SCOP 1.61: Protein: Glutamate dehydrogenase

Lineage for Protein: Glutamate dehydrogenase

Root: SCOP 1.61
Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (117 folds)
Fold c.2: NAD(P)-binding Rossmann-fold domains [51734] (1 superfamily)
Superfamily c.2.1: NAD(P)-binding Rossmann-fold domains [51735] (11 families)
Family c.2.1.7: Amino-acid dehydrogenase-like, C-terminal domain [51883] (5 proteins)
Protein Glutamate dehydrogenase [51884] (7 species)

Species:

Archaeon Pyrococcus furiosus [TaxId:2261] [51886] (1 PDB entry)
- Domains for 1gtm:
  1. Domain d1gtma1: 1gtm A:181-419 [30223]
    Other proteins in same PDB: d1gtma2, d1gtmb2, d1gtmc2
  2. Domain d1gtmb1: 1gtm B:181-419 [30224]
    Other proteins in same PDB: d1gtma2, d1gtmb2, d1gtmc2
  3. Domain d1gtmc1: 1gtm C:181-419 [30225]
    Other proteins in same PDB: d1gtma2, d1gtmb2, d1gtmc2
Archaeon Thermococcus litoralis [TaxId:2265] [51887] (1 PDB entry)
- Domains for 1bvu:
  1. Domain d1bvua1: 1bvu A:181-418 [30226]
    Other proteins in same PDB: d1bvua2, d1bvub2, d1bvuc2, d1bvud2, d1bvue2, d1bvuf2
  2. Domain d1bvub1: 1bvu B:181-418 [30227]
    Other proteins in same PDB: d1bvua2, d1bvub2, d1bvuc2, d1bvud2, d1bvue2, d1bvuf2
  3. Domain d1bvuc1: 1bvu C:181-418 [30228]
    Other proteins in same PDB: d1bvua2, d1bvub2, d1bvuc2, d1bvud2, d1bvue2, d1bvuf2
  4. Domain d1bvud1: 1bvu D:181-418 [30229]
    Other proteins in same PDB: d1bvua2, d1bvub2, d1bvuc2, d1bvud2, d1bvue2, d1bvuf2
  5. Domain d1bvue1: 1bvu E:181-418 [30230]
    Other proteins in same PDB: d1bvua2, d1bvub2, d1bvuc2, d1bvud2, d1bvue2, d1bvuf2
  6. Domain d1bvuf1: 1bvu F:181-418 [30231]
    Other proteins in same PDB: d1bvua2, d1bvub2, d1bvuc2, d1bvud2, d1bvue2, d1bvuf2
Archaeon Thermococcus profundus [TaxId:49899] [63943] (1 PDB entry)
- Domains for 1euz:
  1. Domain d1euza1: 1euz A:181-419 [59513]
    Other proteins in same PDB: d1euza2, d1euzb2, d1euzc2, d1euzd2, d1euze2, d1euzf2
  2. Domain d1euzb1: 1euz B:181-419 [59515]
    Other proteins in same PDB: d1euza2, d1euzb2, d1euzc2, d1euzd2, d1euze2, d1euzf2
  3. Domain d1euzc1: 1euz C:181-419 [59517]
    Other proteins in same PDB: d1euza2, d1euzb2, d1euzc2, d1euzd2, d1euze2, d1euzf2
  4. Domain d1euzd1: 1euz D:181-419 [59519]
    Other proteins in same PDB: d1euza2, d1euzb2, d1euzc2, d1euzd2, d1euze2, d1euzf2
  5. Domain d1euze1: 1euz E:181-419 [59521]
    Other proteins in same PDB: d1euza2, d1euzb2, d1euzc2, d1euzd2, d1euze2, d1euzf2
  6. Domain d1euzf1: 1euz F:181-419 [59523]
