SCOP 1.63: Species: Pseudomonas putida

Lineage for Species: Pseudomonas putida

Root: SCOP 1.63
Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (117 folds)
Fold c.36: Thiamin diphosphate-binding fold (THDP-binding) [52517] (1 superfamily)
3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 213465

Superfamily c.36.1: Thiamin diphosphate-binding fold (THDP-binding) [52518] (4 families)

(S)

both pyridine (Pyr)- and pyrophosphate (PP)-binding modules have this fold
conserved core consists of two Pyr and two PP-modules and binds two coenzyme molecules

Family c.36.1.1: Pyruvate oxidase and decarboxylase THDP-binding domains [52519] (4 proteins)
the N-terminal, Pyr module is separated from the C-terminal, PP module by an alpa/beta domain of Rossmann-like topology

Protein Benzoylformate decarboxylase [52526] (1 species)
Species Pseudomonas putida [TaxId:303] [52527] (2 PDB entries)

PDB entries in Species: Pseudomonas putida:

Domain(s) for 1bfd:
1. Domain d1bfd_2: 1bfd 2-181 [31801]
  Other proteins in same PDB: d1bfd_1
2. Domain d1bfd_3: 1bfd 342-524 [31802]
  Other proteins in same PDB: d1bfd_1
  complexed with ca, mg, tpp

Domain(s) for 1mcz:

Domain d1mcza2: 1mcz A:2-181 [78953]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mcza3: 1mcz A:342-525 [78954]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczb2: 1mcz B:2-181 [78956]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczb3: 1mcz B:342-525 [78957]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczc2: 1mcz C:2-181 [78959]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczc3: 1mcz C:342-525 [78960]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczd2: 1mcz D:2-181 [78962]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczd3: 1mcz D:342-525 [78963]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mcze2: 1mcz E:2-181 [78965]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mcze3: 1mcz E:342-525 [78966]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczf2: 1mcz F:2-181 [78968]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczf3: 1mcz F:342-525 [78969]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczg2: 1mcz G:2-181 [78971]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczg3: 1mcz G:342-525 [78972]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczh2: 1mcz H:2-181 [78974]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczh3: 1mcz H:342-525 [78975]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczi2: 1mcz I:2-181 [78977]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczi3: 1mcz I:342-525 [78978]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczj2: 1mcz J:2-181 [78980]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczj3: 1mcz J:342-525 [78981]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczk2: 1mcz K:2-181 [78983]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczk3: 1mcz K:342-525 [78984]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczl2: 1mcz L:2-181 [78986]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczl3: 1mcz L:342-525 [78987]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczm2: 1mcz M:2-181 [78989]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczm3: 1mcz M:342-525 [78990]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczn2: 1mcz N:2-181 [78992]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczn3: 1mcz N:342-525 [78993]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczo2: 1mcz O:2-181 [78995]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczo3: 1mcz O:342-525 [78996]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczp2: 1mcz P:2-181 [78998]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1

Domain d1mczp3: 1mcz P:342-525 [78999]
Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mczb1, d1mczc1, d1mczd1, d1mcze1, d1mczf1, d1mczg1, d1mczh1, d1mczi1, d1mczj1, d1mczk1, d1mczl1, d1mczm1, d1mczn1, d1mczo1, d1mczp1
complexed with mg, rmn, tdp

More info for Species Pseudomonas putida [TaxId:303] from c.36.1.1 Benzoylformate decarboxylase

Timeline for Species Pseudomonas putida [TaxId:303] from c.36.1.1 Benzoylformate decarboxylase:

Species Pseudomonas putida [TaxId:303] from c.36.1.1 Benzoylformate decarboxylase first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
Species Pseudomonas putida [TaxId:303] from c.36.1.1 Benzoylformate decarboxylase appears in SCOP 1.61
Species Pseudomonas putida [TaxId:303] from c.36.1.1 Benzoylformate decarboxylase does not appear in SCOP 1.65