Lineage for Species: Human (Homo sapiens)

  1. Root: SCOP 1.65
  2. 305035Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (121 folds)
  3. 307887Fold c.2: NAD(P)-binding Rossmann-fold domains [51734] (1 superfamily)
    core: 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456
    The nucleotide-binding modes of this and the next two folds/superfamilies are similar
  4. 307888Superfamily c.2.1: NAD(P)-binding Rossmann-fold domains [51735] (10 families) (S)
  5. 309102Family c.2.1.7: Aminoacid dehydrogenase-like, C-terminal domain [51883] (10 proteins)
    extra N-terminal helix displaces the C-terminal helix (following strand 6) from its usual position creating a family nicotineamide-binding site
  6. 309234Protein Mitochondrial NAD(P)-dependenent malic enzyme [51898] (3 species)
    includes C-terminal additional subdomains
  7. 309252Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] [51899] (7 PDB entries)

PDB entries in Species: Human (Homo sapiens):

  1. Domain(s) for 1do8:
    1. 309261Domain d1do8a1: 1do8 A:280-573 [30289]
      Other proteins in same PDB: d1do8a2, d1do8b2, d1do8c2, d1do8d2
    2. 309262Domain d1do8b1: 1do8 B:280-573 [30290]
      Other proteins in same PDB: d1do8a2, d1do8b2, d1do8c2, d1do8d2
    3. 309263Domain d1do8c1: 1do8 C:280-573 [30291]
      Other proteins in same PDB: d1do8a2, d1do8b2, d1do8c2, d1do8d2
    4. 309264Domain d1do8d1: 1do8 D:280-573 [30292]
      Other proteins in same PDB: d1do8a2, d1do8b2, d1do8c2, d1do8d2
      complexed with mn, nad, oxl; mutant
  2. Domain(s) for 1efk:
    1. 309271Domain d1efka1: 1efk A:280-573 [30299]
      Other proteins in same PDB: d1efka2, d1efkb2, d1efkc2, d1efkd2
    2. 309272Domain d1efkb1: 1efk B:280-573 [30300]
      Other proteins in same PDB: d1efka2, d1efkb2, d1efkc2, d1efkd2
    3. 309273Domain d1efkc1: 1efk C:280-573 [30301]
      Other proteins in same PDB: d1efka2, d1efkb2, d1efkc2, d1efkd2
    4. 309274Domain d1efkd1: 1efk D:280-573 [30302]
      Other proteins in same PDB: d1efka2, d1efkb2, d1efkc2, d1efkd2
      complexed with mak, mo1, nad
  3. Domain(s) for 1efl:
    1. 309267Domain d1efla1: 1efl A:280-573 [30295]
      Other proteins in same PDB: d1efla2, d1eflb2, d1eflc2, d1efld2
    2. 309268Domain d1eflb1: 1efl B:280-573 [30296]
      Other proteins in same PDB: d1efla2, d1eflb2, d1eflc2, d1efld2
    3. 309269Domain d1eflc1: 1efl C:280-573 [30297]
      Other proteins in same PDB: d1efla2, d1eflb2, d1eflc2, d1efld2
    4. 309270Domain d1efld1: 1efl D:280-573 [30298]
      Other proteins in same PDB: d1efla2, d1eflb2, d1eflc2, d1efld2
      complexed with mg, nad, ttn
  4. Domain(s) for 1gz3:
    1. 309253Domain d1gz3a1: 1gz3 A:280-573 [83393]
      Other proteins in same PDB: d1gz3a2, d1gz3b2, d1gz3c2, d1gz3d2