    Other proteins in same PDB: d1euza2, d1euzb2, d1euzc2, d1euzd2, d1euze2, d1euzf2
Clostridium symbiosum [TaxId:1512] [51885] (4 PDB entries)
1. Domain for 1aup:
  - Domain d1aup_1: 1aup 205-449 [30222]
    Other proteins in same PDB: d1aup_2
2. Domain for 1bgv:
  - Domain d1bgva1: 1bgv A:195-449 [30217]
    Other proteins in same PDB: d1bgva2
3. Domains for 1hrd:
  1. Domain d1hrda1: 1hrd A:195-449 [30219]
    Other proteins in same PDB: d1hrda2, d1hrdb2, d1hrdc2
  2. Domain d1hrdb1: 1hrd B:195-449 [30220]
    Other proteins in same PDB: d1hrda2, d1hrdb2, d1hrdc2
  3. Domain d1hrdc1: 1hrd C:195-449 [30221]
    Other proteins in same PDB: d1hrda2, d1hrdb2, d1hrdc2
4. Domain for 1k89:
  - Domain d1k89_1: 1k89 195-449 [30218]
    Other proteins in same PDB: d1k89_2
Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [51889] (3 PDB entries)
1. Domains for 1hwx:
  1. Domain d1hwxa1: 1hwx A:209-501 [30250]
    Other proteins in same PDB: d1hwxa2, d1hwxb2, d1hwxc2, d1hwxd2, d1hwxe2, d1hwxf2
  2. Domain d1hwxb1: 1hwx B:209-501 [30251]
    Other proteins in same PDB: d1hwxa2, d1hwxb2, d1hwxc2, d1hwxd2, d1hwxe2, d1hwxf2
  3. Domain d1hwxc1: 1hwx C:209-501 [30252]
    Other proteins in same PDB: d1hwxa2, d1hwxb2, d1hwxc2, d1hwxd2, d1hwxe2, d1hwxf2
  4. Domain d1hwxd1: 1hwx D:209-501 [30253]
    Other proteins in same PDB: d1hwxa2, d1hwxb2, d1hwxc2, d1hwxd2, d1hwxe2, d1hwxf2
  5. Domain d1hwxe1: 1hwx E:209-501 [30254]
    Other proteins in same PDB: d1hwxa2, d1hwxb2, d1hwxc2, d1hwxd2, d1hwxe2, d1hwxf2
  6. Domain d1hwxf1: 1hwx F:209-501 [30255]
    Other proteins in same PDB: d1hwxa2, d1hwxb2, d1hwxc2, d1hwxd2, d1hwxe2, d1hwxf2
2. Domains for 1hwy:
  1. Domain d1hwya1: 1hwy A:209-501 [30262]
    Other proteins in same PDB: d1hwya2, d1hwyb2, d1hwyc2, d1hwyd2, d1hwye2, d1hwyf2
  2. Domain d1hwyb1: 1hwy B:209-501 [30263]
    Other proteins in same PDB: d1hwya2, d1hwyb2, d1hwyc2, d1hwyd2, d1hwye2, d1hwyf2
  3. Domain d1hwyc1: 1hwy C:209-501 [30264]
    Other proteins in same PDB: d1hwya2, d1hwyb2, d1hwyc2, d1hwyd2, d1hwye2, d1hwyf2
  4. Domain d1hwyd1: 1hwy D:209-501 [30265]
    Other proteins in same PDB: d1hwya2, d1hwyb2, d1hwyc2, d1hwyd2, d1hwye2, d1hwyf2
  5. Domain d1hwye1: 1hwy E:209-501 [30266]
    Other proteins in same PDB: d1hwya2, d1hwyb2, d1hwyc2, d1hwyd2, d1hwye2, d1hwyf2
  6. Domain d1hwyf1: 1hwy F:209-501 [30267]
    Other proteins in same PDB: d1hwya2, d1hwyb2, d1hwyc2, d1hwyd2, d1hwye2, d1hwyf2
3. Domains for 1hwz:
  1. Domain d1hwza1: 1hwz A:209-501 [30256]
