Lineage for Protein: Central domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

  1. Root: SCOP 1.63
  2. 235644Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (117 folds)
  3. 242911Fold c.37: P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases [52539] (1 superfamily)
    3 layers: a/b/a, parallel or mixed beta-sheets of variable sizes
  4. 242912Superfamily c.37.1: P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases [52540] (20 families) (S)
    division into families based on beta-sheet topologies
  5. 243788Family c.37.1.11: RecA protein-like (ATPase-domain) [52670] (9 proteins)
    core: mixed beta-sheet of 8 strands, order 32451678; strand 7 is antiparallel to the rest
  6. 243841Protein Central domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase [52678] (4 species)

Species:

  1. 243842Bacillus sp., strain ps3 [TaxId:1409] [52681] (1 PDB entry)
  2. 243845Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [52679] (9 PDB entries)
    1. Domains for 1bmf:
      1. 243864Domain d1bmfa3: 1bmf A:95-379 [32326]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa2, d1bmfb1, d1bmfb2, d1bmfc1, d1bmfc2, d1bmfd1, d1bmfd2, d1bmfe1, d1bmfe2, d1bmff1, d1bmff2, d1bmfg_
      2. 243865Domain d1bmfb3: 1bmf B:95-379 [32327]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa2, d1bmfb1, d1bmfb2, d1bmfc1, d1bmfc2, d1bmfd1, d1bmfd2, d1bmfe1, d1bmfe2, d1bmff1, d1bmff2, d1bmfg_
      3. 243866Domain d1bmfc3: 1bmf C:95-379 [32328]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa2, d1bmfb1, d1bmfb2, d1bmfc1, d1bmfc2, d1bmfd1, d1bmfd2, d1bmfe1, d1bmfe2, d1bmff1, d1bmff2, d1bmfg_
      4. 243867Domain d1bmfd3: 1bmf D:82-357 [32329]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa2, d1bmfb1, d1bmfb2, d1bmfc1, d1bmfc2, d1bmfd1, d1bmfd2, d1bmfe1, d1bmfe2, d1bmff1, d1bmff2, d1bmfg_
      5. 243868Domain d1bmfe3: 1bmf E:82-357 [32330]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa2, d1bmfb1, d1bmfb2, d1bmfc1, d1bmfc2, d1bmfd1, d1bmfd2, d1bmfe1, d1bmfe2, d1bmff1, d1bmff2, d1bmfg_
      6. 243869Domain d1bmff3: 1bmf F:82-357 [32331]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa2, d1bmfb1, d1bmfb2, d1bmfc1, d1bmfc2, d1bmfd1, d1bmfd2, d1bmfe1, d1bmfe2, d1bmff1, d1bmff2, d1bmfg_
        complexed with adp, anp, mg
    2. Domains for 1cow:
      1. 243894Domain d1cowa3: 1cow A:95-379 [32350]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa2, d1cowb1, d1cowb2, d1cowc1, d1cowc2, d1cowd1, d1cowd2, d1cowe1, d1cowe2, d1cowf1, d1cowf2, d1cowg_
      2. 243895Domain d1cowb3: 1cow B:95-379 [32351]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa2, d1cowb1, d1cowb2, d1cowc1, d1cowc2, d1cowd1, d1cowd2, d1cowe1, d1cowe2, d1cowf1, d1cowf2, d1cowg_
      3. 243896Domain d1cowc3: 1cow C:95-379 [32352]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa2, d1cowb1, d1cowb2, d1cowc1, d1cowc2, d1cowd1, d1cowd2, d1cowe1, d1cowe2, d1cowf1, d1cowf2, d1cowg_
      4. 243897Domain d1cowd3: 1cow D:82-357 [32353]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa2, d1cowb1, d1cowb2, d1cowc1, d1cowc2, d1cowd1, d1cowd2, d1cowe1, d1cowe2, d1cowf1, d1cowf2, d1cowg_
      5. 243898Domain d1cowe3: 1cow E:82-357 [32354]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa2, d1cowb1, d1cowb2, d1cowc1, d1cowc2, d1cowd1, d1cowd2, d1cowe1, d1cowe2, d1cowf1, d1cowf2, d1cowg_
      6. 243899Domain d1cowf3: 1cow F:82-357 [32355]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa2, d1cowb1, d1cowb2, d1cowc1, d1cowc2, d1cowd1, d1cowd2, d1cowe1, d1cowe2, d1cowf1, d1cowf2, d1cowg_
        complexed with adp, anp, aur, mg
