, d1nr7l1
  6. 398684Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] [75252] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1l1f:
      1. 398691Domain d1l1fa2: 1l1f A:10-212 [73457]
        Other proteins in same PDB: d1l1fa1, d1l1fb1, d1l1fc1, d1l1fd1, d1l1fe1, d1l1ff1
      2. 398692Domain d1l1fb2: 1l1f B:10-212 [73459]
        Other proteins in same PDB: d1l1fa1, d1l1fb1, d1l1fc1, d1l1fd1, d1l1fe1, d1l1ff1
      3. 398693Domain d1l1fc2: 1l1f C:10-212 [73461]
        Other proteins in same PDB: d1l1fa1, d1l1fb1, d1l1fc1, d1l1fd1, d1l1fe1, d1l1ff1
      4. 398694Domain d1l1fd2: 1l1f D:10-212 [73463]
        Other proteins in same PDB: d1l1fa1, d1l1fb1, d1l1fc1, d1l1fd1, d1l1fe1, d1l1ff1
      5. 398695Domain d1l1fe2: 1l1f E:10-212 [73465]
        Other proteins in same PDB: d1l1fa1, d1l1fb1, d1l1fc1, d1l1fd1, d1l1fe1, d1l1ff1
      6. 398696Domain d1l1ff2: 1l1f F:10-212 [73467]
        Other proteins in same PDB: d1l1fa1, d1l1fb1, d1l1fc1, d1l1fd1, d1l1fe1, d1l1ff1
    2. Domains for 1nr1:
      1. 398685Domain d1nr1a2: 1nr1 A:10-212 [86081]
        Other proteins in same PDB: d1nr1a1, d1nr1b1, d1nr1c1, d1nr1d1, d1nr1e1, d1nr1f1
      2. 398686Domain d1nr1b2: 1nr1 B:10-212 [86083]
        Other proteins in same PDB: d1nr1a1, d1nr1b1, d1nr1c1, d1nr1d1, d1nr1e1, d1nr1f1
      3. 398687Domain d1nr1c2: 1nr1 C:10-212 [86085]
        Other proteins in same PDB: d1nr1a1, d1nr1b1, d1nr1c1, d1nr1d1, d1nr1e1, d1nr1f1
      4. 398688Domain d1nr1d2: 1nr1 D:10-212 [86087]
        Other proteins in same PDB: d1nr1a1, d1nr1b1, d1nr1c1, d1nr1d1, d1nr1e1, d1nr1f1
      5. 398689Domain d1nr1e2: 1nr1 E:10-212 [86089]
        Other proteins in same PDB: d1nr1a1, d1nr1b1, d1nr1c1, d1nr1d1, d1nr1e1, d1nr1f1
      6. 398690Domain d1nr1f2: 1nr1 F:10-212 [86091]
        Other proteins in same PDB: d1nr1a1, d1nr1b1, d1nr1c1, d1nr1d1, d1nr1e1, d1nr1f1
        mutant
  7. 398697Thermotoga maritima [TaxId:243274] [53229] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1b26:
      1. 398698Domain d1b26a2: 1b26 A:4-178 [33880]
        Other proteins in same PDB: d1b26a1, d1b26b1, d1b26c1, d1b26d1, d1b26e1, d1b26f1
      2. 398699Domain d1b26b2: 1b26 B:4-178 [33881]
        Other proteins in same PDB: d1b26a1, d1b26b1, d1b26c1, d1b26d1, d1b26e1, d1b26f1
      3. 398700Domain d1b26c2: 1b26 C:4-178 [33882]
        Other proteins in same PDB: d1b26a1, d1b26b1, d1b26c1, d1b26d1, d1b26e1, d1b26f1
      4. 398701Domain d1b26d2: 1b26 D:4-178 [33883]
        Other proteins in same PDB: d1b26a1, d1b26b1, d1b26c1, d1b26d1, d1b26e1, d1b26f1
      5. 398702Domain d1b26e2: 1b26 E:4-178 [33884]
        Other proteins in same PDB: d1b26a1, d1b26b1, d1b26c1, d1b26d1, d1b26e1, d1b26f1
      6. 398703Domain d1b26f2: 1b26 F:4-178 [33885]
        Other proteins in same PDB: d1b26a1, d1b26b1, d1b26c1, d1b26d1, d1b26e1, d1b26f1
    2. Domains for 1b3b:
      1. 398704Domain d1b3ba2: 1b3b A:4-178 [33892]
        Other proteins in same PDB: d1b3ba1, d1b3bb1, d1b3bc1, d1b3bd1, d1b3be1, d1b3bf1
      2. 398705Domain d1b3bb2: 1b3b B:4-178 [33893]
        Other proteins in same PDB: d1b3ba1, d1b3bb1, d1b3bc1, d1b3bd1, d1b3be1, d1b3bf1
      3. 398706Domain d1b3bc2: 1b3b C:4-178 [33894]
        Other proteins in same PDB: d1b3ba1, d1b3bb1, d1b3bc1, d1b3bd1, d1b3be1, d1b3bf1
      4. 398707Domain d1b3bd2: 1b3b D:4-178 [33895]
        Other proteins in same PDB: d1b3ba1, d1b3bb1, d1b3bc1, d1b3bd1, d1b3be1, d1b3bf1
      5. 398708Domain d1b3be2: 1b3b E:4-178 [33896]
        Other proteins in same PDB: d1b3ba1, d1b3bb1, d1b3bc1, d1b3bd1, d1b3be1, d1b3bf1
      6. 398709Domain d1b3bf2: 1b3b F:4-178 [33897]
        Other proteins in same PDB: d1b3ba1, d1b3bb1, d1b3bc1, d1b3bd1, d1b3be1, d1b3bf1
    3. Domains for 2tmg:
      1. 398710Domain d2tmga2: 2tmg A:4-178 [33886]
        Other proteins in same PDB: d2tmga1, d2tmgb1, d2tmgc1, d2tmgd1, d2tmge1, d2tmgf1
      2. 398711Domain d2tmgb2: 2tmg B:4-178 [33887]
        Other proteins in same PDB: d2tmga1, d2tmgb1, d2tmgc1, d2tmgd1, d2tmge1, d2tmgf1
      3. 398712Domain d2tmgc2: 2tmg C:4-178 [33888]
        Other proteins in same PDB: d2tmga1, d2tmgb1, d2tmgc1, d2tmgd1, d2tmge1, d2tmgf1
      4. 398713Domain d2tmgd2: 2tmg D:4-178 [33889]
        Other proteins in same PDB: d2tmga1, d2tmgb1, d2tmgc1, d2tmgd1, d2tmge1, d2tmgf1
      5. 398714Domain d2tmge2: 2tmg E:4-178 [33890]
        Other proteins in same PDB: d2tmga1, d2tmgb1, d2tmgc1, d2tmgd1, d2tmge1, d2tmgf1
      6. 398715Domain d2tmgf2: 2tmg F:4-178 [33891]
        Other proteins in same PDB: d2tmga1, d2tmgb1, d2tmgc1, d2tmgd1, d2tmge1, d2tmgf1

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