    Other proteins in same PDB: d1hwza2, d1hwzb2, d1hwzc2, d1hwzd2, d1hwze2, d1hwzf2
  2. Domain d1hwzb1: 1hwz B:209-501 [30257]
    Other proteins in same PDB: d1hwza2, d1hwzb2, d1hwzc2, d1hwzd2, d1hwze2, d1hwzf2
  3. Domain d1hwzc1: 1hwz C:209-501 [30258]
    Other proteins in same PDB: d1hwza2, d1hwzb2, d1hwzc2, d1hwzd2, d1hwze2, d1hwzf2
  4. Domain d1hwzd1: 1hwz D:209-501 [30259]
    Other proteins in same PDB: d1hwza2, d1hwzb2, d1hwzc2, d1hwzd2, d1hwze2, d1hwzf2
  5. Domain d1hwze1: 1hwz E:209-501 [30260]
    Other proteins in same PDB: d1hwza2, d1hwzb2, d1hwzc2, d1hwzd2, d1hwze2, d1hwzf2
  6. Domain d1hwzf1: 1hwz F:209-501 [30261]
    Other proteins in same PDB: d1hwza2, d1hwzb2, d1hwzc2, d1hwzd2, d1hwze2, d1hwzf2
Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] [75115] (1 PDB entry)
- Domains for 1l1f:
  1. Domain d1l1fa1: 1l1f A:213-505 [73456]
    Other proteins in same PDB: d1l1fa2, d1l1fb2, d1l1fc2, d1l1fd2, d1l1fe2, d1l1ff2
  2. Domain d1l1fb1: 1l1f B:213-505 [73458]
    Other proteins in same PDB: d1l1fa2, d1l1fb2, d1l1fc2, d1l1fd2, d1l1fe2, d1l1ff2
  3. Domain d1l1fc1: 1l1f C:213-505 [73460]
    Other proteins in same PDB: d1l1fa2, d1l1fb2, d1l1fc2, d1l1fd2, d1l1fe2, d1l1ff2
  4. Domain d1l1fd1: 1l1f D:213-505 [73462]
    Other proteins in same PDB: d1l1fa2, d1l1fb2, d1l1fc2, d1l1fd2, d1l1fe2, d1l1ff2
  5. Domain d1l1fe1: 1l1f E:213-505 [73464]
    Other proteins in same PDB: d1l1fa2, d1l1fb2, d1l1fc2, d1l1fd2, d1l1fe2, d1l1ff2
  6. Domain d1l1ff1: 1l1f F:213-505 [73466]
    Other proteins in same PDB: d1l1fa2, d1l1fb2, d1l1fc2, d1l1fd2, d1l1fe2, d1l1ff2
Thermotoga maritima [TaxId:243274] [51888] (3 PDB entries)
1. Domains for 1b26:
  1. Domain d1b26a1: 1b26 A:179-412 [30232]
    Other proteins in same PDB: d1b26a2, d1b26b2, d1b26c2, d1b26d2, d1b26e2, d1b26f2
  2. Domain d1b26b1: 1b26 B:179-412 [30233]
    Other proteins in same PDB: d1b26a2, d1b26b2, d1b26c2, d1b26d2, d1b26e2, d1b26f2
  3. Domain d1b26c1: 1b26 C:179-412 [30234]
    Other proteins in same PDB: d1b26a2, d1b26b2, d1b26c2, d1b26d2, d1b26e2, d1b26f2
  4. Domain d1b26d1: 1b26 D:179-412 [30235]
    Other proteins in same PDB: d1b26a2, d1b26b2, d1b26c2, d1b26d2, d1b26e2, d1b26f2
  5. Domain d1b26e1: 1b26 E:179-412 [30236]
    Other proteins in same PDB: d1b26a2, d1b26b2, d1b26c2, d1b26d2, d1b26e2, d1b26f2
  6. Domain d1b26f1: 1b26 F:179-412 [30237]
    Other proteins in same PDB: d1b26a2, d1b26b2, d1b26c2, d1b26d2, d1b26e2, d1b26f2
2. Domains for 1b3b:
  1. Domain d1b3ba1: 1b3b A:179-412 [30244]
    Other proteins in same PDB: d1b3ba2, d1b3bb2, d1b3bc2, d1b3bd2, d1b3be2, d1b3bf2
  2. Domain d1b3bb1: 1b3b B:179-412 [30245]
    Other proteins in same PDB: d1b3ba2, d1b3bb2, d1b3bc2, d1b3bd2, d1b3be2, d1b3bf2
  3. Domain d1b3bc1: 1b3b C:179-412 [30246]
    Other proteins in same PDB: d1b3ba2, d1b3bb2, d1b3bc2, d1b3bd2, d1b3be2, d1b3bf2
  4. Domain d1b3bd1: 1b3b D:179-412 [30247]
    Other proteins in same PDB: d1b3ba2, d1b3bb2, d1b3bc2, d1b3bd2, d1b3be2, d1b3bf2
  5. Domain d1b3be1: 1b3b E:179-412 [30248]
    Other proteins in same PDB: d1b3ba2, d1b3bb2, d1b3bc2, d1b3bd2, d1b3be2, d1b3bf2
  6. Domain d1b3bf1: 1b3b F:179-412 [30249]
    Other proteins in same PDB: d1b3ba2, d1b3bb2, d1b3bc2, d1b3bd2, d1b3be2, d1b3bf2
3. Domains for 2tmg:
  1. Domain d2tmga1: 2tmg A:179-411 [30238]
    Other proteins in same PDB: d2tmga2, d2tmgb2, d2tmgc2, d2tmgd2, d2tmge2, d2tmgf2
  2. Domain d2tmgb1: 2tmg B:179-411 [30239]
    Other proteins in same PDB: d2tmga2, d2tmgb2, d2tmgc2, d2tmgd2, d2tmge2, d2tmgf2
  3. Domain d2tmgc1: 2tmg C:179-411 [30240]
    Other proteins in same PDB: d2tmga2, d2tmgb2, d2tmgc2, d2tmgd2, d2tmge2, d2tmgf2
  4. Domain d2tmgd1: 2tmg D:179-411 [30241]
    Other proteins in same PDB: d2tmga2, d2tmgb2, d2tmgc2, d2tmgd2, d2tmge2, d2tmgf2
  5. Domain d2tmge1: 2tmg E:179-411 [30242]
    Other proteins in same PDB: d2tmga2, d2tmgb2, d2tmgc2, d2tmgd2, d2tmge2, d2tmgf2
  6. Domain d2tmgf1: 2tmg F:179-411 [30243]
    Other proteins in same PDB: d2tmga2, d2tmgb2, d2tmgc2, d2tmgd2, d2tmge2, d2tmgf2

More info for Protein Glutamate dehydrogenase from c.2.1.7: Amino-acid dehydrogenase-like, C-terminal domain

Timeline for Protein Glutamate dehydrogenase from c.2.1.7: Amino-acid dehydrogenase-like, C-terminal domain:

Protein Glutamate dehydrogenase from c.2.1.7: Amino-acid dehydrogenase-like, C-terminal domain first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
Protein Glutamate dehydrogenase from c.2.1.7: Amino-acid dehydrogenase-like, C-terminal domain appears in SCOP 1.59
Protein Glutamate dehydrogenase from c.2.1.7: Amino-acid dehydrogenase-like, C-terminal domain is called Protein Glutamate dehydrogenase from c.2.1.7: Aminoacid dehydrogenase-like, C-terminal domain in SCOP 1.63
Protein Glutamate dehydrogenase from c.2.1.7: Amino-acid dehydrogenase-like, C-terminal domain appears in the current release, SCOPe 2.08, called Protein Glutamate dehydrogenase from c.2.1.7: Aminoacid dehydrogenase-like, C-terminal domain