    3. Domains for 1e1q:
      1. 243870Domain d1e1qa3: 1e1q A:95-379 [32338]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa2, d1e1qb1, d1e1qb2, d1e1qc1, d1e1qc2, d1e1qd1, d1e1qd2, d1e1qe1, d1e1qe2, d1e1qf1, d1e1qf2, d1e1qg_
      2. 243871Domain d1e1qb3: 1e1q B:95-379 [32339]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa2, d1e1qb1, d1e1qb2, d1e1qc1, d1e1qc2, d1e1qd1, d1e1qd2, d1e1qe1, d1e1qe2, d1e1qf1, d1e1qf2, d1e1qg_
      3. 243872Domain d1e1qc3: 1e1q C:95-379 [32340]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa2, d1e1qb1, d1e1qb2, d1e1qc1, d1e1qc2, d1e1qd1, d1e1qd2, d1e1qe1, d1e1qe2, d1e1qf1, d1e1qf2, d1e1qg_
      4. 243873Domain d1e1qd3: 1e1q D:82-357 [32341]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa2, d1e1qb1, d1e1qb2, d1e1qc1, d1e1qc2, d1e1qd1, d1e1qd2, d1e1qe1, d1e1qe2, d1e1qf1, d1e1qf2, d1e1qg_
      5. 243874Domain d1e1qe3: 1e1q E:82-357 [32342]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa2, d1e1qb1, d1e1qb2, d1e1qc1, d1e1qc2, d1e1qd1, d1e1qd2, d1e1qe1, d1e1qe2, d1e1qf1, d1e1qf2, d1e1qg_
      6. 243875Domain d1e1qf3: 1e1q F:82-357 [32343]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa2, d1e1qb1, d1e1qb2, d1e1qc1, d1e1qc2, d1e1qd1, d1e1qd2, d1e1qe1, d1e1qe2, d1e1qf1, d1e1qf2, d1e1qg_
        complexed with adp, anp, mg, po4
    4. Domains for 1e1r:
      1. 243858Domain d1e1ra3: 1e1r A:95-379 [32320]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra2, d1e1rb1, d1e1rb2, d1e1rc1, d1e1rc2, d1e1rd1, d1e1rd2, d1e1re1, d1e1re2, d1e1rf1, d1e1rf2, d1e1rg_
      2. 243859Domain d1e1rb3: 1e1r B:95-379 [32321]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra2, d1e1rb1, d1e1rb2, d1e1rc1, d1e1rc2, d1e1rd1, d1e1rd2, d1e1re1, d1e1re2, d1e1rf1, d1e1rf2, d1e1rg_
      3. 243860Domain d1e1rc3: 1e1r C:95-379 [32322]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra2, d1e1rb1, d1e1rb2, d1e1rc1, d1e1rc2, d1e1rd1, d1e1rd2, d1e1re1, d1e1re2, d1e1rf1, d1e1rf2, d1e1rg_
      4. 243861Domain d1e1rd3: 1e1r D:82-357 [32323]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra2, d1e1rb1, d1e1rb2, d1e1rc1, d1e1rc2, d1e1rd1, d1e1rd2, d1e1re1, d1e1re2, d1e1rf1, d1e1rf2, d1e1rg_
      5. 243862Domain d1e1re3: 1e1r E:82-357 [32324]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra2, d1e1rb1, d1e1rb2, d1e1rc1, d1e1rc2, d1e1rd1, d1e1rd2, d1e1re1, d1e1re2, d1e1rf1, d1e1rf2, d1e1rg_
      6. 243863Domain d1e1rf3: 1e1r F:82-357 [32325]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra2, d1e1rb1, d1e1rb2, d1e1rc1, d1e1rc2, d1e1rd1, d1e1rd2, d1e1re1, d1e1re2, d1e1rf1, d1e1rf2, d1e1rg_
        complexed with adp, af3, anp, mg, po4
    5. Domains for 1e79:
      1. 243846Domain d1e79a3: 1e79 A:95-379 [32314]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a2, d1e79b1, d1e79b2, d1e79c1, d1e79c2, d1e79d1, d1e79d2, d1e79e1, d1e79e2, d1e79f1, d1e79f2, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
      2. 243847Domain d1e79b3: 1e79 B:95-379 [32315]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a2, d1e79b1, d1e79b2, d1e79c1, d1e79c2, d1e79d1, d1e79d2, d1e79e1, d1e79e2, d1e79f1, d1e79f2, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
      3. 243848Domain d1e79c3: 1e79 C:95-379 [32316]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a2, d1e79b1, d1e79b2, d1e79c1, d1e79c2, d1e79d1, d1e79d2, d1e79e1, d1e79e2, d1e79f1, d1e79f2, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
      4. 243849Domain d1e79d3: 1e79 D:82-357 [32317]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a2, d1e79b1, d1e79b2, d1e79c1, d1e79c2, d1e79d1, d1e79d2, d1e79e1, d1e79e2, d1e79f1, d1e79f2, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