    2. 309254Domain d1gz3b1: 1gz3 B:280-573 [83395]
      Other proteins in same PDB: d1gz3a2, d1gz3b2, d1gz3c2, d1gz3d2
    3. 309255Domain d1gz3c1: 1gz3 C:280-573 [83397]
      Other proteins in same PDB: d1gz3a2, d1gz3b2, d1gz3c2, d1gz3d2
    4. 309256Domain d1gz3d1: 1gz3 D:280-573 [83399]
      Other proteins in same PDB: d1gz3a2, d1gz3b2, d1gz3c2, d1gz3d2
      complexed with atp, fum, mn, oxl; mutant
  5. Domain(s) for 1gz4:
    1. 309257Domain d1gz4a1: 1gz4 A:280-573 [70794]
      Other proteins in same PDB: d1gz4a2, d1gz4b2, d1gz4c2, d1gz4d2
    2. 309258Domain d1gz4b1: 1gz4 B:280-573 [70796]
      Other proteins in same PDB: d1gz4a2, d1gz4b2, d1gz4c2, d1gz4d2
    3. 309259Domain d1gz4c1: 1gz4 C:280-573 [70798]
      Other proteins in same PDB: d1gz4a2, d1gz4b2, d1gz4c2, d1gz4d2
    4. 309260Domain d1gz4d1: 1gz4 D:280-573 [70800]
      Other proteins in same PDB: d1gz4a2, d1gz4b2, d1gz4c2, d1gz4d2
      complexed with atp, fum, mn, mse, ttn
  6. Domain(s) for 1pjl:
    1. 309275Domain d1pjla1: 1pjl A:280-573 [88123]
      Other proteins in same PDB: d1pjla2, d1pjlb2, d1pjlc2, d1pjld2, d1pjle2, d1pjlf2, d1pjlg2, d1pjlh2
    2. 309276Domain d1pjlb1: 1pjl B:1280-1573 [88125]
      Other proteins in same PDB: d1pjla2, d1pjlb2, d1pjlc2, d1pjld2, d1pjle2, d1pjlf2, d1pjlg2, d1pjlh2
    3. 309277Domain d1pjlc1: 1pjl C:2280-2573 [88127]
      Other proteins in same PDB: d1pjla2, d1pjlb2, d1pjlc2, d1pjld2, d1pjle2, d1pjlf2, d1pjlg2, d1pjlh2
    4. 309278Domain d1pjld1: 1pjl D:3280-3573 [88129]
      Other proteins in same PDB: d1pjla2, d1pjlb2, d1pjlc2, d1pjld2, d1pjle2, d1pjlf2, d1pjlg2, d1pjlh2
    5. 309279Domain d1pjle1: 1pjl E:4280-4573 [88131]
      Other proteins in same PDB: d1pjla2, d1pjlb2, d1pjlc2, d1pjld2, d1pjle2, d1pjlf2, d1pjlg2, d1pjlh2
    6. 309280Domain d1pjlf1: 1pjl F:5280-5573 [88133]
      Other proteins in same PDB: d1pjla2, d1pjlb2, d1pjlc2, d1pjld2, d1pjle2, d1pjlf2, d1pjlg2, d1pjlh2
    7. 309281Domain d1pjlg1: 1pjl G:6280-6573 [88135]
      Other proteins in same PDB: d1pjla2, d1pjlb2, d1pjlc2, d1pjld2, d1pjle2, d1pjlf2, d1pjlg2, d1pjlh2
    8. 309282Domain d1pjlh1: 1pjl H:7280-7573 [88137]
      Other proteins in same PDB: d1pjla2, d1pjlb2, d1pjlc2, d1pjld2, d1pjle2, d1pjlf2, d1pjlg2, d1pjlh2
      complexed with lu, mse, nad
  7. Domain(s) for 1qr6:
    1. 309265Domain d1qr6a1: 1qr6 A:280-573 [30293]
      Other proteins in same PDB: d1qr6a2, d1qr6b2
    2. 309266Domain d1qr6b1: 1qr6 B:1280-1573 [30294]
      Other proteins in same PDB: d1qr6a2, d1qr6b2
      complexed with nad; mutant

More info for Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] from c.2.1.7 Mitochondrial NAD(P)-dependenent malic enzyme

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