      5. 243850Domain d1e79e3: 1e79 E:82-357 [32318]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a2, d1e79b1, d1e79b2, d1e79c1, d1e79c2, d1e79d1, d1e79d2, d1e79e1, d1e79e2, d1e79f1, d1e79f2, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
      6. 243851Domain d1e79f3: 1e79 F:82-357 [32319]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a2, d1e79b1, d1e79b2, d1e79c1, d1e79c2, d1e79d1, d1e79d2, d1e79e1, d1e79e2, d1e79f1, d1e79f2, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
        complexed with adp, atp, cry, glh, mg, so4
    6. Domains for 1efr:
      1. 243882Domain d1efra3: 1efr A:95-379 [32344]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra2, d1efrb1, d1efrb2, d1efrc1, d1efrc2, d1efrd1, d1efrd2, d1efre1, d1efre2, d1efrf1, d1efrf2, d1efrg_
      2. 243883Domain d1efrb3: 1efr B:95-379 [32345]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra2, d1efrb1, d1efrb2, d1efrc1, d1efrc2, d1efrd1, d1efrd2, d1efre1, d1efre2, d1efrf1, d1efrf2, d1efrg_
      3. 243884Domain d1efrc3: 1efr C:95-379 [32346]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra2, d1efrb1, d1efrb2, d1efrc1, d1efrc2, d1efrd1, d1efrd2, d1efre1, d1efre2, d1efrf1, d1efrf2, d1efrg_
      4. 243885Domain d1efrd3: 1efr D:82-357 [32347]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra2, d1efrb1, d1efrb2, d1efrc1, d1efrc2, d1efrd1, d1efrd2, d1efre1, d1efre2, d1efrf1, d1efrf2, d1efrg_
      5. 243886Domain d1efre3: 1efr E:82-357 [32348]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra2, d1efrb1, d1efrb2, d1efrc1, d1efrc2, d1efrd1, d1efrd2, d1efre1, d1efre2, d1efrf1, d1efrf2, d1efrg_
      6. 243887Domain d1efrf3: 1efr F:82-357 [32349]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra2, d1efrb1, d1efrb2, d1efrc1, d1efrc2, d1efrd1, d1efrd2, d1efre1, d1efre2, d1efrf1, d1efrf2, d1efrg_
        complexed with adp, anp, app, bal, cpi, mg, tlx
    7. Domains for 1h8e:
      1. 243852Domain d1h8ea3: 1h8e A:95-379 [60740]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea2, d1h8eb1, d1h8eb2, d1h8ec1, d1h8ec2, d1h8ed1, d1h8ed2, d1h8ee1, d1h8ee2, d1h8ef1, d1h8ef2, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
      2. 243853Domain d1h8eb3: 1h8e B:95-379 [60743]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea2, d1h8eb1, d1h8eb2, d1h8ec1, d1h8ec2, d1h8ed1, d1h8ed2, d1h8ee1, d1h8ee2, d1h8ef1, d1h8ef2, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
      3. 243854Domain d1h8ec3: 1h8e C:95-379 [60746]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea2, d1h8eb1, d1h8eb2, d1h8ec1, d1h8ec2, d1h8ed1, d1h8ed2, d1h8ee1, d1h8ee2, d1h8ef1, d1h8ef2, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
      4. 243855Domain d1h8ed3: 1h8e D:82-357 [60749]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea2, d1h8eb1, d1h8eb2, d1h8ec1, d1h8ec2, d1h8ed1, d1h8ed2, d1h8ee1, d1h8ee2, d1h8ef1, d1h8ef2, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
      5. 243856Domain d1h8ee3: 1h8e E:82-357 [60752]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea2, d1h8eb1, d1h8eb2, d1h8ec1, d1h8ec2, d1h8ed1, d1h8ed2, d1h8ee1, d1h8ee2, d1h8ef1, d1h8ef2, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
      6. 243857Domain d1h8ef3: 1h8e F:82-357 [60755]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea2, d1h8eb1, d1h8eb2, d1h8ec1, d1h8ec2, d1h8ed1, d1h8ed2, d1h8ee1, d1h8ee2, d1h8ef1, d1h8ef2, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
        complexed with adp, alf, gol, mg, so4
    8. Domains for 1h8h:
      1. 243888Domain d1h8ha3: 1h8h A:95-379 [60761]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha2, d1h8hb1, d1h8hb2, d1h8hc1, d1h8hc2, d1h8hd1, d1h8hd2, d1h8he1, d1h8he2, d1h8hf1, d1h8hf2, d1h8hg_
      2. 243889Domain d1h8hb3: 1h8h B:95-379 [60764]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha2, d1h8hb1, d1h8hb2, d1h8hc1, d1h8hc2, d1h8hd1, d1h8hd2, d1h8he1, d1h8he2, d1h8hf1, d1h8hf2, d1h8hg_
      3. 243890Domain d1h8hc3: 1h8h C:95-379 [60767]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha2, d1h8hb1, d1h8hb2, d1h8hc1, d1h8hc2, d1h8hd1, d1h8hd2, d1h8he1, d1h8he2, d1h8hf1, d1h8hf2, d1h8hg_
      4. 243891Domain d1h8hd3: 1h8h D:82-357 [60770]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha2, d1h8hb1, d1h8hb2, d1h8hc1, d1h8hc2, d1h8hd1, d1h8hd2, d1h8he1, d1h8he2, d1h8hf1, d1h8hf2, d1h8hg_
      5. 243892Domain d1h8he3: 1h8h E:82-357 [60773]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha2, d1h8hb1, d1h8hb2, d1h8hc1, d1h8hc2, d1h8hd1, d1h8hd2, d1h8he1, d1h8he2, d1h8hf1, d1h8hf2, d1h8hg_
      6. 243893Domain d1h8hf3: 1h8h F:82-357 [60776]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha2, d1h8hb1, d1h8hb2, d1h8hc1, d1h8hc2, d1h8hd1, d1h8hd2, d1h8he1, d1h8he2, d1h8hf1, d1h8hf2, d1h8hg_
        complexed with adp, atp, gol, mg, po4
    9. Domains for 1nbm:
      1. 243876Domain d1nbma3: 1nbm A:95-379 [32332]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma2, d1nbmb1, d1nbmb2, d1nbmc1, d1nbmc2, d1nbmd1, d1nbmd2, d1nbme1, d1nbme2, d1nbmf1, d1nbmf2, d1nbmg_
      2. 243877Domain d1nbmb3: 1nbm B:95-379 [32333]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma2, d1nbmb1, d1nbmb2, d1nbmc1, d1nbmc2, d1nbmd1, d1nbmd2, d1nbme1, d1nbme2, d1nbmf1, d1nbmf2, d1nbmg_
      3. 243878Domain d1nbmc3: 1nbm C:95-379 [32334]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma2, d1nbmb1, d1nbmb2, d1nbmc1, d1nbmc2, d1nbmd1, d1nbmd2, d1nbme1, d1nbme2, d1nbmf1, d1nbmf2, d1nbmg_
      4. 243879Domain d1nbmd3: 1nbm D:82-357 [32335]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma2, d1nbmb1, d1nbmb2, d1nbmc1, d1nbmc2, d1nbmd1, d1nbmd2, d1nbme1, d1nbme2, d1nbmf1, d1nbmf2, d1nbmg_
      5. 243880Domain d1nbme3: 1nbm E:82-357 [32336]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma2, d1nbmb1, d1nbmb2, d1nbmc1, d1nbmc2, d1nbmd1, d1nbmd2, d1nbme1, d1nbme2, d1nbmf1, d1nbmf2, d1nbmg_
      6. 243881Domain d1nbmf3: 1nbm F:82-357 [32337]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma2, d1nbmb1, d1nbmb2, d1nbmc1, d1nbmc2, d1nbmd1, d1nbmd2, d1nbme1, d1nbme2, d1nbmf1, d1nbmf2, d1nbmg_
        complexed with adp, atp, mg, po4, tyn
  3. 243900Rat (Rattus norvegicus) [TaxId:10116] [52680] (1 PDB entry)
  4. 243903Spinach (Spinacia oleracea), chloroplast [TaxId:3562] [64024] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1fx0:
      1. 243904Domain d1fx0a3: 1fx0 A:97-372 [60082]
        Other proteins in same PDB: d1fx0a1, d1fx0a2, d1fx0b1, d1fx0b2
      2. 243905Domain d1fx0b3: 1fx0 B:98-377 [60085]
        Other proteins in same PDB: d1fx0a1, d1fx0a2, d1fx0b1, d1fx0b2
    2. Domains for 1kmh:
      1. 243906Domain d1kmha3: 1kmh A:97-372 [72747]
        Other proteins in same PDB: d1kmha1, d1kmha2, d1kmhb1, d1kmhb2
      2. 243907Domain d1kmhb3: 1kmh B:98-377 [72750]
        Other proteins in same PDB: d1kmha1, d1kmha2, d1kmhb1, d1kmhb2
        complexed with ttx

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Timeline for Protein Central domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase from c.37.1.11: RecA protein-like (ATPase-domain):